Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J7SBP8

Protein Details
Accession J7SBP8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-103NGPKNIKISKKKKTDVHGKPTKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-93KNIKISKKKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.833, cyto 5.5, cyto_pero 3.832
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0031297  P:replication fork processing  
KEGG ndi:NDAI_0G04770  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MDFDNDMDMNVNTDDSNNNVTNGDSGPQWDPTDPTSIALDTNLATTSADPTAILTTSRRTQVKLTTERLLTEKGLPYLLKNGPKNIKISKKKKTDVHGKPTKATTTYDNLTNITRFYQIWAHQLYPKAKFKDFLKLAYTLGKTDKNLRNYRIELFQAEMDKDRDDDHDTTTTTTTTTLPKEANTIPNNNTAQDGHSDAVASAFRGQSLFVTDENISENDASADAVNHVSPHVDTANNTNQNESQENFKNAAEDGDDDDDDDDDDLYSISANQSRDRTKHRIQDDEDEGEEDEKEEELQSGKTADNHHDEEMELLKELDELNKNQVSQNNNDDEFEEDQDALEVMQEFGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.19
4 0.17
5 0.18
6 0.18
7 0.18
8 0.19
9 0.19
10 0.17
11 0.12
12 0.14
13 0.15
14 0.18
15 0.19
16 0.19
17 0.2
18 0.2
19 0.25
20 0.22
21 0.22
22 0.2
23 0.19
24 0.18
25 0.17
26 0.16
27 0.1
28 0.11
29 0.1
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.08
37 0.09
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.1
42 0.14
43 0.19
44 0.26
45 0.26
46 0.27
47 0.31
48 0.37
49 0.46
50 0.49
51 0.49
52 0.49
53 0.48
54 0.48
55 0.46
56 0.41
57 0.33
58 0.3
59 0.28
60 0.23
61 0.24
62 0.22
63 0.21
64 0.25
65 0.29
66 0.32
67 0.31
68 0.38
69 0.43
70 0.46
71 0.5
72 0.51
73 0.57
74 0.6
75 0.68
76 0.7
77 0.73
78 0.78
79 0.79
80 0.8
81 0.8
82 0.8
83 0.81
84 0.8
85 0.74
86 0.7
87 0.66
88 0.6
89 0.51
90 0.43
91 0.36
92 0.32
93 0.31
94 0.3
95 0.28
96 0.26
97 0.25
98 0.24
99 0.2
100 0.16
101 0.16
102 0.12
103 0.14
104 0.17
105 0.17
106 0.21
107 0.23
108 0.23
109 0.25
110 0.31
111 0.32
112 0.35
113 0.4
114 0.39
115 0.38
116 0.41
117 0.39
118 0.44
119 0.42
120 0.38
121 0.34
122 0.31
123 0.31
124 0.32
125 0.31
126 0.22
127 0.23
128 0.21
129 0.2
130 0.28
131 0.33
132 0.36
133 0.41
134 0.43
135 0.46
136 0.46
137 0.47
138 0.41
139 0.36
140 0.28
141 0.24
142 0.22
143 0.18
144 0.16
145 0.16
146 0.13
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.14
152 0.15
153 0.15
154 0.16
155 0.16
156 0.17
157 0.16
158 0.15
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.15
168 0.16
169 0.22
170 0.22
171 0.25
172 0.24
173 0.3
174 0.31
175 0.28
176 0.27
177 0.2
178 0.18
179 0.16
180 0.16
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.08
195 0.09
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.14
222 0.23
223 0.28
224 0.28
225 0.28
226 0.28
227 0.31
228 0.32
229 0.28
230 0.26
231 0.25
232 0.27
233 0.27
234 0.26
235 0.24
236 0.22
237 0.22
238 0.16
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.07
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.1
257 0.11
258 0.15
259 0.2
260 0.26
261 0.31
262 0.39
263 0.46
264 0.5
265 0.57
266 0.6
267 0.63
268 0.62
269 0.66
270 0.64
271 0.59
272 0.51
273 0.44
274 0.38
275 0.3
276 0.26
277 0.18
278 0.13
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.11
287 0.12
288 0.15
289 0.18
290 0.22
291 0.27
292 0.29
293 0.29
294 0.28
295 0.27
296 0.26
297 0.25
298 0.21
299 0.15
300 0.12
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.15
305 0.17
306 0.18
307 0.24
308 0.27
309 0.28
310 0.31
311 0.35
312 0.34
313 0.36
314 0.42
315 0.42
316 0.41
317 0.41
318 0.38
319 0.37
320 0.35
321 0.32
322 0.25
323 0.18
324 0.17
325 0.17
326 0.16
327 0.12
328 0.11
329 0.09