Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A197JSH2

Protein Details
Accession A0A197JSH2    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-69SSVTRFKPINRKPVPSKQKPAMRSHydrophilic
237-289NRSRSRSYSRSRSRSRSRSRARSPVRRRSTSKERSHRGRSRSRPRSRSPSRSPHydrophilic
336-379PGQHRSRSRSRSRSRSWDRRRSRSRSPHSRRTGRSRSRSRSRSPBasic
388-407SPPYKRSRQHSPPSQQPQQPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
224-289SRSSSPYRLRSRDNRSRSRSYSRSRSRSRSRSRARSPVRRRSTSKERSHRGRSRSRPRSRSPSRSP
339-395HRSRSRSRSRSRSWDRRRSRSRSPHSRRTGRSRSRSRSRSPPYGSRRSPSPPYKRSR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSLYGDLPPPSKEGDTPVKKPTVEDGAAAGSTSSSPAKTILPAGWSSVTRFKPINRKPVPSKQKPAMRSIPVGFVSQSVTSMTTTVASTTAAITTKEPQNGVTTVYSAPTTVVSSTVTNIAQAPQVPTKTVDENSWLRARIAQVQRQDNDTQGWRQPKRPPVKAQQGGPMSLNDEYEVARPNEYEEFKELFENDRRQLEEEKRNFGRHGTGSGSQYYSRSRSRSRSSSPYRLRSRDNRSRSRSYSRSRSRSRSRSRARSPVRRRSTSKERSHRGRSRSRPRSRSPSRSPLPSFGRRQDPLGRSIDSIPPGQTYGSIAAGPSSDLSMAGPASEHGHPGQHRSRSRSRSRSRSWDRRRSRSRSPHSRRTGRSRSRSRSRSPPYGSRRSPSPPYKRSRQHSPPSQQPQQPTRAYKAFAPPPSQTNLLPQARPVEREPIVTSASPPSSSSLVQNKPAFVMNDASGEEAFNRRAMLSQQRSQPAPQQHQAHPQFQQQQQRQQQPQQQQHRPAFVPAAQASPFKGAPSPVILLTNMVGPGEVDDGLQEETAAECEKFGAVVRCLIFEIKNRNVSPEEAVRIFVKFGAKESAERALKDLHGRFFGGRQVRGQFFDEARFDALQLAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.41
3 0.44
4 0.5
5 0.52
6 0.51
7 0.51
8 0.5
9 0.48
10 0.41
11 0.36
12 0.31
13 0.27
14 0.27
15 0.25
16 0.19
17 0.11
18 0.1
19 0.11
20 0.11
21 0.09
22 0.1
23 0.11
24 0.13
25 0.14
26 0.17
27 0.17
28 0.19
29 0.19
30 0.22
31 0.23
32 0.23
33 0.25
34 0.3
35 0.3
36 0.31
37 0.34
38 0.38
39 0.46
40 0.53
41 0.6
42 0.59
43 0.67
44 0.72
45 0.8
46 0.84
47 0.83
48 0.84
49 0.83
50 0.84
51 0.79
52 0.78
53 0.76
54 0.71
55 0.67
56 0.59
57 0.56
58 0.49
59 0.46
60 0.37
61 0.29
62 0.26
63 0.2
64 0.18
65 0.13
66 0.13
67 0.11
68 0.12
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.1
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.17
82 0.22
83 0.25
84 0.24
85 0.24
86 0.26
87 0.26
88 0.27
89 0.22
90 0.19
91 0.16
92 0.17
93 0.16
94 0.12
95 0.12
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.11
103 0.13
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.14
110 0.17
111 0.18
112 0.19
113 0.2
114 0.21
115 0.23
116 0.26
117 0.25
118 0.23
119 0.24
120 0.26
121 0.3
122 0.31
123 0.29
124 0.26
125 0.27
126 0.28
127 0.31
128 0.36
129 0.37
130 0.41
131 0.47
132 0.48
133 0.5
134 0.49
135 0.41
136 0.38
137 0.35
138 0.32
139 0.31
140 0.39
141 0.38
142 0.44
143 0.5
144 0.55
145 0.62
146 0.66
147 0.69
148 0.7
149 0.77
150 0.77
151 0.72
152 0.71
153 0.63
154 0.57
155 0.49
156 0.39
157 0.3
158 0.24
159 0.21
160 0.13
161 0.11
162 0.1
163 0.11
164 0.14
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.14
169 0.19
170 0.19
171 0.2
172 0.2
173 0.21
174 0.21
175 0.22
176 0.21
177 0.21
178 0.26
179 0.29
180 0.28
181 0.29
182 0.3
183 0.31
184 0.37
185 0.41
186 0.44
187 0.43
188 0.48
189 0.49
190 0.5
191 0.48
192 0.42
193 0.39
194 0.3
195 0.29
196 0.25
197 0.25
198 0.25
199 0.26
200 0.26
201 0.21
202 0.22
203 0.22
204 0.23
205 0.23
206 0.27
207 0.3
208 0.37
209 0.44
210 0.49
211 0.53
212 0.59
213 0.63
214 0.69
215 0.72
216 0.74
217 0.74
218 0.71
219 0.72
220 0.71
221 0.73
222 0.72
223 0.73
224 0.73
225 0.73
226 0.76
227 0.75
228 0.74
229 0.73
230 0.7
231 0.72
232 0.72
233 0.74
234 0.74
235 0.78
236 0.79
237 0.81
238 0.83
239 0.83
240 0.83
241 0.84
242 0.84
243 0.85
244 0.84
245 0.84
246 0.85
247 0.85
248 0.83
249 0.8
250 0.78
251 0.76
252 0.77
253 0.77
254 0.77
255 0.76
256 0.75
257 0.77
258 0.82
259 0.81
260 0.78
261 0.78
262 0.78
263 0.8
264 0.82
265 0.84
266 0.82
267 0.82
268 0.84
269 0.83
270 0.83
271 0.79
272 0.78
273 0.72
274 0.72
275 0.67
276 0.63
277 0.61
278 0.58
279 0.54
280 0.49
281 0.51
282 0.44
283 0.46
284 0.46
285 0.41
286 0.38
287 0.36
288 0.33
289 0.27
290 0.28
291 0.27
292 0.21
293 0.2
294 0.16
295 0.13
296 0.13
297 0.11
298 0.09
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.04
309 0.03
310 0.03
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.03
316 0.04
317 0.06
318 0.07
319 0.08
320 0.07
321 0.11
322 0.11
323 0.17
324 0.22
325 0.28
326 0.31
327 0.37
328 0.46
329 0.52
330 0.61
331 0.66
332 0.69
333 0.71
334 0.74
335 0.79
336 0.8
337 0.83
338 0.84
339 0.84
340 0.84
341 0.85
342 0.88
343 0.85
344 0.85
345 0.85
346 0.85
347 0.85
348 0.85
349 0.85
350 0.85
351 0.87
352 0.83
353 0.82
354 0.83
355 0.81
356 0.82
357 0.82
358 0.82
359 0.83
360 0.84
361 0.8
362 0.8
363 0.77
364 0.76
365 0.72
366 0.72
367 0.71
368 0.73
369 0.7
370 0.62
371 0.59
372 0.55
373 0.58
374 0.58
375 0.6
376 0.59
377 0.64
378 0.71
379 0.75
380 0.75
381 0.77
382 0.77
383 0.77
384 0.78
385 0.78
386 0.79
387 0.79
388 0.8
389 0.73
390 0.71
391 0.66
392 0.64
393 0.63
394 0.56
395 0.53
396 0.48
397 0.46
398 0.42
399 0.44
400 0.43
401 0.41
402 0.41
403 0.37
404 0.37
405 0.39
406 0.38
407 0.3
408 0.28
409 0.33
410 0.32
411 0.3
412 0.29
413 0.33
414 0.32
415 0.35
416 0.32
417 0.3
418 0.27
419 0.29
420 0.29
421 0.25
422 0.26
423 0.23
424 0.22
425 0.19
426 0.19
427 0.17
428 0.16
429 0.16
430 0.16
431 0.16
432 0.2
433 0.25
434 0.27
435 0.34
436 0.35
437 0.33
438 0.32
439 0.34
440 0.3
441 0.23
442 0.23
443 0.16
444 0.16
445 0.16
446 0.16
447 0.13
448 0.12
449 0.12
450 0.11
451 0.11
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.11
456 0.15
457 0.24
458 0.29
459 0.34
460 0.4
461 0.45
462 0.46
463 0.47
464 0.51
465 0.5
466 0.5
467 0.52
468 0.52
469 0.52
470 0.6
471 0.63
472 0.61
473 0.55
474 0.55
475 0.56
476 0.55
477 0.61
478 0.57
479 0.63
480 0.67
481 0.73
482 0.73
483 0.73
484 0.75
485 0.75
486 0.79
487 0.79
488 0.79
489 0.78
490 0.76
491 0.74
492 0.67
493 0.59
494 0.53
495 0.44
496 0.42
497 0.33
498 0.31
499 0.26
500 0.26
501 0.24
502 0.24
503 0.23
504 0.17
505 0.18
506 0.15
507 0.16
508 0.18
509 0.19
510 0.16
511 0.18
512 0.17
513 0.16
514 0.16
515 0.15
516 0.12
517 0.1
518 0.09
519 0.07
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.06
524 0.06
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.08
532 0.09
533 0.08
534 0.07
535 0.08
536 0.08
537 0.08
538 0.11
539 0.15
540 0.14
541 0.2
542 0.2
543 0.2
544 0.22
545 0.23
546 0.22
547 0.24
548 0.32
549 0.34
550 0.41
551 0.41
552 0.44
553 0.44
554 0.44
555 0.43
556 0.41
557 0.4
558 0.32
559 0.34
560 0.31
561 0.29
562 0.28
563 0.25
564 0.23
565 0.18
566 0.2
567 0.25
568 0.25
569 0.27
570 0.29
571 0.36
572 0.34
573 0.34
574 0.34
575 0.31
576 0.33
577 0.4
578 0.42
579 0.37
580 0.36
581 0.37
582 0.37
583 0.35
584 0.4
585 0.38
586 0.36
587 0.37
588 0.42
589 0.43
590 0.45
591 0.45
592 0.43
593 0.38
594 0.42
595 0.38
596 0.33
597 0.33
598 0.3
599 0.27