Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZNX7

Protein Details
Accession A0A178ZNX7    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-123FDTLNKSIKVKKRKRAEGEEPAPKKKKERRREKKSRRAESEALSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-119IKVKKRKRAEGEEPAPKKKKERRREKKSRRAES
130-138GKRSRKSKA
175-183KRSSGKRIR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDYGEEAPPPDAEGLDRPDEHEDQLDDLHDEFEDPQPEHDADTRPNAVDDSDDESLLSEVDEAQFADFDPRAVEVAPDFDTLNKSIKVKKRKRAEGEEPAPKKKKERRREKKSRRAESEALSGGDEVEGKRSRKSKAASGGTQPRERVEINEEDLTPEERRRRALDRAMDAAVKRSSGKRIRKGEIDLEQAADAEIEDLRNRMIAAAEADGELVRQGEPASQKLKMLPEVVSLLNRNTYVQSILDPEMNLLEAVRFFLEPLTDGSLPAYNIQRELFAALSKLPMNKETLISSGIGKVILFYRKSKKAEPAIKRQATKLMEDWSRPILGRSDDHMKKVWATATYDPTRRREAAPVAIPKAKSTIAPGERVSNRAKVQTTPLNYHIVPQLSSTVPHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.23
4 0.23
5 0.24
6 0.29
7 0.3
8 0.29
9 0.28
10 0.25
11 0.22
12 0.22
13 0.21
14 0.17
15 0.16
16 0.15
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.15
21 0.18
22 0.18
23 0.18
24 0.22
25 0.22
26 0.23
27 0.26
28 0.26
29 0.25
30 0.3
31 0.32
32 0.28
33 0.28
34 0.27
35 0.23
36 0.2
37 0.19
38 0.19
39 0.17
40 0.17
41 0.16
42 0.16
43 0.16
44 0.14
45 0.12
46 0.06
47 0.05
48 0.06
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.07
63 0.1
64 0.11
65 0.12
66 0.11
67 0.12
68 0.14
69 0.15
70 0.19
71 0.19
72 0.2
73 0.27
74 0.36
75 0.46
76 0.53
77 0.61
78 0.68
79 0.76
80 0.82
81 0.84
82 0.85
83 0.85
84 0.84
85 0.85
86 0.81
87 0.8
88 0.77
89 0.69
90 0.69
91 0.68
92 0.7
93 0.7
94 0.76
95 0.78
96 0.83
97 0.92
98 0.94
99 0.95
100 0.95
101 0.95
102 0.92
103 0.88
104 0.82
105 0.74
106 0.68
107 0.6
108 0.49
109 0.39
110 0.3
111 0.22
112 0.17
113 0.14
114 0.08
115 0.12
116 0.16
117 0.16
118 0.21
119 0.25
120 0.28
121 0.34
122 0.37
123 0.38
124 0.44
125 0.49
126 0.48
127 0.52
128 0.59
129 0.58
130 0.57
131 0.51
132 0.42
133 0.38
134 0.35
135 0.29
136 0.24
137 0.21
138 0.22
139 0.23
140 0.22
141 0.2
142 0.21
143 0.21
144 0.17
145 0.19
146 0.2
147 0.2
148 0.23
149 0.26
150 0.3
151 0.34
152 0.4
153 0.41
154 0.4
155 0.41
156 0.39
157 0.37
158 0.33
159 0.3
160 0.23
161 0.17
162 0.15
163 0.14
164 0.22
165 0.29
166 0.37
167 0.43
168 0.5
169 0.53
170 0.55
171 0.57
172 0.54
173 0.49
174 0.45
175 0.36
176 0.29
177 0.26
178 0.22
179 0.18
180 0.12
181 0.08
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.06
206 0.08
207 0.11
208 0.13
209 0.13
210 0.14
211 0.16
212 0.18
213 0.17
214 0.17
215 0.15
216 0.14
217 0.16
218 0.16
219 0.15
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.12
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.11
231 0.12
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.06
239 0.05
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.12
253 0.13
254 0.13
255 0.15
256 0.16
257 0.12
258 0.14
259 0.14
260 0.13
261 0.12
262 0.13
263 0.11
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.1
268 0.11
269 0.13
270 0.13
271 0.14
272 0.17
273 0.17
274 0.18
275 0.17
276 0.17
277 0.16
278 0.16
279 0.15
280 0.13
281 0.12
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.12
286 0.16
287 0.17
288 0.22
289 0.3
290 0.38
291 0.43
292 0.47
293 0.52
294 0.57
295 0.65
296 0.68
297 0.7
298 0.73
299 0.76
300 0.73
301 0.67
302 0.65
303 0.57
304 0.52
305 0.44
306 0.41
307 0.38
308 0.37
309 0.38
310 0.33
311 0.32
312 0.29
313 0.27
314 0.23
315 0.23
316 0.23
317 0.25
318 0.33
319 0.34
320 0.37
321 0.38
322 0.35
323 0.34
324 0.35
325 0.33
326 0.26
327 0.28
328 0.31
329 0.37
330 0.42
331 0.47
332 0.49
333 0.5
334 0.54
335 0.52
336 0.49
337 0.47
338 0.47
339 0.48
340 0.51
341 0.54
342 0.53
343 0.56
344 0.53
345 0.47
346 0.44
347 0.37
348 0.29
349 0.27
350 0.31
351 0.3
352 0.34
353 0.35
354 0.41
355 0.42
356 0.46
357 0.45
358 0.42
359 0.41
360 0.43
361 0.44
362 0.38
363 0.44
364 0.48
365 0.5
366 0.49
367 0.49
368 0.49
369 0.46
370 0.47
371 0.44
372 0.38
373 0.32
374 0.28
375 0.28
376 0.23