Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179FFD0

Protein Details
Accession A0A179FFD0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-71EYQGRKRKGFEDYVRRNRINHydrophilic
614-640DIDNVQRQMPRRTKKRRLLEDDTYEEYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 9.5, cyto_mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MESSRGPPRVKNKAAAPVQISAEQLLREAVDRQEVGIETPTQKFTDLEELHEYQGRKRKGFEDYVRRNRINLKNWTQYAQWELEQKEFARARSVFERALDVLPHNVVLWIRYIEAEMKSRNINHARNLLDRAVTILPRVDKLWYKYVYMEEMLGNIPGTRQVFDRWMQWQPDEAAWSAYIKLEKRYGEFERARAIFESFTVVHPEPRNWIKWAKFEEEYGTSELVREVFGNAVESLGDEFVDERLFIAYARFESKLNEYERARAIYKYALDRLPRSKSVLLHKAYTTFEKQFGDKDGVEDVVLSKRRVYYEEQVKENPKNYDAWFDYAGLEESSRDVDRIRDVYERAVAQLPPTQEKRHWRRYIYLWIFYAIWEELEGQDIERARQIYSTCLNLIPHKKFTFAKIWLLAAQFEVRHGQLTAARKLLGRAIGTCPKDKIFNGYIDLERKLFEFVRCRTLYEKHIEYNPANCQTWIKFAELERGLDDLDRTRAIFELAVNQQQLDMPELLWKAYIDFEEEEGEYERTRELYERLLEKTDHVKVWISYAHFEINIPEEEEDEENAEDQPLSEEAKARARKVFERAHKSMRDKDLKEERVSLLNAWLSFEREHGSEEDIDNVQRQMPRRTKKRRLLEDDTYEEYFDYVFPADDQQAKNLSNILAMAQKWKQTGGELSGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.67
3 0.61
4 0.55
5 0.52
6 0.47
7 0.41
8 0.32
9 0.29
10 0.22
11 0.19
12 0.16
13 0.13
14 0.12
15 0.14
16 0.14
17 0.17
18 0.17
19 0.17
20 0.2
21 0.19
22 0.2
23 0.2
24 0.22
25 0.2
26 0.23
27 0.25
28 0.23
29 0.23
30 0.22
31 0.22
32 0.29
33 0.27
34 0.28
35 0.32
36 0.34
37 0.35
38 0.39
39 0.37
40 0.33
41 0.42
42 0.43
43 0.4
44 0.42
45 0.45
46 0.48
47 0.58
48 0.61
49 0.63
50 0.68
51 0.76
52 0.81
53 0.77
54 0.72
55 0.72
56 0.71
57 0.69
58 0.68
59 0.66
60 0.67
61 0.68
62 0.68
63 0.59
64 0.53
65 0.49
66 0.42
67 0.36
68 0.33
69 0.32
70 0.32
71 0.34
72 0.32
73 0.36
74 0.35
75 0.33
76 0.35
77 0.33
78 0.35
79 0.37
80 0.4
81 0.33
82 0.31
83 0.34
84 0.28
85 0.29
86 0.25
87 0.21
88 0.2
89 0.18
90 0.17
91 0.14
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.12
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.12
100 0.14
101 0.16
102 0.2
103 0.2
104 0.22
105 0.25
106 0.26
107 0.34
108 0.38
109 0.4
110 0.41
111 0.46
112 0.47
113 0.47
114 0.5
115 0.43
116 0.35
117 0.31
118 0.28
119 0.24
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.32
132 0.33
133 0.34
134 0.33
135 0.28
136 0.25
137 0.17
138 0.16
139 0.15
140 0.13
141 0.11
142 0.08
143 0.08
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.17
150 0.19
151 0.22
152 0.23
153 0.28
154 0.3
155 0.29
156 0.3
157 0.28
158 0.27
159 0.26
160 0.22
161 0.17
162 0.15
163 0.15
164 0.12
165 0.12
166 0.15
167 0.14
168 0.17
169 0.2
170 0.21
171 0.23
172 0.29
173 0.31
174 0.37
175 0.38
176 0.36
177 0.4
178 0.39
179 0.38
180 0.33
181 0.3
182 0.21
183 0.19
184 0.2
185 0.13
186 0.14
187 0.18
188 0.17
189 0.21
190 0.22
191 0.23
192 0.25
193 0.29
194 0.3
195 0.28
196 0.35
197 0.33
198 0.38
199 0.42
200 0.41
201 0.38
202 0.37
203 0.37
204 0.33
205 0.32
206 0.26
207 0.22
208 0.17
209 0.16
210 0.16
211 0.12
212 0.1
213 0.08
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.12
241 0.15
242 0.2
243 0.22
244 0.27
245 0.25
246 0.28
247 0.3
248 0.31
249 0.29
250 0.24
251 0.23
252 0.2
253 0.22
254 0.21
255 0.22
256 0.22
257 0.23
258 0.27
259 0.31
260 0.33
261 0.32
262 0.33
263 0.32
264 0.33
265 0.39
266 0.43
267 0.4
268 0.37
269 0.36
270 0.35
271 0.34
272 0.33
273 0.28
274 0.22
275 0.23
276 0.22
277 0.22
278 0.2
279 0.21
280 0.21
281 0.18
282 0.17
283 0.15
284 0.14
285 0.13
286 0.11
287 0.1
288 0.11
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.14
293 0.15
294 0.17
295 0.21
296 0.25
297 0.33
298 0.37
299 0.39
300 0.42
301 0.45
302 0.46
303 0.45
304 0.38
305 0.29
306 0.27
307 0.25
308 0.27
309 0.23
310 0.23
311 0.2
312 0.19
313 0.18
314 0.16
315 0.16
316 0.1
317 0.09
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.09
326 0.1
327 0.12
328 0.12
329 0.13
330 0.14
331 0.15
332 0.15
333 0.14
334 0.15
335 0.13
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.32
344 0.39
345 0.47
346 0.52
347 0.5
348 0.53
349 0.56
350 0.63
351 0.56
352 0.51
353 0.41
354 0.37
355 0.34
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.05
363 0.07
364 0.07
365 0.05
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.1
371 0.09
372 0.11
373 0.11
374 0.13
375 0.14
376 0.16
377 0.14
378 0.15
379 0.16
380 0.2
381 0.27
382 0.26
383 0.31
384 0.3
385 0.32
386 0.32
387 0.35
388 0.37
389 0.32
390 0.33
391 0.29
392 0.29
393 0.28
394 0.27
395 0.23
396 0.17
397 0.15
398 0.11
399 0.1
400 0.11
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.12
406 0.17
407 0.19
408 0.18
409 0.19
410 0.19
411 0.19
412 0.2
413 0.19
414 0.15
415 0.14
416 0.18
417 0.24
418 0.26
419 0.27
420 0.27
421 0.25
422 0.27
423 0.26
424 0.27
425 0.23
426 0.23
427 0.24
428 0.25
429 0.27
430 0.27
431 0.28
432 0.22
433 0.19
434 0.18
435 0.17
436 0.16
437 0.17
438 0.22
439 0.23
440 0.31
441 0.31
442 0.33
443 0.34
444 0.36
445 0.38
446 0.37
447 0.38
448 0.32
449 0.35
450 0.38
451 0.36
452 0.36
453 0.37
454 0.35
455 0.32
456 0.3
457 0.29
458 0.25
459 0.3
460 0.27
461 0.22
462 0.2
463 0.21
464 0.29
465 0.27
466 0.27
467 0.22
468 0.21
469 0.2
470 0.17
471 0.18
472 0.11
473 0.12
474 0.11
475 0.11
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.09
481 0.14
482 0.16
483 0.19
484 0.18
485 0.18
486 0.18
487 0.18
488 0.18
489 0.14
490 0.12
491 0.09
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.12
496 0.12
497 0.1
498 0.11
499 0.11
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.13
506 0.14
507 0.15
508 0.12
509 0.12
510 0.12
511 0.1
512 0.11
513 0.12
514 0.12
515 0.16
516 0.21
517 0.24
518 0.26
519 0.28
520 0.28
521 0.29
522 0.33
523 0.32
524 0.28
525 0.26
526 0.26
527 0.24
528 0.26
529 0.27
530 0.22
531 0.2
532 0.2
533 0.21
534 0.18
535 0.18
536 0.17
537 0.16
538 0.16
539 0.15
540 0.13
541 0.13
542 0.14
543 0.15
544 0.14
545 0.13
546 0.12
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.09
551 0.08
552 0.09
553 0.09
554 0.1
555 0.11
556 0.14
557 0.16
558 0.26
559 0.29
560 0.3
561 0.34
562 0.37
563 0.41
564 0.46
565 0.53
566 0.54
567 0.6
568 0.64
569 0.68
570 0.72
571 0.73
572 0.74
573 0.74
574 0.74
575 0.67
576 0.7
577 0.72
578 0.7
579 0.67
580 0.62
581 0.54
582 0.5
583 0.49
584 0.4
585 0.33
586 0.3
587 0.27
588 0.25
589 0.23
590 0.21
591 0.2
592 0.2
593 0.18
594 0.16
595 0.18
596 0.17
597 0.19
598 0.19
599 0.19
600 0.21
601 0.2
602 0.2
603 0.2
604 0.19
605 0.2
606 0.21
607 0.25
608 0.32
609 0.41
610 0.5
611 0.6
612 0.7
613 0.77
614 0.84
615 0.9
616 0.91
617 0.91
618 0.89
619 0.88
620 0.85
621 0.8
622 0.75
623 0.65
624 0.54
625 0.45
626 0.36
627 0.26
628 0.18
629 0.13
630 0.09
631 0.08
632 0.09
633 0.12
634 0.15
635 0.21
636 0.22
637 0.24
638 0.29
639 0.29
640 0.29
641 0.29
642 0.26
643 0.21
644 0.2
645 0.18
646 0.17
647 0.17
648 0.23
649 0.23
650 0.27
651 0.27
652 0.29
653 0.28
654 0.27
655 0.32