Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J9DNP4

Protein Details
Accession J9DNP4    Localization Confidence High Confidence Score 26.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
133-153EIIEGKKEFRNQKTKNKNVLDHydrophilic
453-481KPENKKLKKIETKTFKSDRRIRIHHMKKSBasic
550-589QEKVGYETPKRKKLTKKQFKNKERRRKAKMKLKKAQMVAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-29KKKNEAVK
457-466KKLKKIETKT
468-468K
471-472RR
558-584PKRKKLTKKQFKNKERRRKAKMKLKKA
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSQIEANVDTSKKVDEEKPATKKKNEAVKAEKTGRRVKFDLNDRVMEYVPSKLIKTKEDVNHNSARKSLRNYERKLSHLKIKNNLLKKKHELIDNIKQKSTESKILSSEISSDNVKKEFQKNRQNLNSGKKLEIIEGKKEFRNQKTKNKNVLDISDLKSGNCINNNKFMVKDIEKNHKKSENVSNLKNFKSKQTNDIKDNESLIRSPRKSDEELEKDNIKTSKIDNTLSKDQKNVSDNENQNKCKFVFKKNQEFGKPEEKNKMRTKNLSHPLENKNNLEDSQNKHPSKRFKENETENIIKNKSIMFNKEKNYNSDRNDDEKTNYNQDKSKIFLKKTTNKENIKNGFKKKNNCRDLDDSESEKDFDNESSLEENEQKKSREMIITVNNISHKETKDSLKTYFKKFGKIINVDIEMDNSMCPQKAYITFDGTVNKSIFTTEIVLNDKILRVYYEKPENKKLKKIETKTFKSDRRIRIHHMKKSLTTNDVRQILKSYDFKPIDINLHFDIESHKNYGYCFVSFKKPQAAKKFIKSFGKLKDKLGEHAGAEYSQEKVGYETPKRKKLTKKQFKNKERRRKAKMKLKKAQMVAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.31
3 0.39
4 0.48
5 0.57
6 0.66
7 0.72
8 0.72
9 0.76
10 0.74
11 0.76
12 0.74
13 0.73
14 0.71
15 0.73
16 0.77
17 0.79
18 0.75
19 0.72
20 0.74
21 0.7
22 0.69
23 0.63
24 0.61
25 0.6
26 0.66
27 0.69
28 0.65
29 0.62
30 0.56
31 0.55
32 0.47
33 0.4
34 0.32
35 0.24
36 0.22
37 0.21
38 0.21
39 0.24
40 0.27
41 0.28
42 0.31
43 0.38
44 0.42
45 0.51
46 0.55
47 0.57
48 0.62
49 0.62
50 0.59
51 0.55
52 0.53
53 0.49
54 0.5
55 0.53
56 0.55
57 0.61
58 0.66
59 0.7
60 0.71
61 0.71
62 0.72
63 0.67
64 0.67
65 0.66
66 0.68
67 0.66
68 0.71
69 0.74
70 0.75
71 0.77
72 0.74
73 0.74
74 0.74
75 0.74
76 0.69
77 0.67
78 0.65
79 0.65
80 0.69
81 0.7
82 0.65
83 0.58
84 0.53
85 0.48
86 0.48
87 0.45
88 0.43
89 0.37
90 0.37
91 0.37
92 0.39
93 0.39
94 0.32
95 0.29
96 0.22
97 0.21
98 0.2
99 0.2
100 0.21
101 0.22
102 0.24
103 0.27
104 0.35
105 0.42
106 0.5
107 0.58
108 0.63
109 0.72
110 0.77
111 0.78
112 0.77
113 0.76
114 0.75
115 0.67
116 0.6
117 0.54
118 0.47
119 0.44
120 0.44
121 0.38
122 0.37
123 0.4
124 0.42
125 0.41
126 0.48
127 0.52
128 0.53
129 0.6
130 0.61
131 0.66
132 0.73
133 0.8
134 0.83
135 0.8
136 0.77
137 0.7
138 0.65
139 0.59
140 0.53
141 0.47
142 0.43
143 0.39
144 0.32
145 0.3
146 0.29
147 0.27
148 0.28
149 0.3
150 0.26
151 0.33
152 0.36
153 0.35
154 0.34
155 0.33
156 0.33
157 0.31
158 0.36
159 0.33
160 0.43
161 0.49
162 0.53
163 0.57
164 0.56
165 0.54
166 0.53
167 0.58
168 0.57
169 0.56
170 0.58
171 0.59
172 0.58
173 0.6
174 0.59
175 0.5
176 0.47
177 0.51
178 0.47
179 0.48
180 0.54
181 0.58
182 0.57
183 0.62
184 0.57
185 0.49
186 0.49
187 0.41
188 0.31
189 0.26
190 0.26
191 0.29
192 0.27
193 0.28
194 0.3
195 0.33
196 0.35
197 0.38
198 0.42
199 0.41
200 0.45
201 0.46
202 0.44
203 0.4
204 0.41
205 0.38
206 0.29
207 0.23
208 0.21
209 0.24
210 0.24
211 0.27
212 0.27
213 0.33
214 0.41
215 0.45
216 0.44
217 0.39
218 0.38
219 0.4
220 0.4
221 0.35
222 0.29
223 0.33
224 0.37
225 0.44
226 0.5
227 0.47
228 0.44
229 0.45
230 0.42
231 0.42
232 0.41
233 0.4
234 0.44
235 0.5
236 0.6
237 0.64
238 0.7
239 0.65
240 0.64
241 0.6
242 0.6
243 0.55
244 0.48
245 0.51
246 0.48
247 0.52
248 0.57
249 0.61
250 0.55
251 0.58
252 0.61
253 0.61
254 0.68
255 0.64
256 0.6
257 0.58
258 0.61
259 0.62
260 0.59
261 0.49
262 0.41
263 0.37
264 0.34
265 0.29
266 0.26
267 0.23
268 0.29
269 0.38
270 0.37
271 0.39
272 0.43
273 0.5
274 0.54
275 0.6
276 0.55
277 0.52
278 0.6
279 0.62
280 0.64
281 0.62
282 0.56
283 0.48
284 0.47
285 0.42
286 0.33
287 0.28
288 0.22
289 0.2
290 0.2
291 0.24
292 0.26
293 0.32
294 0.35
295 0.42
296 0.42
297 0.43
298 0.46
299 0.47
300 0.44
301 0.43
302 0.43
303 0.39
304 0.41
305 0.37
306 0.33
307 0.33
308 0.32
309 0.35
310 0.34
311 0.32
312 0.33
313 0.34
314 0.33
315 0.3
316 0.35
317 0.33
318 0.33
319 0.37
320 0.43
321 0.5
322 0.56
323 0.63
324 0.65
325 0.65
326 0.69
327 0.72
328 0.7
329 0.71
330 0.71
331 0.69
332 0.69
333 0.7
334 0.74
335 0.75
336 0.78
337 0.76
338 0.71
339 0.69
340 0.66
341 0.65
342 0.62
343 0.55
344 0.47
345 0.42
346 0.39
347 0.33
348 0.27
349 0.22
350 0.16
351 0.12
352 0.11
353 0.09
354 0.1
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.15
359 0.17
360 0.2
361 0.24
362 0.24
363 0.24
364 0.26
365 0.28
366 0.25
367 0.24
368 0.26
369 0.28
370 0.31
371 0.3
372 0.3
373 0.28
374 0.26
375 0.28
376 0.26
377 0.21
378 0.21
379 0.23
380 0.27
381 0.32
382 0.34
383 0.36
384 0.43
385 0.47
386 0.48
387 0.55
388 0.51
389 0.52
390 0.51
391 0.52
392 0.51
393 0.49
394 0.47
395 0.42
396 0.42
397 0.37
398 0.35
399 0.29
400 0.2
401 0.17
402 0.14
403 0.1
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.07
408 0.1
409 0.14
410 0.19
411 0.21
412 0.23
413 0.24
414 0.26
415 0.3
416 0.28
417 0.28
418 0.23
419 0.21
420 0.17
421 0.17
422 0.15
423 0.12
424 0.14
425 0.11
426 0.14
427 0.18
428 0.18
429 0.18
430 0.19
431 0.18
432 0.15
433 0.14
434 0.13
435 0.12
436 0.16
437 0.23
438 0.32
439 0.38
440 0.44
441 0.54
442 0.62
443 0.65
444 0.7
445 0.7
446 0.71
447 0.74
448 0.76
449 0.77
450 0.77
451 0.79
452 0.8
453 0.82
454 0.78
455 0.78
456 0.79
457 0.78
458 0.77
459 0.76
460 0.76
461 0.78
462 0.8
463 0.78
464 0.78
465 0.73
466 0.68
467 0.71
468 0.67
469 0.63
470 0.57
471 0.55
472 0.54
473 0.56
474 0.51
475 0.43
476 0.42
477 0.38
478 0.39
479 0.39
480 0.33
481 0.37
482 0.37
483 0.37
484 0.36
485 0.37
486 0.37
487 0.33
488 0.35
489 0.27
490 0.28
491 0.27
492 0.24
493 0.26
494 0.24
495 0.26
496 0.24
497 0.24
498 0.22
499 0.23
500 0.28
501 0.25
502 0.22
503 0.23
504 0.24
505 0.32
506 0.36
507 0.4
508 0.44
509 0.49
510 0.56
511 0.62
512 0.69
513 0.67
514 0.74
515 0.78
516 0.76
517 0.78
518 0.75
519 0.73
520 0.73
521 0.76
522 0.69
523 0.65
524 0.66
525 0.59
526 0.58
527 0.56
528 0.48
529 0.38
530 0.38
531 0.34
532 0.25
533 0.24
534 0.21
535 0.17
536 0.15
537 0.14
538 0.12
539 0.13
540 0.19
541 0.25
542 0.34
543 0.42
544 0.51
545 0.6
546 0.65
547 0.71
548 0.77
549 0.8
550 0.82
551 0.83
552 0.85
553 0.87
554 0.93
555 0.96
556 0.96
557 0.96
558 0.96
559 0.96
560 0.96
561 0.95
562 0.95
563 0.94
564 0.94
565 0.94
566 0.94
567 0.93
568 0.92
569 0.91