FuNGI

A0A179FD63

Protein Details

Accession

A0A179FD63

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
106-130	RAAAERRARGRSRNRSKRSRGDAMG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
81-132	RPKILRRDEADRDKLARQEEQKANERAAAERRARGRSRNRSKRSRGDAMGAR

Subcellular Location(s)

mito 13, nucl 11, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MVRARATGRGARRGAAAPSGGRPSTEGNEAADNAGPSNDPATTTPATLDEAVASSSSTTRAPARRGGTTAGTRTTTGGRLRPKILRRDEADRDKLARQEEQKANERAAAERRARGRSRNRSKRSRGDAMGARGGRGTSTASGPFSGGFAGAAGSRGGGWFGGGSGVTGGGFHGGRGKFESKGKGFGEADIRMREARINADKLHVMSPEDELDSDDEAMMAALNGRTASTMPMGIYRREHKEQGVVVATTAELEAAENATGEEESLWVDGEGPGSLTPSDQPEEGVLGTDGNPVLIKKEPDIEDPMDLDSAIKAAPADEDKKKAVLATKPKKELPKDPEERAIQTDLDLLAGELGAVTVTDEAGEAQTEGPSNKDGRLYLFQFPPLIPPLKEVARPHRRTTVKEEGKAFNVMDAPSASDAAVDLTQDDSNRNSHAEDNREEEEPETEGFRSQFLSHGGMIGKLNVRKSGKVELDWGGMNLEMSPAAGMNFLTTAIIVEENDEKPQQGVVGGDSVGMGKIMGRFVLAPIWSEEEDWNVAPEELVVE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.37
3	0.33
4	0.27
5	0.3
6	0.34
7	0.3
8	0.27
9	0.27
10	0.28
11	0.28
12	0.29
13	0.26
14	0.22
15	0.25
16	0.25
17	0.25
18	0.22
19	0.19
20	0.15
21	0.15
22	0.13
23	0.11
24	0.12
25	0.1
26	0.1
27	0.11
28	0.17
29	0.17
30	0.18
31	0.18
32	0.18
33	0.2
34	0.18
35	0.17
36	0.12
37	0.12
38	0.12
39	0.11
40	0.1
41	0.08
42	0.08
43	0.09
44	0.09
45	0.11
46	0.17
47	0.23
48	0.27
49	0.33
50	0.37
51	0.39
52	0.41
53	0.42
54	0.42
55	0.42
56	0.42
57	0.39
58	0.36
59	0.33
60	0.32
61	0.31
62	0.3
63	0.29
64	0.32
65	0.36
66	0.39
67	0.45
68	0.51
69	0.56
70	0.61
71	0.65
72	0.66
73	0.63
74	0.67
75	0.71
76	0.72
77	0.71
78	0.65
79	0.6
80	0.56
81	0.55
82	0.49
83	0.46
84	0.41
85	0.45
86	0.47
87	0.51
88	0.56
89	0.54
90	0.52
91	0.48
92	0.45
93	0.39
94	0.39
95	0.4
96	0.35
97	0.39
98	0.43
99	0.48
100	0.51
101	0.56
102	0.61
103	0.64
104	0.72
105	0.77
106	0.81
107	0.84
108	0.9
109	0.9
110	0.88
111	0.85
112	0.77
113	0.74
114	0.7
115	0.64
116	0.62
117	0.52
118	0.43
119	0.35
120	0.32
121	0.24
122	0.18
123	0.15
124	0.09
125	0.11
126	0.13
127	0.13
128	0.13
129	0.13
130	0.13
131	0.11
132	0.1
133	0.07
134	0.06
135	0.05
136	0.05
137	0.05
138	0.05
139	0.05
140	0.05
141	0.05
142	0.05
143	0.05
144	0.04
145	0.04
146	0.03
147	0.03
148	0.04
149	0.04
150	0.04
151	0.04
152	0.04
153	0.04
154	0.04
155	0.04
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.11
160	0.11
161	0.12
162	0.16
163	0.18
164	0.2
165	0.24
166	0.32
167	0.27
168	0.33
169	0.33
170	0.35
171	0.33
172	0.33
173	0.33
174	0.28
175	0.29
176	0.24
177	0.25
178	0.19
179	0.19
180	0.18
181	0.15
182	0.18
183	0.2
184	0.22
185	0.22
186	0.24
187	0.24
188	0.24
189	0.24
190	0.19
191	0.15
192	0.13
193	0.14
194	0.13
195	0.12
196	0.1
197	0.09
198	0.1
199	0.09
200	0.08
201	0.07
202	0.06
203	0.05
204	0.05
205	0.04
206	0.03
207	0.03
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.05
215	0.05
216	0.06
217	0.06
218	0.11
219	0.12
220	0.14
221	0.17
222	0.2
223	0.26
224	0.28
225	0.3
226	0.26
227	0.29
228	0.28
229	0.27
230	0.25
231	0.19
232	0.16
233	0.14
234	0.13
235	0.09
236	0.08
237	0.05
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.05
262	0.04
263	0.05
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.08
270	0.07
271	0.07
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.06
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.06
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.13
285	0.14
286	0.16
287	0.2
288	0.2
289	0.18
290	0.18
291	0.18
292	0.13
293	0.12
294	0.1
295	0.06
296	0.05
297	0.04
298	0.04
299	0.03
300	0.03
301	0.05
302	0.07
303	0.12
304	0.14
305	0.17
306	0.17
307	0.18
308	0.18
309	0.19
310	0.21
311	0.24
312	0.32
313	0.4
314	0.46
315	0.5
316	0.54
317	0.6
318	0.59
319	0.62
320	0.58
321	0.59
322	0.58
323	0.56
324	0.59
325	0.55
326	0.52
327	0.45
328	0.39
329	0.28
330	0.23
331	0.21
332	0.14
333	0.11
334	0.09
335	0.07
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.02
340	0.02
341	0.02
342	0.02
343	0.02
344	0.02
345	0.02
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.05
354	0.06
355	0.06
356	0.07
357	0.09
358	0.1
359	0.11
360	0.13
361	0.13
362	0.16
363	0.22
364	0.24
365	0.27
366	0.27
367	0.27
368	0.27
369	0.26
370	0.25
371	0.23
372	0.23
373	0.18
374	0.19
375	0.21
376	0.23
377	0.27
378	0.29
379	0.36
380	0.44
381	0.48
382	0.5
383	0.56
384	0.57
385	0.58
386	0.62
387	0.63
388	0.6
389	0.61
390	0.62
391	0.56
392	0.55
393	0.52
394	0.43
395	0.33
396	0.27
397	0.22
398	0.17
399	0.14
400	0.13
401	0.11
402	0.12
403	0.1
404	0.07
405	0.07
406	0.08
407	0.08
408	0.06
409	0.06
410	0.07
411	0.08
412	0.09
413	0.11
414	0.11
415	0.12
416	0.14
417	0.15
418	0.14
419	0.19
420	0.25
421	0.29
422	0.3
423	0.34
424	0.35
425	0.35
426	0.34
427	0.29
428	0.25
429	0.21
430	0.19
431	0.15
432	0.13
433	0.14
434	0.14
435	0.14
436	0.14
437	0.13
438	0.15
439	0.15
440	0.18
441	0.16
442	0.18
443	0.18
444	0.18
445	0.18
446	0.18
447	0.21
448	0.21
449	0.23
450	0.27
451	0.29
452	0.3
453	0.34
454	0.4
455	0.39
456	0.37
457	0.4
458	0.35
459	0.36
460	0.33
461	0.3
462	0.21
463	0.17
464	0.16
465	0.11
466	0.09
467	0.06
468	0.06
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.05
479	0.06
480	0.06
481	0.07
482	0.06
483	0.08
484	0.12
485	0.13
486	0.16
487	0.17
488	0.16
489	0.16
490	0.17
491	0.15
492	0.12
493	0.12
494	0.1
495	0.12
496	0.11
497	0.1
498	0.1
499	0.1
500	0.09
501	0.08
502	0.06
503	0.06
504	0.08
505	0.09
506	0.08
507	0.09
508	0.09
509	0.1
510	0.15
511	0.13
512	0.13
513	0.15
514	0.2
515	0.19
516	0.21
517	0.2
518	0.19
519	0.22
520	0.2
521	0.2
522	0.17
523	0.16
524	0.14

A0A179FD63

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer