Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J9D4Q0

Protein Details
Accession J9D4Q0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MSSEQTKKSKKIKREKSKEQKISEDCHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-18KKSKKIKREKSK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11.5, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSSEQTKKSKKIKREKSKEQKISEDCHSFLEELKNACFADHENNKKSLPSLNRLSLLENVNIYLNSKKRQEILLDNGLLDILKMWLEPMPDYTLPNIQIKKTVLENLYNMPITKTHLLNSSIGKIVHFYSKNARESSDVQHLAKNVMKKWTNIVFEKDEDDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.91
3 0.93
4 0.95
5 0.94
6 0.89
7 0.88
8 0.82
9 0.76
10 0.73
11 0.65
12 0.55
13 0.47
14 0.43
15 0.33
16 0.3
17 0.3
18 0.25
19 0.23
20 0.22
21 0.23
22 0.21
23 0.2
24 0.18
25 0.15
26 0.21
27 0.28
28 0.35
29 0.36
30 0.39
31 0.39
32 0.39
33 0.38
34 0.36
35 0.32
36 0.31
37 0.34
38 0.34
39 0.36
40 0.36
41 0.37
42 0.34
43 0.31
44 0.25
45 0.19
46 0.17
47 0.15
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.15
52 0.17
53 0.2
54 0.2
55 0.21
56 0.23
57 0.25
58 0.26
59 0.29
60 0.3
61 0.27
62 0.26
63 0.24
64 0.22
65 0.18
66 0.13
67 0.07
68 0.03
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.04
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.09
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.14
82 0.19
83 0.19
84 0.16
85 0.19
86 0.19
87 0.2
88 0.2
89 0.22
90 0.2
91 0.2
92 0.22
93 0.2
94 0.22
95 0.2
96 0.19
97 0.15
98 0.14
99 0.16
100 0.18
101 0.16
102 0.15
103 0.19
104 0.21
105 0.23
106 0.24
107 0.23
108 0.23
109 0.22
110 0.2
111 0.17
112 0.17
113 0.22
114 0.21
115 0.21
116 0.28
117 0.35
118 0.4
119 0.4
120 0.4
121 0.36
122 0.39
123 0.42
124 0.42
125 0.39
126 0.36
127 0.37
128 0.37
129 0.37
130 0.36
131 0.36
132 0.29
133 0.35
134 0.37
135 0.35
136 0.42
137 0.46
138 0.49
139 0.48
140 0.51
141 0.46
142 0.45