Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZTL0

Protein Details
Accession A0A178ZTL0    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-74RKAQEEQERHQPKRRKRGNDQTFKMGHBasic
378-398DRDRSDRDYRHKRFDRGGRDDBasic
404-427AWTGQRRWEGSNRSKRRNSSSPELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-64PKRRKR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 9.333, cyto 8.5, cyto_mito 7.333, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MAQPTGKVLEGVFAINKPPSISSAQVLRDLQHKFAESQTFAPLLEKTRKAQEEQERHQPKRRKRGNDQTFKMGHGGTLDPLATGVLTVGLGRGSKSLADFLSCKKTYETVVLFGKSTDTYDIMGKIVAEAPTENITKQVVEDELTRFRGKMKQIPPIYSAIKIDGMKLYEYARSGKELPRELESREVEISDCTLLDFYGPGEHDFRWPAEEASDEEKALAQKIMAGAEATKKSLGQEAAPASPKNPPKERHREHHQSNKLTPEKKAELHTHHLPTQEAEPANAPAARIRLTVSSGFYVRSFAHDLGIACGSYGTMAALVRSIQGEYTNIDPAPEGLIPALTYSDLEAGEGVWGPKIADVLEKWIEAHPAPSNDKRPDDRDRSDRDYRHKRFDRGGRDDSRPQRAWTGQRRWEGSNRSKRRNSSSPEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.18
4 0.17
5 0.17
6 0.18
7 0.2
8 0.22
9 0.22
10 0.28
11 0.29
12 0.34
13 0.34
14 0.32
15 0.35
16 0.35
17 0.35
18 0.32
19 0.31
20 0.27
21 0.32
22 0.36
23 0.32
24 0.31
25 0.31
26 0.28
27 0.26
28 0.26
29 0.23
30 0.23
31 0.29
32 0.31
33 0.31
34 0.39
35 0.42
36 0.44
37 0.51
38 0.56
39 0.58
40 0.61
41 0.69
42 0.69
43 0.72
44 0.78
45 0.78
46 0.77
47 0.78
48 0.82
49 0.81
50 0.82
51 0.88
52 0.9
53 0.91
54 0.87
55 0.85
56 0.77
57 0.68
58 0.59
59 0.48
60 0.37
61 0.28
62 0.24
63 0.15
64 0.14
65 0.13
66 0.1
67 0.1
68 0.09
69 0.07
70 0.05
71 0.05
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.04
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.1
84 0.1
85 0.12
86 0.14
87 0.17
88 0.26
89 0.26
90 0.27
91 0.26
92 0.27
93 0.27
94 0.32
95 0.29
96 0.25
97 0.28
98 0.28
99 0.27
100 0.25
101 0.24
102 0.18
103 0.17
104 0.13
105 0.1
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.11
114 0.1
115 0.09
116 0.08
117 0.09
118 0.12
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.08
127 0.09
128 0.11
129 0.13
130 0.16
131 0.19
132 0.19
133 0.18
134 0.2
135 0.24
136 0.26
137 0.32
138 0.34
139 0.41
140 0.44
141 0.46
142 0.46
143 0.46
144 0.43
145 0.36
146 0.31
147 0.23
148 0.23
149 0.2
150 0.19
151 0.15
152 0.15
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.11
157 0.12
158 0.14
159 0.13
160 0.14
161 0.17
162 0.19
163 0.23
164 0.26
165 0.26
166 0.28
167 0.29
168 0.28
169 0.32
170 0.3
171 0.26
172 0.23
173 0.21
174 0.17
175 0.16
176 0.15
177 0.08
178 0.07
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.13
200 0.13
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.09
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.09
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.12
221 0.12
222 0.09
223 0.12
224 0.14
225 0.16
226 0.18
227 0.18
228 0.16
229 0.22
230 0.26
231 0.29
232 0.34
233 0.37
234 0.45
235 0.56
236 0.61
237 0.64
238 0.69
239 0.73
240 0.74
241 0.8
242 0.78
243 0.73
244 0.7
245 0.71
246 0.68
247 0.6
248 0.54
249 0.5
250 0.46
251 0.42
252 0.44
253 0.41
254 0.4
255 0.44
256 0.48
257 0.44
258 0.43
259 0.41
260 0.36
261 0.32
262 0.28
263 0.26
264 0.2
265 0.17
266 0.16
267 0.15
268 0.16
269 0.15
270 0.14
271 0.1
272 0.12
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.13
278 0.15
279 0.15
280 0.15
281 0.15
282 0.15
283 0.14
284 0.15
285 0.13
286 0.15
287 0.17
288 0.15
289 0.15
290 0.16
291 0.17
292 0.16
293 0.17
294 0.13
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.06
299 0.06
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.06
310 0.07
311 0.08
312 0.09
313 0.11
314 0.13
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.11
319 0.13
320 0.11
321 0.1
322 0.07
323 0.08
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.07
336 0.08
337 0.07
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.07
344 0.1
345 0.1
346 0.15
347 0.17
348 0.17
349 0.18
350 0.19
351 0.21
352 0.18
353 0.21
354 0.2
355 0.24
356 0.3
357 0.36
358 0.43
359 0.47
360 0.53
361 0.56
362 0.57
363 0.62
364 0.65
365 0.66
366 0.67
367 0.69
368 0.7
369 0.74
370 0.75
371 0.76
372 0.78
373 0.77
374 0.79
375 0.79
376 0.78
377 0.78
378 0.81
379 0.8
380 0.78
381 0.8
382 0.75
383 0.74
384 0.78
385 0.76
386 0.76
387 0.69
388 0.63
389 0.61
390 0.62
391 0.65
392 0.66
393 0.68
394 0.66
395 0.71
396 0.73
397 0.71
398 0.72
399 0.72
400 0.73
401 0.73
402 0.75
403 0.78
404 0.82
405 0.84
406 0.84
407 0.84