Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZYT8

Protein Details
Accession A0A178ZYT8    Localization Confidence High Confidence Score 23.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-26SSLRNAVSRRPHKERAQPASREKWGHydrophilic
39-60QDYNLKKKKLSQLSQKARERNPHydrophilic
220-245QDALSRLRAERKRRKRLQDMRVAKLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
208-236PKPKSKKALRAEQDALSRLRAERKRRKRL
280-289IRFKVRERKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSLRNAVSRRPHKERAQPASREKWGLLEKHKDYSLRAQDYNLKKKKLSQLSQKARERNPDEFAFGMISQGRAGLGKHKSKQTGDLAGEDGNKKPRGGVPLSHDAVKLLKTQDAGYLRTVAAKGRRQIERLTEEVGLDSVTIGTSKPATKKIFDDDEGENTAREKKRASDGEVLEDEFSEDETDHPMQGSWDLATTVTRDPGEQDNPPKPKSKKALRAEQDALSRLRAERKRRKRLQDMRVAKLEALKARQREILVLADQLELQRAKMARTVGGMNKNGIRFKVRERKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.83
3 0.83
4 0.83
5 0.82
6 0.82
7 0.82
8 0.78
9 0.71
10 0.6
11 0.58
12 0.54
13 0.52
14 0.52
15 0.52
16 0.5
17 0.53
18 0.56
19 0.5
20 0.47
21 0.5
22 0.52
23 0.48
24 0.46
25 0.44
26 0.5
27 0.58
28 0.65
29 0.63
30 0.57
31 0.53
32 0.6
33 0.66
34 0.68
35 0.67
36 0.67
37 0.71
38 0.77
39 0.86
40 0.86
41 0.84
42 0.79
43 0.8
44 0.74
45 0.68
46 0.63
47 0.54
48 0.49
49 0.41
50 0.37
51 0.28
52 0.22
53 0.19
54 0.13
55 0.12
56 0.09
57 0.09
58 0.08
59 0.07
60 0.08
61 0.13
62 0.2
63 0.27
64 0.32
65 0.38
66 0.43
67 0.43
68 0.49
69 0.47
70 0.47
71 0.41
72 0.37
73 0.33
74 0.3
75 0.31
76 0.26
77 0.23
78 0.23
79 0.22
80 0.21
81 0.21
82 0.22
83 0.25
84 0.27
85 0.28
86 0.28
87 0.35
88 0.37
89 0.36
90 0.33
91 0.28
92 0.27
93 0.24
94 0.2
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.17
100 0.19
101 0.19
102 0.17
103 0.18
104 0.16
105 0.17
106 0.17
107 0.14
108 0.18
109 0.21
110 0.24
111 0.29
112 0.31
113 0.32
114 0.34
115 0.37
116 0.35
117 0.32
118 0.3
119 0.24
120 0.22
121 0.2
122 0.17
123 0.11
124 0.07
125 0.06
126 0.04
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.05
132 0.07
133 0.09
134 0.15
135 0.17
136 0.18
137 0.2
138 0.25
139 0.27
140 0.26
141 0.28
142 0.23
143 0.24
144 0.25
145 0.23
146 0.18
147 0.16
148 0.21
149 0.19
150 0.18
151 0.17
152 0.17
153 0.25
154 0.28
155 0.32
156 0.33
157 0.33
158 0.37
159 0.36
160 0.34
161 0.26
162 0.23
163 0.18
164 0.1
165 0.1
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.08
170 0.09
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.08
183 0.08
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.12
188 0.17
189 0.19
190 0.22
191 0.28
192 0.34
193 0.39
194 0.41
195 0.48
196 0.46
197 0.52
198 0.57
199 0.61
200 0.63
201 0.67
202 0.75
203 0.72
204 0.78
205 0.73
206 0.67
207 0.6
208 0.53
209 0.46
210 0.36
211 0.32
212 0.25
213 0.31
214 0.34
215 0.41
216 0.49
217 0.59
218 0.69
219 0.78
220 0.86
221 0.88
222 0.91
223 0.91
224 0.9
225 0.88
226 0.84
227 0.8
228 0.71
229 0.6
230 0.54
231 0.48
232 0.41
233 0.4
234 0.38
235 0.35
236 0.37
237 0.4
238 0.36
239 0.34
240 0.32
241 0.3
242 0.25
243 0.23
244 0.21
245 0.18
246 0.18
247 0.16
248 0.18
249 0.14
250 0.13
251 0.16
252 0.16
253 0.17
254 0.2
255 0.22
256 0.19
257 0.22
258 0.27
259 0.3
260 0.37
261 0.37
262 0.38
263 0.41
264 0.44
265 0.44
266 0.41
267 0.4
268 0.36
269 0.45