Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J7RTC1

Protein Details
Accession J7RTC1    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-87RKNNDPKTKISVREKNKKEIAKBasic
263-286EFYYRKRLQKWITKRSKDRQFDPFHydrophilic
975-994GKFGQAGKIRKKMNNKKQIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
985-985K
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
KEGG ndi:NDAI_0G04840  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18000  DEXHc_ERCC6  
cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MKDEEEELQQKLGLVNALSQTTLEARISRDVQAHTNETLLLEEQKRLERSENLLHKLQGRIRLLERKNNDPKTKISVREKNKKEIAKLQQEDLRQCFNDINAIKQRLYVLRGKVGADAGTNAGGVFDQGNVVEDENGKRIDESERDFLIRTGKVTAFGSTTGFTLEETIPTKKDENKIKTKQEHDYDEVHAFEMANEQMVENLSDEDEPTITEEDKDQDFIPEKEEEETEDEDTYNPDEELQELEDDPSIISKPGETKDDGDEFYYRKRLQKWITKRSKDRQFDPFPDLDEWRKPHPNIPDAKLNDIFKIPGDIFSLLFNYQKTCVQWLYELHQQNSGGIIGDEMGLGKTIQIIAFLASLHHSGLLDGPVLIVCPATVMKQWCNELHHWWPPFRTIILHSIGSGMGINQKKNLSDEEFENLLMNSNPNDISYEDLQNNTKRKTKSHLENDINIQSLINTVIEKGHIIITTYVGLRLHSDKLLNVNWSYAILDEGHKIRNPDSDISITCKKIKTHNRIILSGTPIQNNLIELWSLFDFIYPGKLGTLPVFQQQFIIPINTGGYANASNIQVQTGIKCATALRDLISPYLLRRVKNDVAKDLPEKKEMVLFCKLTQYQRIKYLEFLNSNELTQIKGGKRHVLYGIDILRKICNHPDLIDRNEKQYDLDYGNPKRSGKMQVVKQLLLLWHNEKHKVLLFTQSRQMLDILENFINSELKSHSEFSTPLKYLRMDGTTNISNRQKLVDQFNNEDYDVFLLTTRVGGLGINLTGANRIIIFDPDWNPSTDMQARERAWRIGQKREVSIYRLMVAGSIEEKIYHRQIFKQFLTNKILTDPKQKRFFKMNELRDLFTLGGDDGLASEELNNELEKHTQSLKKGQTEESDDFDQVTGLNGVSKLESFYSGKEKNEDERLIEGLLGSETALANAATHEAVVGTHTAPTNIIAREANKIAQEALGALRKSRKATMKYEIGTPTWTGKFGQAGKIRKKMNNKKQIGGSSAILANIKKATQIKSPASSDINNPNEHEILLSKIEQYLHSAPDKFATSADIINNLGVNLNEKKDIIRVRALLRTIAHFDRNKKGWYLNDEFQNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.15
3 0.16
4 0.16
5 0.15
6 0.15
7 0.15
8 0.14
9 0.16
10 0.15
11 0.14
12 0.16
13 0.23
14 0.25
15 0.27
16 0.3
17 0.3
18 0.34
19 0.38
20 0.39
21 0.34
22 0.32
23 0.3
24 0.25
25 0.24
26 0.2
27 0.21
28 0.19
29 0.21
30 0.24
31 0.3
32 0.32
33 0.33
34 0.36
35 0.35
36 0.4
37 0.47
38 0.51
39 0.5
40 0.52
41 0.52
42 0.52
43 0.54
44 0.52
45 0.51
46 0.46
47 0.46
48 0.49
49 0.56
50 0.58
51 0.61
52 0.62
53 0.64
54 0.71
55 0.75
56 0.75
57 0.69
58 0.68
59 0.68
60 0.7
61 0.69
62 0.69
63 0.69
64 0.73
65 0.8
66 0.81
67 0.82
68 0.82
69 0.79
70 0.76
71 0.76
72 0.75
73 0.76
74 0.72
75 0.69
76 0.65
77 0.64
78 0.64
79 0.58
80 0.54
81 0.43
82 0.42
83 0.37
84 0.32
85 0.35
86 0.29
87 0.33
88 0.36
89 0.39
90 0.37
91 0.37
92 0.4
93 0.35
94 0.39
95 0.38
96 0.33
97 0.36
98 0.38
99 0.37
100 0.35
101 0.32
102 0.28
103 0.22
104 0.19
105 0.15
106 0.13
107 0.12
108 0.1
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.11
121 0.13
122 0.16
123 0.17
124 0.16
125 0.15
126 0.16
127 0.2
128 0.23
129 0.27
130 0.29
131 0.3
132 0.31
133 0.31
134 0.31
135 0.32
136 0.27
137 0.23
138 0.22
139 0.21
140 0.23
141 0.23
142 0.23
143 0.18
144 0.18
145 0.18
146 0.14
147 0.14
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.12
152 0.11
153 0.13
154 0.16
155 0.18
156 0.18
157 0.21
158 0.24
159 0.27
160 0.35
161 0.42
162 0.49
163 0.57
164 0.65
165 0.73
166 0.77
167 0.77
168 0.78
169 0.76
170 0.73
171 0.66
172 0.61
173 0.55
174 0.49
175 0.43
176 0.34
177 0.27
178 0.2
179 0.16
180 0.15
181 0.11
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.14
202 0.15
203 0.16
204 0.14
205 0.17
206 0.2
207 0.2
208 0.21
209 0.19
210 0.19
211 0.2
212 0.2
213 0.18
214 0.18
215 0.19
216 0.18
217 0.17
218 0.16
219 0.15
220 0.16
221 0.15
222 0.12
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.12
241 0.14
242 0.18
243 0.18
244 0.2
245 0.24
246 0.27
247 0.26
248 0.24
249 0.24
250 0.23
251 0.25
252 0.3
253 0.28
254 0.31
255 0.35
256 0.41
257 0.48
258 0.57
259 0.63
260 0.67
261 0.75
262 0.8
263 0.85
264 0.87
265 0.89
266 0.85
267 0.81
268 0.8
269 0.77
270 0.72
271 0.69
272 0.6
273 0.53
274 0.48
275 0.45
276 0.38
277 0.36
278 0.35
279 0.35
280 0.41
281 0.39
282 0.41
283 0.46
284 0.5
285 0.5
286 0.51
287 0.53
288 0.48
289 0.52
290 0.51
291 0.45
292 0.38
293 0.32
294 0.28
295 0.2
296 0.21
297 0.16
298 0.13
299 0.14
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.15
304 0.12
305 0.13
306 0.12
307 0.11
308 0.12
309 0.14
310 0.15
311 0.16
312 0.17
313 0.16
314 0.19
315 0.2
316 0.23
317 0.28
318 0.31
319 0.29
320 0.31
321 0.3
322 0.27
323 0.26
324 0.21
325 0.14
326 0.09
327 0.08
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.04
360 0.03
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.08
365 0.1
366 0.13
367 0.16
368 0.19
369 0.2
370 0.24
371 0.25
372 0.28
373 0.31
374 0.35
375 0.35
376 0.34
377 0.33
378 0.31
379 0.3
380 0.26
381 0.22
382 0.18
383 0.2
384 0.21
385 0.2
386 0.18
387 0.17
388 0.16
389 0.14
390 0.12
391 0.08
392 0.11
393 0.13
394 0.13
395 0.15
396 0.17
397 0.17
398 0.19
399 0.21
400 0.18
401 0.18
402 0.19
403 0.21
404 0.2
405 0.2
406 0.19
407 0.15
408 0.13
409 0.11
410 0.1
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.08
416 0.08
417 0.11
418 0.12
419 0.15
420 0.14
421 0.16
422 0.19
423 0.23
424 0.28
425 0.28
426 0.32
427 0.31
428 0.33
429 0.39
430 0.45
431 0.5
432 0.55
433 0.62
434 0.6
435 0.61
436 0.63
437 0.57
438 0.49
439 0.38
440 0.28
441 0.18
442 0.14
443 0.11
444 0.07
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.09
459 0.08
460 0.08
461 0.09
462 0.1
463 0.11
464 0.11
465 0.11
466 0.11
467 0.14
468 0.16
469 0.16
470 0.14
471 0.13
472 0.12
473 0.12
474 0.11
475 0.08
476 0.07
477 0.06
478 0.06
479 0.08
480 0.09
481 0.11
482 0.12
483 0.13
484 0.13
485 0.16
486 0.18
487 0.17
488 0.18
489 0.18
490 0.18
491 0.23
492 0.25
493 0.23
494 0.24
495 0.25
496 0.25
497 0.32
498 0.41
499 0.44
500 0.51
501 0.56
502 0.57
503 0.55
504 0.56
505 0.5
506 0.44
507 0.39
508 0.3
509 0.24
510 0.21
511 0.2
512 0.17
513 0.15
514 0.12
515 0.07
516 0.06
517 0.05
518 0.07
519 0.06
520 0.07
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.07
526 0.06
527 0.06
528 0.05
529 0.05
530 0.06
531 0.07
532 0.08
533 0.08
534 0.12
535 0.12
536 0.12
537 0.12
538 0.12
539 0.13
540 0.12
541 0.12
542 0.08
543 0.07
544 0.08
545 0.07
546 0.07
547 0.06
548 0.06
549 0.05
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.08
556 0.08
557 0.07
558 0.07
559 0.08
560 0.08
561 0.07
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.09
566 0.09
567 0.08
568 0.09
569 0.1
570 0.1
571 0.11
572 0.1
573 0.09
574 0.17
575 0.19
576 0.17
577 0.19
578 0.26
579 0.3
580 0.35
581 0.36
582 0.32
583 0.32
584 0.34
585 0.37
586 0.37
587 0.34
588 0.31
589 0.3
590 0.26
591 0.28
592 0.25
593 0.24
594 0.22
595 0.21
596 0.2
597 0.24
598 0.26
599 0.23
600 0.31
601 0.33
602 0.31
603 0.37
604 0.39
605 0.35
606 0.36
607 0.39
608 0.36
609 0.32
610 0.31
611 0.27
612 0.25
613 0.25
614 0.23
615 0.19
616 0.14
617 0.12
618 0.16
619 0.13
620 0.18
621 0.19
622 0.24
623 0.24
624 0.26
625 0.27
626 0.24
627 0.23
628 0.23
629 0.26
630 0.22
631 0.22
632 0.21
633 0.2
634 0.19
635 0.2
636 0.19
637 0.16
638 0.15
639 0.16
640 0.23
641 0.26
642 0.3
643 0.37
644 0.35
645 0.36
646 0.36
647 0.35
648 0.29
649 0.25
650 0.24
651 0.17
652 0.21
653 0.25
654 0.27
655 0.32
656 0.34
657 0.33
658 0.31
659 0.33
660 0.34
661 0.34
662 0.38
663 0.39
664 0.44
665 0.47
666 0.46
667 0.43
668 0.39
669 0.32
670 0.26
671 0.23
672 0.18
673 0.19
674 0.22
675 0.24
676 0.22
677 0.23
678 0.25
679 0.25
680 0.23
681 0.27
682 0.28
683 0.28
684 0.33
685 0.34
686 0.31
687 0.29
688 0.29
689 0.2
690 0.18
691 0.17
692 0.15
693 0.13
694 0.12
695 0.12
696 0.12
697 0.12
698 0.1
699 0.1
700 0.08
701 0.1
702 0.12
703 0.14
704 0.14
705 0.15
706 0.16
707 0.19
708 0.25
709 0.24
710 0.23
711 0.24
712 0.23
713 0.23
714 0.25
715 0.24
716 0.18
717 0.18
718 0.22
719 0.24
720 0.24
721 0.29
722 0.29
723 0.27
724 0.26
725 0.27
726 0.26
727 0.26
728 0.33
729 0.34
730 0.35
731 0.38
732 0.4
733 0.4
734 0.36
735 0.32
736 0.24
737 0.18
738 0.14
739 0.1
740 0.08
741 0.06
742 0.06
743 0.06
744 0.06
745 0.05
746 0.04
747 0.04
748 0.04
749 0.05
750 0.05
751 0.05
752 0.05
753 0.05
754 0.06
755 0.06
756 0.06
757 0.05
758 0.06
759 0.06
760 0.07
761 0.08
762 0.11
763 0.13
764 0.16
765 0.17
766 0.18
767 0.19
768 0.18
769 0.23
770 0.23
771 0.24
772 0.24
773 0.3
774 0.3
775 0.34
776 0.37
777 0.34
778 0.34
779 0.38
780 0.4
781 0.43
782 0.49
783 0.47
784 0.47
785 0.51
786 0.49
787 0.45
788 0.44
789 0.36
790 0.3
791 0.26
792 0.23
793 0.17
794 0.15
795 0.12
796 0.09
797 0.08
798 0.07
799 0.07
800 0.09
801 0.13
802 0.17
803 0.2
804 0.21
805 0.27
806 0.34
807 0.41
808 0.42
809 0.47
810 0.46
811 0.48
812 0.53
813 0.48
814 0.42
815 0.38
816 0.42
817 0.36
818 0.43
819 0.46
820 0.48
821 0.57
822 0.59
823 0.6
824 0.63
825 0.65
826 0.65
827 0.67
828 0.66
829 0.66
830 0.67
831 0.62
832 0.54
833 0.51
834 0.4
835 0.3
836 0.23
837 0.12
838 0.09
839 0.07
840 0.06
841 0.05
842 0.05
843 0.05
844 0.05
845 0.05
846 0.05
847 0.06
848 0.07
849 0.07
850 0.07
851 0.08
852 0.11
853 0.12
854 0.14
855 0.2
856 0.23
857 0.26
858 0.35
859 0.4
860 0.44
861 0.46
862 0.47
863 0.46
864 0.5
865 0.49
866 0.45
867 0.41
868 0.34
869 0.32
870 0.28
871 0.23
872 0.15
873 0.14
874 0.09
875 0.07
876 0.08
877 0.08
878 0.08
879 0.09
880 0.09
881 0.09
882 0.09
883 0.12
884 0.12
885 0.14
886 0.23
887 0.26
888 0.27
889 0.3
890 0.33
891 0.35
892 0.42
893 0.41
894 0.34
895 0.33
896 0.32
897 0.29
898 0.25
899 0.19
900 0.12
901 0.11
902 0.08
903 0.06
904 0.06
905 0.05
906 0.05
907 0.06
908 0.05
909 0.05
910 0.05
911 0.07
912 0.05
913 0.05
914 0.05
915 0.05
916 0.05
917 0.06
918 0.07
919 0.06
920 0.09
921 0.09
922 0.1
923 0.1
924 0.12
925 0.15
926 0.14
927 0.16
928 0.16
929 0.17
930 0.22
931 0.24
932 0.25
933 0.21
934 0.22
935 0.2
936 0.18
937 0.17
938 0.13
939 0.15
940 0.18
941 0.17
942 0.19
943 0.25
944 0.29
945 0.32
946 0.38
947 0.43
948 0.44
949 0.5
950 0.56
951 0.59
952 0.57
953 0.6
954 0.56
955 0.48
956 0.44
957 0.39
958 0.36
959 0.28
960 0.28
961 0.22
962 0.21
963 0.27
964 0.27
965 0.34
966 0.36
967 0.45
968 0.52
969 0.59
970 0.64
971 0.65
972 0.74
973 0.76
974 0.79
975 0.81
976 0.78
977 0.78
978 0.78
979 0.77
980 0.69
981 0.62
982 0.52
983 0.44
984 0.39
985 0.33
986 0.28
987 0.22
988 0.2
989 0.18
990 0.17
991 0.19
992 0.23
993 0.25
994 0.31
995 0.39
996 0.43
997 0.47
998 0.5
999 0.5
1000 0.49
1001 0.47
1002 0.46
1003 0.48
1004 0.47
1005 0.42
1006 0.41
1007 0.4
1008 0.37
1009 0.34
1010 0.29
1011 0.21
1012 0.19
1013 0.19
1014 0.18
1015 0.15
1016 0.17
1017 0.19
1018 0.18
1019 0.23
1020 0.23
1021 0.25
1022 0.29
1023 0.3
1024 0.28
1025 0.31
1026 0.34
1027 0.28
1028 0.25
1029 0.24
1030 0.2
1031 0.22
1032 0.23
1033 0.21
1034 0.19
1035 0.19
1036 0.19
1037 0.15
1038 0.15
1039 0.11
1040 0.15
1041 0.17
1042 0.18
1043 0.19
1044 0.19
1045 0.21
1046 0.27
1047 0.32
1048 0.32
1049 0.36
1050 0.38
1051 0.41
1052 0.47
1053 0.48
1054 0.45
1055 0.41
1056 0.41
1057 0.4
1058 0.39
1059 0.43
1060 0.43
1061 0.47
1062 0.53
1063 0.56
1064 0.55
1065 0.53
1066 0.54
1067 0.54
1068 0.56
1069 0.58
1070 0.56