Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A197JUM3

Protein Details
Accession A0A197JUM3    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-153GPSSRRSRSRSPVQRRRSRSPPRKKRSVSPPVAKKRNYHydrophilic
215-244SSASKRRVSRSPSPRPTKKRSRGPFDDEEDHydrophilic
300-319ELERQQAERSRKRKLERERRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-71DARKEERERKIREIEEERQRK
107-236GSRSRSRSPGPSSRRSRSRSPVQRRRSRSPPRKKRSVSPPVAKKRNYSPEYRKRSPSPRRRRSVSPVKRKSMADKDRGRDRDREYERDRDRDRDRAGSSKSKYGDGSSSSASKRRVSRSPSPRPTKKRSR
308-319RSRKRKLERERR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MFPNMRIPTSSVNHVRDAGLKAIRDGPVPLNATKRDRRTIEEISAELREKDARKEERERKIREIEEERQRKNQQREKAIQGAKLSRALMGDDAQETDRLRKEVTSGGSRSRSRSPGPSSRRSRSRSPVQRRRSRSPPRKKRSVSPPVAKKRNYSPEYRKRSPSPRRRRSVSPVKRKSMADKDRGRDRDREYERDRDRDRDRAGSSKSKYGDGSSSSASKRRVSRSPSPRPTKKRSRGPFDDEEDFSVSSVIGSLFGTRYRSRAANEDLSDDDMEARPDEVFREEARSARIAKKEDEMEAELERQQAERSRKRKLERERR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.42
3 0.39
4 0.38
5 0.36
6 0.31
7 0.29
8 0.28
9 0.32
10 0.31
11 0.28
12 0.27
13 0.24
14 0.26
15 0.29
16 0.29
17 0.31
18 0.36
19 0.43
20 0.48
21 0.52
22 0.54
23 0.54
24 0.58
25 0.59
26 0.6
27 0.58
28 0.53
29 0.47
30 0.41
31 0.41
32 0.36
33 0.29
34 0.24
35 0.24
36 0.22
37 0.27
38 0.34
39 0.38
40 0.44
41 0.54
42 0.62
43 0.68
44 0.76
45 0.76
46 0.74
47 0.75
48 0.71
49 0.69
50 0.67
51 0.65
52 0.67
53 0.7
54 0.66
55 0.66
56 0.72
57 0.72
58 0.75
59 0.74
60 0.72
61 0.73
62 0.76
63 0.74
64 0.75
65 0.69
66 0.62
67 0.59
68 0.54
69 0.46
70 0.43
71 0.36
72 0.27
73 0.24
74 0.21
75 0.17
76 0.14
77 0.13
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.14
84 0.16
85 0.16
86 0.16
87 0.15
88 0.16
89 0.19
90 0.23
91 0.25
92 0.25
93 0.29
94 0.35
95 0.37
96 0.39
97 0.39
98 0.39
99 0.36
100 0.41
101 0.43
102 0.46
103 0.52
104 0.59
105 0.62
106 0.66
107 0.72
108 0.69
109 0.69
110 0.68
111 0.71
112 0.72
113 0.75
114 0.78
115 0.79
116 0.84
117 0.84
118 0.84
119 0.84
120 0.84
121 0.84
122 0.85
123 0.86
124 0.85
125 0.88
126 0.84
127 0.82
128 0.81
129 0.81
130 0.79
131 0.77
132 0.78
133 0.78
134 0.82
135 0.75
136 0.67
137 0.65
138 0.66
139 0.59
140 0.57
141 0.58
142 0.6
143 0.68
144 0.69
145 0.66
146 0.62
147 0.7
148 0.73
149 0.73
150 0.74
151 0.75
152 0.78
153 0.78
154 0.78
155 0.77
156 0.78
157 0.77
158 0.77
159 0.75
160 0.72
161 0.72
162 0.66
163 0.64
164 0.63
165 0.6
166 0.58
167 0.57
168 0.58
169 0.63
170 0.67
171 0.63
172 0.58
173 0.56
174 0.57
175 0.55
176 0.58
177 0.53
178 0.58
179 0.59
180 0.61
181 0.59
182 0.56
183 0.55
184 0.54
185 0.53
186 0.49
187 0.47
188 0.45
189 0.47
190 0.48
191 0.46
192 0.44
193 0.43
194 0.38
195 0.37
196 0.32
197 0.29
198 0.24
199 0.24
200 0.2
201 0.22
202 0.22
203 0.26
204 0.27
205 0.3
206 0.33
207 0.36
208 0.42
209 0.45
210 0.54
211 0.6
212 0.69
213 0.74
214 0.79
215 0.83
216 0.85
217 0.87
218 0.88
219 0.87
220 0.87
221 0.86
222 0.86
223 0.84
224 0.83
225 0.8
226 0.75
227 0.7
228 0.6
229 0.53
230 0.45
231 0.37
232 0.29
233 0.21
234 0.15
235 0.1
236 0.09
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.07
242 0.09
243 0.13
244 0.14
245 0.16
246 0.19
247 0.22
248 0.23
249 0.29
250 0.34
251 0.37
252 0.38
253 0.38
254 0.36
255 0.35
256 0.33
257 0.27
258 0.22
259 0.15
260 0.15
261 0.13
262 0.12
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.14
268 0.14
269 0.19
270 0.2
271 0.22
272 0.25
273 0.27
274 0.29
275 0.33
276 0.39
277 0.37
278 0.38
279 0.43
280 0.43
281 0.41
282 0.42
283 0.37
284 0.33
285 0.31
286 0.31
287 0.26
288 0.24
289 0.22
290 0.18
291 0.19
292 0.25
293 0.33
294 0.41
295 0.47
296 0.56
297 0.64
298 0.73
299 0.79