FuNGI

A0A179EZ39

Protein Details

Accession

A0A179EZ39

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
36-60	EAAKEYHHAVRKQKRRHWEEFLAED	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-22	RR
46-49	RKQK

Subcellular Location(s)

mito 18, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MDLTRLRQIYTFWRNQARARRRAGPLAPDLERKASEAAKEYHHAVRKQKRRHWEEFLAEDGNIWRASKYLGRRSANLEEKVPPLKKEDGMTTTGRLEQAEELLRTFFPPLPIQIEDELEGPPRAPLAWPELTMEEVERKVMAAKPWKAPGDDGLPATVWKELWPVVKERVLHLFRLSLGSGELPRQWRSARIIPLKKPDKDDYTAARAWRPISLLSTLGKVLEAVVAERISYMVETHGLLPANHFGARKRRSAEQALILLQENIYRAWRMGKVLSLVSFDVKGAYNGVFRERLLQRLAARGLPGQLVRWVDAFCSGRTASIDVNGYHSPQKPLPQAGLPQGSPLSPILFLFFNADLVQTSISTTEGAIAFVDDYSAWVTGKTAEANRDGIQAIIDRAVAWARRSGATFEGSKTAVIHFTRTARRGSQNNFVVNGQTIQPKDTAKVLGVVLDAELRYKEHIAEAAAKGLSVAMQLKRLRGLSPRVARQLFAAAVAPAMDYASNVWTHACGEKETIWLSQAQAVGAQAVTGAFRSVAAAIAEAEASIEPVLQRHARAAAKTWTSLRTLPSEHPLARLSIRICQRFTSPMQKMARRYRDGAGEWLEVIQEFAMAPWEGRIRVVCDVDRDEAAEAARTARGVVISTSSSERGGMVGMGGYVEYVTAKGKRDVLVRFSVTLGPREDVNPYMAELEAMAWAFRYVPVKLPHRNVVIVSSNRAAVQVVGQPRQQSGQRAVQEVYRQARLPHLRDVPVSVLWVPAGHEGFRPGAAAKTAAREATKDGCVREKARYQARSTRTRLLLGQQQQQRQRIPIGVGRHSQRIDTALPGKHTRTIYDALSAKESRILVQLRTGKCRLNRYLHSIRATGSDQCSCGQAAETVEHFLFRCRRWNSEREDMIRYERTKVGNLSFFLGGKSGSDGEGWKPDMAAVRTTIKFAMATGRLDADI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.65
3	0.73
4	0.73
5	0.73
6	0.73
7	0.74
8	0.71
9	0.76
10	0.73
11	0.7
12	0.67
13	0.65
14	0.61
15	0.58
16	0.55
17	0.5
18	0.45
19	0.39
20	0.36
21	0.32
22	0.31
23	0.32
24	0.32
25	0.32
26	0.35
27	0.37
28	0.4
29	0.45
30	0.48
31	0.52
32	0.6
33	0.65
34	0.73
35	0.77
36	0.8
37	0.82
38	0.85
39	0.84
40	0.83
41	0.8
42	0.73
43	0.69
44	0.6
45	0.51
46	0.43
47	0.34
48	0.28
49	0.21
50	0.18
51	0.13
52	0.12
53	0.15
54	0.2
55	0.28
56	0.34
57	0.43
58	0.46
59	0.5
60	0.56
61	0.64
62	0.66
63	0.6
64	0.54
65	0.48
66	0.49
67	0.55
68	0.51
69	0.43
70	0.39
71	0.41
72	0.41
73	0.4
74	0.42
75	0.37
76	0.38
77	0.38
78	0.36
79	0.33
80	0.32
81	0.29
82	0.23
83	0.21
84	0.18
85	0.2
86	0.22
87	0.2
88	0.19
89	0.19
90	0.19
91	0.18
92	0.2
93	0.18
94	0.17
95	0.18
96	0.2
97	0.23
98	0.24
99	0.26
100	0.25
101	0.25
102	0.22
103	0.21
104	0.19
105	0.17
106	0.16
107	0.13
108	0.12
109	0.1
110	0.1
111	0.1
112	0.11
113	0.16
114	0.18
115	0.18
116	0.2
117	0.21
118	0.21
119	0.21
120	0.2
121	0.17
122	0.15
123	0.15
124	0.13
125	0.12
126	0.14
127	0.17
128	0.22
129	0.28
130	0.33
131	0.38
132	0.45
133	0.47
134	0.45
135	0.43
136	0.41
137	0.37
138	0.35
139	0.29
140	0.24
141	0.22
142	0.21
143	0.2
144	0.17
145	0.11
146	0.09
147	0.1
148	0.12
149	0.18
150	0.2
151	0.23
152	0.27
153	0.3
154	0.31
155	0.31
156	0.38
157	0.35
158	0.34
159	0.31
160	0.28
161	0.25
162	0.27
163	0.24
164	0.15
165	0.13
166	0.14
167	0.14
168	0.14
169	0.17
170	0.18
171	0.2
172	0.23
173	0.23
174	0.26
175	0.31
176	0.37
177	0.42
178	0.49
179	0.56
180	0.59
181	0.69
182	0.73
183	0.7
184	0.7
185	0.67
186	0.62
187	0.58
188	0.57
189	0.52
190	0.51
191	0.5
192	0.45
193	0.41
194	0.37
195	0.34
196	0.29
197	0.25
198	0.19
199	0.19
200	0.19
201	0.18
202	0.17
203	0.17
204	0.16
205	0.15
206	0.13
207	0.11
208	0.09
209	0.08
210	0.07
211	0.06
212	0.08
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.07
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.05
221	0.06
222	0.07
223	0.08
224	0.1
225	0.11
226	0.11
227	0.12
228	0.13
229	0.14
230	0.15
231	0.16
232	0.17
233	0.26
234	0.3
235	0.35
236	0.36
237	0.4
238	0.44
239	0.5
240	0.5
241	0.46
242	0.45
243	0.4
244	0.38
245	0.33
246	0.27
247	0.21
248	0.17
249	0.12
250	0.09
251	0.1
252	0.09
253	0.09
254	0.12
255	0.13
256	0.14
257	0.15
258	0.16
259	0.17
260	0.18
261	0.18
262	0.17
263	0.16
264	0.15
265	0.14
266	0.12
267	0.11
268	0.1
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.1
273	0.1
274	0.13
275	0.13
276	0.12
277	0.2
278	0.2
279	0.22
280	0.22
281	0.25
282	0.24
283	0.28
284	0.3
285	0.23
286	0.23
287	0.2
288	0.2
289	0.18
290	0.17
291	0.12
292	0.14
293	0.14
294	0.14
295	0.14
296	0.13
297	0.11
298	0.16
299	0.17
300	0.13
301	0.16
302	0.15
303	0.15
304	0.15
305	0.17
306	0.12
307	0.13
308	0.15
309	0.12
310	0.16
311	0.16
312	0.17
313	0.2
314	0.21
315	0.22
316	0.21
317	0.27
318	0.26
319	0.27
320	0.28
321	0.26
322	0.27
323	0.29
324	0.3
325	0.24
326	0.22
327	0.21
328	0.19
329	0.17
330	0.15
331	0.11
332	0.08
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.1
338	0.09
339	0.09
340	0.09
341	0.09
342	0.07
343	0.08
344	0.08
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.07
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.05
358	0.06
359	0.03
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.06
367	0.07
368	0.08
369	0.09
370	0.11
371	0.13
372	0.15
373	0.15
374	0.16
375	0.15
376	0.13
377	0.12
378	0.1
379	0.09
380	0.07
381	0.07
382	0.05
383	0.06
384	0.07
385	0.08
386	0.08
387	0.09
388	0.1
389	0.11
390	0.12
391	0.13
392	0.13
393	0.15
394	0.15
395	0.14
396	0.15
397	0.14
398	0.14
399	0.13
400	0.12
401	0.13
402	0.12
403	0.13
404	0.13
405	0.18
406	0.22
407	0.23
408	0.25
409	0.25
410	0.3
411	0.35
412	0.37
413	0.41
414	0.42
415	0.41
416	0.4
417	0.36
418	0.31
419	0.26
420	0.22
421	0.15
422	0.13
423	0.12
424	0.12
425	0.13
426	0.13
427	0.14
428	0.14
429	0.13
430	0.1
431	0.12
432	0.11
433	0.1
434	0.09
435	0.08
436	0.07
437	0.07
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.07
448	0.1
449	0.1
450	0.11
451	0.11
452	0.1
453	0.1
454	0.09
455	0.08
456	0.05
457	0.07
458	0.06
459	0.12
460	0.13
461	0.14
462	0.16
463	0.16
464	0.17
465	0.19
466	0.23
467	0.26
468	0.3
469	0.34
470	0.38
471	0.38
472	0.36
473	0.33
474	0.3
475	0.22
476	0.17
477	0.13
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.06
482	0.04
483	0.04
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.04
488	0.04
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.06
493	0.08
494	0.08
495	0.07
496	0.09
497	0.1
498	0.11
499	0.12
500	0.11
501	0.1
502	0.1
503	0.1
504	0.11
505	0.11
506	0.09
507	0.08
508	0.08
509	0.08
510	0.07
511	0.06
512	0.04
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.03
517	0.03
518	0.03
519	0.03
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.05
526	0.05
527	0.04
528	0.04
529	0.03
530	0.04
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.04
535	0.06
536	0.07
537	0.07
538	0.08
539	0.13
540	0.15
541	0.15
542	0.19
543	0.22
544	0.22
545	0.24
546	0.25
547	0.21
548	0.22
549	0.23
550	0.22
551	0.19
552	0.21
553	0.21
554	0.23
555	0.25
556	0.24
557	0.24
558	0.23
559	0.22
560	0.2
561	0.21
562	0.18
563	0.2
564	0.26
565	0.27
566	0.27
567	0.27
568	0.28
569	0.29
570	0.32
571	0.36
572	0.32
573	0.36
574	0.41
575	0.45
576	0.51
577	0.56
578	0.61
579	0.55
580	0.55
581	0.5
582	0.49
583	0.46
584	0.42
585	0.36
586	0.28
587	0.24
588	0.21
589	0.18
590	0.13
591	0.11
592	0.07
593	0.04
594	0.03
595	0.03
596	0.05
597	0.05
598	0.05
599	0.06
600	0.08
601	0.08
602	0.09
603	0.1
604	0.1
605	0.13
606	0.15
607	0.15
608	0.16
609	0.19
610	0.19
611	0.19
612	0.17
613	0.14
614	0.13
615	0.12
616	0.1
617	0.08
618	0.08
619	0.08
620	0.07
621	0.07
622	0.07
623	0.07
624	0.06
625	0.07
626	0.07
627	0.08
628	0.09
629	0.11
630	0.11
631	0.11
632	0.11
633	0.1
634	0.09
635	0.08
636	0.07
637	0.05
638	0.04
639	0.04
640	0.04
641	0.03
642	0.03
643	0.03
644	0.03
645	0.03
646	0.03
647	0.06
648	0.08
649	0.11
650	0.13
651	0.16
652	0.18
653	0.24
654	0.26
655	0.29
656	0.32
657	0.31
658	0.3
659	0.29
660	0.3
661	0.26
662	0.26
663	0.23
664	0.19
665	0.18
666	0.18
667	0.19
668	0.16
669	0.16
670	0.13
671	0.12
672	0.12
673	0.11
674	0.1
675	0.08
676	0.07
677	0.06
678	0.06
679	0.05
680	0.05
681	0.05
682	0.05
683	0.07
684	0.09
685	0.09
686	0.16
687	0.23
688	0.3
689	0.36
690	0.41
691	0.45
692	0.46
693	0.46
694	0.4
695	0.38
696	0.38
697	0.33
698	0.32
699	0.27
700	0.25
701	0.24
702	0.23
703	0.19
704	0.12
705	0.12
706	0.14
707	0.17
708	0.19
709	0.21
710	0.22
711	0.22
712	0.26
713	0.27
714	0.27
715	0.28
716	0.33
717	0.35
718	0.37
719	0.37
720	0.36
721	0.37
722	0.39
723	0.37
724	0.32
725	0.3
726	0.28
727	0.36
728	0.4
729	0.4
730	0.41
731	0.43
732	0.42
733	0.41
734	0.43
735	0.37
736	0.3
737	0.28
738	0.2
739	0.16
740	0.13
741	0.13
742	0.11
743	0.12
744	0.12
745	0.11
746	0.12
747	0.13
748	0.14
749	0.14
750	0.14
751	0.11
752	0.11
753	0.11
754	0.13
755	0.12
756	0.15
757	0.17
758	0.18
759	0.18
760	0.18
761	0.21
762	0.24
763	0.28
764	0.26
765	0.27
766	0.31
767	0.36
768	0.38
769	0.41
770	0.42
771	0.46
772	0.53
773	0.56
774	0.57
775	0.6
776	0.66
777	0.68
778	0.68
779	0.68
780	0.61
781	0.58
782	0.54
783	0.51
784	0.52
785	0.49
786	0.52
787	0.5
788	0.55
789	0.59
790	0.63
791	0.6
792	0.55
793	0.51
794	0.46
795	0.43
796	0.41
797	0.4
798	0.4
799	0.42
800	0.43
801	0.46
802	0.43
803	0.4
804	0.36
805	0.33
806	0.29
807	0.29
808	0.32
809	0.29
810	0.33
811	0.37
812	0.37
813	0.4
814	0.39
815	0.35
816	0.33
817	0.33
818	0.29
819	0.32
820	0.33
821	0.29
822	0.34
823	0.33
824	0.28
825	0.29
826	0.28
827	0.23
828	0.26
829	0.27
830	0.22
831	0.3
832	0.37
833	0.37
834	0.44
835	0.45
836	0.45
837	0.49
838	0.57
839	0.57
840	0.59
841	0.6
842	0.63
843	0.69
844	0.69
845	0.67
846	0.6
847	0.52
848	0.48
849	0.45
850	0.4
851	0.36
852	0.31
853	0.28
854	0.28
855	0.28
856	0.24
857	0.22
858	0.18
859	0.15
860	0.15
861	0.16
862	0.16
863	0.18
864	0.18
865	0.18
866	0.17
867	0.22
868	0.26
869	0.26
870	0.35
871	0.35
872	0.44
873	0.5
874	0.58
875	0.6
876	0.64
877	0.7
878	0.65
879	0.67
880	0.61
881	0.61
882	0.61
883	0.54
884	0.48
885	0.45
886	0.43
887	0.43
888	0.44
889	0.44
890	0.42
891	0.41
892	0.4
893	0.37
894	0.34
895	0.3
896	0.26
897	0.19
898	0.14
899	0.16
900	0.13
901	0.11
902	0.12
903	0.14
904	0.16
905	0.22
906	0.23
907	0.21
908	0.2
909	0.22
910	0.27
911	0.27
912	0.27
913	0.24
914	0.29
915	0.3
916	0.32
917	0.3
918	0.24
919	0.22
920	0.21
921	0.25
922	0.21
923	0.22
924	0.22

A0A179EZ39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer