FuNGI

A0A179F9P0

Protein Details

Accession

A0A179F9P0

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-40	STSQNGAHRSQKPNPLRPMRKRPRPANPLVAPSRK	Hydrophilic
183-208	APVMKENTPKRPKKQKEEKTMFNRAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
17-43	KPNPLRPMRKRPRPANPLVAPSRKTPG
191-203	PKRPKKQKEEKTM
206-206	R
491-510	SKQRPGELTKKTKSLKRAGS
522-529	SRKKMKKS
667-673	KRLRRRK

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MPGQPSTSQNGAHRSQKPNPLRPMRKRPRPANPLVAPSRKTPGKPTTKSASTLGQQTGLNGSKTTSDGQREQYGGWSEPPPQYQYNDIPIMTTKKSLLEGLRYHLMKFSQARVSDTPIDPTNQDEFARPVTLHRRDARQPPPGRAVKEEEPEPIQVDEKEAERLAQLKAEREAQRAIDQAKIAPVMKENTPKRPKKQKEEKTMFNRAPKSEAAKKESDLRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAALSEANVAFMIDKSVFRMVPLEKWYRFNAKPPFQPFTIDQAEAFMNRKVDVGRWVMKDEEKRAGQSDLEATRRLLYGRGQMIKTESATFKAASRSEKLEHDELDVSGDEFQDDDETPYFERVEDDDLKESKERIRREQLGANLFGEGDEQEVDKELQEQLREELERQKYGKSTKKALIKRDREDIYESDDSEEKPWSSSSDDESSAEEEEETNKDEEKKDADAKESQIETKDKAKGAGSKGSITPQSKQRPGELTKKTKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMKKSSASGNGSRAGTPAAQSNMARRSKAGHASTSDGEATAGEMSDSVVPVRKGVKMVGNSGKGTPVASRAGSPNPATAGVSPSTQTAGIEPWEILDKIPQDGIAITDLIKQFHGRVGDRPGQMSRGEWIKLVKQLCDYGPDKRLRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.61
3	0.67
4	0.72
5	0.75
6	0.8
7	0.82
8	0.85
9	0.87
10	0.91
11	0.91
12	0.92
13	0.93
14	0.93
15	0.93
16	0.92
17	0.9
18	0.89
19	0.84
20	0.82
21	0.81
22	0.78
23	0.69
24	0.63
25	0.63
26	0.58
27	0.54
28	0.54
29	0.55
30	0.59
31	0.61
32	0.65
33	0.66
34	0.64
35	0.65
36	0.59
37	0.55
38	0.48
39	0.49
40	0.43
41	0.37
42	0.33
43	0.31
44	0.34
45	0.3
46	0.28
47	0.22
48	0.21
49	0.19
50	0.21
51	0.24
52	0.23
53	0.26
54	0.3
55	0.34
56	0.38
57	0.38
58	0.36
59	0.38
60	0.37
61	0.32
62	0.31
63	0.28
64	0.28
65	0.31
66	0.33
67	0.32
68	0.31
69	0.32
70	0.34
71	0.36
72	0.38
73	0.37
74	0.33
75	0.3
76	0.31
77	0.34
78	0.29
79	0.27
80	0.22
81	0.21
82	0.22
83	0.25
84	0.25
85	0.27
86	0.28
87	0.31
88	0.38
89	0.37
90	0.35
91	0.35
92	0.32
93	0.31
94	0.32
95	0.32
96	0.31
97	0.32
98	0.37
99	0.35
100	0.4
101	0.4
102	0.38
103	0.37
104	0.32
105	0.32
106	0.27
107	0.29
108	0.26
109	0.23
110	0.23
111	0.2
112	0.2
113	0.21
114	0.22
115	0.18
116	0.21
117	0.29
118	0.34
119	0.4
120	0.43
121	0.47
122	0.53
123	0.62
124	0.64
125	0.65
126	0.64
127	0.63
128	0.68
129	0.67
130	0.62
131	0.57
132	0.56
133	0.52
134	0.51
135	0.47
136	0.4
137	0.37
138	0.35
139	0.33
140	0.26
141	0.22
142	0.17
143	0.18
144	0.16
145	0.15
146	0.17
147	0.15
148	0.14
149	0.13
150	0.16
151	0.14
152	0.16
153	0.17
154	0.17
155	0.19
156	0.27
157	0.29
158	0.29
159	0.31
160	0.29
161	0.3
162	0.31
163	0.3
164	0.24
165	0.22
166	0.21
167	0.2
168	0.2
169	0.18
170	0.15
171	0.17
172	0.17
173	0.2
174	0.29
175	0.31
176	0.39
177	0.49
178	0.56
179	0.63
180	0.72
181	0.78
182	0.8
183	0.87
184	0.87
185	0.88
186	0.88
187	0.89
188	0.86
189	0.86
190	0.8
191	0.77
192	0.71
193	0.61
194	0.56
195	0.49
196	0.47
197	0.45
198	0.46
199	0.44
200	0.41
201	0.41
202	0.47
203	0.47
204	0.44
205	0.39
206	0.35
207	0.32
208	0.31
209	0.31
210	0.24
211	0.23
212	0.2
213	0.18
214	0.16
215	0.13
216	0.11
217	0.11
218	0.12
219	0.14
220	0.13
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.11
226	0.09
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.07
235	0.07
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.05
243	0.06
244	0.07
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.12
249	0.12
250	0.16
251	0.21
252	0.26
253	0.26
254	0.29
255	0.32
256	0.36
257	0.36
258	0.4
259	0.44
260	0.44
261	0.49
262	0.51
263	0.52
264	0.45
265	0.47
266	0.41
267	0.38
268	0.35
269	0.28
270	0.23
271	0.21
272	0.2
273	0.18
274	0.18
275	0.13
276	0.1
277	0.1
278	0.11
279	0.1
280	0.11
281	0.14
282	0.16
283	0.2
284	0.21
285	0.22
286	0.22
287	0.25
288	0.28
289	0.27
290	0.28
291	0.24
292	0.24
293	0.25
294	0.24
295	0.2
296	0.18
297	0.2
298	0.17
299	0.17
300	0.17
301	0.16
302	0.16
303	0.16
304	0.15
305	0.12
306	0.11
307	0.14
308	0.18
309	0.21
310	0.21
311	0.21
312	0.22
313	0.22
314	0.21
315	0.18
316	0.14
317	0.12
318	0.14
319	0.13
320	0.13
321	0.15
322	0.17
323	0.17
324	0.18
325	0.19
326	0.2
327	0.22
328	0.24
329	0.23
330	0.21
331	0.21
332	0.19
333	0.16
334	0.15
335	0.13
336	0.1
337	0.08
338	0.08
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.07
347	0.07
348	0.08
349	0.08
350	0.07
351	0.08
352	0.08
353	0.12
354	0.13
355	0.14
356	0.17
357	0.17
358	0.19
359	0.19
360	0.19
361	0.2
362	0.24
363	0.26
364	0.3
365	0.38
366	0.41
367	0.44
368	0.47
369	0.47
370	0.45
371	0.42
372	0.35
373	0.27
374	0.22
375	0.18
376	0.14
377	0.09
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.06
383	0.06
384	0.05
385	0.07
386	0.08
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.13
392	0.14
393	0.14
394	0.2
395	0.22
396	0.25
397	0.25
398	0.26
399	0.28
400	0.35
401	0.42
402	0.39
403	0.43
404	0.45
405	0.54
406	0.57
407	0.63
408	0.66
409	0.67
410	0.66
411	0.67
412	0.63
413	0.56
414	0.54
415	0.45
416	0.41
417	0.34
418	0.3
419	0.24
420	0.24
421	0.22
422	0.19
423	0.2
424	0.13
425	0.12
426	0.12
427	0.12
428	0.13
429	0.13
430	0.17
431	0.18
432	0.19
433	0.18
434	0.19
435	0.19
436	0.17
437	0.16
438	0.12
439	0.09
440	0.1
441	0.1
442	0.11
443	0.11
444	0.12
445	0.14
446	0.15
447	0.17
448	0.18
449	0.21
450	0.25
451	0.26
452	0.28
453	0.29
454	0.3
455	0.33
456	0.31
457	0.28
458	0.27
459	0.27
460	0.26
461	0.29
462	0.31
463	0.27
464	0.28
465	0.3
466	0.31
467	0.33
468	0.37
469	0.32
470	0.31
471	0.31
472	0.32
473	0.36
474	0.32
475	0.33
476	0.36
477	0.43
478	0.46
479	0.47
480	0.48
481	0.5
482	0.53
483	0.58
484	0.59
485	0.6
486	0.59
487	0.65
488	0.66
489	0.63
490	0.66
491	0.65
492	0.64
493	0.62
494	0.65
495	0.62
496	0.6
497	0.57
498	0.51
499	0.45
500	0.36
501	0.29
502	0.22
503	0.23
504	0.22
505	0.21
506	0.23
507	0.22
508	0.27
509	0.36
510	0.41
511	0.39
512	0.45
513	0.55
514	0.61
515	0.66
516	0.71
517	0.72
518	0.75
519	0.75
520	0.7
521	0.65
522	0.55
523	0.48
524	0.38
525	0.29
526	0.22
527	0.18
528	0.19
529	0.16
530	0.18
531	0.18
532	0.23
533	0.3
534	0.33
535	0.32
536	0.29
537	0.31
538	0.35
539	0.43
540	0.4
541	0.36
542	0.36
543	0.4
544	0.41
545	0.38
546	0.32
547	0.23
548	0.2
549	0.15
550	0.13
551	0.09
552	0.08
553	0.05
554	0.05
555	0.06
556	0.06
557	0.07
558	0.07
559	0.1
560	0.11
561	0.13
562	0.15
563	0.17
564	0.18
565	0.21
566	0.27
567	0.26
568	0.33
569	0.39
570	0.41
571	0.4
572	0.39
573	0.38
574	0.31
575	0.29
576	0.23
577	0.19
578	0.18
579	0.17
580	0.19
581	0.21
582	0.24
583	0.28
584	0.28
585	0.27
586	0.25
587	0.25
588	0.24
589	0.21
590	0.21
591	0.18
592	0.17
593	0.16
594	0.15
595	0.15
596	0.14
597	0.14
598	0.11
599	0.12
600	0.12
601	0.13
602	0.12
603	0.12
604	0.15
605	0.15
606	0.14
607	0.17
608	0.17
609	0.17
610	0.18
611	0.17
612	0.14
613	0.14
614	0.15
615	0.12
616	0.11
617	0.1
618	0.15
619	0.16
620	0.16
621	0.17
622	0.17
623	0.17
624	0.2
625	0.26
626	0.22
627	0.27
628	0.34
629	0.41
630	0.42
631	0.45
632	0.43
633	0.4
634	0.39
635	0.35
636	0.32
637	0.29
638	0.28
639	0.27
640	0.29
641	0.3
642	0.36
643	0.37
644	0.35
645	0.33
646	0.36
647	0.35
648	0.39
649	0.37
650	0.38
651	0.44
652	0.5
653	0.55

A0A179F9P0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer