Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J9D4W0

Protein Details
Accession J9D4W0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1007-1026IRRPIFLKSDNIRRRKRNPRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1018-1026IRRRKRNPR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.333, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MHNTDINDHKSNVDTCDQPEKEGRLSVEINTGDISVCGQKNDYHILHNHLDGDNLADKKKFNQLCTNNIEENNDTLSILQRNNSSSMRESGEHISSADSNLCSSNAETSFSKRVTKDGNIKYRLENQNNNLDSMNEIASPDMGNGNCLDRNYDNSCVYESYQSSGQNYYSLTDISRYQNFFCNNVDSNEVKMYLDGQFQVSNANQNGYQQQIDTSNFTSAADSSQTQASENMYKNYMMKEHSEGINSSAVYEDEFSTNFKNQINYENQENLLNKSSNYKNQINNFEAQENLNKKTFFTRNNGAKSENAENFVDLGRETHDHEDISNTKNFAIRDENINLTLIKNNDCIEENNNQKDDYYMNMSMQNTNDCGNSAQSTRFNDELRENVYMSNSNSMCYPKISKSSFNSKLESNIMSKNNRMFDFVHNKYQIKGDNEAEQFAQKNLQSNCYYNANDERENNINKSYDNLQNKFTHKLNKSFQKCDGENISETEHDVHNVISIICKNAERSGVESNENNVYSQLVSNNHVNSDANFGIKMQNNTDRLYSSHMSAVNGENYMSNNLYDAYENNSDMQQARNHNIYHMNNKIDENEYYNDNFNGNSDLDRAKDSLGTFQTDNFIQENQSGNSNSVILNKMSSDLASYQQPDSQTSGYKNYMKSDISCNNQNDLENYYYKDSHKDNLMGNDSKLENLGHTDQYLCSDQSFKNLSPSNNLLCNYNNPSQSNDGCPNIANYITNNNLNNDHLNDNIYRRRTNLNSGYLMDDQQHNNSLSVNNNEYYNLQATNKHHPNELYPNYYRNTHSIKGSLGINPTKFDFNKDLIKDERFGKPTNFSAQRINPEYNRYETKLSYFNNRGHVSREMKMRFTRDQYSTPINYQINEDQHNQMQSANSSMLYKQKMINNGYQNDENLQNNYQHQNYQQYAVKQDGTKMFTENNESTTAYKKWEEIQRIMQKSKDKEVTYNKPIYNVAQQKNICAHCGTDKTSLWRRFEGLFVCNACGLYYKMHGIRRPIFLKSDNIRRRKRNPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.4
4 0.39
5 0.39
6 0.43
7 0.43
8 0.41
9 0.43
10 0.4
11 0.35
12 0.36
13 0.33
14 0.34
15 0.3
16 0.28
17 0.24
18 0.22
19 0.17
20 0.15
21 0.16
22 0.15
23 0.16
24 0.16
25 0.18
26 0.19
27 0.23
28 0.31
29 0.3
30 0.29
31 0.32
32 0.37
33 0.39
34 0.38
35 0.38
36 0.3
37 0.29
38 0.24
39 0.25
40 0.24
41 0.24
42 0.24
43 0.23
44 0.24
45 0.27
46 0.36
47 0.37
48 0.37
49 0.45
50 0.49
51 0.56
52 0.61
53 0.64
54 0.59
55 0.56
56 0.54
57 0.45
58 0.41
59 0.35
60 0.28
61 0.22
62 0.18
63 0.2
64 0.2
65 0.2
66 0.21
67 0.22
68 0.24
69 0.29
70 0.3
71 0.29
72 0.29
73 0.31
74 0.32
75 0.3
76 0.32
77 0.32
78 0.32
79 0.29
80 0.26
81 0.24
82 0.2
83 0.21
84 0.2
85 0.15
86 0.14
87 0.15
88 0.15
89 0.14
90 0.14
91 0.18
92 0.16
93 0.19
94 0.2
95 0.24
96 0.3
97 0.31
98 0.36
99 0.31
100 0.36
101 0.39
102 0.46
103 0.51
104 0.54
105 0.62
106 0.62
107 0.64
108 0.63
109 0.67
110 0.68
111 0.66
112 0.64
113 0.59
114 0.64
115 0.63
116 0.59
117 0.5
118 0.4
119 0.32
120 0.26
121 0.22
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.19
136 0.17
137 0.23
138 0.26
139 0.3
140 0.29
141 0.28
142 0.3
143 0.27
144 0.28
145 0.27
146 0.24
147 0.22
148 0.24
149 0.24
150 0.24
151 0.24
152 0.23
153 0.2
154 0.19
155 0.17
156 0.15
157 0.14
158 0.12
159 0.12
160 0.16
161 0.19
162 0.24
163 0.25
164 0.26
165 0.32
166 0.33
167 0.34
168 0.32
169 0.33
170 0.29
171 0.29
172 0.32
173 0.26
174 0.26
175 0.26
176 0.24
177 0.19
178 0.17
179 0.17
180 0.14
181 0.15
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.16
187 0.15
188 0.19
189 0.18
190 0.19
191 0.17
192 0.19
193 0.21
194 0.2
195 0.2
196 0.14
197 0.15
198 0.18
199 0.19
200 0.2
201 0.2
202 0.18
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.13
207 0.13
208 0.12
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.14
215 0.16
216 0.2
217 0.22
218 0.22
219 0.22
220 0.23
221 0.23
222 0.24
223 0.24
224 0.19
225 0.2
226 0.22
227 0.25
228 0.25
229 0.26
230 0.24
231 0.24
232 0.25
233 0.21
234 0.17
235 0.14
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.08
241 0.09
242 0.11
243 0.13
244 0.15
245 0.17
246 0.17
247 0.19
248 0.19
249 0.26
250 0.31
251 0.31
252 0.33
253 0.33
254 0.32
255 0.34
256 0.34
257 0.29
258 0.28
259 0.26
260 0.22
261 0.26
262 0.3
263 0.32
264 0.38
265 0.41
266 0.43
267 0.5
268 0.56
269 0.52
270 0.52
271 0.47
272 0.41
273 0.36
274 0.31
275 0.31
276 0.28
277 0.28
278 0.27
279 0.25
280 0.25
281 0.32
282 0.36
283 0.34
284 0.37
285 0.44
286 0.49
287 0.54
288 0.56
289 0.5
290 0.46
291 0.45
292 0.45
293 0.37
294 0.32
295 0.27
296 0.25
297 0.24
298 0.22
299 0.18
300 0.11
301 0.09
302 0.08
303 0.09
304 0.11
305 0.13
306 0.14
307 0.13
308 0.14
309 0.17
310 0.18
311 0.21
312 0.21
313 0.19
314 0.18
315 0.21
316 0.21
317 0.19
318 0.22
319 0.2
320 0.23
321 0.25
322 0.26
323 0.23
324 0.24
325 0.22
326 0.17
327 0.19
328 0.15
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.15
333 0.16
334 0.17
335 0.17
336 0.23
337 0.27
338 0.3
339 0.31
340 0.29
341 0.28
342 0.27
343 0.24
344 0.2
345 0.19
346 0.15
347 0.15
348 0.19
349 0.19
350 0.2
351 0.2
352 0.19
353 0.15
354 0.15
355 0.14
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.13
362 0.16
363 0.19
364 0.21
365 0.23
366 0.22
367 0.23
368 0.23
369 0.23
370 0.23
371 0.21
372 0.18
373 0.17
374 0.17
375 0.17
376 0.16
377 0.2
378 0.16
379 0.15
380 0.16
381 0.17
382 0.16
383 0.17
384 0.19
385 0.16
386 0.23
387 0.25
388 0.29
389 0.33
390 0.42
391 0.48
392 0.48
393 0.48
394 0.41
395 0.42
396 0.39
397 0.36
398 0.28
399 0.25
400 0.27
401 0.26
402 0.28
403 0.29
404 0.31
405 0.29
406 0.29
407 0.26
408 0.29
409 0.36
410 0.37
411 0.4
412 0.4
413 0.4
414 0.38
415 0.39
416 0.36
417 0.3
418 0.31
419 0.25
420 0.28
421 0.28
422 0.28
423 0.25
424 0.22
425 0.2
426 0.16
427 0.17
428 0.11
429 0.17
430 0.17
431 0.22
432 0.22
433 0.23
434 0.25
435 0.27
436 0.26
437 0.22
438 0.28
439 0.26
440 0.26
441 0.26
442 0.27
443 0.28
444 0.29
445 0.28
446 0.24
447 0.21
448 0.19
449 0.21
450 0.22
451 0.24
452 0.29
453 0.29
454 0.31
455 0.35
456 0.38
457 0.39
458 0.38
459 0.39
460 0.36
461 0.42
462 0.45
463 0.5
464 0.54
465 0.53
466 0.56
467 0.54
468 0.51
469 0.47
470 0.43
471 0.36
472 0.31
473 0.29
474 0.25
475 0.17
476 0.17
477 0.15
478 0.11
479 0.09
480 0.09
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.07
487 0.07
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.09
492 0.11
493 0.1
494 0.12
495 0.15
496 0.16
497 0.17
498 0.17
499 0.18
500 0.18
501 0.18
502 0.15
503 0.12
504 0.1
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.09
509 0.11
510 0.13
511 0.13
512 0.13
513 0.13
514 0.13
515 0.11
516 0.14
517 0.12
518 0.1
519 0.1
520 0.1
521 0.13
522 0.16
523 0.16
524 0.14
525 0.19
526 0.21
527 0.22
528 0.22
529 0.19
530 0.18
531 0.22
532 0.2
533 0.16
534 0.17
535 0.17
536 0.16
537 0.17
538 0.18
539 0.13
540 0.13
541 0.12
542 0.09
543 0.09
544 0.1
545 0.09
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.1
553 0.11
554 0.11
555 0.12
556 0.11
557 0.12
558 0.12
559 0.14
560 0.13
561 0.15
562 0.17
563 0.2
564 0.2
565 0.21
566 0.28
567 0.28
568 0.3
569 0.31
570 0.3
571 0.28
572 0.29
573 0.28
574 0.24
575 0.22
576 0.19
577 0.17
578 0.17
579 0.17
580 0.17
581 0.16
582 0.14
583 0.14
584 0.11
585 0.11
586 0.1
587 0.09
588 0.1
589 0.1
590 0.1
591 0.12
592 0.12
593 0.1
594 0.11
595 0.11
596 0.14
597 0.15
598 0.16
599 0.15
600 0.15
601 0.17
602 0.15
603 0.16
604 0.12
605 0.11
606 0.1
607 0.12
608 0.14
609 0.12
610 0.15
611 0.14
612 0.14
613 0.14
614 0.14
615 0.12
616 0.12
617 0.13
618 0.1
619 0.1
620 0.1
621 0.1
622 0.1
623 0.09
624 0.08
625 0.08
626 0.09
627 0.11
628 0.13
629 0.12
630 0.14
631 0.15
632 0.15
633 0.16
634 0.16
635 0.17
636 0.17
637 0.2
638 0.23
639 0.26
640 0.26
641 0.26
642 0.28
643 0.26
644 0.27
645 0.3
646 0.31
647 0.32
648 0.38
649 0.37
650 0.36
651 0.37
652 0.35
653 0.29
654 0.27
655 0.25
656 0.19
657 0.19
658 0.19
659 0.2
660 0.2
661 0.23
662 0.21
663 0.22
664 0.24
665 0.26
666 0.26
667 0.3
668 0.35
669 0.32
670 0.3
671 0.3
672 0.27
673 0.23
674 0.21
675 0.16
676 0.11
677 0.13
678 0.15
679 0.12
680 0.12
681 0.13
682 0.12
683 0.15
684 0.16
685 0.13
686 0.11
687 0.14
688 0.14
689 0.19
690 0.23
691 0.2
692 0.25
693 0.29
694 0.3
695 0.31
696 0.35
697 0.32
698 0.33
699 0.33
700 0.28
701 0.25
702 0.29
703 0.3
704 0.31
705 0.32
706 0.29
707 0.31
708 0.34
709 0.34
710 0.34
711 0.32
712 0.28
713 0.25
714 0.25
715 0.23
716 0.2
717 0.19
718 0.14
719 0.11
720 0.14
721 0.16
722 0.2
723 0.2
724 0.2
725 0.21
726 0.22
727 0.23
728 0.21
729 0.19
730 0.17
731 0.18
732 0.18
733 0.22
734 0.26
735 0.28
736 0.26
737 0.28
738 0.34
739 0.35
740 0.42
741 0.44
742 0.43
743 0.42
744 0.42
745 0.43
746 0.37
747 0.35
748 0.28
749 0.25
750 0.21
751 0.2
752 0.23
753 0.19
754 0.19
755 0.19
756 0.19
757 0.19
758 0.22
759 0.23
760 0.2
761 0.19
762 0.2
763 0.19
764 0.2
765 0.18
766 0.16
767 0.14
768 0.19
769 0.23
770 0.32
771 0.38
772 0.37
773 0.38
774 0.37
775 0.42
776 0.46
777 0.47
778 0.44
779 0.4
780 0.42
781 0.41
782 0.44
783 0.4
784 0.36
785 0.37
786 0.33
787 0.33
788 0.32
789 0.3
790 0.3
791 0.3
792 0.27
793 0.27
794 0.29
795 0.27
796 0.26
797 0.27
798 0.3
799 0.28
800 0.3
801 0.29
802 0.28
803 0.35
804 0.35
805 0.38
806 0.37
807 0.39
808 0.38
809 0.38
810 0.41
811 0.37
812 0.38
813 0.36
814 0.37
815 0.38
816 0.44
817 0.45
818 0.4
819 0.44
820 0.46
821 0.52
822 0.52
823 0.53
824 0.46
825 0.47
826 0.49
827 0.46
828 0.46
829 0.41
830 0.4
831 0.36
832 0.37
833 0.38
834 0.37
835 0.41
836 0.42
837 0.43
838 0.48
839 0.49
840 0.46
841 0.43
842 0.49
843 0.45
844 0.44
845 0.49
846 0.44
847 0.47
848 0.51
849 0.53
850 0.52
851 0.52
852 0.54
853 0.5
854 0.5
855 0.5
856 0.52
857 0.49
858 0.45
859 0.47
860 0.41
861 0.37
862 0.38
863 0.38
864 0.35
865 0.36
866 0.37
867 0.33
868 0.36
869 0.36
870 0.32
871 0.28
872 0.25
873 0.22
874 0.21
875 0.18
876 0.15
877 0.15
878 0.17
879 0.22
880 0.22
881 0.24
882 0.27
883 0.3
884 0.37
885 0.4
886 0.46
887 0.48
888 0.49
889 0.51
890 0.48
891 0.45
892 0.4
893 0.41
894 0.35
895 0.3
896 0.29
897 0.27
898 0.29
899 0.33
900 0.32
901 0.31
902 0.32
903 0.37
904 0.37
905 0.39
906 0.4
907 0.38
908 0.39
909 0.4
910 0.4
911 0.33
912 0.37
913 0.38
914 0.36
915 0.34
916 0.33
917 0.32
918 0.3
919 0.37
920 0.32
921 0.28
922 0.27
923 0.27
924 0.26
925 0.29
926 0.28
927 0.25
928 0.25
929 0.25
930 0.31
931 0.38
932 0.43
933 0.44
934 0.53
935 0.58
936 0.64
937 0.66
938 0.63
939 0.63
940 0.62
941 0.66
942 0.63
943 0.56
944 0.58
945 0.64
946 0.69
947 0.69
948 0.72
949 0.63
950 0.59
951 0.58
952 0.53
953 0.53
954 0.53
955 0.49
956 0.49
957 0.49
958 0.5
959 0.56
960 0.53
961 0.46
962 0.37
963 0.35
964 0.33
965 0.37
966 0.37
967 0.35
968 0.37
969 0.43
970 0.52
971 0.57
972 0.54
973 0.53
974 0.51
975 0.46
976 0.49
977 0.44
978 0.37
979 0.36
980 0.33
981 0.32
982 0.29
983 0.28
984 0.23
985 0.21
986 0.2
987 0.16
988 0.17
989 0.23
990 0.28
991 0.34
992 0.38
993 0.44
994 0.49
995 0.55
996 0.56
997 0.53
998 0.53
999 0.5
1000 0.56
1001 0.56
1002 0.61
1003 0.61
1004 0.68
1005 0.74
1006 0.79