Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A197JED8

Protein Details
Accession A0A197JED8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-88NTTPPPRRTRGASKRKPKRTPRQLLALITHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-80PRRTRGASKRKPKRTP
202-220GVRGKGGRRGKSRTGEFRG
Subcellular Location(s) cyto 9.5cyto_nucl 9.5, nucl 8.5, extr 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008160  Collagen  
Pfam View protein in Pfam  
PF01391  Collagen  
Amino Acid Sequences MPDEYKRNGAALTRNEICILVHVYQYIIGVGPAHEHEHEHEHEHDANDPNNSASDSENNNTTPPPRRTRGASKRKPKRTPRQLLALITGVGASTAQKAISLYKSGQAPRETTEKLGRPKLSVPETTSNAIRQIIATAVEQGAPVGTPEIKRRLKDEYELEIAKSTLVRYIKHLGHVSGEGGKVWYPGSERYQPDHGTDKAGGVRGKGGRRGKSRTGEFRGKAPAVATTRATGAQADEAEQDYQEQDAAAIAEEHNAYYEGQEDYEGYEGEEGYDGYEGQEGYEGYEGYEGYEGYEGYEGYEGDEGYEGYEGQEGYEGYEGYEGYEGENGYEGYEGEEGYEGYEGEEGYEGEEGENGAPEAHDGELQQPNQQYIHIGRMRSIGEHARSQHNQTTHPPAEDIPEVFYEDEVQDALMDELEGELQRELEDERYSRDPEFMDDDTPLSEPEQPPASALEPVTHIAPRSQADFDRQQQEDDDDLPDFRDNNAAFNVPRRSTRSATAAATLVTPTHSSVTVPQKRRSLRTHIGLAAPSPPPSSVEGGAGSRFAAALVSDEHHPDHLQVQDAILILQENARQRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.36
4 0.31
5 0.27
6 0.25
7 0.19
8 0.17
9 0.16
10 0.16
11 0.16
12 0.16
13 0.13
14 0.09
15 0.08
16 0.08
17 0.07
18 0.09
19 0.1
20 0.13
21 0.13
22 0.14
23 0.17
24 0.23
25 0.24
26 0.26
27 0.27
28 0.29
29 0.32
30 0.31
31 0.34
32 0.32
33 0.33
34 0.31
35 0.3
36 0.26
37 0.23
38 0.23
39 0.19
40 0.16
41 0.19
42 0.21
43 0.23
44 0.26
45 0.25
46 0.26
47 0.27
48 0.3
49 0.35
50 0.38
51 0.44
52 0.46
53 0.5
54 0.57
55 0.66
56 0.72
57 0.74
58 0.76
59 0.79
60 0.85
61 0.91
62 0.94
63 0.93
64 0.94
65 0.94
66 0.94
67 0.9
68 0.89
69 0.85
70 0.77
71 0.7
72 0.6
73 0.48
74 0.37
75 0.29
76 0.19
77 0.12
78 0.09
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.11
86 0.14
87 0.16
88 0.16
89 0.2
90 0.25
91 0.28
92 0.33
93 0.33
94 0.32
95 0.32
96 0.38
97 0.35
98 0.34
99 0.39
100 0.4
101 0.45
102 0.5
103 0.49
104 0.45
105 0.49
106 0.52
107 0.49
108 0.46
109 0.45
110 0.44
111 0.45
112 0.45
113 0.42
114 0.35
115 0.32
116 0.29
117 0.23
118 0.16
119 0.14
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.09
134 0.14
135 0.24
136 0.28
137 0.3
138 0.32
139 0.38
140 0.4
141 0.44
142 0.45
143 0.41
144 0.42
145 0.42
146 0.39
147 0.33
148 0.29
149 0.23
150 0.19
151 0.13
152 0.12
153 0.14
154 0.14
155 0.17
156 0.24
157 0.25
158 0.3
159 0.31
160 0.27
161 0.27
162 0.27
163 0.24
164 0.19
165 0.18
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.12
174 0.17
175 0.23
176 0.26
177 0.29
178 0.34
179 0.34
180 0.35
181 0.37
182 0.33
183 0.29
184 0.27
185 0.25
186 0.21
187 0.24
188 0.21
189 0.17
190 0.21
191 0.22
192 0.25
193 0.31
194 0.35
195 0.39
196 0.45
197 0.51
198 0.54
199 0.57
200 0.61
201 0.63
202 0.64
203 0.65
204 0.59
205 0.57
206 0.55
207 0.47
208 0.41
209 0.32
210 0.3
211 0.24
212 0.25
213 0.21
214 0.16
215 0.17
216 0.17
217 0.16
218 0.11
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.06
276 0.05
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.05
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.05
349 0.05
350 0.09
351 0.14
352 0.14
353 0.17
354 0.17
355 0.18
356 0.18
357 0.18
358 0.16
359 0.13
360 0.21
361 0.21
362 0.2
363 0.2
364 0.23
365 0.24
366 0.22
367 0.24
368 0.2
369 0.2
370 0.24
371 0.26
372 0.3
373 0.31
374 0.35
375 0.37
376 0.34
377 0.34
378 0.35
379 0.41
380 0.36
381 0.35
382 0.32
383 0.27
384 0.29
385 0.27
386 0.23
387 0.15
388 0.14
389 0.14
390 0.13
391 0.13
392 0.11
393 0.09
394 0.09
395 0.07
396 0.06
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.06
411 0.07
412 0.08
413 0.11
414 0.11
415 0.15
416 0.18
417 0.21
418 0.21
419 0.22
420 0.2
421 0.21
422 0.25
423 0.22
424 0.19
425 0.18
426 0.18
427 0.17
428 0.17
429 0.15
430 0.11
431 0.15
432 0.14
433 0.16
434 0.19
435 0.18
436 0.18
437 0.2
438 0.2
439 0.17
440 0.16
441 0.15
442 0.13
443 0.14
444 0.15
445 0.14
446 0.13
447 0.12
448 0.16
449 0.16
450 0.17
451 0.19
452 0.19
453 0.25
454 0.31
455 0.37
456 0.41
457 0.4
458 0.38
459 0.37
460 0.38
461 0.34
462 0.28
463 0.24
464 0.17
465 0.16
466 0.17
467 0.17
468 0.15
469 0.13
470 0.18
471 0.17
472 0.18
473 0.2
474 0.21
475 0.2
476 0.27
477 0.33
478 0.29
479 0.34
480 0.37
481 0.41
482 0.42
483 0.46
484 0.45
485 0.43
486 0.42
487 0.4
488 0.35
489 0.29
490 0.26
491 0.22
492 0.16
493 0.13
494 0.12
495 0.1
496 0.11
497 0.11
498 0.11
499 0.18
500 0.29
501 0.37
502 0.43
503 0.49
504 0.56
505 0.63
506 0.7
507 0.69
508 0.68
509 0.68
510 0.68
511 0.68
512 0.64
513 0.6
514 0.54
515 0.48
516 0.43
517 0.35
518 0.29
519 0.23
520 0.2
521 0.18
522 0.2
523 0.22
524 0.19
525 0.19
526 0.2
527 0.2
528 0.2
529 0.19
530 0.16
531 0.13
532 0.11
533 0.09
534 0.07
535 0.06
536 0.07
537 0.08
538 0.11
539 0.12
540 0.14
541 0.15
542 0.17
543 0.17
544 0.17
545 0.19
546 0.2
547 0.21
548 0.2
549 0.19
550 0.2
551 0.19
552 0.18
553 0.14
554 0.12
555 0.09
556 0.11
557 0.14