Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J9D8L3

Protein Details
Accession J9D8L3    Localization Confidence Low Confidence Score 6.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
241-264NPHAIECIKKSIKKNKKLIVTILCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 9, mito 9, cyto 9, cyto_nucl 9, cyto_mito 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030382  MeTrfase_TRM5/TYW2  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0102522  F:tRNA 4-demethylwyosine alpha-amino-alpha-carboxypropyltransferase activity  
GO:0006400  P:tRNA modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF02475  Met_10  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51684  SAM_MT_TRM5_TYW2  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MTNIKELQKKITAKFVPVNKKHIKDCIKKYESYFLKYERLPHMLSLSKKYDQFEFCMKDIPNGTDTIILIDKNVNMKDENEMGEITITLNYKYFNSSEIFDMLKIPNVGSFQMIGHIIHLNLIPEQYEYKKIYGEVFLMKNKNIKSVIYKTNSVHGIYRTFQFEVIAGIDDLKTVHTENNINYYIDYEKVYWNSKLSAERMKLVTKCFKKGDIIADCTCGAGPLALLAAKMDFKVFANDLNPHAIECIKKSIKKNKKLIVTILCCII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.58
3 0.61
4 0.6
5 0.67
6 0.66
7 0.7
8 0.68
9 0.71
10 0.72
11 0.71
12 0.75
13 0.77
14 0.72
15 0.7
16 0.7
17 0.7
18 0.65
19 0.6
20 0.55
21 0.48
22 0.49
23 0.46
24 0.49
25 0.44
26 0.43
27 0.39
28 0.35
29 0.36
30 0.36
31 0.38
32 0.38
33 0.38
34 0.38
35 0.39
36 0.4
37 0.41
38 0.37
39 0.38
40 0.4
41 0.39
42 0.35
43 0.38
44 0.37
45 0.35
46 0.35
47 0.33
48 0.26
49 0.22
50 0.22
51 0.17
52 0.17
53 0.15
54 0.14
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.12
59 0.15
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.15
64 0.17
65 0.18
66 0.18
67 0.15
68 0.14
69 0.13
70 0.12
71 0.11
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.12
84 0.13
85 0.14
86 0.14
87 0.12
88 0.14
89 0.12
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.09
97 0.09
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.12
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.14
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.21
129 0.24
130 0.21
131 0.2
132 0.22
133 0.27
134 0.33
135 0.32
136 0.36
137 0.33
138 0.37
139 0.37
140 0.32
141 0.28
142 0.22
143 0.21
144 0.19
145 0.21
146 0.18
147 0.17
148 0.16
149 0.14
150 0.13
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.09
164 0.12
165 0.12
166 0.18
167 0.19
168 0.18
169 0.18
170 0.18
171 0.17
172 0.15
173 0.16
174 0.12
175 0.13
176 0.16
177 0.19
178 0.19
179 0.19
180 0.2
181 0.22
182 0.24
183 0.25
184 0.3
185 0.29
186 0.31
187 0.33
188 0.37
189 0.36
190 0.38
191 0.44
192 0.41
193 0.46
194 0.44
195 0.44
196 0.43
197 0.44
198 0.47
199 0.44
200 0.45
201 0.4
202 0.4
203 0.37
204 0.33
205 0.29
206 0.2
207 0.14
208 0.08
209 0.07
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.12
222 0.13
223 0.15
224 0.18
225 0.2
226 0.22
227 0.25
228 0.24
229 0.2
230 0.21
231 0.21
232 0.19
233 0.19
234 0.27
235 0.3
236 0.37
237 0.46
238 0.56
239 0.64
240 0.73
241 0.8
242 0.79
243 0.82
244 0.81
245 0.81
246 0.8
247 0.75