Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZB25

Protein Details
Accession A0A178ZB25    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-52GGGGHFNNRKRRYREDDYEDRRPQRRRYEEPLAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-30RRRGGGGGGGGGGGGGHFNNRKRR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027159  CBP80  
IPR015172  MIF4G-like_typ-1  
IPR015174  MIF4G-like_typ-2  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF09088  MIF4G_like  
PF09090  MIF4G_like_2  
Amino Acid Sequences MADYDRRRRGGGGGGGGGGGGGHFNNRKRRYREDDYEDRRPQRRRYEEPLAATLRKQVLSIAESPVRRAEDEVEIIAKTLAENYFDSDLTSGFLDLVVQLPVEQPLKIPFVAAILLVSNVQKPEFTTEVLVKVGEALQKQMNNGAWREVKLYLRLLGCLQGMFEGDGIFPLLEELFSRAADLQMKSSEDSLGLELVKVILMTLPYTMASSATGFETQATALLEKTDIIASTAHPLESLVDPFPSREVGAPSGSESALALLQKHMQDESRNSWELACLPRPWKGNRSPEEEDPLTGAQKHPFPNVTVPETVNNGPRPLFPEIYFSVYREQDIETVPPLSDPAALLVRDALSDTINVLDFNRAVAAKFLIDVDCYFAPDTFVKRATPFDKLREVAGDKATWKPEDVVVDAAFSQLLQLPAPEHKLVYYHSVLTEACKLAPAAVAPSLGRAIRFLYRNVDKMDLELSQRFLDWFAHHLSNFGFTWKWTEWVDDVNLPDVHPRKAFIIDALDKEIRLSFSKRIKGTLPEPYQALISEAKEKDVPDFKYNDESTPFAAEGKEIAQMIRRKATSEEFDSILEKIEQEAAASGLSDPSLASTDVFVTSICWVGSKSLSHALACIERCKERLLAISASSSACRKQIITSVVDYWRDQRGVGVILVDKLLNYQILTPESVVEWALIDHVSRGTLLATTWCYELVSNTTRKVAGRVRSIVAAVRSPGIPEGQRLELQQTLTRELEGMKSLFAMIEDAVLSIRDGNQDEMMESSDALRAEEEELLKAWGGRWARVFQRKYAVEESWVREELAKPLPVVEEKPAADEAMKIDDDTGAMNGAGQVVGAGENGATDAIDDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.3
3 0.28
4 0.24
5 0.15
6 0.09
7 0.05
8 0.04
9 0.09
10 0.15
11 0.22
12 0.33
13 0.42
14 0.52
15 0.58
16 0.68
17 0.72
18 0.77
19 0.81
20 0.8
21 0.82
22 0.81
23 0.85
24 0.84
25 0.84
26 0.82
27 0.8
28 0.79
29 0.79
30 0.81
31 0.79
32 0.78
33 0.8
34 0.79
35 0.76
36 0.75
37 0.7
38 0.62
39 0.54
40 0.51
41 0.45
42 0.38
43 0.33
44 0.27
45 0.25
46 0.27
47 0.28
48 0.28
49 0.3
50 0.3
51 0.31
52 0.34
53 0.32
54 0.29
55 0.28
56 0.25
57 0.24
58 0.26
59 0.26
60 0.23
61 0.21
62 0.2
63 0.19
64 0.15
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.15
71 0.17
72 0.17
73 0.17
74 0.15
75 0.14
76 0.13
77 0.13
78 0.09
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.1
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.14
93 0.17
94 0.17
95 0.16
96 0.13
97 0.13
98 0.14
99 0.12
100 0.09
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.16
111 0.17
112 0.18
113 0.19
114 0.2
115 0.22
116 0.22
117 0.21
118 0.15
119 0.14
120 0.15
121 0.15
122 0.13
123 0.15
124 0.18
125 0.2
126 0.2
127 0.24
128 0.26
129 0.26
130 0.27
131 0.3
132 0.29
133 0.29
134 0.31
135 0.3
136 0.28
137 0.28
138 0.29
139 0.28
140 0.25
141 0.26
142 0.24
143 0.23
144 0.21
145 0.17
146 0.15
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.09
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.05
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.08
166 0.1
167 0.15
168 0.15
169 0.15
170 0.17
171 0.18
172 0.18
173 0.19
174 0.17
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.05
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.08
212 0.07
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.11
218 0.12
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.12
234 0.13
235 0.14
236 0.14
237 0.14
238 0.15
239 0.14
240 0.12
241 0.1
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.07
247 0.11
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.13
252 0.16
253 0.2
254 0.25
255 0.28
256 0.28
257 0.28
258 0.27
259 0.26
260 0.26
261 0.26
262 0.22
263 0.2
264 0.21
265 0.26
266 0.31
267 0.34
268 0.38
269 0.42
270 0.49
271 0.51
272 0.58
273 0.58
274 0.56
275 0.59
276 0.52
277 0.43
278 0.36
279 0.31
280 0.23
281 0.2
282 0.18
283 0.14
284 0.18
285 0.19
286 0.2
287 0.2
288 0.21
289 0.25
290 0.27
291 0.28
292 0.25
293 0.24
294 0.23
295 0.25
296 0.25
297 0.25
298 0.22
299 0.2
300 0.19
301 0.19
302 0.21
303 0.22
304 0.22
305 0.18
306 0.21
307 0.22
308 0.26
309 0.26
310 0.22
311 0.23
312 0.21
313 0.21
314 0.17
315 0.17
316 0.13
317 0.14
318 0.14
319 0.1
320 0.11
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.06
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.08
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.1
364 0.13
365 0.12
366 0.13
367 0.13
368 0.14
369 0.18
370 0.19
371 0.25
372 0.25
373 0.27
374 0.31
375 0.3
376 0.3
377 0.29
378 0.28
379 0.23
380 0.22
381 0.19
382 0.15
383 0.18
384 0.19
385 0.16
386 0.15
387 0.13
388 0.14
389 0.14
390 0.13
391 0.12
392 0.1
393 0.11
394 0.1
395 0.09
396 0.07
397 0.06
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.04
402 0.05
403 0.06
404 0.07
405 0.09
406 0.09
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.1
411 0.13
412 0.13
413 0.11
414 0.11
415 0.12
416 0.12
417 0.12
418 0.14
419 0.1
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.05
430 0.06
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.06
435 0.07
436 0.11
437 0.12
438 0.13
439 0.18
440 0.2
441 0.23
442 0.24
443 0.25
444 0.21
445 0.2
446 0.21
447 0.16
448 0.15
449 0.14
450 0.13
451 0.11
452 0.11
453 0.11
454 0.1
455 0.1
456 0.09
457 0.1
458 0.12
459 0.13
460 0.13
461 0.14
462 0.13
463 0.15
464 0.14
465 0.13
466 0.1
467 0.08
468 0.13
469 0.13
470 0.15
471 0.13
472 0.14
473 0.14
474 0.15
475 0.17
476 0.14
477 0.14
478 0.15
479 0.14
480 0.13
481 0.17
482 0.17
483 0.18
484 0.16
485 0.17
486 0.15
487 0.16
488 0.16
489 0.13
490 0.17
491 0.17
492 0.18
493 0.21
494 0.19
495 0.18
496 0.18
497 0.18
498 0.13
499 0.13
500 0.15
501 0.18
502 0.25
503 0.32
504 0.32
505 0.33
506 0.34
507 0.37
508 0.38
509 0.41
510 0.38
511 0.34
512 0.33
513 0.31
514 0.29
515 0.24
516 0.22
517 0.14
518 0.12
519 0.17
520 0.16
521 0.17
522 0.18
523 0.18
524 0.2
525 0.25
526 0.27
527 0.24
528 0.26
529 0.26
530 0.32
531 0.33
532 0.31
533 0.26
534 0.24
535 0.21
536 0.21
537 0.2
538 0.13
539 0.12
540 0.1
541 0.09
542 0.09
543 0.09
544 0.08
545 0.08
546 0.13
547 0.17
548 0.19
549 0.24
550 0.23
551 0.23
552 0.26
553 0.3
554 0.29
555 0.3
556 0.3
557 0.26
558 0.26
559 0.26
560 0.23
561 0.2
562 0.15
563 0.11
564 0.09
565 0.09
566 0.08
567 0.07
568 0.07
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.04
577 0.04
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.06
587 0.07
588 0.08
589 0.07
590 0.07
591 0.07
592 0.08
593 0.1
594 0.1
595 0.12
596 0.17
597 0.18
598 0.17
599 0.18
600 0.18
601 0.21
602 0.21
603 0.23
604 0.2
605 0.21
606 0.22
607 0.24
608 0.23
609 0.2
610 0.24
611 0.24
612 0.23
613 0.22
614 0.22
615 0.21
616 0.21
617 0.2
618 0.16
619 0.14
620 0.13
621 0.13
622 0.13
623 0.14
624 0.2
625 0.22
626 0.23
627 0.24
628 0.27
629 0.3
630 0.31
631 0.3
632 0.26
633 0.27
634 0.25
635 0.22
636 0.19
637 0.18
638 0.17
639 0.17
640 0.15
641 0.12
642 0.12
643 0.13
644 0.12
645 0.09
646 0.08
647 0.09
648 0.07
649 0.07
650 0.08
651 0.1
652 0.11
653 0.12
654 0.12
655 0.12
656 0.12
657 0.12
658 0.11
659 0.08
660 0.07
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.07
673 0.08
674 0.1
675 0.11
676 0.11
677 0.11
678 0.11
679 0.11
680 0.12
681 0.15
682 0.19
683 0.21
684 0.22
685 0.24
686 0.25
687 0.26
688 0.31
689 0.33
690 0.34
691 0.39
692 0.41
693 0.41
694 0.4
695 0.41
696 0.37
697 0.32
698 0.27
699 0.21
700 0.19
701 0.17
702 0.16
703 0.17
704 0.17
705 0.15
706 0.16
707 0.19
708 0.2
709 0.22
710 0.22
711 0.24
712 0.24
713 0.25
714 0.26
715 0.25
716 0.26
717 0.25
718 0.24
719 0.21
720 0.2
721 0.2
722 0.19
723 0.17
724 0.13
725 0.13
726 0.13
727 0.12
728 0.11
729 0.1
730 0.06
731 0.07
732 0.07
733 0.06
734 0.07
735 0.07
736 0.07
737 0.06
738 0.08
739 0.1
740 0.12
741 0.13
742 0.15
743 0.15
744 0.15
745 0.15
746 0.16
747 0.13
748 0.12
749 0.11
750 0.12
751 0.12
752 0.12
753 0.11
754 0.1
755 0.11
756 0.15
757 0.15
758 0.13
759 0.14
760 0.14
761 0.14
762 0.14
763 0.12
764 0.15
765 0.16
766 0.18
767 0.21
768 0.26
769 0.35
770 0.45
771 0.47
772 0.47
773 0.55
774 0.55
775 0.57
776 0.57
777 0.49
778 0.46
779 0.5
780 0.5
781 0.46
782 0.44
783 0.38
784 0.35
785 0.35
786 0.34
787 0.34
788 0.3
789 0.25
790 0.25
791 0.28
792 0.28
793 0.29
794 0.27
795 0.27
796 0.25
797 0.28
798 0.27
799 0.25
800 0.22
801 0.22
802 0.19
803 0.18
804 0.18
805 0.15
806 0.15
807 0.14
808 0.14
809 0.14
810 0.12
811 0.08
812 0.07
813 0.08
814 0.07
815 0.07
816 0.07
817 0.06
818 0.05
819 0.05
820 0.05
821 0.05
822 0.05
823 0.04
824 0.04
825 0.05
826 0.05
827 0.04