Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A197JDD2

Protein Details
Accession A0A197JDD2    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
285-307MDDAKEINRRKRKRAQMIAQGMMHydrophilic
357-383FYNTTQSKLMLRKKRVKRYEDDDPPITHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
293-298RRKRKR
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences MSQQPLKKKYGNEFLCKTRYRNTLPLPPFAPKLLALPSSSERYIKYQETGLNEATAHELILDNQYAMPIDLIEMRENFFGEGRPAHHGDNSNTILNPTDELLLTVPVRTNVAGPGALNALNNGAIAAEVHRMPVPKTKLPNVSWLRRTEYISSETPTGAGKGAYKDTPIRKDKMVVDNSREGQIAAIEKTEDEFLASLKHPTKPGVTAVESLPIFPDFNIWGNSYTLVTFDVDPEINNERSVQSQANDQGTSKAQTAQRSSNALIKPMSDANDPETWLAYYLPDMDDAKEINRRKRKRAQMIAQGMMVTADEEDHDKVIPYTLQRDYTYSTNPCPALSQLVFTFRDDADNNRQKSAFYNTTQSKLMLRKKRVKRYEDDDPPITHIDAKSRMMTSDEMAEKNEALKAISS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.73
3 0.71
4 0.65
5 0.63
6 0.64
7 0.62
8 0.65
9 0.65
10 0.66
11 0.65
12 0.68
13 0.63
14 0.58
15 0.54
16 0.45
17 0.4
18 0.3
19 0.29
20 0.27
21 0.25
22 0.22
23 0.24
24 0.27
25 0.3
26 0.31
27 0.29
28 0.27
29 0.3
30 0.35
31 0.33
32 0.32
33 0.31
34 0.34
35 0.37
36 0.39
37 0.35
38 0.3
39 0.28
40 0.26
41 0.23
42 0.19
43 0.14
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.12
48 0.11
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.06
56 0.06
57 0.08
58 0.1
59 0.12
60 0.12
61 0.14
62 0.14
63 0.15
64 0.14
65 0.12
66 0.12
67 0.12
68 0.14
69 0.14
70 0.19
71 0.21
72 0.21
73 0.25
74 0.28
75 0.28
76 0.33
77 0.34
78 0.3
79 0.28
80 0.27
81 0.25
82 0.21
83 0.19
84 0.13
85 0.11
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.11
120 0.18
121 0.23
122 0.27
123 0.31
124 0.37
125 0.43
126 0.44
127 0.53
128 0.52
129 0.55
130 0.55
131 0.53
132 0.52
133 0.48
134 0.49
135 0.41
136 0.37
137 0.34
138 0.31
139 0.29
140 0.25
141 0.22
142 0.19
143 0.17
144 0.14
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.19
153 0.23
154 0.32
155 0.35
156 0.36
157 0.34
158 0.39
159 0.43
160 0.46
161 0.48
162 0.43
163 0.43
164 0.45
165 0.45
166 0.41
167 0.36
168 0.27
169 0.19
170 0.17
171 0.14
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.07
183 0.07
184 0.1
185 0.12
186 0.14
187 0.14
188 0.15
189 0.16
190 0.16
191 0.18
192 0.17
193 0.17
194 0.16
195 0.16
196 0.18
197 0.17
198 0.16
199 0.14
200 0.11
201 0.1
202 0.08
203 0.09
204 0.06
205 0.08
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.1
212 0.1
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.1
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.13
228 0.16
229 0.14
230 0.11
231 0.15
232 0.19
233 0.2
234 0.2
235 0.19
236 0.19
237 0.19
238 0.2
239 0.17
240 0.18
241 0.19
242 0.23
243 0.26
244 0.28
245 0.3
246 0.31
247 0.32
248 0.33
249 0.31
250 0.29
251 0.26
252 0.22
253 0.21
254 0.2
255 0.21
256 0.15
257 0.15
258 0.17
259 0.18
260 0.18
261 0.16
262 0.15
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.11
275 0.13
276 0.19
277 0.24
278 0.32
279 0.42
280 0.47
281 0.56
282 0.65
283 0.74
284 0.77
285 0.83
286 0.82
287 0.83
288 0.84
289 0.77
290 0.67
291 0.56
292 0.45
293 0.34
294 0.25
295 0.14
296 0.07
297 0.04
298 0.04
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.1
306 0.11
307 0.12
308 0.16
309 0.19
310 0.23
311 0.23
312 0.25
313 0.27
314 0.28
315 0.33
316 0.31
317 0.31
318 0.33
319 0.32
320 0.3
321 0.29
322 0.26
323 0.27
324 0.24
325 0.24
326 0.2
327 0.25
328 0.26
329 0.25
330 0.27
331 0.2
332 0.24
333 0.22
334 0.27
335 0.32
336 0.4
337 0.41
338 0.42
339 0.42
340 0.38
341 0.41
342 0.44
343 0.4
344 0.34
345 0.42
346 0.42
347 0.45
348 0.46
349 0.44
350 0.41
351 0.43
352 0.5
353 0.5
354 0.57
355 0.64
356 0.73
357 0.83
358 0.86
359 0.85
360 0.84
361 0.83
362 0.83
363 0.83
364 0.8
365 0.74
366 0.66
367 0.62
368 0.56
369 0.48
370 0.41
371 0.32
372 0.31
373 0.31
374 0.32
375 0.33
376 0.31
377 0.31
378 0.3
379 0.3
380 0.25
381 0.29
382 0.3
383 0.27
384 0.28
385 0.28
386 0.26
387 0.26
388 0.26
389 0.18