Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179FXT1

Protein Details
Accession A0A179FXT1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
326-349NPPSSPQTQRTHRKHPRRDDLDEHBasic
422-451LASWKPNRRGNYHRKRRRWARTNEIVDKTRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
428-440NRRGNYHRKRRRW
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 11.5, cyto 3.5, nucl 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSRNVVQPNGWVALRLPNETLRVLQVTPNTCVTAIAHTAPPQFRPVPLTVVLFCRTISLGKYGSFPSNLLIERPFHLTYEIQEKRDGEKFSRLRVVPGTELNADILAETNQNEPTDGEAAIVAGEGEELALVDETGKVVARSNREVIDDSARQTLTADEIEVLKRKGAAAGKDLIAKLMLSHTAIDQKTTYSLAKYKLLKERKFLRRFTVLPLDVVLLGQWLLEDRDAGKILEMRLEMMGLLGCWADVHFGGEPVSGVSEPHGGRWLAVDDTGGLLVAAMAERMGILHPEPTREDDEDASENHGERQQTEALHEQADTNGTSEQHNPPSSPQTQRTHRKHPRRDDLDEHYALTNTITLIHTNSQPNLSILRYFDYDATDANPSYPYHPLFTNLLPISWLQLVDPAEDAVYFEKPEDITSEQLASWKPNRRGNYHRKRRRWARTNEIVDKTRAGGFTGLAVASTMDPISILRQVLPLLSGGSPIAIYSPTIEPLAQLVDCFSIGRRAAWVSSPPAEAEGKSQAELDRWGGTREFPINPTLVLGASVQSSRARRWQVLPGRTHPFMTSRGGADGFLFTGWRTIPAEGRISARGKFQKKKVDGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.26
4 0.26
5 0.29
6 0.29
7 0.29
8 0.24
9 0.25
10 0.23
11 0.25
12 0.28
13 0.29
14 0.31
15 0.31
16 0.29
17 0.26
18 0.26
19 0.24
20 0.21
21 0.2
22 0.2
23 0.2
24 0.22
25 0.28
26 0.3
27 0.3
28 0.32
29 0.31
30 0.3
31 0.33
32 0.31
33 0.3
34 0.31
35 0.32
36 0.28
37 0.31
38 0.31
39 0.27
40 0.24
41 0.21
42 0.2
43 0.18
44 0.18
45 0.18
46 0.18
47 0.19
48 0.22
49 0.23
50 0.25
51 0.25
52 0.23
53 0.21
54 0.23
55 0.23
56 0.22
57 0.21
58 0.2
59 0.21
60 0.26
61 0.25
62 0.2
63 0.22
64 0.21
65 0.22
66 0.31
67 0.33
68 0.3
69 0.33
70 0.34
71 0.36
72 0.42
73 0.42
74 0.35
75 0.41
76 0.43
77 0.45
78 0.52
79 0.47
80 0.45
81 0.46
82 0.46
83 0.39
84 0.38
85 0.36
86 0.28
87 0.28
88 0.24
89 0.2
90 0.16
91 0.12
92 0.1
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.1
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.14
103 0.13
104 0.11
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.05
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.02
114 0.02
115 0.02
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.09
126 0.14
127 0.18
128 0.22
129 0.25
130 0.26
131 0.27
132 0.29
133 0.28
134 0.31
135 0.28
136 0.26
137 0.27
138 0.25
139 0.23
140 0.21
141 0.19
142 0.15
143 0.13
144 0.11
145 0.08
146 0.1
147 0.12
148 0.15
149 0.15
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.17
154 0.19
155 0.2
156 0.2
157 0.23
158 0.24
159 0.26
160 0.26
161 0.22
162 0.18
163 0.15
164 0.12
165 0.1
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.15
171 0.15
172 0.16
173 0.15
174 0.14
175 0.15
176 0.17
177 0.17
178 0.13
179 0.17
180 0.19
181 0.25
182 0.28
183 0.33
184 0.41
185 0.5
186 0.5
187 0.54
188 0.62
189 0.66
190 0.7
191 0.66
192 0.63
193 0.61
194 0.59
195 0.57
196 0.56
197 0.46
198 0.38
199 0.36
200 0.3
201 0.23
202 0.21
203 0.15
204 0.06
205 0.05
206 0.04
207 0.03
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.1
218 0.1
219 0.12
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.07
226 0.06
227 0.04
228 0.04
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.06
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.03
262 0.03
263 0.02
264 0.02
265 0.02
266 0.02
267 0.02
268 0.02
269 0.02
270 0.02
271 0.02
272 0.03
273 0.03
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.1
278 0.13
279 0.15
280 0.16
281 0.17
282 0.13
283 0.15
284 0.15
285 0.15
286 0.14
287 0.12
288 0.11
289 0.11
290 0.13
291 0.11
292 0.1
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.14
297 0.16
298 0.14
299 0.15
300 0.14
301 0.12
302 0.1
303 0.11
304 0.09
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.12
310 0.14
311 0.18
312 0.18
313 0.18
314 0.19
315 0.24
316 0.27
317 0.29
318 0.33
319 0.36
320 0.45
321 0.55
322 0.6
323 0.66
324 0.72
325 0.78
326 0.8
327 0.83
328 0.85
329 0.82
330 0.81
331 0.76
332 0.73
333 0.7
334 0.6
335 0.51
336 0.4
337 0.33
338 0.27
339 0.21
340 0.13
341 0.06
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.08
346 0.09
347 0.13
348 0.14
349 0.15
350 0.14
351 0.15
352 0.15
353 0.15
354 0.14
355 0.12
356 0.11
357 0.12
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.11
364 0.12
365 0.12
366 0.11
367 0.11
368 0.11
369 0.1
370 0.12
371 0.15
372 0.14
373 0.15
374 0.15
375 0.17
376 0.18
377 0.18
378 0.23
379 0.19
380 0.18
381 0.17
382 0.17
383 0.16
384 0.14
385 0.14
386 0.07
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.09
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.06
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.11
403 0.11
404 0.12
405 0.13
406 0.14
407 0.13
408 0.15
409 0.16
410 0.17
411 0.22
412 0.29
413 0.35
414 0.41
415 0.45
416 0.5
417 0.6
418 0.67
419 0.72
420 0.74
421 0.79
422 0.82
423 0.88
424 0.92
425 0.92
426 0.92
427 0.9
428 0.89
429 0.89
430 0.88
431 0.86
432 0.82
433 0.73
434 0.64
435 0.55
436 0.47
437 0.39
438 0.29
439 0.22
440 0.16
441 0.13
442 0.12
443 0.12
444 0.1
445 0.08
446 0.07
447 0.07
448 0.06
449 0.07
450 0.05
451 0.04
452 0.05
453 0.05
454 0.07
455 0.08
456 0.09
457 0.09
458 0.1
459 0.1
460 0.1
461 0.11
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.08
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.06
470 0.07
471 0.05
472 0.05
473 0.08
474 0.09
475 0.1
476 0.11
477 0.11
478 0.1
479 0.11
480 0.13
481 0.1
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.12
489 0.13
490 0.14
491 0.15
492 0.16
493 0.17
494 0.19
495 0.22
496 0.21
497 0.23
498 0.24
499 0.22
500 0.23
501 0.23
502 0.21
503 0.21
504 0.22
505 0.21
506 0.2
507 0.22
508 0.2
509 0.2
510 0.22
511 0.21
512 0.19
513 0.19
514 0.21
515 0.2
516 0.21
517 0.24
518 0.26
519 0.26
520 0.23
521 0.24
522 0.23
523 0.22
524 0.22
525 0.18
526 0.14
527 0.12
528 0.11
529 0.09
530 0.1
531 0.1
532 0.11
533 0.15
534 0.18
535 0.21
536 0.28
537 0.33
538 0.36
539 0.41
540 0.49
541 0.54
542 0.6
543 0.63
544 0.63
545 0.65
546 0.62
547 0.59
548 0.51
549 0.44
550 0.4
551 0.38
552 0.34
553 0.28
554 0.29
555 0.28
556 0.26
557 0.23
558 0.21
559 0.16
560 0.13
561 0.12
562 0.09
563 0.11
564 0.11
565 0.13
566 0.13
567 0.15
568 0.19
569 0.23
570 0.27
571 0.27
572 0.3
573 0.33
574 0.34
575 0.34
576 0.39
577 0.44
578 0.5
579 0.57
580 0.63
581 0.67