Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZSY5

Protein Details
Accession A0A178ZSY5    Localization Confidence Low Confidence Score 6.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-108KMYLEFRIKHLKKKNPVKYRTEFNKVNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14, cyto 6.5, cyto_nucl 6, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF13181  TPR_8  
Amino Acid Sequences MPGTLRRSHNDSKVAMKSLKPDLYLIANEDTIYEQDILRNPGSVRPWLTYIDFKMRNGTIHEQAFVQERACIQLPRSYKLWKMYLEFRIKHLKKKNPVKYRTEFNKVNALFERALILLNKMPVIWEMYLAFLLRQPYVTKTRRTFDRALRALPVTQHNRIWKLYKSFANSAGGETAVRVWARYVQVHPEDMEDYIELLIETGHYLEAVKRYIQILNNPKFVSKHVKSEFQLWSEMVELMVDKARHIGNSSVAGFDPDTIIRSGIERFADQRGKLWAGLATYWITRGDFEKARDVFEEGITTVMTVRDFTMIFDAYVEFEESILSTLMDAASARAAKGVVDPDKDFELDLRMMRFEHLMDRRPFLVNDVLLRQNPNNVVEWEKRVALWNDNKQEIVQTYADAIAAVAPKKAVGKFHELWLNYAKFYEEAGDLDTARMILDKAVKVPYKSVAELADTWIGWAEMELRNENFDGAMKVMATATKAPKRSTVDYFDETLSPQQRVHKSWKVWSFYVDLVESVGSLDDTRAVYDRIFELRIATPQTVVNYANLLEEHGYYEESFKVYERGLDVFTYPVAFELWNLYLTKAVDRKIGIERLRDLFEQAVEQCPPSFAKPIYLMYGSLEEERGLARSAMRIYERATRAVSDEDRLSMFEFYITKSATNFGLTSTRPIYERAIAALPDKEAKIMCLKFAEMERRLGEIDRARAIYGHASQFADPRVDRGFWETWEKFEVAHGNEDTFKEMLRIKRSVAAQFNTDVAFIASQAVARGQAAAAAAGEGEGVGAEQRDGEVQDAMAALERQARAPVGFVAASTGPEGGNRAAPPNTVDETDHTADQDASANPDALDVDIDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.56
3 0.5
4 0.49
5 0.51
6 0.51
7 0.44
8 0.39
9 0.35
10 0.36
11 0.35
12 0.32
13 0.26
14 0.22
15 0.21
16 0.2
17 0.19
18 0.15
19 0.16
20 0.13
21 0.11
22 0.15
23 0.19
24 0.23
25 0.22
26 0.25
27 0.23
28 0.28
29 0.31
30 0.32
31 0.31
32 0.3
33 0.32
34 0.32
35 0.34
36 0.35
37 0.36
38 0.41
39 0.41
40 0.39
41 0.43
42 0.41
43 0.41
44 0.41
45 0.42
46 0.39
47 0.38
48 0.38
49 0.32
50 0.32
51 0.35
52 0.3
53 0.24
54 0.19
55 0.17
56 0.21
57 0.23
58 0.23
59 0.2
60 0.25
61 0.28
62 0.31
63 0.34
64 0.35
65 0.37
66 0.43
67 0.47
68 0.45
69 0.46
70 0.5
71 0.56
72 0.61
73 0.57
74 0.55
75 0.6
76 0.59
77 0.64
78 0.65
79 0.66
80 0.67
81 0.77
82 0.82
83 0.82
84 0.87
85 0.87
86 0.84
87 0.85
88 0.83
89 0.81
90 0.76
91 0.68
92 0.7
93 0.6
94 0.58
95 0.5
96 0.46
97 0.37
98 0.32
99 0.3
100 0.2
101 0.21
102 0.17
103 0.16
104 0.14
105 0.15
106 0.15
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.15
111 0.13
112 0.12
113 0.11
114 0.12
115 0.13
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.12
120 0.11
121 0.12
122 0.13
123 0.18
124 0.27
125 0.33
126 0.39
127 0.43
128 0.5
129 0.56
130 0.62
131 0.65
132 0.64
133 0.69
134 0.64
135 0.61
136 0.58
137 0.53
138 0.47
139 0.44
140 0.44
141 0.39
142 0.39
143 0.41
144 0.43
145 0.45
146 0.47
147 0.47
148 0.44
149 0.45
150 0.48
151 0.48
152 0.49
153 0.49
154 0.48
155 0.48
156 0.42
157 0.37
158 0.31
159 0.25
160 0.19
161 0.16
162 0.13
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.13
168 0.16
169 0.18
170 0.2
171 0.24
172 0.27
173 0.28
174 0.28
175 0.25
176 0.24
177 0.21
178 0.2
179 0.12
180 0.11
181 0.09
182 0.09
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.07
193 0.09
194 0.11
195 0.11
196 0.12
197 0.14
198 0.18
199 0.2
200 0.27
201 0.35
202 0.39
203 0.44
204 0.43
205 0.43
206 0.4
207 0.41
208 0.43
209 0.36
210 0.4
211 0.39
212 0.45
213 0.45
214 0.52
215 0.52
216 0.43
217 0.42
218 0.32
219 0.29
220 0.23
221 0.22
222 0.14
223 0.1
224 0.08
225 0.07
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.11
230 0.11
231 0.12
232 0.13
233 0.14
234 0.13
235 0.17
236 0.17
237 0.15
238 0.15
239 0.15
240 0.14
241 0.12
242 0.11
243 0.08
244 0.09
245 0.08
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.11
253 0.13
254 0.19
255 0.23
256 0.22
257 0.24
258 0.25
259 0.25
260 0.24
261 0.23
262 0.18
263 0.15
264 0.15
265 0.14
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.14
274 0.16
275 0.18
276 0.26
277 0.26
278 0.27
279 0.27
280 0.27
281 0.23
282 0.19
283 0.18
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.11
325 0.12
326 0.14
327 0.15
328 0.16
329 0.17
330 0.17
331 0.15
332 0.12
333 0.12
334 0.11
335 0.12
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.11
341 0.09
342 0.14
343 0.17
344 0.24
345 0.25
346 0.26
347 0.27
348 0.28
349 0.28
350 0.23
351 0.22
352 0.16
353 0.16
354 0.17
355 0.17
356 0.17
357 0.18
358 0.16
359 0.16
360 0.17
361 0.17
362 0.15
363 0.14
364 0.18
365 0.18
366 0.21
367 0.19
368 0.18
369 0.17
370 0.19
371 0.2
372 0.22
373 0.27
374 0.31
375 0.33
376 0.34
377 0.34
378 0.3
379 0.3
380 0.24
381 0.2
382 0.13
383 0.1
384 0.09
385 0.1
386 0.09
387 0.08
388 0.07
389 0.05
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.06
395 0.08
396 0.09
397 0.11
398 0.13
399 0.2
400 0.21
401 0.24
402 0.28
403 0.26
404 0.27
405 0.3
406 0.27
407 0.2
408 0.19
409 0.16
410 0.12
411 0.12
412 0.11
413 0.07
414 0.06
415 0.07
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.05
422 0.05
423 0.04
424 0.05
425 0.07
426 0.07
427 0.09
428 0.13
429 0.15
430 0.15
431 0.16
432 0.19
433 0.18
434 0.18
435 0.18
436 0.14
437 0.14
438 0.14
439 0.15
440 0.12
441 0.1
442 0.09
443 0.08
444 0.07
445 0.06
446 0.05
447 0.06
448 0.08
449 0.09
450 0.1
451 0.1
452 0.11
453 0.11
454 0.11
455 0.09
456 0.07
457 0.07
458 0.06
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.06
465 0.08
466 0.13
467 0.17
468 0.2
469 0.21
470 0.26
471 0.31
472 0.34
473 0.35
474 0.36
475 0.37
476 0.37
477 0.38
478 0.33
479 0.29
480 0.25
481 0.25
482 0.21
483 0.17
484 0.16
485 0.21
486 0.24
487 0.27
488 0.35
489 0.38
490 0.39
491 0.45
492 0.51
493 0.48
494 0.45
495 0.44
496 0.38
497 0.32
498 0.31
499 0.23
500 0.16
501 0.12
502 0.11
503 0.09
504 0.06
505 0.05
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.07
513 0.07
514 0.07
515 0.08
516 0.1
517 0.1
518 0.11
519 0.1
520 0.12
521 0.12
522 0.15
523 0.16
524 0.15
525 0.14
526 0.14
527 0.15
528 0.14
529 0.14
530 0.12
531 0.1
532 0.11
533 0.1
534 0.09
535 0.09
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.08
541 0.07
542 0.09
543 0.09
544 0.08
545 0.09
546 0.08
547 0.09
548 0.09
549 0.1
550 0.1
551 0.11
552 0.11
553 0.11
554 0.11
555 0.1
556 0.1
557 0.09
558 0.08
559 0.07
560 0.06
561 0.06
562 0.05
563 0.08
564 0.08
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.11
569 0.12
570 0.16
571 0.16
572 0.17
573 0.18
574 0.18
575 0.21
576 0.24
577 0.31
578 0.3
579 0.3
580 0.33
581 0.33
582 0.35
583 0.32
584 0.28
585 0.22
586 0.2
587 0.18
588 0.16
589 0.16
590 0.13
591 0.14
592 0.13
593 0.13
594 0.14
595 0.13
596 0.16
597 0.14
598 0.17
599 0.19
600 0.2
601 0.22
602 0.21
603 0.2
604 0.17
605 0.19
606 0.16
607 0.14
608 0.13
609 0.1
610 0.1
611 0.1
612 0.1
613 0.09
614 0.08
615 0.08
616 0.1
617 0.11
618 0.14
619 0.15
620 0.15
621 0.17
622 0.25
623 0.26
624 0.26
625 0.26
626 0.24
627 0.25
628 0.28
629 0.27
630 0.22
631 0.21
632 0.19
633 0.19
634 0.19
635 0.18
636 0.14
637 0.12
638 0.11
639 0.11
640 0.11
641 0.14
642 0.14
643 0.13
644 0.13
645 0.15
646 0.14
647 0.14
648 0.13
649 0.12
650 0.15
651 0.15
652 0.19
653 0.19
654 0.2
655 0.19
656 0.21
657 0.23
658 0.22
659 0.22
660 0.2
661 0.2
662 0.19
663 0.21
664 0.2
665 0.18
666 0.18
667 0.17
668 0.16
669 0.14
670 0.15
671 0.21
672 0.2
673 0.21
674 0.2
675 0.2
676 0.21
677 0.26
678 0.33
679 0.27
680 0.31
681 0.3
682 0.3
683 0.31
684 0.29
685 0.3
686 0.27
687 0.28
688 0.27
689 0.27
690 0.25
691 0.25
692 0.25
693 0.24
694 0.23
695 0.22
696 0.21
697 0.21
698 0.22
699 0.25
700 0.25
701 0.25
702 0.21
703 0.22
704 0.22
705 0.22
706 0.22
707 0.25
708 0.25
709 0.23
710 0.32
711 0.3
712 0.29
713 0.31
714 0.31
715 0.25
716 0.26
717 0.3
718 0.22
719 0.27
720 0.26
721 0.24
722 0.26
723 0.27
724 0.26
725 0.2
726 0.19
727 0.16
728 0.21
729 0.26
730 0.29
731 0.31
732 0.3
733 0.36
734 0.4
735 0.44
736 0.46
737 0.43
738 0.39
739 0.38
740 0.38
741 0.32
742 0.28
743 0.21
744 0.14
745 0.12
746 0.09
747 0.09
748 0.08
749 0.07
750 0.08
751 0.08
752 0.08
753 0.08
754 0.08
755 0.07
756 0.08
757 0.08
758 0.07
759 0.07
760 0.06
761 0.06
762 0.05
763 0.05
764 0.03
765 0.03
766 0.03
767 0.03
768 0.03
769 0.04
770 0.04
771 0.04
772 0.05
773 0.06
774 0.07
775 0.09
776 0.09
777 0.08
778 0.09
779 0.09
780 0.09
781 0.1
782 0.09
783 0.09
784 0.13
785 0.14
786 0.14
787 0.16
788 0.17
789 0.15
790 0.17
791 0.17
792 0.14
793 0.14
794 0.13
795 0.15
796 0.14
797 0.14
798 0.13
799 0.13
800 0.1
801 0.11
802 0.13
803 0.11
804 0.15
805 0.16
806 0.19
807 0.2
808 0.21
809 0.22
810 0.25
811 0.27
812 0.24
813 0.25
814 0.24
815 0.3
816 0.32
817 0.31
818 0.26
819 0.25
820 0.23
821 0.22
822 0.23
823 0.16
824 0.18
825 0.19
826 0.19
827 0.17
828 0.18
829 0.17
830 0.13
831 0.13