Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178Z4W9

Protein Details
Accession A0A178Z4W9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-131QDVDERMGKRRKRLREEREREELEEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-123GKRRKRLREE
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 5.5, cyto_mito 5.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF14559  TPR_19  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSRRDFLNQQAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPARDGPSAEQIQEALARRAQQLGAAPPTAYGAGAKKQEQEEEDDDRFQDPDNETGLFASGNFTQDDDEADRIYQDVDERMGKRRKRLREEREREELEEYNRKNPKISDQFADLKRGLVTLTDDDWANLPDPGDLTGKNRRARQSRLQRSYVVPDSVLARARDSAEFSTSVQDDAMDGVVTSSDQKDGTMTNFADIGAARDRVLQTRLDRAAKADAGTGTATTIDPKGYLTSLETSEFDPSKVQLGEIQRVRTLLDSVIKTNPKHAPAWIAAARLEEYAGKIVAARKKMAQGCEMCPKSEDAWLENIRLNEGQNAKIIAANAIKNNERSTRLWIEAMRLETEPRAKKRVLRQAIDHIPQSVAIWKEAVNLEEDPDDAKLLLAKATEIIPLSVELWLALARLETPENAQAVLNKARKAVPTSHEIWIAAARLQEQMGNANKVNIMNRAVKALVKEGAMLKREEWITEAEKCEEEGAVLTCGAIIRETLGWSLDEDDDRKEIFKDDAKASIGREKFETARAIYAYALRVFPTSRSLWLAAADLERNHGTKDALWQVLEKAVEACPQSEDLWLQLAREKWHAGEIDDARRVLGKAFNQNPNNEEIWLAAVRLEADAGQVSQARELLATARQEAPTERVWYKSAAYERQLGNTDVALDLVLQGLTSRVIDKKETRFPRSPKLWMMKGQIYEDKGMIPQAREAYAQGTRACPKSVPLWLLAARLEQKQGIIIKARSVLDRARLQNPKNAELWAESVRVELQANPPNVQQAKILMSKGLQECPKSGLLWSENIWKLQPRSQRKPLSLEAIKAADNDPVLFVTVGRIFWSERRLDKAMNWFEKALVADPDLGDSWAWYLKFLMQHGTEEKREDVIAKCVANEPKHGEVWQSIRKDPKNASLSTKEVLMEVMKRLEAKEVIN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.23
3 0.2
4 0.15
5 0.13
6 0.1
7 0.09
8 0.08
9 0.09
10 0.08
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.15
15 0.15
16 0.16
17 0.21
18 0.23
19 0.25
20 0.3
21 0.31
22 0.29
23 0.31
24 0.31
25 0.28
26 0.33
27 0.32
28 0.27
29 0.25
30 0.22
31 0.2
32 0.25
33 0.25
34 0.21
35 0.21
36 0.23
37 0.23
38 0.26
39 0.25
40 0.22
41 0.24
42 0.27
43 0.28
44 0.27
45 0.26
46 0.23
47 0.24
48 0.22
49 0.17
50 0.13
51 0.13
52 0.18
53 0.23
54 0.25
55 0.29
56 0.31
57 0.35
58 0.35
59 0.39
60 0.38
61 0.4
62 0.4
63 0.37
64 0.36
65 0.32
66 0.31
67 0.25
68 0.26
69 0.21
70 0.21
71 0.21
72 0.21
73 0.2
74 0.2
75 0.19
76 0.13
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.14
92 0.14
93 0.11
94 0.1
95 0.11
96 0.13
97 0.19
98 0.21
99 0.3
100 0.39
101 0.42
102 0.5
103 0.58
104 0.66
105 0.7
106 0.8
107 0.81
108 0.84
109 0.89
110 0.87
111 0.88
112 0.81
113 0.72
114 0.66
115 0.59
116 0.54
117 0.54
118 0.48
119 0.47
120 0.5
121 0.48
122 0.48
123 0.46
124 0.49
125 0.5
126 0.52
127 0.47
128 0.47
129 0.55
130 0.54
131 0.57
132 0.47
133 0.38
134 0.34
135 0.3
136 0.24
137 0.16
138 0.17
139 0.14
140 0.15
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.15
146 0.13
147 0.11
148 0.1
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.16
155 0.25
156 0.32
157 0.37
158 0.43
159 0.5
160 0.55
161 0.62
162 0.68
163 0.71
164 0.74
165 0.77
166 0.75
167 0.7
168 0.66
169 0.66
170 0.6
171 0.5
172 0.39
173 0.32
174 0.3
175 0.29
176 0.29
177 0.22
178 0.18
179 0.19
180 0.21
181 0.2
182 0.21
183 0.2
184 0.18
185 0.19
186 0.18
187 0.2
188 0.18
189 0.18
190 0.14
191 0.13
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.1
207 0.11
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.14
214 0.13
215 0.14
216 0.11
217 0.12
218 0.11
219 0.14
220 0.15
221 0.17
222 0.19
223 0.2
224 0.2
225 0.27
226 0.32
227 0.32
228 0.31
229 0.31
230 0.33
231 0.3
232 0.28
233 0.23
234 0.18
235 0.16
236 0.16
237 0.14
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.11
251 0.12
252 0.13
253 0.14
254 0.14
255 0.17
256 0.17
257 0.16
258 0.14
259 0.14
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.15
264 0.18
265 0.26
266 0.28
267 0.29
268 0.26
269 0.26
270 0.27
271 0.23
272 0.2
273 0.14
274 0.17
275 0.16
276 0.18
277 0.24
278 0.28
279 0.27
280 0.32
281 0.34
282 0.32
283 0.32
284 0.3
285 0.29
286 0.26
287 0.32
288 0.27
289 0.24
290 0.21
291 0.21
292 0.21
293 0.16
294 0.15
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.08
301 0.13
302 0.16
303 0.18
304 0.19
305 0.2
306 0.27
307 0.3
308 0.31
309 0.32
310 0.31
311 0.33
312 0.42
313 0.41
314 0.35
315 0.32
316 0.32
317 0.27
318 0.27
319 0.24
320 0.15
321 0.21
322 0.22
323 0.23
324 0.23
325 0.22
326 0.2
327 0.2
328 0.19
329 0.17
330 0.17
331 0.16
332 0.15
333 0.16
334 0.14
335 0.15
336 0.15
337 0.12
338 0.13
339 0.14
340 0.14
341 0.17
342 0.18
343 0.18
344 0.21
345 0.21
346 0.23
347 0.22
348 0.27
349 0.28
350 0.28
351 0.29
352 0.27
353 0.27
354 0.26
355 0.26
356 0.21
357 0.17
358 0.17
359 0.16
360 0.23
361 0.26
362 0.26
363 0.3
364 0.29
365 0.35
366 0.44
367 0.52
368 0.53
369 0.5
370 0.5
371 0.55
372 0.61
373 0.57
374 0.49
375 0.39
376 0.31
377 0.28
378 0.24
379 0.19
380 0.12
381 0.1
382 0.1
383 0.09
384 0.12
385 0.12
386 0.12
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.08
393 0.08
394 0.07
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.06
404 0.07
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.05
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.03
418 0.03
419 0.04
420 0.05
421 0.05
422 0.06
423 0.08
424 0.08
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.12
429 0.19
430 0.2
431 0.19
432 0.2
433 0.22
434 0.23
435 0.25
436 0.26
437 0.21
438 0.23
439 0.26
440 0.26
441 0.25
442 0.24
443 0.22
444 0.18
445 0.16
446 0.12
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.07
453 0.11
454 0.12
455 0.14
456 0.13
457 0.13
458 0.14
459 0.14
460 0.15
461 0.12
462 0.14
463 0.15
464 0.15
465 0.16
466 0.15
467 0.15
468 0.15
469 0.15
470 0.13
471 0.1
472 0.11
473 0.13
474 0.15
475 0.16
476 0.16
477 0.14
478 0.16
479 0.16
480 0.15
481 0.13
482 0.13
483 0.14
484 0.16
485 0.17
486 0.15
487 0.15
488 0.15
489 0.14
490 0.11
491 0.08
492 0.07
493 0.06
494 0.06
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.04
501 0.03
502 0.04
503 0.04
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.08
513 0.09
514 0.1
515 0.1
516 0.1
517 0.09
518 0.1
519 0.11
520 0.14
521 0.17
522 0.17
523 0.2
524 0.21
525 0.21
526 0.21
527 0.26
528 0.23
529 0.2
530 0.2
531 0.19
532 0.19
533 0.21
534 0.22
535 0.16
536 0.17
537 0.16
538 0.15
539 0.14
540 0.14
541 0.13
542 0.12
543 0.11
544 0.1
545 0.1
546 0.1
547 0.1
548 0.13
549 0.12
550 0.13
551 0.14
552 0.15
553 0.15
554 0.15
555 0.15
556 0.11
557 0.12
558 0.11
559 0.09
560 0.11
561 0.11
562 0.11
563 0.1
564 0.11
565 0.1
566 0.1
567 0.15
568 0.17
569 0.17
570 0.17
571 0.17
572 0.17
573 0.19
574 0.18
575 0.13
576 0.1
577 0.09
578 0.12
579 0.12
580 0.11
581 0.1
582 0.11
583 0.11
584 0.11
585 0.11
586 0.09
587 0.12
588 0.11
589 0.11
590 0.12
591 0.14
592 0.15
593 0.17
594 0.17
595 0.14
596 0.17
597 0.18
598 0.15
599 0.2
600 0.22
601 0.24
602 0.25
603 0.25
604 0.22
605 0.22
606 0.21
607 0.16
608 0.17
609 0.16
610 0.24
611 0.3
612 0.39
613 0.41
614 0.42
615 0.42
616 0.42
617 0.39
618 0.3
619 0.24
620 0.16
621 0.15
622 0.13
623 0.12
624 0.08
625 0.07
626 0.07
627 0.07
628 0.07
629 0.04
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.07
635 0.08
636 0.08
637 0.08
638 0.08
639 0.08
640 0.08
641 0.09
642 0.1
643 0.11
644 0.12
645 0.14
646 0.15
647 0.16
648 0.17
649 0.18
650 0.18
651 0.23
652 0.21
653 0.21
654 0.22
655 0.23
656 0.23
657 0.25
658 0.27
659 0.26
660 0.28
661 0.32
662 0.32
663 0.34
664 0.35
665 0.3
666 0.26
667 0.21
668 0.2
669 0.13
670 0.12
671 0.09
672 0.06
673 0.05
674 0.05
675 0.04
676 0.03
677 0.03
678 0.04
679 0.04
680 0.05
681 0.07
682 0.09
683 0.11
684 0.16
685 0.22
686 0.29
687 0.38
688 0.46
689 0.51
690 0.58
691 0.62
692 0.68
693 0.68
694 0.66
695 0.66
696 0.66
697 0.63
698 0.6
699 0.61
700 0.56
701 0.52
702 0.5
703 0.45
704 0.39
705 0.36
706 0.3
707 0.24
708 0.2
709 0.21
710 0.19
711 0.16
712 0.17
713 0.17
714 0.18
715 0.18
716 0.18
717 0.18
718 0.18
719 0.2
720 0.19
721 0.21
722 0.24
723 0.26
724 0.26
725 0.23
726 0.23
727 0.25
728 0.29
729 0.26
730 0.23
731 0.26
732 0.26
733 0.27
734 0.25
735 0.24
736 0.22
737 0.21
738 0.21
739 0.18
740 0.16
741 0.19
742 0.21
743 0.2
744 0.23
745 0.23
746 0.24
747 0.28
748 0.29
749 0.26
750 0.27
751 0.27
752 0.28
753 0.35
754 0.37
755 0.41
756 0.48
757 0.49
758 0.52
759 0.53
760 0.5
761 0.44
762 0.4
763 0.33
764 0.27
765 0.28
766 0.25
767 0.21
768 0.18
769 0.17
770 0.17
771 0.16
772 0.15
773 0.14
774 0.18
775 0.24
776 0.26
777 0.27
778 0.27
779 0.33
780 0.33
781 0.32
782 0.26
783 0.22
784 0.25
785 0.27
786 0.27
787 0.21
788 0.2
789 0.26
790 0.28
791 0.31
792 0.3
793 0.28
794 0.29
795 0.32
796 0.33
797 0.27
798 0.25
799 0.25
800 0.23
801 0.24
802 0.24
803 0.3
804 0.3
805 0.3
806 0.32
807 0.31
808 0.33
809 0.37
810 0.45
811 0.46
812 0.54
813 0.63
814 0.7
815 0.69
816 0.73
817 0.71
818 0.72
819 0.65
820 0.58
821 0.52
822 0.45
823 0.41
824 0.35
825 0.3
826 0.23
827 0.19
828 0.17
829 0.13
830 0.11
831 0.12
832 0.11
833 0.1
834 0.11
835 0.12
836 0.12
837 0.12
838 0.14
839 0.14
840 0.18
841 0.23
842 0.25
843 0.27
844 0.34
845 0.36
846 0.37
847 0.41
848 0.48
849 0.52
850 0.52
851 0.51
852 0.45
853 0.42
854 0.42
855 0.38
856 0.3
857 0.22
858 0.18
859 0.17
860 0.17
861 0.18
862 0.16
863 0.15
864 0.12
865 0.1
866 0.11
867 0.13
868 0.13
869 0.11
870 0.12
871 0.15
872 0.18
873 0.2
874 0.24
875 0.22
876 0.27
877 0.32
878 0.37
879 0.36
880 0.37
881 0.37
882 0.32
883 0.31
884 0.31
885 0.27
886 0.27
887 0.29
888 0.26
889 0.26
890 0.32
891 0.38
892 0.36
893 0.39
894 0.39
895 0.39
896 0.41
897 0.4
898 0.36
899 0.35
900 0.41
901 0.43
902 0.42
903 0.42
904 0.5
905 0.54
906 0.58
907 0.57
908 0.59
909 0.58
910 0.57
911 0.6
912 0.56
913 0.56
914 0.5
915 0.47
916 0.38
917 0.31
918 0.29
919 0.25
920 0.21
921 0.21
922 0.22
923 0.21
924 0.22
925 0.23
926 0.26