Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179F3F1

Protein Details
Accession A0A179F3F1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-261DVDRRSRSVSRSRSRSRSRSRSRSRSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-151RKLRRKG
241-261RSVSRSRSRSRSRSRSRSRSP
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKGDTVQADARRFLDERGSTAALAPNGLNPATIMEKAVKDRIIESYFYKEQCFALNEADIIDRVVEHVNFIGGTHGNSQKPSPFLCLAFKLLELSPSDEILQEYLSYGGEHFKYLRALACFYFRLTRKAVDVYQTLEPFLEDRRKLRRKGRNGTSLTYVDDFVDDLLSKERVCATSLWKMPKREILEDLEELEPRVSPLGDLEDILEEDADEGGGEEEQRNGDGEEGEISDGMDVDRRSRSVSRSRSRSRSRSRSRSRSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.33
3 0.27
4 0.27
5 0.31
6 0.31
7 0.27
8 0.28
9 0.3
10 0.22
11 0.21
12 0.19
13 0.15
14 0.15
15 0.15
16 0.13
17 0.1
18 0.12
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.14
23 0.16
24 0.19
25 0.23
26 0.22
27 0.21
28 0.22
29 0.27
30 0.26
31 0.26
32 0.25
33 0.29
34 0.31
35 0.32
36 0.31
37 0.27
38 0.25
39 0.27
40 0.26
41 0.21
42 0.19
43 0.18
44 0.17
45 0.16
46 0.16
47 0.12
48 0.1
49 0.08
50 0.06
51 0.07
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.08
62 0.12
63 0.16
64 0.17
65 0.18
66 0.19
67 0.2
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.2
72 0.21
73 0.22
74 0.23
75 0.22
76 0.21
77 0.2
78 0.17
79 0.15
80 0.15
81 0.13
82 0.14
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.09
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.12
104 0.11
105 0.12
106 0.12
107 0.15
108 0.14
109 0.14
110 0.19
111 0.18
112 0.2
113 0.2
114 0.2
115 0.19
116 0.21
117 0.21
118 0.19
119 0.18
120 0.18
121 0.19
122 0.18
123 0.17
124 0.14
125 0.13
126 0.11
127 0.13
128 0.16
129 0.14
130 0.18
131 0.28
132 0.35
133 0.42
134 0.51
135 0.58
136 0.63
137 0.72
138 0.77
139 0.76
140 0.73
141 0.69
142 0.64
143 0.55
144 0.47
145 0.37
146 0.29
147 0.19
148 0.16
149 0.13
150 0.08
151 0.08
152 0.06
153 0.05
154 0.07
155 0.08
156 0.07
157 0.08
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.12
162 0.15
163 0.22
164 0.27
165 0.35
166 0.39
167 0.41
168 0.42
169 0.48
170 0.47
171 0.42
172 0.41
173 0.37
174 0.35
175 0.34
176 0.34
177 0.28
178 0.24
179 0.21
180 0.18
181 0.13
182 0.1
183 0.1
184 0.07
185 0.06
186 0.07
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.05
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.09
222 0.09
223 0.12
224 0.14
225 0.15
226 0.2
227 0.23
228 0.3
229 0.36
230 0.47
231 0.54
232 0.62
233 0.71
234 0.77
235 0.84
236 0.88
237 0.89
238 0.9
239 0.9
240 0.91
241 0.93