FuNGI

A0A178ZQ99

Protein Details

Accession

A0A178ZQ99

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
417-442	ANPGGGKRKGAKGKRGKNGNEKYGLQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
419-434	PGGGKRKGAKGKRGKN

Subcellular Location(s)

nucl 11, mito 11, mito_nucl 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRKRWIDKNSAQTFQLLYRPQTDPALHDEAAGERALYQVAGPGSSSSHKPEFKEGLHLTDLENGLDFEDMRENEGEAAQYGIYYDDTSYDYMQHLRDIGEGGGESHFVESVPVKGKGKAKTVKLEDALRELSVDDSQSVAASDMFSTFSTSTRPRTYQNQQEVPDEIAGFQPDMDPRLREVLEALDDDAYVDDKDDEDIFAALTQDGRNGELDLEDFEANYVEDEDEGWESDVTEKAPEQPSELKLTPTVPATTELPPPDAEIAAAEDGDWLRDFAKFKRDNARKAPPKAAESIIAASAIHDKAPTLYTLNGTPLRQKKRKGALTNPSSYSMTSSSLARTSGQQLLDARFDQVEKMYSLDEGEEFDDMDGGMSLASGMTGRSKMSQLSTTSFADEGAVREDFDSMMDGFLGDWNKANPGGGKRKGAKGKRGKNGNEKYGLQQLDEVRAELGPARIHRRTTTKT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.44
3	0.43
4	0.37
5	0.32
6	0.34
7	0.35
8	0.35
9	0.39
10	0.36
11	0.32
12	0.35
13	0.38
14	0.32
15	0.3
16	0.29
17	0.25
18	0.25
19	0.22
20	0.15
21	0.09
22	0.1
23	0.09
24	0.08
25	0.07
26	0.09
27	0.09
28	0.1
29	0.1
30	0.1
31	0.12
32	0.15
33	0.17
34	0.2
35	0.27
36	0.31
37	0.33
38	0.4
39	0.44
40	0.43
41	0.5
42	0.46
43	0.42
44	0.41
45	0.39
46	0.32
47	0.31
48	0.3
49	0.2
50	0.19
51	0.14
52	0.13
53	0.13
54	0.12
55	0.08
56	0.13
57	0.13
58	0.15
59	0.15
60	0.15
61	0.15
62	0.16
63	0.15
64	0.09
65	0.1
66	0.07
67	0.07
68	0.07
69	0.07
70	0.07
71	0.07
72	0.06
73	0.07
74	0.09
75	0.1
76	0.11
77	0.11
78	0.12
79	0.14
80	0.15
81	0.14
82	0.14
83	0.13
84	0.13
85	0.14
86	0.12
87	0.1
88	0.09
89	0.09
90	0.08
91	0.08
92	0.08
93	0.07
94	0.07
95	0.06
96	0.07
97	0.07
98	0.1
99	0.14
100	0.17
101	0.19
102	0.24
103	0.3
104	0.34
105	0.43
106	0.46
107	0.47
108	0.53
109	0.56
110	0.57
111	0.55
112	0.54
113	0.47
114	0.44
115	0.39
116	0.3
117	0.25
118	0.2
119	0.17
120	0.13
121	0.12
122	0.08
123	0.07
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.06
128	0.06
129	0.06
130	0.06
131	0.06
132	0.07
133	0.07
134	0.09
135	0.08
136	0.09
137	0.13
138	0.15
139	0.2
140	0.23
141	0.25
142	0.27
143	0.35
144	0.44
145	0.49
146	0.56
147	0.58
148	0.55
149	0.55
150	0.53
151	0.46
152	0.38
153	0.28
154	0.2
155	0.14
156	0.12
157	0.09
158	0.08
159	0.08
160	0.07
161	0.09
162	0.1
163	0.1
164	0.1
165	0.14
166	0.14
167	0.13
168	0.13
169	0.12
170	0.12
171	0.12
172	0.11
173	0.08
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.06
178	0.05
179	0.05
180	0.04
181	0.04
182	0.06
183	0.06
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.04
191	0.05
192	0.05
193	0.06
194	0.06
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.06
200	0.07
201	0.06
202	0.07
203	0.07
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.05
210	0.03
211	0.03
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.05
217	0.04
218	0.05
219	0.05
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.1
225	0.12
226	0.12
227	0.14
228	0.17
229	0.18
230	0.23
231	0.23
232	0.2
233	0.18
234	0.19
235	0.18
236	0.16
237	0.15
238	0.1
239	0.11
240	0.13
241	0.14
242	0.16
243	0.16
244	0.16
245	0.15
246	0.15
247	0.14
248	0.11
249	0.09
250	0.06
251	0.07
252	0.06
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.04
260	0.05
261	0.07
262	0.09
263	0.11
264	0.21
265	0.23
266	0.27
267	0.38
268	0.44
269	0.49
270	0.56
271	0.65
272	0.64
273	0.66
274	0.7
275	0.63
276	0.59
277	0.55
278	0.48
279	0.38
280	0.31
281	0.27
282	0.19
283	0.15
284	0.12
285	0.1
286	0.12
287	0.1
288	0.09
289	0.08
290	0.07
291	0.08
292	0.09
293	0.1
294	0.08
295	0.09
296	0.1
297	0.11
298	0.16
299	0.17
300	0.17
301	0.24
302	0.31
303	0.41
304	0.46
305	0.5
306	0.55
307	0.63
308	0.71
309	0.72
310	0.73
311	0.73
312	0.75
313	0.75
314	0.68
315	0.61
316	0.53
317	0.45
318	0.37
319	0.28
320	0.22
321	0.18
322	0.16
323	0.15
324	0.15
325	0.16
326	0.14
327	0.15
328	0.17
329	0.2
330	0.19
331	0.2
332	0.22
333	0.23
334	0.25
335	0.24
336	0.21
337	0.17
338	0.17
339	0.15
340	0.14
341	0.14
342	0.11
343	0.12
344	0.11
345	0.11
346	0.11
347	0.11
348	0.09
349	0.09
350	0.09
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.07
355	0.06
356	0.06
357	0.05
358	0.04
359	0.04
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.06
367	0.07
368	0.08
369	0.1
370	0.11
371	0.13
372	0.16
373	0.21
374	0.22
375	0.25
376	0.28
377	0.27
378	0.27
379	0.25
380	0.22
381	0.19
382	0.17
383	0.15
384	0.14
385	0.13
386	0.12
387	0.12
388	0.13
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.08
393	0.08
394	0.08
395	0.07
396	0.07
397	0.1
398	0.11
399	0.1
400	0.11
401	0.12
402	0.14
403	0.14
404	0.15
405	0.17
406	0.25
407	0.35
408	0.39
409	0.47
410	0.51
411	0.6
412	0.68
413	0.72
414	0.73
415	0.75
416	0.79
417	0.8
418	0.85
419	0.85
420	0.86
421	0.87
422	0.85
423	0.81
424	0.73
425	0.68
426	0.66
427	0.58
428	0.48
429	0.43
430	0.37
431	0.37
432	0.35
433	0.31
434	0.24
435	0.22
436	0.22
437	0.19
438	0.2
439	0.18
440	0.23
441	0.3
442	0.34
443	0.37
444	0.43

A0A178ZQ99

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer