Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZIM9

Protein Details
Accession A0A178ZIM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
613-638YTLLLLRSRIRRRRWRAPKSLVDRLPHydrophilic
704-730RSPHTEKRSAKSSKRKRYTGRQVECVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
621-630RIRRRRWRAP
710-720KRSAKSSKRKR
Subcellular Location(s) extr 9, plas 5, golg 4, mito 3, E.R. 3, nucl 1, cyto 1, cyto_nucl 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046450  PA_dom_sf  
IPR003137  PA_domain  
IPR001841  Znf_RING  
IPR011016  Znf_RING-CH  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0008237  F:metallopeptidase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02225  PA  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16454  RING-H2_PA-TM-RING  
Amino Acid Sequences MRPLRFLLLLFFFVALPVALTFWSLLAASVNAVDSFQPGFNTKSGRLRAFFSFSTPSSLFPPSAVISLTNDNSTFFLARPAAFGPSLPSKGLSGQLWVGKGFGDDALLKEENIQVAGWELGCSDVPGWVEEKAKSIKNLPAVEQSQAKTKVPRSTDNDLSGRDGPESLSNESLLQDDGTDDYLHHPLPDSNPATPGEPGEPANADLSDKKQSTHADIESLQESADIAGKIVMLSRGGCGFLEKVKWAQRRGGIALIVGDNEKGAQLTIMYAKGDTSNITIPALFTSYTSAHLLSSLVPQEDGDDEDAKSKPHDKAVTANSGADQKEHANKPIFTSTKPGGTKPTPLSAAASAEEEGESWMKNVLSVMGLGDNSPFSHGEDSRRPPSSGNIDWVLLEDWKEEARLDLKDSKNTLTSAAAAATSTLKAKSTSSRRIGADDFVIGVQDWRDTDLVAPKPSTTSQNALEEAGKADPTDTASSVKASTSLDATLKGGSITPGSGEYDHEKSEHLNRFQRGNAPSNRIPSSSDILQSQEKGSWFNIFRSSQGMQEPSPENMPLNEKDNQGKEKSSTGDDEHELPGLWVTLTPTSVSASPFVDTLLVLVVSPLVTLTVVYTLLLLRSRIRRRRWRAPKSLVDRLPVRTYHTMSTASSTTSSWVESPDAASPTSPLLISANPNVSQRPRPRSQTTTGIFPGGSVESQLSHPRSPHTEKRSAKSSKRKRYTGRQVECVVCLEEYVDGESQVMSLPCGHEFHVDCITPWLVTRRRTCPICKGDVVRSMTRQSLQQYYEDEEDDDDIGRDSLEIGRTEGERTSDDVQNRVAQTVNQEPSAAIPIPSLSREDEDVERGQDPDVPLLGGSESLSSESTITPQMLRQDHGRGSERRQGRDGQSMWRNMVSASVGRLSGDTLWRQTPVDRNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.1
3 0.08
4 0.07
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.07
9 0.06
10 0.07
11 0.06
12 0.06
13 0.07
14 0.07
15 0.07
16 0.08
17 0.09
18 0.08
19 0.08
20 0.08
21 0.09
22 0.11
23 0.11
24 0.13
25 0.14
26 0.17
27 0.2
28 0.24
29 0.27
30 0.34
31 0.4
32 0.44
33 0.44
34 0.45
35 0.47
36 0.48
37 0.44
38 0.4
39 0.38
40 0.33
41 0.38
42 0.34
43 0.31
44 0.29
45 0.31
46 0.27
47 0.22
48 0.24
49 0.18
50 0.19
51 0.18
52 0.15
53 0.16
54 0.21
55 0.22
56 0.21
57 0.2
58 0.2
59 0.2
60 0.21
61 0.19
62 0.14
63 0.17
64 0.17
65 0.17
66 0.18
67 0.19
68 0.19
69 0.18
70 0.18
71 0.19
72 0.23
73 0.25
74 0.23
75 0.23
76 0.21
77 0.23
78 0.27
79 0.22
80 0.19
81 0.21
82 0.23
83 0.23
84 0.22
85 0.21
86 0.17
87 0.16
88 0.14
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.15
94 0.15
95 0.15
96 0.16
97 0.17
98 0.16
99 0.16
100 0.14
101 0.09
102 0.1
103 0.11
104 0.09
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.11
115 0.12
116 0.15
117 0.15
118 0.21
119 0.24
120 0.26
121 0.28
122 0.32
123 0.34
124 0.39
125 0.41
126 0.38
127 0.42
128 0.4
129 0.41
130 0.41
131 0.38
132 0.38
133 0.4
134 0.39
135 0.38
136 0.42
137 0.46
138 0.45
139 0.53
140 0.52
141 0.56
142 0.6
143 0.6
144 0.57
145 0.51
146 0.51
147 0.45
148 0.38
149 0.31
150 0.25
151 0.2
152 0.22
153 0.23
154 0.21
155 0.19
156 0.19
157 0.18
158 0.19
159 0.18
160 0.14
161 0.1
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.1
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.13
174 0.16
175 0.24
176 0.24
177 0.22
178 0.25
179 0.26
180 0.26
181 0.24
182 0.23
183 0.17
184 0.16
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.14
189 0.15
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.15
194 0.21
195 0.2
196 0.2
197 0.23
198 0.25
199 0.29
200 0.33
201 0.31
202 0.27
203 0.28
204 0.3
205 0.26
206 0.24
207 0.18
208 0.12
209 0.11
210 0.09
211 0.11
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.11
228 0.13
229 0.13
230 0.18
231 0.26
232 0.31
233 0.33
234 0.37
235 0.39
236 0.41
237 0.42
238 0.39
239 0.31
240 0.26
241 0.25
242 0.2
243 0.16
244 0.12
245 0.1
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.11
270 0.08
271 0.07
272 0.09
273 0.09
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.09
281 0.11
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.12
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.18
297 0.17
298 0.22
299 0.24
300 0.23
301 0.3
302 0.34
303 0.38
304 0.34
305 0.32
306 0.28
307 0.29
308 0.28
309 0.21
310 0.18
311 0.15
312 0.22
313 0.23
314 0.27
315 0.28
316 0.28
317 0.31
318 0.37
319 0.36
320 0.29
321 0.33
322 0.29
323 0.32
324 0.33
325 0.31
326 0.3
327 0.3
328 0.36
329 0.32
330 0.34
331 0.28
332 0.27
333 0.28
334 0.22
335 0.22
336 0.16
337 0.15
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.09
364 0.11
365 0.15
366 0.22
367 0.27
368 0.32
369 0.34
370 0.33
371 0.31
372 0.34
373 0.36
374 0.31
375 0.29
376 0.25
377 0.23
378 0.22
379 0.22
380 0.18
381 0.12
382 0.1
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.08
390 0.09
391 0.12
392 0.19
393 0.2
394 0.23
395 0.25
396 0.25
397 0.24
398 0.24
399 0.22
400 0.15
401 0.14
402 0.11
403 0.1
404 0.08
405 0.06
406 0.07
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.15
415 0.22
416 0.3
417 0.33
418 0.38
419 0.38
420 0.4
421 0.4
422 0.34
423 0.27
424 0.19
425 0.15
426 0.1
427 0.1
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.12
438 0.14
439 0.15
440 0.15
441 0.14
442 0.15
443 0.16
444 0.19
445 0.15
446 0.16
447 0.17
448 0.19
449 0.2
450 0.19
451 0.18
452 0.15
453 0.14
454 0.11
455 0.09
456 0.07
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.08
469 0.08
470 0.07
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.06
485 0.06
486 0.07
487 0.1
488 0.11
489 0.12
490 0.12
491 0.11
492 0.13
493 0.2
494 0.25
495 0.27
496 0.31
497 0.33
498 0.35
499 0.36
500 0.41
501 0.37
502 0.38
503 0.38
504 0.39
505 0.39
506 0.42
507 0.42
508 0.36
509 0.34
510 0.29
511 0.28
512 0.23
513 0.21
514 0.17
515 0.19
516 0.19
517 0.18
518 0.16
519 0.14
520 0.13
521 0.14
522 0.13
523 0.16
524 0.16
525 0.17
526 0.22
527 0.2
528 0.2
529 0.23
530 0.23
531 0.2
532 0.21
533 0.22
534 0.17
535 0.21
536 0.22
537 0.19
538 0.19
539 0.17
540 0.15
541 0.14
542 0.18
543 0.15
544 0.17
545 0.19
546 0.2
547 0.24
548 0.28
549 0.3
550 0.28
551 0.29
552 0.26
553 0.26
554 0.26
555 0.24
556 0.22
557 0.2
558 0.21
559 0.21
560 0.22
561 0.19
562 0.17
563 0.15
564 0.13
565 0.11
566 0.08
567 0.07
568 0.05
569 0.05
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.07
574 0.08
575 0.09
576 0.09
577 0.09
578 0.1
579 0.1
580 0.09
581 0.09
582 0.08
583 0.07
584 0.06
585 0.05
586 0.05
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.03
591 0.03
592 0.03
593 0.03
594 0.03
595 0.03
596 0.03
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.04
601 0.05
602 0.06
603 0.07
604 0.08
605 0.11
606 0.2
607 0.3
608 0.38
609 0.48
610 0.58
611 0.66
612 0.76
613 0.84
614 0.85
615 0.86
616 0.88
617 0.88
618 0.85
619 0.85
620 0.77
621 0.71
622 0.64
623 0.57
624 0.52
625 0.43
626 0.4
627 0.35
628 0.34
629 0.31
630 0.3
631 0.27
632 0.23
633 0.26
634 0.21
635 0.17
636 0.16
637 0.14
638 0.14
639 0.13
640 0.13
641 0.1
642 0.11
643 0.11
644 0.1
645 0.12
646 0.13
647 0.13
648 0.13
649 0.12
650 0.12
651 0.11
652 0.12
653 0.1
654 0.08
655 0.08
656 0.09
657 0.11
658 0.14
659 0.16
660 0.17
661 0.18
662 0.21
663 0.24
664 0.31
665 0.37
666 0.43
667 0.46
668 0.52
669 0.59
670 0.62
671 0.63
672 0.64
673 0.58
674 0.56
675 0.51
676 0.44
677 0.37
678 0.3
679 0.26
680 0.17
681 0.15
682 0.09
683 0.08
684 0.08
685 0.1
686 0.17
687 0.18
688 0.19
689 0.21
690 0.24
691 0.31
692 0.38
693 0.45
694 0.47
695 0.54
696 0.58
697 0.63
698 0.69
699 0.71
700 0.73
701 0.75
702 0.78
703 0.79
704 0.82
705 0.86
706 0.85
707 0.87
708 0.89
709 0.89
710 0.85
711 0.81
712 0.77
713 0.7
714 0.62
715 0.53
716 0.43
717 0.31
718 0.24
719 0.17
720 0.12
721 0.1
722 0.11
723 0.09
724 0.07
725 0.08
726 0.08
727 0.07
728 0.08
729 0.08
730 0.07
731 0.07
732 0.09
733 0.1
734 0.11
735 0.12
736 0.15
737 0.17
738 0.2
739 0.23
740 0.23
741 0.22
742 0.24
743 0.23
744 0.18
745 0.19
746 0.24
747 0.24
748 0.32
749 0.38
750 0.41
751 0.49
752 0.54
753 0.58
754 0.6
755 0.62
756 0.61
757 0.61
758 0.59
759 0.57
760 0.6
761 0.6
762 0.54
763 0.5
764 0.47
765 0.44
766 0.4
767 0.38
768 0.34
769 0.35
770 0.33
771 0.32
772 0.32
773 0.33
774 0.34
775 0.31
776 0.27
777 0.21
778 0.2
779 0.18
780 0.15
781 0.11
782 0.1
783 0.09
784 0.08
785 0.07
786 0.07
787 0.1
788 0.12
789 0.12
790 0.12
791 0.15
792 0.16
793 0.17
794 0.17
795 0.17
796 0.16
797 0.19
798 0.23
799 0.26
800 0.27
801 0.28
802 0.29
803 0.32
804 0.32
805 0.29
806 0.25
807 0.21
808 0.25
809 0.31
810 0.31
811 0.26
812 0.26
813 0.25
814 0.25
815 0.28
816 0.23
817 0.15
818 0.13
819 0.14
820 0.15
821 0.16
822 0.17
823 0.14
824 0.16
825 0.18
826 0.21
827 0.22
828 0.24
829 0.25
830 0.26
831 0.25
832 0.23
833 0.22
834 0.22
835 0.21
836 0.19
837 0.17
838 0.15
839 0.14
840 0.14
841 0.13
842 0.1
843 0.09
844 0.07
845 0.07
846 0.08
847 0.09
848 0.09
849 0.1
850 0.1
851 0.11
852 0.13
853 0.14
854 0.14
855 0.16
856 0.23
857 0.25
858 0.27
859 0.3
860 0.34
861 0.37
862 0.43
863 0.47
864 0.45
865 0.49
866 0.55
867 0.58
868 0.56
869 0.57
870 0.58
871 0.56
872 0.61
873 0.56
874 0.57
875 0.58
876 0.57
877 0.56
878 0.49
879 0.44
880 0.34
881 0.34
882 0.27
883 0.21
884 0.19
885 0.18
886 0.17
887 0.17
888 0.18
889 0.17
890 0.17
891 0.2
892 0.21
893 0.23
894 0.25
895 0.26
896 0.28
897 0.31