Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZXV5

Protein Details
Accession A0A178ZXV5    Localization Confidence Low Confidence Score 7.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
955-975LKEYRTQRNAEKQWRIQRCGEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 10.833, mito_nucl 9.833, cyto 7.5, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MPFKFKHLVQLLKELDTARKQAQSSSTCPARSVHELVIQWFRGYDSEILRHGPSAVAFLCCLLLDRVPHLVYGLQEKSLAGVLCKALFIENTTRGRQLHAWEATGLDLATCLEKHVMALAENDSPASHREVTLEEIHDVLWQLAANSRFASGEMKRHRNGVRSEALLRPILSRLHSGEAKWLVRMILKSYDPVQIPEHLVLGCFHFLLPDVLPFQNSLEEAIKVLEKPELISIPHHPPAALQRGYRQECARHLTPKLGVMIKRQEYFKARSIRHCCQMADTRTMSVERKYDGWYCQVHIDKSKGRDCIQLFSKRGKDSTKPWVRLHGALEAGLRLSEPDCAITQNCIIEGEMLVWSRSRKAILPFEKIRKYITYYGRAIGAAADSPRSSDEQLMVIFYDCLWHDNHNLVDEPHHKRRQRLERIVSVTEGVAELGDRQEIRFGTASAKEELQRFFGYAIEQRWEGFVLKGRTDPYFSTSCHTSAIKLKKDYIKGLGDAADLCIVGGRRDAAEAEKYGGSPNWTSFHVACLRNKEAVQTFGTEPQFLILDILTRQTMSEDTFRELNQRGLAFYLPISELTEQMNVKIDQPAIRRQPPTVLFTKPFVVEVTGAAFTKPSDVAYYTLRFPRDVRLQFGRPLTETHSFEELQEMAKESLTPAVPEEQEEVDWIERLIKADGNRHQCTDLHVGGTPSPSREPTPSMSLRMSSPLAASRTEPENIYPAQSSPGNRGGTGKYGEHLNPKVASTIQSSPLQLVANRSIALSMAIHHASGLQLSTKRKYEDSDLPTATAKRPRKDTTNRLLIPLRYCLRSETGSVHPYEPPAVFRSPMEVTDQNCSNSTERQPLSELKNVRAVRELEKHGATLADFVDHHEVENGRTVRKHVGKRGSATHPDNQSLAKPPRSLDDIILTIMSASTLSLQDVQSVNKVTMVLVQFVDKPYSRVVRNAIYEIINAVLKEYRTQRNAEKQWRIQRCGEDPEPESQPQQQRRIIFFYNVKIRSCFSVSGSDLLQGAGELLRKQEVKKYFAGGMLITIDQDRDEVVSRATWHWRESVRLLDELQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.42
3 0.39
4 0.4
5 0.35
6 0.38
7 0.36
8 0.39
9 0.45
10 0.44
11 0.44
12 0.49
13 0.5
14 0.46
15 0.46
16 0.44
17 0.41
18 0.42
19 0.41
20 0.36
21 0.36
22 0.37
23 0.39
24 0.44
25 0.39
26 0.33
27 0.29
28 0.26
29 0.2
30 0.22
31 0.23
32 0.2
33 0.23
34 0.25
35 0.28
36 0.28
37 0.27
38 0.25
39 0.22
40 0.17
41 0.17
42 0.17
43 0.15
44 0.14
45 0.14
46 0.14
47 0.12
48 0.13
49 0.11
50 0.12
51 0.12
52 0.15
53 0.19
54 0.19
55 0.19
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.24
60 0.23
61 0.19
62 0.19
63 0.19
64 0.19
65 0.21
66 0.19
67 0.13
68 0.14
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.14
73 0.12
74 0.12
75 0.15
76 0.19
77 0.25
78 0.29
79 0.32
80 0.35
81 0.34
82 0.38
83 0.38
84 0.36
85 0.38
86 0.36
87 0.35
88 0.31
89 0.32
90 0.28
91 0.25
92 0.2
93 0.1
94 0.08
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.13
106 0.15
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.16
114 0.15
115 0.14
116 0.15
117 0.17
118 0.21
119 0.24
120 0.24
121 0.2
122 0.19
123 0.19
124 0.18
125 0.17
126 0.13
127 0.09
128 0.07
129 0.07
130 0.12
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.14
137 0.19
138 0.17
139 0.26
140 0.35
141 0.42
142 0.43
143 0.5
144 0.53
145 0.55
146 0.57
147 0.55
148 0.51
149 0.47
150 0.5
151 0.46
152 0.45
153 0.39
154 0.35
155 0.29
156 0.26
157 0.24
158 0.22
159 0.22
160 0.21
161 0.25
162 0.26
163 0.25
164 0.29
165 0.34
166 0.32
167 0.3
168 0.28
169 0.24
170 0.25
171 0.26
172 0.22
173 0.22
174 0.21
175 0.23
176 0.25
177 0.29
178 0.26
179 0.28
180 0.27
181 0.24
182 0.26
183 0.24
184 0.23
185 0.18
186 0.17
187 0.15
188 0.15
189 0.13
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.12
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.14
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.11
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.16
219 0.2
220 0.25
221 0.28
222 0.27
223 0.24
224 0.24
225 0.3
226 0.36
227 0.34
228 0.29
229 0.32
230 0.42
231 0.45
232 0.49
233 0.45
234 0.41
235 0.43
236 0.49
237 0.47
238 0.44
239 0.41
240 0.41
241 0.4
242 0.38
243 0.37
244 0.35
245 0.32
246 0.33
247 0.4
248 0.4
249 0.42
250 0.4
251 0.41
252 0.42
253 0.45
254 0.47
255 0.47
256 0.46
257 0.53
258 0.6
259 0.61
260 0.62
261 0.6
262 0.53
263 0.5
264 0.56
265 0.49
266 0.47
267 0.42
268 0.35
269 0.33
270 0.35
271 0.31
272 0.25
273 0.23
274 0.19
275 0.2
276 0.22
277 0.24
278 0.24
279 0.28
280 0.26
281 0.25
282 0.3
283 0.32
284 0.31
285 0.31
286 0.35
287 0.35
288 0.4
289 0.43
290 0.41
291 0.39
292 0.44
293 0.42
294 0.43
295 0.45
296 0.47
297 0.45
298 0.48
299 0.52
300 0.47
301 0.49
302 0.46
303 0.44
304 0.42
305 0.5
306 0.53
307 0.53
308 0.53
309 0.57
310 0.56
311 0.54
312 0.5
313 0.42
314 0.33
315 0.27
316 0.26
317 0.18
318 0.15
319 0.11
320 0.09
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.09
328 0.1
329 0.11
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.09
343 0.1
344 0.11
345 0.11
346 0.14
347 0.19
348 0.29
349 0.33
350 0.41
351 0.47
352 0.54
353 0.57
354 0.54
355 0.51
356 0.43
357 0.43
358 0.43
359 0.42
360 0.41
361 0.38
362 0.38
363 0.36
364 0.34
365 0.29
366 0.21
367 0.15
368 0.09
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.13
392 0.13
393 0.13
394 0.14
395 0.13
396 0.16
397 0.22
398 0.28
399 0.35
400 0.42
401 0.43
402 0.48
403 0.58
404 0.65
405 0.69
406 0.71
407 0.68
408 0.68
409 0.7
410 0.66
411 0.56
412 0.46
413 0.35
414 0.25
415 0.18
416 0.1
417 0.05
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.05
422 0.05
423 0.04
424 0.07
425 0.07
426 0.09
427 0.09
428 0.1
429 0.12
430 0.14
431 0.16
432 0.15
433 0.16
434 0.17
435 0.19
436 0.19
437 0.19
438 0.16
439 0.15
440 0.14
441 0.13
442 0.13
443 0.13
444 0.14
445 0.12
446 0.12
447 0.12
448 0.12
449 0.12
450 0.12
451 0.09
452 0.14
453 0.14
454 0.15
455 0.16
456 0.17
457 0.17
458 0.18
459 0.18
460 0.17
461 0.17
462 0.17
463 0.18
464 0.19
465 0.18
466 0.18
467 0.18
468 0.16
469 0.21
470 0.29
471 0.31
472 0.31
473 0.35
474 0.38
475 0.41
476 0.41
477 0.38
478 0.32
479 0.27
480 0.27
481 0.23
482 0.18
483 0.15
484 0.13
485 0.08
486 0.06
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.07
498 0.08
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.1
503 0.1
504 0.1
505 0.09
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.12
510 0.12
511 0.15
512 0.2
513 0.22
514 0.23
515 0.27
516 0.28
517 0.28
518 0.28
519 0.27
520 0.22
521 0.21
522 0.2
523 0.17
524 0.16
525 0.19
526 0.2
527 0.17
528 0.15
529 0.13
530 0.13
531 0.1
532 0.1
533 0.04
534 0.05
535 0.05
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.06
542 0.07
543 0.1
544 0.1
545 0.12
546 0.13
547 0.13
548 0.17
549 0.17
550 0.17
551 0.16
552 0.15
553 0.13
554 0.13
555 0.13
556 0.1
557 0.09
558 0.08
559 0.06
560 0.06
561 0.07
562 0.07
563 0.08
564 0.08
565 0.11
566 0.1
567 0.1
568 0.13
569 0.12
570 0.12
571 0.13
572 0.13
573 0.15
574 0.17
575 0.24
576 0.27
577 0.31
578 0.32
579 0.3
580 0.36
581 0.34
582 0.36
583 0.32
584 0.3
585 0.27
586 0.27
587 0.28
588 0.23
589 0.2
590 0.16
591 0.14
592 0.11
593 0.09
594 0.1
595 0.09
596 0.08
597 0.08
598 0.08
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.06
603 0.06
604 0.07
605 0.09
606 0.12
607 0.14
608 0.15
609 0.18
610 0.19
611 0.19
612 0.18
613 0.23
614 0.29
615 0.3
616 0.32
617 0.35
618 0.37
619 0.4
620 0.41
621 0.36
622 0.27
623 0.27
624 0.27
625 0.27
626 0.26
627 0.24
628 0.25
629 0.24
630 0.23
631 0.23
632 0.19
633 0.14
634 0.13
635 0.12
636 0.1
637 0.1
638 0.09
639 0.08
640 0.11
641 0.1
642 0.09
643 0.08
644 0.11
645 0.11
646 0.12
647 0.13
648 0.11
649 0.11
650 0.11
651 0.11
652 0.09
653 0.09
654 0.08
655 0.08
656 0.08
657 0.09
658 0.09
659 0.11
660 0.12
661 0.19
662 0.26
663 0.32
664 0.33
665 0.33
666 0.34
667 0.32
668 0.35
669 0.34
670 0.28
671 0.21
672 0.21
673 0.2
674 0.19
675 0.21
676 0.17
677 0.13
678 0.14
679 0.14
680 0.15
681 0.16
682 0.19
683 0.2
684 0.26
685 0.26
686 0.28
687 0.27
688 0.27
689 0.25
690 0.25
691 0.23
692 0.16
693 0.15
694 0.15
695 0.16
696 0.15
697 0.16
698 0.16
699 0.18
700 0.19
701 0.18
702 0.15
703 0.17
704 0.17
705 0.18
706 0.15
707 0.13
708 0.14
709 0.17
710 0.17
711 0.18
712 0.25
713 0.23
714 0.23
715 0.25
716 0.24
717 0.25
718 0.27
719 0.22
720 0.17
721 0.19
722 0.21
723 0.25
724 0.25
725 0.25
726 0.23
727 0.23
728 0.23
729 0.2
730 0.2
731 0.18
732 0.2
733 0.2
734 0.22
735 0.21
736 0.2
737 0.22
738 0.21
739 0.17
740 0.18
741 0.17
742 0.16
743 0.16
744 0.16
745 0.14
746 0.13
747 0.12
748 0.09
749 0.07
750 0.09
751 0.09
752 0.09
753 0.09
754 0.09
755 0.08
756 0.08
757 0.08
758 0.08
759 0.12
760 0.16
761 0.2
762 0.24
763 0.26
764 0.27
765 0.29
766 0.33
767 0.38
768 0.4
769 0.43
770 0.41
771 0.4
772 0.41
773 0.4
774 0.38
775 0.38
776 0.39
777 0.37
778 0.44
779 0.47
780 0.55
781 0.63
782 0.69
783 0.7
784 0.73
785 0.69
786 0.66
787 0.66
788 0.59
789 0.52
790 0.49
791 0.42
792 0.33
793 0.33
794 0.3
795 0.29
796 0.28
797 0.27
798 0.24
799 0.26
800 0.28
801 0.29
802 0.28
803 0.26
804 0.25
805 0.26
806 0.22
807 0.19
808 0.19
809 0.19
810 0.18
811 0.17
812 0.21
813 0.2
814 0.2
815 0.23
816 0.23
817 0.23
818 0.28
819 0.3
820 0.27
821 0.27
822 0.29
823 0.25
824 0.27
825 0.29
826 0.32
827 0.3
828 0.31
829 0.33
830 0.36
831 0.39
832 0.41
833 0.4
834 0.34
835 0.42
836 0.41
837 0.39
838 0.38
839 0.36
840 0.36
841 0.4
842 0.42
843 0.38
844 0.38
845 0.37
846 0.32
847 0.3
848 0.23
849 0.18
850 0.14
851 0.1
852 0.1
853 0.12
854 0.16
855 0.15
856 0.15
857 0.16
858 0.17
859 0.16
860 0.24
861 0.24
862 0.22
863 0.23
864 0.25
865 0.31
866 0.39
867 0.46
868 0.47
869 0.55
870 0.59
871 0.63
872 0.68
873 0.66
874 0.66
875 0.64
876 0.62
877 0.57
878 0.53
879 0.49
880 0.43
881 0.38
882 0.38
883 0.41
884 0.39
885 0.36
886 0.35
887 0.38
888 0.41
889 0.39
890 0.32
891 0.3
892 0.26
893 0.25
894 0.24
895 0.19
896 0.14
897 0.12
898 0.1
899 0.05
900 0.04
901 0.05
902 0.06
903 0.07
904 0.1
905 0.1
906 0.14
907 0.15
908 0.17
909 0.19
910 0.2
911 0.19
912 0.18
913 0.18
914 0.14
915 0.18
916 0.18
917 0.16
918 0.15
919 0.17
920 0.18
921 0.19
922 0.23
923 0.18
924 0.19
925 0.23
926 0.29
927 0.29
928 0.31
929 0.35
930 0.37
931 0.4
932 0.41
933 0.38
934 0.33
935 0.31
936 0.27
937 0.24
938 0.19
939 0.15
940 0.14
941 0.14
942 0.13
943 0.18
944 0.25
945 0.31
946 0.34
947 0.39
948 0.46
949 0.54
950 0.64
951 0.69
952 0.72
953 0.73
954 0.8
955 0.84
956 0.81
957 0.76
958 0.74
959 0.7
960 0.68
961 0.63
962 0.59
963 0.52
964 0.52
965 0.5
966 0.45
967 0.42
968 0.41
969 0.46
970 0.48
971 0.54
972 0.54
973 0.55
974 0.58
975 0.62
976 0.57
977 0.55
978 0.52
979 0.53
980 0.57
981 0.55
982 0.53
983 0.48
984 0.47
985 0.44
986 0.42
987 0.36
988 0.29
989 0.32
990 0.31
991 0.32
992 0.31
993 0.27
994 0.23
995 0.21
996 0.18
997 0.11
998 0.1
999 0.09
1000 0.1
1001 0.1
1002 0.11
1003 0.16
1004 0.19
1005 0.21
1006 0.28
1007 0.33
1008 0.36
1009 0.38
1010 0.41
1011 0.39
1012 0.39
1013 0.39
1014 0.31
1015 0.26
1016 0.23
1017 0.2
1018 0.16
1019 0.14
1020 0.12
1021 0.1
1022 0.1
1023 0.09
1024 0.09
1025 0.11
1026 0.12
1027 0.12
1028 0.15
1029 0.18
1030 0.22
1031 0.3
1032 0.31
1033 0.31
1034 0.36
1035 0.38
1036 0.41
1037 0.42
1038 0.47
1039 0.41
1040 0.41