Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178Z5E8

Protein Details
Accession A0A178Z5E8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-122PERPSVPPPETKRKYRRHPKPDENAPERPPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-112ETKRKYRRHPK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR001660  SAM  
IPR013761  SAM/pointed_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PF00536  SAM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd09487  SAM_superfamily  
Amino Acid Sequences MTDLAPHLERLGLEQYLDAFIGEGFDTWETLTDIQESDFDALNVKLGHRRKLQRAIADYRGVSYERLFGSPAQEGLSESSRGFDAVAGPPAGPERPSVPPPETKRKYRRHPKPDENAPERPPSAYVIFSNKVREEVKDQNLSFTQIAKLVGDRWQKLDPAGKEPFEAQASAAKEKYNVQLSAYRKTEEYKDYMAYLSEFKARHGPSSEAKRPKLEQESSGSIISTKSLEANPEGTAQASGHFRGGSMGSSASSPFIGGTIHPSGSAGTMQRPQLPSSRSGTPPLVQQSREYFRPGLLSSHSSVSDESSTVRSEVPEPLMRAAGLSLGVGSGTPPLPALPPSASSVESTGSPDPLARSRLSYFVQQQQQHQPQQQTPPPPPPAAIPPPPPFGSVPHGPTPLPYHSTLPSPTMQESSSRNRPVDFRAYQDTPRASHASIHLPSPGREQLSPTQLPPILSHERPPEFPQGPGARSLPFPPRTGGMGTTTLPHLGRAMDQPRPVATNPLQIRQPGHDDGRPGFNRSESDAATTLAGLATGVPRPDITRPGTHPPLPRPPRRSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.16
4 0.16
5 0.12
6 0.08
7 0.07
8 0.08
9 0.08
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.08
15 0.09
16 0.1
17 0.1
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.11
22 0.12
23 0.12
24 0.13
25 0.13
26 0.12
27 0.13
28 0.12
29 0.14
30 0.15
31 0.15
32 0.21
33 0.25
34 0.33
35 0.4
36 0.49
37 0.56
38 0.65
39 0.71
40 0.71
41 0.75
42 0.74
43 0.71
44 0.67
45 0.58
46 0.49
47 0.45
48 0.37
49 0.3
50 0.24
51 0.23
52 0.19
53 0.19
54 0.19
55 0.18
56 0.2
57 0.21
58 0.2
59 0.16
60 0.15
61 0.15
62 0.18
63 0.19
64 0.17
65 0.15
66 0.16
67 0.15
68 0.14
69 0.14
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.15
74 0.15
75 0.14
76 0.15
77 0.16
78 0.16
79 0.14
80 0.13
81 0.14
82 0.18
83 0.21
84 0.26
85 0.28
86 0.36
87 0.44
88 0.54
89 0.57
90 0.62
91 0.7
92 0.76
93 0.83
94 0.86
95 0.89
96 0.88
97 0.93
98 0.93
99 0.93
100 0.93
101 0.92
102 0.88
103 0.84
104 0.77
105 0.72
106 0.62
107 0.52
108 0.43
109 0.35
110 0.3
111 0.25
112 0.23
113 0.23
114 0.26
115 0.27
116 0.3
117 0.27
118 0.3
119 0.29
120 0.29
121 0.29
122 0.35
123 0.4
124 0.44
125 0.43
126 0.43
127 0.43
128 0.43
129 0.37
130 0.3
131 0.24
132 0.18
133 0.18
134 0.14
135 0.14
136 0.12
137 0.19
138 0.24
139 0.24
140 0.25
141 0.27
142 0.27
143 0.29
144 0.35
145 0.3
146 0.31
147 0.34
148 0.31
149 0.3
150 0.3
151 0.3
152 0.23
153 0.21
154 0.15
155 0.16
156 0.18
157 0.19
158 0.19
159 0.17
160 0.17
161 0.2
162 0.24
163 0.24
164 0.22
165 0.22
166 0.27
167 0.3
168 0.36
169 0.36
170 0.32
171 0.27
172 0.29
173 0.32
174 0.29
175 0.3
176 0.24
177 0.24
178 0.23
179 0.23
180 0.21
181 0.18
182 0.16
183 0.13
184 0.15
185 0.14
186 0.14
187 0.21
188 0.21
189 0.23
190 0.24
191 0.27
192 0.29
193 0.38
194 0.46
195 0.47
196 0.48
197 0.5
198 0.49
199 0.52
200 0.53
201 0.46
202 0.4
203 0.38
204 0.4
205 0.38
206 0.36
207 0.29
208 0.21
209 0.19
210 0.16
211 0.12
212 0.08
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.08
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.07
254 0.08
255 0.11
256 0.12
257 0.15
258 0.16
259 0.17
260 0.21
261 0.21
262 0.22
263 0.23
264 0.26
265 0.24
266 0.26
267 0.26
268 0.22
269 0.24
270 0.27
271 0.26
272 0.23
273 0.23
274 0.26
275 0.28
276 0.28
277 0.28
278 0.22
279 0.2
280 0.22
281 0.2
282 0.16
283 0.15
284 0.16
285 0.14
286 0.16
287 0.15
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.11
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.14
302 0.15
303 0.15
304 0.15
305 0.15
306 0.14
307 0.13
308 0.11
309 0.08
310 0.05
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.11
328 0.13
329 0.13
330 0.13
331 0.13
332 0.12
333 0.12
334 0.13
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.13
341 0.16
342 0.13
343 0.16
344 0.17
345 0.2
346 0.21
347 0.24
348 0.26
349 0.31
350 0.38
351 0.37
352 0.41
353 0.48
354 0.54
355 0.54
356 0.55
357 0.52
358 0.49
359 0.54
360 0.55
361 0.51
362 0.48
363 0.5
364 0.49
365 0.45
366 0.41
367 0.35
368 0.37
369 0.37
370 0.38
371 0.37
372 0.37
373 0.4
374 0.41
375 0.4
376 0.34
377 0.31
378 0.31
379 0.28
380 0.29
381 0.29
382 0.29
383 0.27
384 0.28
385 0.3
386 0.27
387 0.27
388 0.24
389 0.23
390 0.23
391 0.26
392 0.26
393 0.24
394 0.23
395 0.22
396 0.21
397 0.21
398 0.2
399 0.2
400 0.24
401 0.3
402 0.36
403 0.39
404 0.38
405 0.38
406 0.4
407 0.42
408 0.46
409 0.4
410 0.36
411 0.39
412 0.41
413 0.42
414 0.45
415 0.42
416 0.34
417 0.37
418 0.35
419 0.28
420 0.28
421 0.29
422 0.3
423 0.29
424 0.28
425 0.29
426 0.28
427 0.28
428 0.31
429 0.32
430 0.26
431 0.26
432 0.3
433 0.31
434 0.37
435 0.37
436 0.33
437 0.34
438 0.34
439 0.34
440 0.3
441 0.31
442 0.31
443 0.3
444 0.35
445 0.37
446 0.38
447 0.4
448 0.43
449 0.45
450 0.39
451 0.39
452 0.42
453 0.39
454 0.38
455 0.39
456 0.36
457 0.28
458 0.29
459 0.32
460 0.33
461 0.31
462 0.32
463 0.3
464 0.3
465 0.31
466 0.31
467 0.29
468 0.23
469 0.23
470 0.21
471 0.21
472 0.2
473 0.2
474 0.19
475 0.17
476 0.15
477 0.13
478 0.15
479 0.21
480 0.25
481 0.27
482 0.29
483 0.31
484 0.32
485 0.35
486 0.33
487 0.33
488 0.31
489 0.36
490 0.37
491 0.4
492 0.41
493 0.4
494 0.43
495 0.39
496 0.43
497 0.39
498 0.4
499 0.38
500 0.39
501 0.39
502 0.46
503 0.44
504 0.42
505 0.38
506 0.36
507 0.36
508 0.36
509 0.38
510 0.29
511 0.31
512 0.28
513 0.27
514 0.24
515 0.22
516 0.17
517 0.12
518 0.11
519 0.07
520 0.06
521 0.07
522 0.09
523 0.1
524 0.1
525 0.11
526 0.14
527 0.18
528 0.24
529 0.27
530 0.32
531 0.37
532 0.46
533 0.52
534 0.56
535 0.6
536 0.63
537 0.69
538 0.71
539 0.76