Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A219AR38

Protein Details
Accession A0A219AR38    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
227-248ISGSHGKKQRERERKVKQTIDFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-109RGGYGARVRGGRGSRRPR
233-241KKQRERERK
256-289ERTRGAPRGRGGRGGRGGERGGDRGRGGNFRGGR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.5, nucl 12.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSQVASQNRFAFLGNDDSGEDKPIAPVKTVDKATARTTKRNVEPQAPAAPTRGTGNRRGGPRGNEGAFRDRGAGSDRNHARSTDEASRDGPRGGYGARVRGGRGSRRPRENDDRHTSRTGVHPGSEKQAAQSWGANEGEAELKDEQAGEAIAQSEKKDALAEDAAGEEPAEPEDKSVSYADYLAQQAEKKLSLEGGFKVREANEGSKLDKKWAGAKALEKAEDEDFISGSHGKKQRERERKVKQTIDFDPRFVEPERTRGAPRGRGGRGGRGGERGGDRGRGGNFRGGRGGAANINTKDESAFPSLGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.19
4 0.2
5 0.2
6 0.21
7 0.19
8 0.13
9 0.15
10 0.2
11 0.21
12 0.2
13 0.23
14 0.25
15 0.32
16 0.33
17 0.34
18 0.33
19 0.35
20 0.41
21 0.47
22 0.47
23 0.48
24 0.53
25 0.57
26 0.61
27 0.67
28 0.65
29 0.63
30 0.63
31 0.6
32 0.61
33 0.54
34 0.47
35 0.4
36 0.35
37 0.29
38 0.28
39 0.3
40 0.27
41 0.32
42 0.39
43 0.43
44 0.46
45 0.51
46 0.52
47 0.5
48 0.53
49 0.53
50 0.46
51 0.45
52 0.45
53 0.45
54 0.41
55 0.37
56 0.32
57 0.25
58 0.24
59 0.25
60 0.27
61 0.22
62 0.31
63 0.35
64 0.37
65 0.38
66 0.37
67 0.35
68 0.31
69 0.35
70 0.33
71 0.32
72 0.29
73 0.3
74 0.32
75 0.31
76 0.29
77 0.23
78 0.16
79 0.15
80 0.13
81 0.17
82 0.16
83 0.18
84 0.21
85 0.21
86 0.21
87 0.25
88 0.3
89 0.31
90 0.39
91 0.46
92 0.51
93 0.59
94 0.63
95 0.67
96 0.73
97 0.73
98 0.73
99 0.72
100 0.7
101 0.66
102 0.63
103 0.56
104 0.47
105 0.43
106 0.4
107 0.31
108 0.27
109 0.26
110 0.25
111 0.28
112 0.28
113 0.23
114 0.18
115 0.21
116 0.21
117 0.18
118 0.19
119 0.15
120 0.16
121 0.16
122 0.15
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.08
127 0.1
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.03
136 0.03
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.14
182 0.17
183 0.17
184 0.17
185 0.18
186 0.17
187 0.18
188 0.19
189 0.2
190 0.21
191 0.22
192 0.25
193 0.29
194 0.29
195 0.3
196 0.28
197 0.27
198 0.28
199 0.3
200 0.32
201 0.29
202 0.32
203 0.35
204 0.36
205 0.36
206 0.3
207 0.28
208 0.25
209 0.23
210 0.2
211 0.14
212 0.11
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.18
218 0.23
219 0.27
220 0.33
221 0.44
222 0.53
223 0.61
224 0.69
225 0.72
226 0.78
227 0.84
228 0.87
229 0.85
230 0.8
231 0.77
232 0.77
233 0.76
234 0.67
235 0.57
236 0.5
237 0.43
238 0.4
239 0.34
240 0.35
241 0.26
242 0.31
243 0.34
244 0.35
245 0.36
246 0.41
247 0.46
248 0.45
249 0.49
250 0.52
251 0.5
252 0.56
253 0.56
254 0.57
255 0.56
256 0.54
257 0.5
258 0.44
259 0.43
260 0.39
261 0.38
262 0.34
263 0.3
264 0.28
265 0.27
266 0.28
267 0.31
268 0.31
269 0.31
270 0.34
271 0.34
272 0.33
273 0.36
274 0.31
275 0.29
276 0.26
277 0.26
278 0.22
279 0.23
280 0.28
281 0.26
282 0.29
283 0.29
284 0.27
285 0.25
286 0.23
287 0.24
288 0.22