Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A197K209

Protein Details
Accession A0A197K209    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-284YDPEAFTKKERAKPYKVKKLNNAGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-284FTKKERAKPYKVKKLNNAGK
Subcellular Location(s) mito 11, cyto_nucl 8.5, cyto 8, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034215  RBM42_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12383  RRM_RBM42  
Amino Acid Sequences MDPSYAAPAPAVPAYPQYPQPQPYQPYGVAGPSIGGVGRGGYAAGGRHGGGGGAGPGPGPGGYYGHNGARGPVVGAGPGINNGYTQPYGIPGAVEEPPVSEYEDLNKLFVDPKKAQEEAEAAAAALAEEEDKAAKAKAAATVIRKAAGKTWEDSTLLEFEENDFRLFAGDLGNEVTDEILTKTFSKYPSFLKAKVVRDKRTDKSRGYGFISFAEPDDFARAWKEMNGKYVGNRPIKLRKSQWKDRNVEIVREPKAPRGPYDPEAFTKKERAKPYKVKKLNNAGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.25
4 0.28
5 0.33
6 0.36
7 0.41
8 0.45
9 0.47
10 0.48
11 0.49
12 0.44
13 0.41
14 0.39
15 0.34
16 0.26
17 0.22
18 0.17
19 0.11
20 0.11
21 0.08
22 0.07
23 0.05
24 0.05
25 0.05
26 0.05
27 0.05
28 0.04
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.08
33 0.07
34 0.08
35 0.08
36 0.07
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.06
49 0.08
50 0.11
51 0.13
52 0.14
53 0.16
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.14
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.07
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.08
88 0.08
89 0.11
90 0.16
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.13
95 0.18
96 0.19
97 0.23
98 0.2
99 0.24
100 0.28
101 0.29
102 0.28
103 0.25
104 0.25
105 0.19
106 0.18
107 0.13
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.06
112 0.04
113 0.03
114 0.02
115 0.02
116 0.02
117 0.03
118 0.03
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.06
124 0.08
125 0.1
126 0.12
127 0.14
128 0.17
129 0.17
130 0.18
131 0.18
132 0.16
133 0.18
134 0.18
135 0.17
136 0.16
137 0.18
138 0.17
139 0.18
140 0.18
141 0.16
142 0.13
143 0.12
144 0.1
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.11
171 0.14
172 0.15
173 0.17
174 0.2
175 0.29
176 0.33
177 0.33
178 0.39
179 0.44
180 0.5
181 0.57
182 0.62
183 0.58
184 0.63
185 0.69
186 0.68
187 0.7
188 0.69
189 0.63
190 0.62
191 0.6
192 0.56
193 0.54
194 0.48
195 0.39
196 0.35
197 0.33
198 0.26
199 0.23
200 0.19
201 0.14
202 0.12
203 0.14
204 0.12
205 0.11
206 0.13
207 0.13
208 0.12
209 0.15
210 0.22
211 0.2
212 0.25
213 0.28
214 0.27
215 0.3
216 0.37
217 0.42
218 0.41
219 0.41
220 0.43
221 0.5
222 0.54
223 0.59
224 0.61
225 0.64
226 0.68
227 0.76
228 0.79
229 0.79
230 0.79
231 0.77
232 0.78
233 0.7
234 0.66
235 0.62
236 0.61
237 0.54
238 0.55
239 0.51
240 0.48
241 0.52
242 0.49
243 0.47
244 0.45
245 0.49
246 0.47
247 0.52
248 0.48
249 0.46
250 0.49
251 0.48
252 0.45
253 0.48
254 0.52
255 0.54
256 0.61
257 0.64
258 0.69
259 0.76
260 0.84
261 0.85
262 0.87
263 0.88
264 0.88