Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179FCJ0

Protein Details
Accession A0A179FCJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-93REGSRSPLKRPAKQARVHRPFKRQKGILNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-88SPLKRPAKQARVHRPFKRQ
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039601  Rrn5  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MDSDEEYAVDEQSVAEHESDFAYTELDEVQGVYSTVNQSDRESSYLPSDQSIDLRTRQALSQDEREGSRSPLKRPAKQARVHRPFKRQKGILNTEYIDLLNRDIDDAAHRVCLDETVDLPGSQLGLTTWSAVEKQQFFESLSRLGRYDLPGIAARIGTKSEIEVKQYIHLLHTTQERRADFNRRSYLESAEYPAAVEISQQCCHAQEEVADAISVRQERSEQQREAKKWGGNWDITPSIARRLTRRGEEGVSTSESTLRFAQLFHLSNWLKLSERVFMNSSIPGSNWNNIDDRHPSMWATALDDFHSLAVSVTRRLVQSTLFISMSRIRAKKELIPTTREIVRAKDVEAAVASLGMMHNSNNLWIKAARRLRLDVYEEPPDRDDEDIEEEPMDYEEVEAALSGDTNADESRSPQGRILKIEGLSGDDLDDDDEEDNYDTGVDSEGGFKQEIDEEEDEITHEANEILWYSAPELKDIQAAKEALKLRITMERKQEAEAALHDEYASYQAEMEMWNILQKRPPMEPPKVQDPGRVHRSNVGVEDVYPLGRNWATKLEYYGEWETLDTEKQKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.09
4 0.1
5 0.11
6 0.11
7 0.12
8 0.1
9 0.09
10 0.08
11 0.09
12 0.09
13 0.08
14 0.08
15 0.07
16 0.07
17 0.07
18 0.08
19 0.07
20 0.09
21 0.11
22 0.13
23 0.16
24 0.16
25 0.18
26 0.23
27 0.24
28 0.26
29 0.25
30 0.25
31 0.28
32 0.3
33 0.28
34 0.25
35 0.26
36 0.24
37 0.24
38 0.26
39 0.24
40 0.23
41 0.26
42 0.26
43 0.26
44 0.26
45 0.28
46 0.32
47 0.34
48 0.38
49 0.4
50 0.41
51 0.4
52 0.41
53 0.38
54 0.36
55 0.39
56 0.37
57 0.37
58 0.44
59 0.52
60 0.56
61 0.65
62 0.71
63 0.72
64 0.75
65 0.82
66 0.83
67 0.85
68 0.87
69 0.85
70 0.85
71 0.86
72 0.89
73 0.88
74 0.81
75 0.79
76 0.79
77 0.8
78 0.72
79 0.67
80 0.58
81 0.49
82 0.45
83 0.37
84 0.28
85 0.19
86 0.16
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.12
101 0.1
102 0.1
103 0.13
104 0.14
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.05
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.09
118 0.11
119 0.17
120 0.16
121 0.18
122 0.19
123 0.2
124 0.21
125 0.23
126 0.23
127 0.22
128 0.23
129 0.22
130 0.21
131 0.22
132 0.22
133 0.22
134 0.23
135 0.18
136 0.18
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.16
141 0.14
142 0.12
143 0.12
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.16
148 0.17
149 0.2
150 0.22
151 0.22
152 0.23
153 0.25
154 0.24
155 0.18
156 0.18
157 0.15
158 0.16
159 0.24
160 0.24
161 0.25
162 0.3
163 0.3
164 0.33
165 0.38
166 0.44
167 0.4
168 0.47
169 0.51
170 0.47
171 0.5
172 0.48
173 0.46
174 0.4
175 0.36
176 0.3
177 0.24
178 0.21
179 0.17
180 0.16
181 0.12
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.13
186 0.13
187 0.14
188 0.14
189 0.15
190 0.16
191 0.16
192 0.12
193 0.09
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.12
206 0.22
207 0.29
208 0.3
209 0.37
210 0.45
211 0.47
212 0.52
213 0.53
214 0.46
215 0.41
216 0.45
217 0.42
218 0.35
219 0.34
220 0.31
221 0.26
222 0.25
223 0.23
224 0.17
225 0.17
226 0.18
227 0.19
228 0.18
229 0.24
230 0.28
231 0.29
232 0.32
233 0.29
234 0.28
235 0.28
236 0.27
237 0.23
238 0.21
239 0.18
240 0.15
241 0.15
242 0.14
243 0.14
244 0.13
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.12
249 0.15
250 0.17
251 0.15
252 0.23
253 0.22
254 0.23
255 0.23
256 0.21
257 0.17
258 0.17
259 0.18
260 0.14
261 0.15
262 0.16
263 0.16
264 0.16
265 0.17
266 0.16
267 0.15
268 0.11
269 0.11
270 0.13
271 0.13
272 0.15
273 0.14
274 0.15
275 0.16
276 0.16
277 0.18
278 0.17
279 0.18
280 0.17
281 0.16
282 0.15
283 0.14
284 0.16
285 0.14
286 0.13
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.08
293 0.08
294 0.06
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.1
303 0.11
304 0.09
305 0.11
306 0.12
307 0.13
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.15
312 0.18
313 0.22
314 0.22
315 0.22
316 0.24
317 0.27
318 0.3
319 0.36
320 0.41
321 0.38
322 0.41
323 0.42
324 0.43
325 0.43
326 0.41
327 0.33
328 0.27
329 0.28
330 0.24
331 0.23
332 0.24
333 0.21
334 0.18
335 0.17
336 0.15
337 0.1
338 0.09
339 0.08
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.05
346 0.05
347 0.08
348 0.1
349 0.1
350 0.12
351 0.13
352 0.15
353 0.23
354 0.28
355 0.29
356 0.3
357 0.32
358 0.33
359 0.36
360 0.4
361 0.35
362 0.34
363 0.39
364 0.37
365 0.36
366 0.34
367 0.31
368 0.26
369 0.23
370 0.19
371 0.12
372 0.17
373 0.16
374 0.15
375 0.14
376 0.14
377 0.13
378 0.13
379 0.11
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.08
397 0.15
398 0.18
399 0.19
400 0.22
401 0.28
402 0.31
403 0.34
404 0.36
405 0.33
406 0.31
407 0.31
408 0.27
409 0.23
410 0.2
411 0.17
412 0.13
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.08
431 0.09
432 0.11
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.13
437 0.14
438 0.17
439 0.17
440 0.16
441 0.17
442 0.17
443 0.17
444 0.14
445 0.13
446 0.08
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.08
455 0.09
456 0.13
457 0.13
458 0.14
459 0.14
460 0.14
461 0.19
462 0.19
463 0.19
464 0.21
465 0.21
466 0.21
467 0.26
468 0.28
469 0.26
470 0.27
471 0.26
472 0.23
473 0.31
474 0.35
475 0.35
476 0.41
477 0.45
478 0.45
479 0.46
480 0.47
481 0.39
482 0.37
483 0.33
484 0.29
485 0.22
486 0.21
487 0.19
488 0.16
489 0.15
490 0.15
491 0.13
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.09
499 0.08
500 0.13
501 0.14
502 0.15
503 0.2
504 0.23
505 0.26
506 0.3
507 0.39
508 0.43
509 0.5
510 0.58
511 0.6
512 0.66
513 0.69
514 0.66
515 0.64
516 0.63
517 0.64
518 0.66
519 0.61
520 0.54
521 0.52
522 0.55
523 0.51
524 0.45
525 0.4
526 0.31
527 0.28
528 0.3
529 0.24
530 0.21
531 0.19
532 0.16
533 0.16
534 0.17
535 0.18
536 0.17
537 0.23
538 0.25
539 0.26
540 0.29
541 0.29
542 0.28
543 0.34
544 0.34
545 0.28
546 0.26
547 0.25
548 0.24
549 0.22
550 0.26