Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179FCB3

Protein Details
Accession A0A179FCB3    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-128KSPSRKSSKSIMSNHKCRSGHydrophilic
138-160VSTQPWKKYKSKTPEKDVGRRSIHydrophilic
298-318NVNPVSKPKAPRKKPRTITGLHydrophilic
345-377KPLAETSKKPKARKKPTKTKKKPEPPKPVLFSPBasic
634-658STAASPTRRPRGRPRKNSVDNTQIQHydrophilic
665-689QAPETPKRGRGRPRKDSQPTPTKPTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-313KPKAPRKKPR
351-371SKKPKARKKPTKTKKKPEPPK
641-649RRPRGRPRK
670-694PKRGRGRPRKDSQPTPTKPTASKRI
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MASPDVFLSSPPRGSRQHVNMIPTSSPDMPPLQELLSQKPKKPTIRSGSKAVPIPDDAKSTFTSARELWKSAQSVEVNLLSPSVAQESIVLLDDIETAMPAPEDACQIKSPSRKSSKSIMSNHKCRSGGSDLGDEVGVSTQPWKKYKSKTPEKDVGRRSISPDRDNLGLASDQTTAENKPRETTPVGDLPKIRPEDGTKWNERESLLLEPAMVRRKNWTPPTKSATIILDSEASTIGEDAVAADQDGEAKSFGSLLSAYKCSESSTHDNAAYQSDGSAGTKRKVADQRVDSVVISVNNVNPVSKPKAPRKKPRTITGLATAAYRQPTQAELTDVTQDGVAVGQPKPLAETSKKPKARKKPTKTKKKPEPPKPVLFSPETALKQVAKQDFVFGTSSQLATEQSPTFLRELQLAMKDSNQLDYVDFTTPLNSDAIEPPEARPKLWDAAARDIDGDLFDVEVVNLTGSSPRLAKTPGEADPFGYFKGDDASSPSNGVSSAGGCAKDDGSFVDIADILPPVCSKPTHKSSGRQQILTGAEAEAHQASKLSTSVEILGSQPMRENANTEPLVDKGHKTKDTANSSRPTFEQYTDVELSKKISQYGFKPVKRRSAMIALLDQCWRQIGHGSQQRGMKTTSTAASPTRRPRGRPRKNSVDNTQIQEPPPSAQAPETPKRGRGRPRKDSQPTPTKPTASKRITTPTRKRSTKSDATVPQKVLAAKVIEIPDSESEVADALGSSPLSSQSSTFSSPEKVNLTMSVDNDTELSLTMTPTDAQTHLFTHITKAVTTAPRTTDPANPSWYEKILMYDPIVLEDLASWLNSGQLSRVGYDEEVNPVELKKWCESKSICCLWKINLRGKERKRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.48
3 0.51
4 0.57
5 0.56
6 0.59
7 0.57
8 0.57
9 0.52
10 0.45
11 0.42
12 0.34
13 0.3
14 0.28
15 0.27
16 0.24
17 0.25
18 0.24
19 0.21
20 0.23
21 0.25
22 0.31
23 0.39
24 0.43
25 0.47
26 0.54
27 0.61
28 0.65
29 0.71
30 0.73
31 0.72
32 0.78
33 0.78
34 0.76
35 0.75
36 0.73
37 0.69
38 0.61
39 0.53
40 0.46
41 0.44
42 0.39
43 0.36
44 0.31
45 0.29
46 0.28
47 0.28
48 0.28
49 0.26
50 0.28
51 0.25
52 0.33
53 0.34
54 0.35
55 0.35
56 0.38
57 0.39
58 0.35
59 0.4
60 0.32
61 0.3
62 0.31
63 0.29
64 0.24
65 0.22
66 0.21
67 0.14
68 0.13
69 0.12
70 0.11
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.1
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.07
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.1
91 0.11
92 0.13
93 0.15
94 0.18
95 0.25
96 0.33
97 0.37
98 0.44
99 0.52
100 0.54
101 0.57
102 0.64
103 0.67
104 0.69
105 0.73
106 0.74
107 0.74
108 0.8
109 0.8
110 0.78
111 0.69
112 0.6
113 0.57
114 0.51
115 0.46
116 0.4
117 0.38
118 0.3
119 0.3
120 0.3
121 0.23
122 0.17
123 0.13
124 0.09
125 0.06
126 0.11
127 0.15
128 0.21
129 0.25
130 0.31
131 0.38
132 0.48
133 0.58
134 0.64
135 0.71
136 0.74
137 0.8
138 0.83
139 0.84
140 0.85
141 0.81
142 0.79
143 0.73
144 0.66
145 0.63
146 0.63
147 0.61
148 0.55
149 0.52
150 0.46
151 0.42
152 0.4
153 0.33
154 0.27
155 0.21
156 0.17
157 0.15
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.14
162 0.13
163 0.19
164 0.24
165 0.22
166 0.24
167 0.25
168 0.29
169 0.3
170 0.31
171 0.3
172 0.33
173 0.35
174 0.36
175 0.37
176 0.35
177 0.4
178 0.39
179 0.34
180 0.28
181 0.31
182 0.35
183 0.42
184 0.46
185 0.45
186 0.47
187 0.48
188 0.48
189 0.43
190 0.38
191 0.31
192 0.27
193 0.22
194 0.19
195 0.17
196 0.16
197 0.2
198 0.26
199 0.24
200 0.2
201 0.25
202 0.3
203 0.39
204 0.48
205 0.53
206 0.53
207 0.6
208 0.67
209 0.64
210 0.59
211 0.53
212 0.46
213 0.39
214 0.32
215 0.25
216 0.19
217 0.16
218 0.15
219 0.12
220 0.1
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.1
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.19
251 0.23
252 0.26
253 0.29
254 0.28
255 0.29
256 0.28
257 0.29
258 0.23
259 0.16
260 0.11
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.13
265 0.14
266 0.14
267 0.17
268 0.18
269 0.25
270 0.31
271 0.36
272 0.4
273 0.41
274 0.44
275 0.44
276 0.44
277 0.37
278 0.3
279 0.27
280 0.18
281 0.16
282 0.12
283 0.1
284 0.12
285 0.12
286 0.11
287 0.1
288 0.15
289 0.19
290 0.23
291 0.3
292 0.38
293 0.49
294 0.59
295 0.69
296 0.74
297 0.79
298 0.82
299 0.83
300 0.8
301 0.73
302 0.67
303 0.61
304 0.54
305 0.44
306 0.37
307 0.29
308 0.23
309 0.21
310 0.17
311 0.12
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.12
318 0.13
319 0.14
320 0.13
321 0.12
322 0.1
323 0.09
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.13
335 0.14
336 0.23
337 0.3
338 0.4
339 0.46
340 0.52
341 0.6
342 0.67
343 0.76
344 0.79
345 0.82
346 0.83
347 0.88
348 0.92
349 0.95
350 0.95
351 0.94
352 0.94
353 0.94
354 0.93
355 0.94
356 0.9
357 0.88
358 0.81
359 0.72
360 0.66
361 0.57
362 0.47
363 0.37
364 0.35
365 0.27
366 0.23
367 0.22
368 0.18
369 0.18
370 0.22
371 0.22
372 0.18
373 0.17
374 0.18
375 0.17
376 0.18
377 0.18
378 0.12
379 0.13
380 0.12
381 0.12
382 0.09
383 0.1
384 0.09
385 0.08
386 0.11
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.11
391 0.11
392 0.12
393 0.11
394 0.1
395 0.11
396 0.11
397 0.13
398 0.13
399 0.13
400 0.13
401 0.15
402 0.14
403 0.14
404 0.13
405 0.11
406 0.1
407 0.1
408 0.11
409 0.09
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.08
414 0.09
415 0.08
416 0.06
417 0.07
418 0.08
419 0.1
420 0.1
421 0.11
422 0.11
423 0.19
424 0.19
425 0.18
426 0.17
427 0.17
428 0.18
429 0.2
430 0.22
431 0.17
432 0.23
433 0.24
434 0.23
435 0.21
436 0.19
437 0.17
438 0.14
439 0.11
440 0.05
441 0.04
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.04
451 0.04
452 0.05
453 0.06
454 0.06
455 0.08
456 0.09
457 0.09
458 0.11
459 0.15
460 0.17
461 0.2
462 0.2
463 0.2
464 0.2
465 0.2
466 0.18
467 0.14
468 0.11
469 0.07
470 0.1
471 0.09
472 0.07
473 0.11
474 0.13
475 0.13
476 0.14
477 0.13
478 0.11
479 0.11
480 0.11
481 0.07
482 0.05
483 0.06
484 0.07
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.07
506 0.11
507 0.18
508 0.24
509 0.32
510 0.36
511 0.43
512 0.51
513 0.61
514 0.61
515 0.54
516 0.49
517 0.46
518 0.44
519 0.37
520 0.28
521 0.17
522 0.13
523 0.13
524 0.13
525 0.08
526 0.07
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.07
532 0.06
533 0.06
534 0.07
535 0.08
536 0.08
537 0.09
538 0.08
539 0.11
540 0.11
541 0.11
542 0.11
543 0.12
544 0.13
545 0.13
546 0.14
547 0.12
548 0.19
549 0.19
550 0.19
551 0.18
552 0.17
553 0.2
554 0.19
555 0.2
556 0.18
557 0.25
558 0.26
559 0.27
560 0.33
561 0.39
562 0.47
563 0.51
564 0.51
565 0.51
566 0.5
567 0.5
568 0.44
569 0.41
570 0.34
571 0.29
572 0.27
573 0.22
574 0.26
575 0.26
576 0.26
577 0.21
578 0.2
579 0.22
580 0.21
581 0.21
582 0.17
583 0.18
584 0.21
585 0.22
586 0.33
587 0.39
588 0.41
589 0.49
590 0.52
591 0.59
592 0.58
593 0.57
594 0.51
595 0.49
596 0.48
597 0.42
598 0.43
599 0.34
600 0.33
601 0.33
602 0.28
603 0.21
604 0.18
605 0.16
606 0.11
607 0.14
608 0.14
609 0.22
610 0.29
611 0.32
612 0.35
613 0.39
614 0.39
615 0.37
616 0.36
617 0.27
618 0.23
619 0.23
620 0.2
621 0.18
622 0.19
623 0.21
624 0.25
625 0.32
626 0.38
627 0.45
628 0.48
629 0.53
630 0.63
631 0.7
632 0.76
633 0.79
634 0.8
635 0.81
636 0.87
637 0.89
638 0.84
639 0.82
640 0.76
641 0.7
642 0.66
643 0.57
644 0.49
645 0.43
646 0.37
647 0.28
648 0.26
649 0.22
650 0.17
651 0.15
652 0.2
653 0.26
654 0.32
655 0.38
656 0.38
657 0.45
658 0.5
659 0.57
660 0.62
661 0.65
662 0.69
663 0.72
664 0.78
665 0.82
666 0.85
667 0.86
668 0.85
669 0.85
670 0.8
671 0.78
672 0.75
673 0.68
674 0.65
675 0.64
676 0.65
677 0.59
678 0.57
679 0.54
680 0.59
681 0.64
682 0.69
683 0.71
684 0.71
685 0.76
686 0.79
687 0.77
688 0.76
689 0.76
690 0.75
691 0.7
692 0.69
693 0.67
694 0.69
695 0.72
696 0.65
697 0.57
698 0.5
699 0.45
700 0.36
701 0.31
702 0.25
703 0.19
704 0.22
705 0.21
706 0.18
707 0.18
708 0.19
709 0.16
710 0.18
711 0.18
712 0.13
713 0.12
714 0.11
715 0.11
716 0.09
717 0.07
718 0.05
719 0.06
720 0.06
721 0.06
722 0.06
723 0.08
724 0.1
725 0.1
726 0.1
727 0.12
728 0.16
729 0.18
730 0.19
731 0.2
732 0.22
733 0.23
734 0.27
735 0.27
736 0.25
737 0.24
738 0.25
739 0.27
740 0.26
741 0.26
742 0.25
743 0.22
744 0.21
745 0.2
746 0.18
747 0.13
748 0.11
749 0.11
750 0.08
751 0.08
752 0.08
753 0.08
754 0.09
755 0.1
756 0.12
757 0.11
758 0.13
759 0.15
760 0.16
761 0.18
762 0.19
763 0.19
764 0.2
765 0.24
766 0.23
767 0.21
768 0.21
769 0.25
770 0.29
771 0.32
772 0.32
773 0.32
774 0.34
775 0.37
776 0.38
777 0.38
778 0.37
779 0.39
780 0.4
781 0.38
782 0.4
783 0.4
784 0.39
785 0.34
786 0.29
787 0.29
788 0.26
789 0.26
790 0.23
791 0.23
792 0.21
793 0.21
794 0.21
795 0.17
796 0.14
797 0.12
798 0.12
799 0.09
800 0.09
801 0.08
802 0.07
803 0.09
804 0.09
805 0.09
806 0.09
807 0.13
808 0.14
809 0.15
810 0.16
811 0.16
812 0.16
813 0.19
814 0.19
815 0.19
816 0.19
817 0.2
818 0.2
819 0.18
820 0.22
821 0.23
822 0.27
823 0.29
824 0.36
825 0.36
826 0.44
827 0.47
828 0.51
829 0.57
830 0.62
831 0.59
832 0.56
833 0.57
834 0.55
835 0.6
836 0.6
837 0.59
838 0.59
839 0.64
840 0.7