FuNGI

A0A178ZC74

Protein Details

Accession

A0A178ZC74

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-39	ATADTDTRNPKRRKISNPPSEPRNNAH	Hydrophilic
42-69	RHTNRVEKTSRGKRPSPRPPRDLRGSTG	Basic
99-119	LDKIWIRNKNQHRTQPWWKSL	Hydrophilic
496-522	ATTTTKGKDKGKGKGKRKGKNAIDDLF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-64	PKRRKISNPPSEPRNNAHARRHTNRVEKTSRGKRPSPRPPRDL
501-515	KGKDKGKGKGKRKGK

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10, cyto 4.5, plas 3, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR047205 RMP1 IPR047204 RMP1_RBD
Gene Ontology	GO:0000172 C:ribonuclease MRP complex GO:0042134 F:rRNA primary transcript binding
CDD	cd22573 RMP1_RBD

Amino Acid Sequences

MDQSQDIEGRPVATADTDTRNPKRRKISNPPSEPRNNAHARRHTNRVEKTSRGKRPSPRPPRDLRGSTGQAKPDSGLSTPQGTSKREPKFSLPFAKSVLDKIWIRNKNQHRTQPWWKSLSMLRKAVSRLVTIEQEERSLRDRPLGYGGATAMDAKAVRARFEREAQLRGEKEIWIDWIRQVLIPKAYLGFSGLVSDTQFAHLGLVLVGLLADVVGSVGLPTPSERQEGVEQALRRTGTITATTGRRDPSGTLETATSEAMARSLTAKSIRVTGLQSGEVVERTYDSDDLGEVVERKRSGPKQEQEQEQEQDREPSQAPTRPRSGRGADRNLAVLGKEDQDQALMVTGLADEDAPETNPSSTAERSRTAPSPSPTATAAAAASLATSFSPRDSVAIAAQTSQDDDDGGCGALPPPGPPPPPRRQHPHALPPGLAATGTTTTTTTTTSIVPNDKQVQTTPTATTTIAGAGDGAGKQVQARSKSNPEHNNSSSRSSITATTTTKGKDKGKGKGKRKGKNAIDDLFAGFT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.15
3	0.21
4	0.26
5	0.34
6	0.43
7	0.53
8	0.57
9	0.64
10	0.7
11	0.74
12	0.79
13	0.81
14	0.84
15	0.84
16	0.9
17	0.89
18	0.88
19	0.86
20	0.81
21	0.75
22	0.73
23	0.72
24	0.69
25	0.71
26	0.72
27	0.73
28	0.74
29	0.78
30	0.78
31	0.78
32	0.78
33	0.78
34	0.75
35	0.73
36	0.78
37	0.79
38	0.8
39	0.78
40	0.78
41	0.78
42	0.82
43	0.85
44	0.86
45	0.85
46	0.85
47	0.86
48	0.87
49	0.87
50	0.8
51	0.74
52	0.72
53	0.69
54	0.66
55	0.62
56	0.58
57	0.5
58	0.46
59	0.41
60	0.35
61	0.3
62	0.24
63	0.23
64	0.2
65	0.22
66	0.22
67	0.26
68	0.29
69	0.31
70	0.36
71	0.42
72	0.47
73	0.49
74	0.52
75	0.54
76	0.58
77	0.62
78	0.65
79	0.59
80	0.54
81	0.51
82	0.5
83	0.43
84	0.37
85	0.31
86	0.28
87	0.27
88	0.31
89	0.38
90	0.41
91	0.45
92	0.52
93	0.6
94	0.64
95	0.71
96	0.74
97	0.71
98	0.74
99	0.8
100	0.81
101	0.78
102	0.71
103	0.62
104	0.57
105	0.57
106	0.58
107	0.54
108	0.49
109	0.43
110	0.43
111	0.45
112	0.45
113	0.4
114	0.32
115	0.27
116	0.25
117	0.26
118	0.25
119	0.26
120	0.22
121	0.23
122	0.22
123	0.21
124	0.22
125	0.23
126	0.21
127	0.24
128	0.24
129	0.23
130	0.27
131	0.26
132	0.23
133	0.21
134	0.2
135	0.15
136	0.14
137	0.12
138	0.07
139	0.07
140	0.07
141	0.06
142	0.1
143	0.1
144	0.12
145	0.14
146	0.19
147	0.21
148	0.25
149	0.33
150	0.32
151	0.35
152	0.36
153	0.4
154	0.37
155	0.35
156	0.32
157	0.25
158	0.22
159	0.2
160	0.21
161	0.16
162	0.16
163	0.14
164	0.16
165	0.16
166	0.16
167	0.17
168	0.16
169	0.16
170	0.15
171	0.15
172	0.14
173	0.13
174	0.12
175	0.12
176	0.09
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.08
183	0.07
184	0.07
185	0.08
186	0.07
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.05
191	0.05
192	0.04
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.02
197	0.02
198	0.02
199	0.01
200	0.01
201	0.02
202	0.02
203	0.02
204	0.02
205	0.03
206	0.03
207	0.04
208	0.07
209	0.08
210	0.1
211	0.1
212	0.12
213	0.14
214	0.15
215	0.16
216	0.18
217	0.18
218	0.17
219	0.19
220	0.17
221	0.15
222	0.15
223	0.14
224	0.11
225	0.11
226	0.12
227	0.12
228	0.14
229	0.15
230	0.16
231	0.16
232	0.15
233	0.15
234	0.15
235	0.16
236	0.17
237	0.16
238	0.15
239	0.14
240	0.14
241	0.14
242	0.13
243	0.08
244	0.06
245	0.06
246	0.05
247	0.05
248	0.04
249	0.05
250	0.05
251	0.07
252	0.08
253	0.09
254	0.09
255	0.12
256	0.12
257	0.12
258	0.13
259	0.14
260	0.14
261	0.12
262	0.12
263	0.11
264	0.1
265	0.09
266	0.08
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.07
271	0.07
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.07
280	0.09
281	0.09
282	0.1
283	0.17
284	0.2
285	0.28
286	0.36
287	0.4
288	0.48
289	0.55
290	0.59
291	0.58
292	0.59
293	0.55
294	0.49
295	0.46
296	0.37
297	0.33
298	0.28
299	0.26
300	0.22
301	0.22
302	0.22
303	0.24
304	0.28
305	0.29
306	0.36
307	0.36
308	0.38
309	0.4
310	0.42
311	0.46
312	0.51
313	0.53
314	0.48
315	0.46
316	0.44
317	0.39
318	0.34
319	0.24
320	0.18
321	0.12
322	0.11
323	0.11
324	0.1
325	0.1
326	0.1
327	0.1
328	0.08
329	0.07
330	0.06
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.03
337	0.03
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.06
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.09
346	0.11
347	0.13
348	0.17
349	0.2
350	0.21
351	0.24
352	0.27
353	0.29
354	0.32
355	0.36
356	0.34
357	0.36
358	0.35
359	0.35
360	0.31
361	0.29
362	0.24
363	0.18
364	0.16
365	0.1
366	0.09
367	0.07
368	0.06
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.09
379	0.1
380	0.1
381	0.13
382	0.12
383	0.12
384	0.12
385	0.12
386	0.12
387	0.1
388	0.09
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.06
394	0.05
395	0.06
396	0.06
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.11
401	0.16
402	0.19
403	0.26
404	0.34
405	0.42
406	0.5
407	0.57
408	0.63
409	0.65
410	0.72
411	0.75
412	0.77
413	0.77
414	0.71
415	0.64
416	0.56
417	0.5
418	0.4
419	0.3
420	0.19
421	0.12
422	0.11
423	0.11
424	0.1
425	0.09
426	0.1
427	0.11
428	0.12
429	0.11
430	0.11
431	0.12
432	0.14
433	0.19
434	0.23
435	0.23
436	0.29
437	0.35
438	0.35
439	0.35
440	0.35
441	0.34
442	0.33
443	0.35
444	0.3
445	0.24
446	0.25
447	0.23
448	0.21
449	0.18
450	0.15
451	0.12
452	0.1
453	0.08
454	0.07
455	0.08
456	0.08
457	0.08
458	0.07
459	0.07
460	0.09
461	0.13
462	0.19
463	0.23
464	0.27
465	0.34
466	0.43
467	0.52
468	0.6
469	0.66
470	0.67
471	0.7
472	0.7
473	0.71
474	0.66
475	0.62
476	0.55
477	0.47
478	0.41
479	0.34
480	0.33
481	0.29
482	0.32
483	0.29
484	0.29
485	0.32
486	0.33
487	0.37
488	0.42
489	0.44
490	0.47
491	0.52
492	0.6
493	0.66
494	0.73
495	0.77
496	0.8
497	0.84
498	0.85
499	0.86
500	0.87
501	0.85
502	0.86
503	0.84
504	0.78
505	0.71
506	0.63

A0A178ZC74

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer