FuNGI

A0A178ZMD8

Protein Details

Accession

A0A178ZMD8

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
61-80	EEVKVTKKRKPISKLDEARL	Hydrophilic
93-113	ARSGKFSKKLRLKGKGHEFSD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
67-107	KKRKPISKLDEARLLSAPGIPKLRADARSGKFSKKLRLKGK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012923 Csm3 IPR040038 TIPIN/Csm3/Swi3
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0007049 P:cell cycle GO:0006974 P:DNA damage response GO:0000076 P:DNA replication checkpoint signaling GO:0031297 P:replication fork processing
Pfam	View protein in Pfam PF07962 Swi3

Amino Acid Sequences

MAADPLTASTVDGLLNLDNFDYDDPFNDRPTQQDGVEGLSSSPGFKRKADDLLDASLGLDEEVKVTKKRKPISKLDEARLLSAPGIPKLRADARSGKFSKKLRLKGKGHEFSDVARLLNYYQLWLDNLYPRAKFADGLQLIEKVGHSRRMQIMRKEWIDEGKPGYIRDREANKIADREKEADKEADDLFVGVQPAADNVGPEAANADVGPEDDSLFVPDLHNNADNGEDDGILPDDDELDALLAEQETRITTRPVAVSKPTEDDDSEGDDDLDALLAEQEMRRAPPPPPTSQHTSTFAPKLKPSPFGGDDSDEDEEMDDLDALLAEQEARMQPSTAQSKLSSIQASSTQNKDRPSSAADQELTQDDELDVLIAEQEARGHVAREAPTSSAPAVRPATPPAAAVADGADGADGADMFSSSPVRGTAPIGLGLSGQLELERDPASPRSTVTTTTGRTYEAGASESEDAQRSRPGDDSIEETAEEKQESQGLDAGDMFSSSPVQNE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.09
3	0.09
4	0.09
5	0.08
6	0.09
7	0.1
8	0.11
9	0.11
10	0.13
11	0.18
12	0.2
13	0.23
14	0.26
15	0.26
16	0.27
17	0.33
18	0.33
19	0.28
20	0.31
21	0.28
22	0.27
23	0.28
24	0.24
25	0.19
26	0.18
27	0.18
28	0.15
29	0.17
30	0.19
31	0.21
32	0.22
33	0.28
34	0.3
35	0.37
36	0.4
37	0.42
38	0.4
39	0.4
40	0.39
41	0.34
42	0.29
43	0.22
44	0.18
45	0.12
46	0.09
47	0.06
48	0.07
49	0.1
50	0.12
51	0.17
52	0.22
53	0.27
54	0.35
55	0.44
56	0.52
57	0.58
58	0.66
59	0.7
60	0.77
61	0.81
62	0.78
63	0.77
64	0.69
65	0.63
66	0.53
67	0.44
68	0.34
69	0.28
70	0.24
71	0.2
72	0.22
73	0.19
74	0.18
75	0.23
76	0.28
77	0.28
78	0.31
79	0.37
80	0.37
81	0.47
82	0.5
83	0.5
84	0.52
85	0.55
86	0.6
87	0.6
88	0.66
89	0.65
90	0.73
91	0.74
92	0.77
93	0.82
94	0.81
95	0.73
96	0.68
97	0.58
98	0.49
99	0.5
100	0.4
101	0.3
102	0.21
103	0.2
104	0.16
105	0.19
106	0.17
107	0.12
108	0.11
109	0.12
110	0.12
111	0.13
112	0.14
113	0.16
114	0.2
115	0.22
116	0.21
117	0.21
118	0.23
119	0.22
120	0.2
121	0.17
122	0.23
123	0.21
124	0.23
125	0.23
126	0.21
127	0.21
128	0.21
129	0.2
130	0.13
131	0.15
132	0.2
133	0.19
134	0.24
135	0.31
136	0.4
137	0.46
138	0.5
139	0.54
140	0.55
141	0.57
142	0.54
143	0.49
144	0.44
145	0.4
146	0.35
147	0.31
148	0.26
149	0.26
150	0.24
151	0.27
152	0.24
153	0.24
154	0.28
155	0.3
156	0.3
157	0.33
158	0.36
159	0.34
160	0.38
161	0.38
162	0.35
163	0.33
164	0.33
165	0.32
166	0.3
167	0.3
168	0.26
169	0.24
170	0.23
171	0.2
172	0.17
173	0.14
174	0.11
175	0.09
176	0.09
177	0.08
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.06
183	0.06
184	0.05
185	0.04
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.04
195	0.04
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.08
207	0.09
208	0.1
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.09
213	0.09
214	0.08
215	0.07
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.05
220	0.05
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.02
231	0.02
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.05
237	0.06
238	0.06
239	0.08
240	0.11
241	0.12
242	0.13
243	0.15
244	0.17
245	0.17
246	0.19
247	0.18
248	0.17
249	0.16
250	0.16
251	0.14
252	0.14
253	0.14
254	0.11
255	0.1
256	0.09
257	0.09
258	0.07
259	0.06
260	0.03
261	0.02
262	0.02
263	0.02
264	0.03
265	0.03
266	0.04
267	0.05
268	0.06
269	0.07
270	0.09
271	0.1
272	0.19
273	0.23
274	0.27
275	0.31
276	0.35
277	0.41
278	0.43
279	0.46
280	0.41
281	0.39
282	0.38
283	0.4
284	0.39
285	0.34
286	0.32
287	0.35
288	0.33
289	0.34
290	0.33
291	0.33
292	0.31
293	0.32
294	0.31
295	0.27
296	0.26
297	0.25
298	0.23
299	0.17
300	0.15
301	0.12
302	0.1
303	0.08
304	0.08
305	0.04
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.02
314	0.04
315	0.05
316	0.06
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.15
321	0.19
322	0.19
323	0.2
324	0.19
325	0.21
326	0.22
327	0.24
328	0.19
329	0.15
330	0.16
331	0.19
332	0.24
333	0.25
334	0.29
335	0.32
336	0.35
337	0.37
338	0.38
339	0.34
340	0.32
341	0.33
342	0.33
343	0.3
344	0.31
345	0.29
346	0.27
347	0.27
348	0.26
349	0.23
350	0.18
351	0.16
352	0.1
353	0.09
354	0.09
355	0.07
356	0.05
357	0.04
358	0.04
359	0.03
360	0.04
361	0.03
362	0.04
363	0.04
364	0.06
365	0.07
366	0.07
367	0.09
368	0.13
369	0.15
370	0.17
371	0.18
372	0.17
373	0.18
374	0.19
375	0.19
376	0.18
377	0.17
378	0.2
379	0.21
380	0.22
381	0.23
382	0.25
383	0.27
384	0.23
385	0.23
386	0.19
387	0.18
388	0.16
389	0.14
390	0.11
391	0.08
392	0.07
393	0.07
394	0.05
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.03
402	0.04
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.07
407	0.08
408	0.09
409	0.1
410	0.12
411	0.14
412	0.14
413	0.16
414	0.15
415	0.15
416	0.13
417	0.12
418	0.11
419	0.08
420	0.07
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.09
425	0.09
426	0.09
427	0.12
428	0.16
429	0.18
430	0.18
431	0.19
432	0.23
433	0.24
434	0.26
435	0.28
436	0.32
437	0.32
438	0.35
439	0.35
440	0.3
441	0.29
442	0.29
443	0.26
444	0.21
445	0.19
446	0.16
447	0.17
448	0.17
449	0.18
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.18
454	0.23
455	0.22
456	0.22
457	0.24
458	0.24
459	0.24
460	0.26
461	0.29
462	0.27
463	0.27
464	0.25
465	0.24
466	0.23
467	0.22
468	0.21
469	0.17
470	0.15
471	0.17
472	0.17
473	0.18
474	0.19
475	0.17
476	0.17
477	0.17
478	0.16
479	0.13
480	0.13
481	0.11
482	0.09
483	0.11

A0A178ZMD8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer