Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZKQ2

Protein Details
Accession A0A178ZKQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-42AHPAARELSSARKKRKRKKDDDAQDGEEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-32SSARKKRKRKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
Gene Ontology GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MPHIFVPPVATQRAHPAARELSSARKKRKRKKDDDAQDGEEASQILYDMNSQSETVANLDYTAVVTPLERLQRRVAGQPLDQPPPPFPFPHTEVPSQKSWAARGDLDEERNSSQVSRLSDSSRSLHIQHLAALSTIVHRSLLDDDFPRAARALGLLFREDIVSKNAAVRTQGYMGIAAEVLLRNGSAREPNPSQRISAIPFTLEGFERAKRFYERLIVRHPYHKSWPEAVNAVDYYLAMFNLWIYVVQAQYAAKSTTHGDDESDVGSVTSSPRVGRSANQPDKKVRELEQADQIASRMDSCMATVPYMDEPELIRLRAMVALWVADLHEDCAYLSSLGDVKAVDMSLDPGSPVAPLHEDQPADHDEHRREAARARDKAHDLLSRLEGEARSDGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.34
3 0.36
4 0.37
5 0.38
6 0.41
7 0.34
8 0.37
9 0.46
10 0.54
11 0.59
12 0.64
13 0.74
14 0.8
15 0.89
16 0.9
17 0.91
18 0.93
19 0.93
20 0.94
21 0.94
22 0.91
23 0.84
24 0.74
25 0.64
26 0.53
27 0.43
28 0.32
29 0.21
30 0.13
31 0.09
32 0.07
33 0.06
34 0.08
35 0.07
36 0.08
37 0.09
38 0.09
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.12
55 0.2
56 0.21
57 0.23
58 0.27
59 0.33
60 0.35
61 0.39
62 0.41
63 0.37
64 0.38
65 0.44
66 0.45
67 0.44
68 0.43
69 0.39
70 0.36
71 0.38
72 0.37
73 0.3
74 0.28
75 0.3
76 0.33
77 0.41
78 0.42
79 0.43
80 0.46
81 0.49
82 0.49
83 0.45
84 0.42
85 0.35
86 0.33
87 0.3
88 0.27
89 0.24
90 0.23
91 0.26
92 0.27
93 0.28
94 0.27
95 0.25
96 0.23
97 0.23
98 0.22
99 0.17
100 0.16
101 0.17
102 0.19
103 0.19
104 0.2
105 0.22
106 0.25
107 0.27
108 0.27
109 0.26
110 0.25
111 0.24
112 0.25
113 0.25
114 0.23
115 0.22
116 0.21
117 0.18
118 0.15
119 0.14
120 0.11
121 0.09
122 0.09
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.07
127 0.1
128 0.1
129 0.11
130 0.12
131 0.13
132 0.15
133 0.15
134 0.14
135 0.12
136 0.11
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.06
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.07
174 0.08
175 0.13
176 0.16
177 0.21
178 0.25
179 0.25
180 0.25
181 0.24
182 0.25
183 0.22
184 0.21
185 0.17
186 0.13
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.11
194 0.12
195 0.13
196 0.15
197 0.15
198 0.16
199 0.16
200 0.23
201 0.24
202 0.28
203 0.34
204 0.38
205 0.38
206 0.44
207 0.45
208 0.4
209 0.43
210 0.44
211 0.4
212 0.39
213 0.39
214 0.34
215 0.33
216 0.3
217 0.25
218 0.21
219 0.17
220 0.12
221 0.1
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.07
241 0.09
242 0.1
243 0.11
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.12
250 0.11
251 0.09
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.09
260 0.11
261 0.12
262 0.15
263 0.25
264 0.35
265 0.43
266 0.49
267 0.52
268 0.57
269 0.61
270 0.61
271 0.55
272 0.47
273 0.48
274 0.46
275 0.46
276 0.47
277 0.43
278 0.39
279 0.35
280 0.32
281 0.23
282 0.19
283 0.16
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.14
295 0.13
296 0.11
297 0.11
298 0.17
299 0.18
300 0.17
301 0.15
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.14
306 0.09
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.08
331 0.07
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.1
342 0.11
343 0.13
344 0.17
345 0.17
346 0.17
347 0.22
348 0.22
349 0.22
350 0.26
351 0.31
352 0.3
353 0.34
354 0.39
355 0.37
356 0.37
357 0.4
358 0.47
359 0.5
360 0.52
361 0.51
362 0.55
363 0.57
364 0.59
365 0.59
366 0.54
367 0.46
368 0.45
369 0.45
370 0.39
371 0.35
372 0.35
373 0.29
374 0.26