Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178Z2T1

Protein Details
Accession A0A178Z2T1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
184-206REPAPGRKRSRSRSPTPPREPALBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-219KPFERREPAPGRKRSRSRSPTPPREPALMRAPTGPRALQRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
Amino Acid Sequences MDPQQGVMDVNQPRNKKTAEDDEDDEDDEDDVDSVKAKSRDLVGVPLSMAALEQCRERWTAVQLLQRLQRCTDDQMWQEVVRDYDGYEFFNSQLSAWYDDKTIILQILDILDRLPQRTKNKIVDSKIDKTMESLTHHSDERIATHASALLGAWSKLQLVYRIPLKKRDDASAPVKTETKPFERREPAPGRKRSRSRSPTPPREPALMRAPTGPRALQRRGSFRSRPFIPFHHHMDAIDDEVDDPSAALTTTTPRHMSCLVRSSQDGETQGYMNHLSCRNGATEILAGLLQKYLGSLGTWW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.45
3 0.42
4 0.44
5 0.46
6 0.47
7 0.5
8 0.51
9 0.51
10 0.51
11 0.48
12 0.41
13 0.3
14 0.23
15 0.18
16 0.14
17 0.09
18 0.08
19 0.07
20 0.08
21 0.08
22 0.14
23 0.15
24 0.15
25 0.18
26 0.2
27 0.24
28 0.24
29 0.29
30 0.24
31 0.24
32 0.24
33 0.21
34 0.18
35 0.14
36 0.12
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.09
41 0.09
42 0.12
43 0.13
44 0.14
45 0.16
46 0.18
47 0.24
48 0.28
49 0.32
50 0.33
51 0.37
52 0.42
53 0.44
54 0.42
55 0.37
56 0.36
57 0.32
58 0.35
59 0.34
60 0.34
61 0.32
62 0.34
63 0.35
64 0.32
65 0.31
66 0.27
67 0.23
68 0.18
69 0.16
70 0.12
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.12
77 0.13
78 0.13
79 0.1
80 0.13
81 0.13
82 0.16
83 0.16
84 0.17
85 0.16
86 0.16
87 0.16
88 0.13
89 0.12
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.07
99 0.08
100 0.1
101 0.13
102 0.18
103 0.24
104 0.3
105 0.37
106 0.41
107 0.49
108 0.54
109 0.54
110 0.56
111 0.58
112 0.55
113 0.54
114 0.48
115 0.4
116 0.34
117 0.34
118 0.28
119 0.24
120 0.22
121 0.19
122 0.2
123 0.21
124 0.19
125 0.18
126 0.16
127 0.14
128 0.14
129 0.12
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.1
147 0.17
148 0.23
149 0.25
150 0.32
151 0.35
152 0.4
153 0.41
154 0.41
155 0.38
156 0.38
157 0.43
158 0.41
159 0.38
160 0.34
161 0.34
162 0.31
163 0.32
164 0.3
165 0.31
166 0.33
167 0.35
168 0.42
169 0.46
170 0.48
171 0.54
172 0.59
173 0.62
174 0.63
175 0.7
176 0.69
177 0.73
178 0.79
179 0.78
180 0.79
181 0.78
182 0.76
183 0.77
184 0.8
185 0.82
186 0.81
187 0.8
188 0.72
189 0.69
190 0.63
191 0.57
192 0.54
193 0.45
194 0.39
195 0.36
196 0.35
197 0.32
198 0.33
199 0.29
200 0.26
201 0.31
202 0.34
203 0.37
204 0.4
205 0.45
206 0.49
207 0.55
208 0.57
209 0.56
210 0.6
211 0.56
212 0.56
213 0.52
214 0.52
215 0.52
216 0.5
217 0.51
218 0.47
219 0.44
220 0.39
221 0.38
222 0.34
223 0.28
224 0.23
225 0.16
226 0.12
227 0.11
228 0.12
229 0.08
230 0.07
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.09
237 0.12
238 0.15
239 0.17
240 0.17
241 0.21
242 0.25
243 0.29
244 0.3
245 0.35
246 0.34
247 0.35
248 0.36
249 0.36
250 0.35
251 0.35
252 0.32
253 0.27
254 0.26
255 0.23
256 0.23
257 0.21
258 0.2
259 0.17
260 0.2
261 0.21
262 0.21
263 0.22
264 0.23
265 0.23
266 0.23
267 0.22
268 0.18
269 0.16
270 0.14
271 0.14
272 0.13
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.08
277 0.06
278 0.07
279 0.06
280 0.06