Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178Z6B4

Protein Details
Accession A0A178Z6B4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
385-411ADKMSARERFLQRKREREEEARKKKEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
393-413RFLQRKREREEEARKKKEAGG
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018612  NSRP1_N  
Gene Ontology GO:0000381  P:regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF09745  NSRP1_N  
Amino Acid Sequences MPSLAFGLNSAKSSSGVSKPAQKRKAFFDDDDDDAGEEIAAAPAPAYGAKKTSKPLRPLKDLDDGADDGEPPSKSHKLSQYGLQLPKSKSAGSATGTDKYVNLSALRSAKLHDEEASKIDASVYDYDAAYETFHAEKEKTSNEAGAPSGPKYMGSLLQSAEVRKRDQLRAREKLLQREREAEGDEFADKEKFVTGAYKKQQEEIKRMEEEEKKREEAEEERRKQGGGMTAFHKRMLEKDEERMRLIKEAEEEAARRKEGGVQEETPIEEEKSEAKMAEELNKQGAHIVVNDEGEVVDKRQLLSAGLNVAPKKPGKEHQPTARAESARKDEYWKSSKAVDARHAQRERQSRMMERQIEEMMEKQQQAEAEEEKQLQDKVKSKVSEADKMSARERFLQRKREREEEARKKKEAGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.26
4 0.29
5 0.38
6 0.47
7 0.57
8 0.64
9 0.64
10 0.65
11 0.68
12 0.74
13 0.7
14 0.62
15 0.6
16 0.56
17 0.53
18 0.5
19 0.42
20 0.32
21 0.26
22 0.23
23 0.15
24 0.1
25 0.07
26 0.06
27 0.05
28 0.04
29 0.04
30 0.04
31 0.05
32 0.07
33 0.09
34 0.1
35 0.14
36 0.18
37 0.21
38 0.29
39 0.39
40 0.45
41 0.53
42 0.62
43 0.66
44 0.72
45 0.73
46 0.71
47 0.7
48 0.63
49 0.55
50 0.49
51 0.4
52 0.33
53 0.28
54 0.23
55 0.14
56 0.17
57 0.16
58 0.12
59 0.18
60 0.2
61 0.22
62 0.28
63 0.35
64 0.38
65 0.4
66 0.46
67 0.5
68 0.54
69 0.57
70 0.56
71 0.55
72 0.5
73 0.53
74 0.48
75 0.39
76 0.33
77 0.31
78 0.3
79 0.25
80 0.29
81 0.26
82 0.28
83 0.28
84 0.26
85 0.24
86 0.22
87 0.21
88 0.17
89 0.14
90 0.12
91 0.16
92 0.18
93 0.19
94 0.18
95 0.18
96 0.21
97 0.22
98 0.23
99 0.21
100 0.21
101 0.21
102 0.23
103 0.23
104 0.18
105 0.16
106 0.15
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.11
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.08
117 0.07
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.14
125 0.16
126 0.17
127 0.17
128 0.18
129 0.17
130 0.18
131 0.17
132 0.16
133 0.15
134 0.13
135 0.14
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.12
144 0.15
145 0.16
146 0.16
147 0.2
148 0.19
149 0.19
150 0.22
151 0.27
152 0.31
153 0.38
154 0.46
155 0.51
156 0.55
157 0.58
158 0.62
159 0.61
160 0.64
161 0.65
162 0.62
163 0.54
164 0.52
165 0.49
166 0.42
167 0.41
168 0.31
169 0.23
170 0.18
171 0.16
172 0.12
173 0.11
174 0.1
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.12
181 0.13
182 0.21
183 0.26
184 0.32
185 0.32
186 0.36
187 0.4
188 0.38
189 0.43
190 0.4
191 0.39
192 0.33
193 0.34
194 0.36
195 0.39
196 0.4
197 0.4
198 0.38
199 0.35
200 0.34
201 0.34
202 0.3
203 0.29
204 0.35
205 0.39
206 0.4
207 0.42
208 0.42
209 0.42
210 0.39
211 0.35
212 0.3
213 0.22
214 0.21
215 0.21
216 0.26
217 0.26
218 0.27
219 0.25
220 0.19
221 0.19
222 0.21
223 0.25
224 0.21
225 0.29
226 0.35
227 0.36
228 0.37
229 0.37
230 0.34
231 0.31
232 0.29
233 0.23
234 0.18
235 0.17
236 0.17
237 0.16
238 0.16
239 0.18
240 0.2
241 0.18
242 0.16
243 0.15
244 0.19
245 0.21
246 0.24
247 0.23
248 0.22
249 0.24
250 0.24
251 0.24
252 0.21
253 0.18
254 0.14
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.12
263 0.13
264 0.19
265 0.2
266 0.19
267 0.22
268 0.22
269 0.21
270 0.2
271 0.19
272 0.13
273 0.11
274 0.12
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.1
284 0.1
285 0.11
286 0.12
287 0.13
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.14
293 0.17
294 0.17
295 0.17
296 0.2
297 0.21
298 0.23
299 0.25
300 0.3
301 0.37
302 0.46
303 0.53
304 0.59
305 0.66
306 0.65
307 0.67
308 0.67
309 0.59
310 0.52
311 0.5
312 0.47
313 0.42
314 0.4
315 0.39
316 0.37
317 0.44
318 0.48
319 0.43
320 0.39
321 0.38
322 0.42
323 0.42
324 0.42
325 0.4
326 0.44
327 0.49
328 0.56
329 0.57
330 0.56
331 0.59
332 0.64
333 0.63
334 0.61
335 0.6
336 0.57
337 0.63
338 0.69
339 0.67
340 0.59
341 0.57
342 0.5
343 0.45
344 0.39
345 0.32
346 0.27
347 0.25
348 0.24
349 0.2
350 0.21
351 0.21
352 0.21
353 0.23
354 0.21
355 0.2
356 0.23
357 0.24
358 0.23
359 0.25
360 0.26
361 0.27
362 0.31
363 0.36
364 0.38
365 0.44
366 0.45
367 0.44
368 0.5
369 0.52
370 0.53
371 0.5
372 0.51
373 0.49
374 0.51
375 0.53
376 0.49
377 0.46
378 0.46
379 0.51
380 0.55
381 0.58
382 0.66
383 0.7
384 0.76
385 0.81
386 0.8
387 0.8
388 0.8
389 0.82
390 0.83
391 0.85
392 0.83
393 0.79