Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J9DQW4

Protein Details
Accession J9DQW4    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-31NSYNISSDKKSGRPRGRPRTSNPDDKQSHydrophilic
294-321GALGLFSQKKQKRTRRKFKAVDGRDINVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-19RPRG
302-311KKQKRTRRKF
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSLNSYNISSDKKSGRPRGRPRTSNPDDKQSDDAEPISFSGNFTDTKVNKKSENRFYGGSKPTFARGMTEKTLKIEFFMLEGLEGFENKTTRSKMTEVALRGSEGLKEWFYESGINRELPETWADFKKKVIDYCLERDITQIKKFNDETWENFFIRCNDFVKMQKIDTKVVFRYLRTMKMPIHLKIIVLACVEDFDVLIDRVKETNSIQRSLVESRYGKKHTEDAYQERRKNKECFRCGKPGHYFRDCQNEKILRIGKRFDADEGLDRREILIDNAKHKAIFDTGAVSSFICSGALGLFSQKKQKRTRRKFKAVDGRDINVSRMLEATISYNGIKNCG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.66
3 0.72
4 0.8
5 0.85
6 0.89
7 0.9
8 0.88
9 0.89
10 0.86
11 0.86
12 0.8
13 0.79
14 0.72
15 0.67
16 0.63
17 0.55
18 0.49
19 0.4
20 0.36
21 0.27
22 0.23
23 0.2
24 0.19
25 0.16
26 0.14
27 0.13
28 0.14
29 0.13
30 0.15
31 0.23
32 0.22
33 0.31
34 0.36
35 0.38
36 0.44
37 0.53
38 0.6
39 0.62
40 0.67
41 0.63
42 0.6
43 0.6
44 0.62
45 0.6
46 0.52
47 0.45
48 0.39
49 0.38
50 0.37
51 0.33
52 0.29
53 0.25
54 0.29
55 0.31
56 0.34
57 0.32
58 0.33
59 0.36
60 0.31
61 0.28
62 0.24
63 0.18
64 0.15
65 0.14
66 0.11
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.1
76 0.14
77 0.15
78 0.17
79 0.2
80 0.22
81 0.23
82 0.27
83 0.32
84 0.29
85 0.3
86 0.29
87 0.25
88 0.24
89 0.21
90 0.17
91 0.13
92 0.13
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.1
97 0.1
98 0.13
99 0.13
100 0.16
101 0.18
102 0.18
103 0.17
104 0.17
105 0.17
106 0.15
107 0.16
108 0.13
109 0.14
110 0.19
111 0.21
112 0.21
113 0.22
114 0.27
115 0.28
116 0.28
117 0.28
118 0.28
119 0.31
120 0.35
121 0.37
122 0.32
123 0.29
124 0.29
125 0.3
126 0.28
127 0.28
128 0.3
129 0.26
130 0.3
131 0.31
132 0.32
133 0.33
134 0.32
135 0.31
136 0.32
137 0.35
138 0.3
139 0.29
140 0.29
141 0.24
142 0.23
143 0.22
144 0.17
145 0.14
146 0.17
147 0.2
148 0.23
149 0.22
150 0.22
151 0.24
152 0.25
153 0.26
154 0.26
155 0.26
156 0.22
157 0.27
158 0.27
159 0.23
160 0.28
161 0.27
162 0.29
163 0.27
164 0.3
165 0.24
166 0.3
167 0.34
168 0.28
169 0.3
170 0.26
171 0.24
172 0.25
173 0.24
174 0.18
175 0.14
176 0.13
177 0.09
178 0.08
179 0.09
180 0.05
181 0.04
182 0.03
183 0.04
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.09
191 0.09
192 0.17
193 0.18
194 0.2
195 0.2
196 0.21
197 0.24
198 0.25
199 0.25
200 0.23
201 0.22
202 0.25
203 0.32
204 0.33
205 0.31
206 0.31
207 0.36
208 0.33
209 0.38
210 0.4
211 0.42
212 0.51
213 0.58
214 0.61
215 0.61
216 0.64
217 0.64
218 0.66
219 0.67
220 0.67
221 0.67
222 0.7
223 0.7
224 0.74
225 0.7
226 0.71
227 0.71
228 0.69
229 0.68
230 0.65
231 0.61
232 0.55
233 0.63
234 0.56
235 0.48
236 0.49
237 0.45
238 0.41
239 0.47
240 0.49
241 0.44
242 0.46
243 0.47
244 0.42
245 0.4
246 0.41
247 0.34
248 0.31
249 0.27
250 0.3
251 0.31
252 0.3
253 0.27
254 0.26
255 0.24
256 0.22
257 0.21
258 0.16
259 0.22
260 0.22
261 0.26
262 0.3
263 0.3
264 0.29
265 0.29
266 0.28
267 0.21
268 0.18
269 0.15
270 0.15
271 0.15
272 0.16
273 0.16
274 0.14
275 0.12
276 0.11
277 0.11
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.06
284 0.11
285 0.15
286 0.18
287 0.28
288 0.33
289 0.42
290 0.51
291 0.62
292 0.69
293 0.76
294 0.85
295 0.87
296 0.93
297 0.93
298 0.93
299 0.94
300 0.89
301 0.88
302 0.83
303 0.74
304 0.71
305 0.63
306 0.53
307 0.47
308 0.4
309 0.3
310 0.25
311 0.22
312 0.15
313 0.14
314 0.15
315 0.12
316 0.14
317 0.14
318 0.18