Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZSX6

Protein Details
Accession A0A178ZSX6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-63ADTEEFRKVKRKQAKPSAPAAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-53KRK
Subcellular Location(s) mito 13, cyto 6, nucl 5, extr 1, pero 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01717  Sm_B  
Amino Acid Sequences MANKQGKMQNLINYRMRVTMNDGRQMTGQMLAFDKHMNLVLADTEEFRKVKRKQAKPSAPAAPGSAAATVESEEKRTLGLVILRGTNIVSCWDNLLPGGHRQLFRLGQVYPDRLAEVFRLDWVVPWQGWGWVVRHLREQCHLEALVFRPKHQRDFQAERHHLGSLELEEVDYLGHPEDHPMGLGALLLGSEVHQEVRQQACLPDFKVAPQAQEEDFHLQDLEGGNCGYVTHSRKQSMTDLRRYMVENPKEKLDRCVVSKNIGGTYERRLSLHLHGNRPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.47
3 0.43
4 0.36
5 0.38
6 0.39
7 0.38
8 0.44
9 0.43
10 0.4
11 0.4
12 0.39
13 0.32
14 0.27
15 0.22
16 0.16
17 0.17
18 0.16
19 0.16
20 0.16
21 0.15
22 0.13
23 0.13
24 0.12
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.11
30 0.11
31 0.12
32 0.15
33 0.15
34 0.16
35 0.25
36 0.28
37 0.37
38 0.46
39 0.54
40 0.61
41 0.72
42 0.81
43 0.77
44 0.81
45 0.78
46 0.7
47 0.62
48 0.52
49 0.42
50 0.32
51 0.27
52 0.2
53 0.12
54 0.1
55 0.09
56 0.08
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.09
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.11
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.1
84 0.12
85 0.16
86 0.17
87 0.18
88 0.19
89 0.23
90 0.22
91 0.22
92 0.22
93 0.17
94 0.19
95 0.21
96 0.22
97 0.19
98 0.18
99 0.17
100 0.15
101 0.16
102 0.11
103 0.1
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.09
116 0.1
117 0.09
118 0.14
119 0.16
120 0.16
121 0.22
122 0.24
123 0.24
124 0.27
125 0.29
126 0.22
127 0.23
128 0.22
129 0.16
130 0.16
131 0.17
132 0.21
133 0.18
134 0.19
135 0.26
136 0.27
137 0.33
138 0.35
139 0.39
140 0.4
141 0.48
142 0.54
143 0.56
144 0.57
145 0.53
146 0.51
147 0.44
148 0.36
149 0.29
150 0.22
151 0.12
152 0.1
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.02
176 0.03
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.06
182 0.11
183 0.13
184 0.14
185 0.14
186 0.16
187 0.18
188 0.21
189 0.21
190 0.2
191 0.19
192 0.18
193 0.25
194 0.24
195 0.23
196 0.22
197 0.24
198 0.21
199 0.22
200 0.24
201 0.21
202 0.2
203 0.19
204 0.17
205 0.14
206 0.15
207 0.15
208 0.13
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.13
216 0.17
217 0.23
218 0.29
219 0.32
220 0.33
221 0.37
222 0.44
223 0.49
224 0.53
225 0.55
226 0.53
227 0.52
228 0.53
229 0.52
230 0.52
231 0.51
232 0.51
233 0.48
234 0.47
235 0.54
236 0.57
237 0.55
238 0.54
239 0.52
240 0.48
241 0.47
242 0.53
243 0.47
244 0.47
245 0.48
246 0.45
247 0.39
248 0.36
249 0.34
250 0.28
251 0.33
252 0.34
253 0.33
254 0.31
255 0.3
256 0.32
257 0.36
258 0.44
259 0.44