Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZFR4

Protein Details
Accession A0A178ZFR4    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-66KSKGQLKQEKSERRAKKQRKSREREKGQEPSABasic
85-107SPGDAKKKEKVAKTRKERRGSTTBasic
200-225KDSGDQRSQKREKKSKGRRINVELTAHydrophilic
228-264GGKSKDRQAKIKTKNEKLKEERERRRLKEKAEREKAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-60AKSKGQLKQEKSERRAKKQRKSREREK
89-103AKKKEKVAKTRKERR
208-270QKREKKSKGRRINVELTAGGGGKSKDRQAKIKTKNEKLKEERERRRLKEKAEREKAGPKTKGP
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSKKRKIDQVQDDSGITQEPVDQKSQTATPNPPAKSKGQLKQEKSERRAKKQRKSREREKGQEPSAGVDTVLPVPKPTSTETEPSPGDAKKKEKVAKTRKERRGSTTPGDDGDTKTTTPTRFIVFVGNLPYETTSEQIKEHFSKLSPTSVRHSTDKKTGKSKGYAFVEFDSYDKMKTCLKLYHHSMFDPAGKDNGADDEKDSGDQRSQKREKKSKGRRINVELTAGGGGKSKDRQAKIKTKNEKLKEERERRRLKEKAEREKAGPKTKGPPETGANATAVAGTEVKDSRGDIHPSRLSRVAH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.37
3 0.26
4 0.17
5 0.14
6 0.16
7 0.18
8 0.2
9 0.2
10 0.2
11 0.23
12 0.27
13 0.28
14 0.29
15 0.32
16 0.38
17 0.46
18 0.47
19 0.49
20 0.49
21 0.48
22 0.52
23 0.56
24 0.55
25 0.57
26 0.65
27 0.66
28 0.72
29 0.79
30 0.79
31 0.76
32 0.79
33 0.77
34 0.79
35 0.84
36 0.84
37 0.85
38 0.85
39 0.9
40 0.91
41 0.92
42 0.92
43 0.92
44 0.92
45 0.9
46 0.89
47 0.87
48 0.79
49 0.74
50 0.63
51 0.55
52 0.46
53 0.37
54 0.28
55 0.19
56 0.17
57 0.15
58 0.16
59 0.12
60 0.11
61 0.12
62 0.13
63 0.15
64 0.16
65 0.19
66 0.2
67 0.24
68 0.25
69 0.3
70 0.29
71 0.29
72 0.3
73 0.25
74 0.27
75 0.3
76 0.33
77 0.33
78 0.41
79 0.46
80 0.5
81 0.59
82 0.65
83 0.69
84 0.75
85 0.81
86 0.83
87 0.85
88 0.82
89 0.79
90 0.77
91 0.73
92 0.68
93 0.62
94 0.54
95 0.46
96 0.44
97 0.37
98 0.29
99 0.26
100 0.21
101 0.16
102 0.16
103 0.18
104 0.16
105 0.17
106 0.17
107 0.16
108 0.16
109 0.16
110 0.18
111 0.15
112 0.16
113 0.16
114 0.15
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.13
126 0.14
127 0.15
128 0.15
129 0.15
130 0.17
131 0.18
132 0.23
133 0.22
134 0.22
135 0.25
136 0.28
137 0.31
138 0.31
139 0.34
140 0.31
141 0.38
142 0.43
143 0.42
144 0.45
145 0.48
146 0.48
147 0.5
148 0.49
149 0.48
150 0.45
151 0.42
152 0.36
153 0.32
154 0.29
155 0.24
156 0.22
157 0.17
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.15
164 0.17
165 0.19
166 0.23
167 0.3
168 0.35
169 0.4
170 0.39
171 0.37
172 0.36
173 0.32
174 0.31
175 0.26
176 0.2
177 0.15
178 0.14
179 0.13
180 0.12
181 0.14
182 0.12
183 0.1
184 0.1
185 0.11
186 0.12
187 0.13
188 0.14
189 0.11
190 0.15
191 0.21
192 0.25
193 0.34
194 0.42
195 0.48
196 0.58
197 0.67
198 0.73
199 0.78
200 0.85
201 0.85
202 0.87
203 0.9
204 0.88
205 0.86
206 0.84
207 0.75
208 0.67
209 0.55
210 0.46
211 0.37
212 0.28
213 0.2
214 0.14
215 0.12
216 0.12
217 0.14
218 0.19
219 0.25
220 0.29
221 0.37
222 0.45
223 0.55
224 0.62
225 0.7
226 0.75
227 0.78
228 0.84
229 0.83
230 0.85
231 0.82
232 0.83
233 0.83
234 0.84
235 0.84
236 0.85
237 0.87
238 0.84
239 0.86
240 0.82
241 0.8
242 0.8
243 0.8
244 0.81
245 0.81
246 0.79
247 0.74
248 0.76
249 0.76
250 0.75
251 0.69
252 0.62
253 0.62
254 0.66
255 0.67
256 0.62
257 0.58
258 0.52
259 0.54
260 0.51
261 0.43
262 0.36
263 0.29
264 0.25
265 0.2
266 0.16
267 0.11
268 0.09
269 0.08
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.14
275 0.17
276 0.23
277 0.29
278 0.29
279 0.37
280 0.43
281 0.45
282 0.49