Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179FVQ1

Protein Details
Accession A0A179FVQ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
479-502EREWEEARLRRRQKRKDGVTDGATBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
488-493RRRQKR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11.5, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPQSQVPPRVFSPPQHSPSPGGSQPGFAMPPNKRVRTDGGPASQPGSPYAISPYAASPGAAGSPPLNAASPTYSATTPVSSGYNTPYTNGHNATGLNLPDARAGTSTPPLHTPQPPPISMPQYTNATMAPVPQTTASPVPGPSVMGPPQRPAERPAKDYEYDVTDSLAGTGIDLRAEEQYMSELYSNAMDANSEARTGFAQHPPGAKSSFYGAGPANQPAETASEQDQKQLAVKAAEQAWADSSMRLAVQRTQEINDPFLLVAILHRRAEKIARENHIGLNLDMKNNAQTMGKMRLPEQFPSPKVTVKVEPGPDSTMVHTTGSYIPHDSYLVDQLALMSIATKQRLREMVEDADGVAVNRQKTSHGEISEDWATAAAPMNVEPLGAAAETDPAVQEAGEDGVAVPSDTAPLKREYLYVLLYFYLFSLFHDIAGYLTGSNSKIGSADEAALGNGTKPSKMAKISSFMTVTMRELARQEREWEEARLRRRQKRKDGVTDGATPSRSGSVAPGTPGSVAPESDKPMTKKEMKKNQALKAAEANSHANQNLTSSMFAGLGGKSNLFGKKKGAKTYDWMNVGRGGSGTSTPTRATPGAGGKGINGTPGTPSPANLAMTTEGRNRLGTWREDKEKGKNIQLRDWVVVLERDGREAKALQQAYMHLDASNPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.5
3 0.54
4 0.54
5 0.54
6 0.5
7 0.52
8 0.53
9 0.46
10 0.43
11 0.38
12 0.35
13 0.34
14 0.33
15 0.29
16 0.24
17 0.3
18 0.27
19 0.37
20 0.44
21 0.48
22 0.47
23 0.49
24 0.54
25 0.53
26 0.57
27 0.55
28 0.52
29 0.51
30 0.5
31 0.48
32 0.43
33 0.36
34 0.3
35 0.25
36 0.19
37 0.16
38 0.19
39 0.19
40 0.18
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.18
45 0.17
46 0.12
47 0.11
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.08
52 0.09
53 0.1
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.11
58 0.13
59 0.14
60 0.15
61 0.16
62 0.16
63 0.17
64 0.18
65 0.18
66 0.16
67 0.16
68 0.15
69 0.14
70 0.15
71 0.18
72 0.22
73 0.21
74 0.22
75 0.23
76 0.26
77 0.3
78 0.31
79 0.27
80 0.23
81 0.23
82 0.24
83 0.25
84 0.22
85 0.19
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.17
90 0.15
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.2
95 0.21
96 0.21
97 0.23
98 0.26
99 0.3
100 0.35
101 0.37
102 0.39
103 0.43
104 0.42
105 0.43
106 0.46
107 0.47
108 0.43
109 0.41
110 0.36
111 0.35
112 0.35
113 0.32
114 0.26
115 0.23
116 0.21
117 0.19
118 0.18
119 0.14
120 0.13
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.16
125 0.16
126 0.15
127 0.15
128 0.16
129 0.15
130 0.16
131 0.14
132 0.17
133 0.2
134 0.24
135 0.25
136 0.27
137 0.32
138 0.34
139 0.34
140 0.35
141 0.41
142 0.4
143 0.42
144 0.45
145 0.45
146 0.43
147 0.43
148 0.4
149 0.34
150 0.31
151 0.28
152 0.22
153 0.17
154 0.16
155 0.14
156 0.12
157 0.08
158 0.06
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.11
187 0.14
188 0.16
189 0.19
190 0.21
191 0.24
192 0.25
193 0.27
194 0.25
195 0.22
196 0.19
197 0.19
198 0.19
199 0.15
200 0.17
201 0.15
202 0.17
203 0.18
204 0.19
205 0.17
206 0.14
207 0.14
208 0.12
209 0.15
210 0.12
211 0.13
212 0.15
213 0.2
214 0.21
215 0.23
216 0.23
217 0.2
218 0.22
219 0.22
220 0.2
221 0.14
222 0.15
223 0.16
224 0.16
225 0.18
226 0.16
227 0.14
228 0.14
229 0.15
230 0.14
231 0.11
232 0.1
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.11
238 0.13
239 0.17
240 0.18
241 0.19
242 0.24
243 0.24
244 0.25
245 0.21
246 0.18
247 0.15
248 0.13
249 0.12
250 0.07
251 0.07
252 0.09
253 0.12
254 0.12
255 0.13
256 0.13
257 0.14
258 0.18
259 0.21
260 0.25
261 0.29
262 0.32
263 0.35
264 0.36
265 0.36
266 0.35
267 0.31
268 0.24
269 0.23
270 0.2
271 0.17
272 0.16
273 0.16
274 0.14
275 0.13
276 0.14
277 0.08
278 0.08
279 0.11
280 0.16
281 0.18
282 0.17
283 0.18
284 0.23
285 0.25
286 0.25
287 0.27
288 0.28
289 0.27
290 0.31
291 0.32
292 0.28
293 0.28
294 0.29
295 0.26
296 0.24
297 0.28
298 0.25
299 0.25
300 0.24
301 0.24
302 0.21
303 0.2
304 0.17
305 0.14
306 0.13
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.09
318 0.08
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.03
328 0.04
329 0.06
330 0.08
331 0.09
332 0.09
333 0.12
334 0.15
335 0.17
336 0.18
337 0.2
338 0.2
339 0.2
340 0.19
341 0.16
342 0.14
343 0.11
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.09
351 0.12
352 0.17
353 0.2
354 0.19
355 0.2
356 0.2
357 0.25
358 0.24
359 0.22
360 0.16
361 0.12
362 0.11
363 0.09
364 0.1
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.03
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.03
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.04
396 0.05
397 0.06
398 0.08
399 0.1
400 0.11
401 0.12
402 0.13
403 0.13
404 0.15
405 0.16
406 0.14
407 0.13
408 0.12
409 0.11
410 0.11
411 0.09
412 0.08
413 0.06
414 0.06
415 0.1
416 0.1
417 0.1
418 0.1
419 0.1
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.05
424 0.05
425 0.06
426 0.06
427 0.07
428 0.07
429 0.06
430 0.07
431 0.07
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.06
441 0.08
442 0.08
443 0.07
444 0.08
445 0.1
446 0.14
447 0.16
448 0.2
449 0.2
450 0.24
451 0.26
452 0.28
453 0.27
454 0.24
455 0.23
456 0.2
457 0.19
458 0.18
459 0.17
460 0.15
461 0.16
462 0.2
463 0.22
464 0.23
465 0.26
466 0.24
467 0.28
468 0.29
469 0.31
470 0.34
471 0.35
472 0.4
473 0.47
474 0.54
475 0.59
476 0.67
477 0.74
478 0.78
479 0.83
480 0.86
481 0.87
482 0.85
483 0.82
484 0.76
485 0.71
486 0.63
487 0.56
488 0.46
489 0.36
490 0.29
491 0.24
492 0.19
493 0.14
494 0.12
495 0.13
496 0.13
497 0.15
498 0.14
499 0.14
500 0.14
501 0.14
502 0.15
503 0.12
504 0.12
505 0.14
506 0.16
507 0.19
508 0.22
509 0.27
510 0.26
511 0.3
512 0.37
513 0.43
514 0.5
515 0.57
516 0.65
517 0.67
518 0.75
519 0.79
520 0.79
521 0.78
522 0.7
523 0.63
524 0.59
525 0.55
526 0.47
527 0.41
528 0.37
529 0.3
530 0.31
531 0.29
532 0.21
533 0.19
534 0.18
535 0.17
536 0.14
537 0.13
538 0.11
539 0.12
540 0.11
541 0.11
542 0.11
543 0.09
544 0.11
545 0.11
546 0.11
547 0.11
548 0.15
549 0.21
550 0.22
551 0.23
552 0.29
553 0.38
554 0.44
555 0.52
556 0.52
557 0.49
558 0.52
559 0.59
560 0.59
561 0.55
562 0.5
563 0.43
564 0.43
565 0.4
566 0.35
567 0.26
568 0.19
569 0.15
570 0.15
571 0.17
572 0.14
573 0.16
574 0.16
575 0.17
576 0.2
577 0.2
578 0.2
579 0.21
580 0.25
581 0.27
582 0.28
583 0.27
584 0.24
585 0.27
586 0.26
587 0.23
588 0.17
589 0.14
590 0.15
591 0.17
592 0.22
593 0.18
594 0.19
595 0.21
596 0.24
597 0.25
598 0.22
599 0.23
600 0.2
601 0.22
602 0.25
603 0.26
604 0.26
605 0.26
606 0.27
607 0.26
608 0.3
609 0.34
610 0.38
611 0.41
612 0.46
613 0.51
614 0.58
615 0.63
616 0.65
617 0.69
618 0.68
619 0.7
620 0.68
621 0.66
622 0.67
623 0.68
624 0.63
625 0.56
626 0.5
627 0.41
628 0.37
629 0.34
630 0.27
631 0.27
632 0.23
633 0.25
634 0.26
635 0.25
636 0.26
637 0.26
638 0.29
639 0.3
640 0.31
641 0.27
642 0.28
643 0.29
644 0.32
645 0.33
646 0.29
647 0.2