Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A197JG60

Protein Details
Accession A0A197JG60    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
455-475QEQLDKEKAEKERSRKKKKLFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
460-474KEKAEKERSRKKKKL
Subcellular Location(s) mito_nucl 11.666, nucl 11, mito 11, cyto_nucl 8.666, cyto_mito 8.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
Amino Acid Sequences MTRLTRKDNDTLRKQEWRLLFVPGSGTSLASSAAASQGSASQPHSQTGNIVPEEYASDTFLVKAFFSETEKYYVVILTNLKQTWYEKLEHYAIRERSKLIRSFAYEEDTQLEALLLSLSTVISTAHDVPVSGSKTSATPSKQILQGRHGKLYMIVGFEFGLATMYWKFKLSPMIASTSDVSRTLALKTAATFSQSPLFPTNLSQLIDDVNDGGSGSNTRTDANGANKRGRRTFLEDSEDEYDDKQPRDFAPEDDDDELDEDQRNADGVSVLFDHLVLPLIALNNAYRKQTRTLEAVIKNKESEVVEALEMLEQHGIGYHNRRRATERFDKTLVDTKLQEDVEQLMIPQLVGPKELFADKKVASLCTIISRNAGEHANPSQSLLERNMTSQEAGSSQSSRRAAGGESMSLLKDVGASVPTPTVIPGADRNAGNANGGANSKAIKEAEELERRRVLQEQLDKEKAEKERSRKKKKLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.7
3 0.65
4 0.61
5 0.53
6 0.5
7 0.44
8 0.35
9 0.37
10 0.3
11 0.28
12 0.22
13 0.2
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.1
18 0.09
19 0.07
20 0.08
21 0.08
22 0.07
23 0.08
24 0.1
25 0.11
26 0.13
27 0.16
28 0.21
29 0.22
30 0.25
31 0.25
32 0.23
33 0.24
34 0.28
35 0.32
36 0.25
37 0.25
38 0.22
39 0.22
40 0.23
41 0.22
42 0.18
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.13
48 0.12
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.11
53 0.15
54 0.17
55 0.18
56 0.22
57 0.22
58 0.22
59 0.21
60 0.2
61 0.17
62 0.17
63 0.18
64 0.17
65 0.22
66 0.22
67 0.22
68 0.23
69 0.24
70 0.27
71 0.28
72 0.28
73 0.24
74 0.3
75 0.34
76 0.34
77 0.37
78 0.4
79 0.42
80 0.43
81 0.43
82 0.41
83 0.42
84 0.47
85 0.47
86 0.42
87 0.41
88 0.41
89 0.43
90 0.42
91 0.4
92 0.34
93 0.3
94 0.3
95 0.25
96 0.21
97 0.16
98 0.14
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.04
103 0.03
104 0.04
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.07
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.16
117 0.17
118 0.15
119 0.14
120 0.13
121 0.14
122 0.16
123 0.2
124 0.17
125 0.19
126 0.22
127 0.26
128 0.31
129 0.35
130 0.36
131 0.39
132 0.46
133 0.46
134 0.45
135 0.41
136 0.36
137 0.32
138 0.32
139 0.26
140 0.18
141 0.15
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.07
147 0.06
148 0.04
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.17
157 0.17
158 0.2
159 0.2
160 0.24
161 0.23
162 0.24
163 0.24
164 0.19
165 0.18
166 0.14
167 0.13
168 0.11
169 0.11
170 0.1
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.11
175 0.13
176 0.12
177 0.14
178 0.13
179 0.12
180 0.16
181 0.15
182 0.17
183 0.17
184 0.17
185 0.15
186 0.16
187 0.18
188 0.15
189 0.16
190 0.14
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.08
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.09
208 0.12
209 0.19
210 0.25
211 0.26
212 0.33
213 0.36
214 0.39
215 0.39
216 0.39
217 0.34
218 0.36
219 0.39
220 0.36
221 0.39
222 0.36
223 0.37
224 0.37
225 0.34
226 0.26
227 0.22
228 0.21
229 0.19
230 0.19
231 0.16
232 0.15
233 0.14
234 0.19
235 0.2
236 0.17
237 0.19
238 0.2
239 0.21
240 0.2
241 0.2
242 0.15
243 0.15
244 0.14
245 0.09
246 0.09
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.09
271 0.11
272 0.13
273 0.14
274 0.16
275 0.21
276 0.24
277 0.27
278 0.27
279 0.3
280 0.36
281 0.4
282 0.45
283 0.43
284 0.41
285 0.38
286 0.34
287 0.33
288 0.25
289 0.2
290 0.15
291 0.13
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.06
299 0.04
300 0.04
301 0.06
302 0.07
303 0.08
304 0.17
305 0.21
306 0.27
307 0.29
308 0.31
309 0.36
310 0.4
311 0.47
312 0.49
313 0.51
314 0.5
315 0.5
316 0.5
317 0.48
318 0.51
319 0.43
320 0.36
321 0.31
322 0.27
323 0.3
324 0.29
325 0.26
326 0.18
327 0.18
328 0.16
329 0.15
330 0.14
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.09
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.11
341 0.14
342 0.14
343 0.13
344 0.18
345 0.17
346 0.21
347 0.22
348 0.21
349 0.19
350 0.19
351 0.19
352 0.2
353 0.21
354 0.18
355 0.19
356 0.19
357 0.18
358 0.2
359 0.2
360 0.15
361 0.16
362 0.19
363 0.2
364 0.19
365 0.2
366 0.19
367 0.19
368 0.21
369 0.21
370 0.22
371 0.19
372 0.21
373 0.22
374 0.21
375 0.2
376 0.18
377 0.16
378 0.13
379 0.15
380 0.16
381 0.16
382 0.16
383 0.23
384 0.23
385 0.23
386 0.23
387 0.22
388 0.21
389 0.23
390 0.24
391 0.18
392 0.18
393 0.19
394 0.18
395 0.17
396 0.16
397 0.1
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.08
410 0.11
411 0.13
412 0.17
413 0.21
414 0.21
415 0.23
416 0.26
417 0.26
418 0.24
419 0.21
420 0.18
421 0.15
422 0.16
423 0.15
424 0.12
425 0.13
426 0.12
427 0.15
428 0.15
429 0.14
430 0.15
431 0.2
432 0.28
433 0.37
434 0.39
435 0.41
436 0.46
437 0.46
438 0.46
439 0.45
440 0.41
441 0.4
442 0.47
443 0.5
444 0.55
445 0.58
446 0.57
447 0.54
448 0.57
449 0.55
450 0.56
451 0.55
452 0.57
453 0.63
454 0.73
455 0.83