Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J9DQM1

Protein Details
Accession J9DQM1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
468-487DPPRRGVSKKTIQNIRKNDNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 10, cyto_nucl 9, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR045850  TRM2_met  
IPR010280  U5_MeTrfase_fam  
Gene Ontology GO:0008173  F:RNA methyltransferase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05958  tRNA_U5-meth_tr  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51687  SAM_MT_RNA_M5U  
Amino Acid Sequences MFYYKITNIPRYISHKELFKVIKEQIDLSNNRHKLSYKPNSEHAKLICHQEIPTVTELIIKKNICNIVQSEEPFIDKNKKFKNVILQPKSEYDIRNSVTPLWNMPYENQIEHKKTQIEKFYKRKIEYFKTTKFERNNFQFRFGFDHLNIPMLGYLSKIYIHEHNLVFDVQNCNNISPKLIEKINVIKNLISDKPALIYDSQSRTGFFRSLLVRNFNEEYIALLQLYDPNYEFLSFLKNNADYECGEKKSLFLENYKIIKLFPFDNLHIQCFNARFNGFVPSKTFSIRGDNHLHYKILDRTFKVSFFSFFQTNLATAENLCIKLREHQFKNKKLYDFCCGSGFFSIILSNYFRAIIGVEIENSSIEDALVNININEIKNIKIVKDDVTKFQTDISDFSLIPQIELNPIVNKSCDTELLNEKKNTEIINNFLEKTIQNQIDIKEEKNNSQSQSLFSFKDDNIEKCSMILDPPRRGVSKKTIQNIRKNDNINEIIYISCDYKASYGNILDLCKNTSNSYKNEPFRIQKVLAFDMFPNTENSEVVLILIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.5
3 0.49
4 0.55
5 0.52
6 0.48
7 0.49
8 0.46
9 0.47
10 0.42
11 0.43
12 0.41
13 0.46
14 0.45
15 0.44
16 0.5
17 0.48
18 0.47
19 0.47
20 0.42
21 0.41
22 0.49
23 0.53
24 0.53
25 0.56
26 0.64
27 0.7
28 0.71
29 0.7
30 0.61
31 0.58
32 0.51
33 0.53
34 0.47
35 0.4
36 0.38
37 0.36
38 0.36
39 0.31
40 0.3
41 0.23
42 0.2
43 0.24
44 0.25
45 0.24
46 0.29
47 0.26
48 0.25
49 0.31
50 0.36
51 0.3
52 0.33
53 0.3
54 0.29
55 0.34
56 0.34
57 0.31
58 0.27
59 0.28
60 0.26
61 0.28
62 0.33
63 0.31
64 0.39
65 0.44
66 0.51
67 0.53
68 0.56
69 0.63
70 0.63
71 0.7
72 0.68
73 0.65
74 0.6
75 0.6
76 0.59
77 0.52
78 0.44
79 0.38
80 0.38
81 0.35
82 0.35
83 0.33
84 0.34
85 0.34
86 0.33
87 0.31
88 0.26
89 0.27
90 0.25
91 0.25
92 0.26
93 0.24
94 0.24
95 0.28
96 0.32
97 0.35
98 0.35
99 0.39
100 0.4
101 0.43
102 0.48
103 0.52
104 0.54
105 0.59
106 0.68
107 0.72
108 0.75
109 0.73
110 0.73
111 0.72
112 0.72
113 0.73
114 0.72
115 0.7
116 0.67
117 0.69
118 0.69
119 0.68
120 0.65
121 0.65
122 0.65
123 0.68
124 0.63
125 0.65
126 0.58
127 0.52
128 0.53
129 0.46
130 0.41
131 0.32
132 0.35
133 0.29
134 0.29
135 0.27
136 0.19
137 0.17
138 0.13
139 0.12
140 0.07
141 0.08
142 0.06
143 0.07
144 0.08
145 0.1
146 0.12
147 0.16
148 0.21
149 0.21
150 0.21
151 0.21
152 0.21
153 0.19
154 0.19
155 0.21
156 0.15
157 0.2
158 0.2
159 0.19
160 0.21
161 0.21
162 0.19
163 0.17
164 0.18
165 0.18
166 0.18
167 0.19
168 0.2
169 0.28
170 0.32
171 0.33
172 0.31
173 0.27
174 0.28
175 0.3
176 0.28
177 0.21
178 0.17
179 0.14
180 0.14
181 0.14
182 0.14
183 0.1
184 0.12
185 0.16
186 0.19
187 0.22
188 0.2
189 0.21
190 0.21
191 0.23
192 0.21
193 0.16
194 0.17
195 0.18
196 0.22
197 0.24
198 0.28
199 0.26
200 0.29
201 0.3
202 0.26
203 0.22
204 0.18
205 0.16
206 0.13
207 0.12
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.09
212 0.1
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.07
220 0.13
221 0.12
222 0.13
223 0.15
224 0.15
225 0.15
226 0.16
227 0.17
228 0.12
229 0.17
230 0.19
231 0.18
232 0.18
233 0.17
234 0.17
235 0.17
236 0.21
237 0.17
238 0.15
239 0.17
240 0.23
241 0.25
242 0.25
243 0.23
244 0.19
245 0.18
246 0.18
247 0.16
248 0.14
249 0.15
250 0.16
251 0.22
252 0.23
253 0.24
254 0.22
255 0.22
256 0.2
257 0.18
258 0.17
259 0.13
260 0.12
261 0.11
262 0.11
263 0.18
264 0.17
265 0.16
266 0.18
267 0.18
268 0.19
269 0.2
270 0.2
271 0.14
272 0.2
273 0.21
274 0.24
275 0.27
276 0.29
277 0.32
278 0.32
279 0.31
280 0.25
281 0.27
282 0.27
283 0.26
284 0.27
285 0.24
286 0.26
287 0.27
288 0.27
289 0.26
290 0.21
291 0.18
292 0.17
293 0.19
294 0.16
295 0.15
296 0.15
297 0.14
298 0.13
299 0.13
300 0.11
301 0.08
302 0.07
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.17
310 0.24
311 0.31
312 0.35
313 0.44
314 0.54
315 0.61
316 0.7
317 0.68
318 0.65
319 0.62
320 0.61
321 0.57
322 0.51
323 0.44
324 0.37
325 0.32
326 0.28
327 0.23
328 0.2
329 0.13
330 0.11
331 0.09
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.05
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.08
362 0.09
363 0.09
364 0.12
365 0.13
366 0.13
367 0.14
368 0.16
369 0.19
370 0.27
371 0.28
372 0.3
373 0.34
374 0.34
375 0.32
376 0.32
377 0.29
378 0.22
379 0.21
380 0.19
381 0.18
382 0.16
383 0.17
384 0.21
385 0.19
386 0.18
387 0.17
388 0.14
389 0.13
390 0.14
391 0.14
392 0.11
393 0.12
394 0.13
395 0.13
396 0.13
397 0.14
398 0.15
399 0.16
400 0.15
401 0.19
402 0.27
403 0.33
404 0.4
405 0.39
406 0.38
407 0.38
408 0.38
409 0.35
410 0.3
411 0.26
412 0.23
413 0.27
414 0.28
415 0.27
416 0.25
417 0.26
418 0.21
419 0.23
420 0.27
421 0.22
422 0.22
423 0.24
424 0.25
425 0.32
426 0.34
427 0.32
428 0.32
429 0.33
430 0.36
431 0.39
432 0.42
433 0.36
434 0.39
435 0.38
436 0.33
437 0.36
438 0.35
439 0.3
440 0.28
441 0.29
442 0.25
443 0.31
444 0.33
445 0.3
446 0.32
447 0.33
448 0.31
449 0.27
450 0.28
451 0.21
452 0.21
453 0.27
454 0.29
455 0.32
456 0.36
457 0.41
458 0.42
459 0.44
460 0.47
461 0.48
462 0.51
463 0.54
464 0.58
465 0.64
466 0.7
467 0.78
468 0.81
469 0.77
470 0.76
471 0.73
472 0.67
473 0.65
474 0.6
475 0.51
476 0.43
477 0.37
478 0.29
479 0.25
480 0.23
481 0.16
482 0.13
483 0.12
484 0.11
485 0.12
486 0.15
487 0.16
488 0.19
489 0.18
490 0.22
491 0.24
492 0.25
493 0.26
494 0.25
495 0.27
496 0.26
497 0.27
498 0.27
499 0.33
500 0.36
501 0.39
502 0.47
503 0.53
504 0.55
505 0.61
506 0.65
507 0.64
508 0.63
509 0.65
510 0.58
511 0.52
512 0.51
513 0.49
514 0.43
515 0.38
516 0.33
517 0.32
518 0.31
519 0.29
520 0.26
521 0.23
522 0.22
523 0.2
524 0.21
525 0.16
526 0.14