Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A197JIA4

Protein Details
Accession A0A197JIA4    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-74EDLTDQPKKKTKTPKPKAQHVPKKNKNVAAAHydrophilic
98-117DENSNKKKSGKKSVEEKYEAHydrophilic
122-143ATTKPVKESKKARNAPKETKDLHydrophilic
458-483AAKRLAFKDRKTKEKHILIKKKAGGVBasic
496-518DLGIKKGKAKVKANVPKKKVVKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-69KKKTKTPKPKAQHVPKKNK
103-110KKKSGKKS
125-135KPVKESKKARN
178-180KRK
189-195AASKKAK
435-518AGGKKGKDGKPARAQHAPIKMDGAAKRLAFKDRKTKEKHILIKKKAGGVVEGERAQKGAKVDLGIKKGKAKVKANVPKKKVVKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13.833, cyto 11.5, mito_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034221  RBM34_RRM2  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12395  RRM2_RBM34  
Amino Acid Sequences MSLTSALLKGKTVESSLDSLFKNSAGPTKAQAPIAAKVRQPYPEDLTDQPKKKTKTPKPKAQHVPKKNKNVAAAQEESDNNDNDIDFEDEEDEEDEEDENSNKKKSGKKSVEEKYEAKVAAATTKPVKESKKARNAPKETKDLIEQQTKHDYGEDIDMEESKIEDLVHESLRKPANNKRKADTETKEAAASKKAKKASSTTDGGDSDDEDASPDTNKDGTKKSDDPERQARTAFVGNLAVTSMTKGDFKKLKAAFAAFGPVESIRFRSIAFSELLPRKIAFITGKLHPERDVVNAYIVFKSKASVTKAVAAMNGQLFLNKHIRVDTVDGAKKHQPKKSVFVGNLAFDAQEEDLWNFFKDSGDIENVRIIRDRKTNLGKGFAYVTFQDRASVDVALRLHDTKMGTRKMRVVRCKRLEEEAKTDGTQARTKTAVAGAGGKKGKDGKPARAQHAPIKMDGAAKRLAFKDRKTKEKHILIKKKAGGVVEGERAQKGAKVDLGIKKGKAKVKANVPKKKVVKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.23
3 0.23
4 0.26
5 0.25
6 0.25
7 0.24
8 0.22
9 0.21
10 0.19
11 0.24
12 0.21
13 0.23
14 0.24
15 0.3
16 0.34
17 0.33
18 0.35
19 0.32
20 0.37
21 0.41
22 0.42
23 0.38
24 0.39
25 0.42
26 0.44
27 0.44
28 0.43
29 0.42
30 0.42
31 0.44
32 0.44
33 0.5
34 0.53
35 0.55
36 0.57
37 0.59
38 0.6
39 0.64
40 0.7
41 0.72
42 0.74
43 0.79
44 0.83
45 0.84
46 0.9
47 0.93
48 0.93
49 0.93
50 0.93
51 0.93
52 0.92
53 0.93
54 0.9
55 0.85
56 0.79
57 0.75
58 0.71
59 0.66
60 0.59
61 0.49
62 0.46
63 0.4
64 0.39
65 0.35
66 0.28
67 0.22
68 0.19
69 0.18
70 0.14
71 0.16
72 0.14
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.1
80 0.08
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.1
86 0.13
87 0.15
88 0.16
89 0.19
90 0.25
91 0.32
92 0.4
93 0.5
94 0.56
95 0.62
96 0.71
97 0.77
98 0.8
99 0.78
100 0.71
101 0.64
102 0.6
103 0.51
104 0.41
105 0.33
106 0.24
107 0.24
108 0.22
109 0.22
110 0.21
111 0.23
112 0.25
113 0.29
114 0.33
115 0.36
116 0.45
117 0.52
118 0.58
119 0.65
120 0.72
121 0.78
122 0.83
123 0.85
124 0.82
125 0.79
126 0.71
127 0.64
128 0.58
129 0.55
130 0.52
131 0.5
132 0.44
133 0.4
134 0.46
135 0.44
136 0.4
137 0.34
138 0.28
139 0.21
140 0.23
141 0.19
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.1
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.07
153 0.09
154 0.12
155 0.13
156 0.14
157 0.19
158 0.23
159 0.25
160 0.27
161 0.34
162 0.43
163 0.5
164 0.53
165 0.52
166 0.56
167 0.59
168 0.63
169 0.58
170 0.55
171 0.5
172 0.47
173 0.44
174 0.38
175 0.34
176 0.32
177 0.35
178 0.32
179 0.34
180 0.38
181 0.38
182 0.39
183 0.42
184 0.43
185 0.42
186 0.4
187 0.35
188 0.34
189 0.33
190 0.31
191 0.26
192 0.19
193 0.15
194 0.12
195 0.1
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.08
203 0.09
204 0.11
205 0.15
206 0.18
207 0.23
208 0.26
209 0.28
210 0.35
211 0.38
212 0.41
213 0.47
214 0.48
215 0.44
216 0.41
217 0.4
218 0.33
219 0.31
220 0.25
221 0.16
222 0.12
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.07
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.07
232 0.08
233 0.13
234 0.17
235 0.18
236 0.26
237 0.26
238 0.27
239 0.26
240 0.27
241 0.22
242 0.19
243 0.21
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.11
258 0.1
259 0.16
260 0.19
261 0.2
262 0.19
263 0.18
264 0.17
265 0.16
266 0.18
267 0.12
268 0.12
269 0.15
270 0.17
271 0.23
272 0.23
273 0.24
274 0.22
275 0.23
276 0.21
277 0.2
278 0.19
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.12
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.15
290 0.17
291 0.19
292 0.2
293 0.24
294 0.25
295 0.25
296 0.23
297 0.19
298 0.17
299 0.14
300 0.13
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.11
305 0.16
306 0.14
307 0.15
308 0.14
309 0.15
310 0.16
311 0.19
312 0.19
313 0.21
314 0.24
315 0.24
316 0.28
317 0.33
318 0.4
319 0.43
320 0.43
321 0.44
322 0.44
323 0.5
324 0.56
325 0.57
326 0.49
327 0.49
328 0.48
329 0.4
330 0.37
331 0.31
332 0.22
333 0.14
334 0.15
335 0.09
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.11
348 0.14
349 0.14
350 0.15
351 0.18
352 0.18
353 0.19
354 0.22
355 0.21
356 0.22
357 0.28
358 0.29
359 0.34
360 0.42
361 0.48
362 0.46
363 0.5
364 0.45
365 0.4
366 0.41
367 0.33
368 0.27
369 0.21
370 0.22
371 0.18
372 0.17
373 0.18
374 0.15
375 0.16
376 0.15
377 0.15
378 0.12
379 0.13
380 0.14
381 0.13
382 0.15
383 0.14
384 0.13
385 0.15
386 0.16
387 0.19
388 0.26
389 0.33
390 0.34
391 0.36
392 0.44
393 0.5
394 0.58
395 0.63
396 0.66
397 0.69
398 0.74
399 0.79
400 0.74
401 0.74
402 0.74
403 0.69
404 0.65
405 0.58
406 0.53
407 0.46
408 0.45
409 0.39
410 0.35
411 0.34
412 0.28
413 0.27
414 0.26
415 0.25
416 0.25
417 0.23
418 0.2
419 0.17
420 0.24
421 0.22
422 0.28
423 0.3
424 0.28
425 0.29
426 0.35
427 0.36
428 0.39
429 0.44
430 0.46
431 0.54
432 0.62
433 0.66
434 0.66
435 0.67
436 0.64
437 0.68
438 0.6
439 0.5
440 0.45
441 0.4
442 0.39
443 0.37
444 0.32
445 0.28
446 0.27
447 0.3
448 0.31
449 0.38
450 0.38
451 0.44
452 0.52
453 0.55
454 0.65
455 0.69
456 0.76
457 0.77
458 0.81
459 0.84
460 0.84
461 0.87
462 0.85
463 0.86
464 0.81
465 0.76
466 0.69
467 0.6
468 0.5
469 0.45
470 0.42
471 0.38
472 0.37
473 0.33
474 0.3
475 0.3
476 0.28
477 0.26
478 0.23
479 0.2
480 0.19
481 0.2
482 0.28
483 0.34
484 0.41
485 0.43
486 0.44
487 0.48
488 0.52
489 0.56
490 0.58
491 0.59
492 0.61
493 0.67
494 0.74
495 0.77
496 0.81
497 0.8
498 0.81