Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J9DN04

Protein Details
Accession J9DN04    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
286-310LSHTHKKSAKFVNNKYKRSNNKMSEHydrophilic
1095-1127KHHNYNLSSNDKKRRRYNKHLKKDEPKNSSQIPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1106-1117KKRRRYNKHLKK
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 9.333, cyto 5.5, cyto_mito 4.666, E.R. 3, mito 2.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004871  Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03178  CPSF_A  
Amino Acid Sequences MIKKVKFLICLLTKKLKTKTCFFDQTHNEKSQIHTKEKETDNSAKNIIFSNAEKIIDWESQPQETINEETKNISKNLYSYTKTNFKDKYIRNKKTFYFGKFLNHFIQVTSECIVIDNQPLRLYKEIKTLKNISDQVLEEKKDRNSTVQCFYVQTSDRYLYLVFAKNYKNITIKEKKNYEAELNEKNRENIQLAQENSCLDKNVISDNKKKLSTKNHSTSNMVFQKDYVSSNNVSQENYASSNFFSQNNHVSSNISLQNKSLPLNGTRNNISERKILLDQKKDNTNLSHTHKKSAKFVNNKYKRSNNKMSENILFDENEFLEFIEITCDLRCFTVSHNYLMYIKKYKLYIHKNGKIVYVGFMKFDQTARNILCEDDLKNYINHIKNENQQNLYEFSDRKNLYFRNNIDYSQSKNKKNIYNKGKYTTEQNCNYLAHIENLLKNENYNKKIQDHIENHYKLNEPKKIASQLNTDEIEIISQQNPIILLRSSSILYIYTYKNQKLIKLKNDPVKLAPSIQNFHKSLYKNRECIMLWPEKILFTRNNRVFIHKIDKKFDSINSNYIITKHMFAEFRFTKNVDPFCGYVVKEFPLPVDLEKIIWDNKNHVYCGVSKNFRSYVHNNFEKDIEQSCELNNSQSDQNSCNSILHTKKDVFDTQNNFCSRKSSVSDISQVSKDINTEKNLDSSSVSEKDQIIDSNSSVTSKTSFSLVLLDKTLDVLDTFVLDDNEYIGDYKFLMLNDTQKTELLPEKYYSNFLVVLANFLQGENDLVKSRILLFELKNVQNENTIFDKNNPKIYSKHDIIDKKIYNDGFNLDLINNEENNNKTDNESSKKEFLDRNFTENTLSQNEYNKNINKNNIINENQNLKNMWLDKKDQNNAFIKNLKDISKNKLNHNSHSKQTDTINSNIVYQDKNGNLSQKFDDLNENIIKTPVNNTVTSEKRYNIEDNHIDHNLNMIDTTNNNYNNQNTKTRVDYKGQTHKAFKLLACLPIKSSAISCDSIRGNLVIGQGTRLMIYKIDRLEGLVAIAFHDLSIIAVSLSVIKNFILVGDLLRGVTFFYFQTRPVKIIKLSFSEPIKNLTMVHIYKFNTIQSYKINTKHHNYNLSSNDKKRRRYNKHLKKDEPKNSSQIPHINKCELSLCALYNNNISIYTYSPNNVLSKNGEILIKRADACINDFIIGQTNTFLYSNYLLYKVAKIDDNPATKMLQRNSFVRFFKENVMLGYYNIFKMQYKHLNQITTKPILDISALRDAWLMDWKLKKELCSLLNVNLDDIYGAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.69
3 0.68
4 0.66
5 0.68
6 0.69
7 0.69
8 0.73
9 0.68
10 0.7
11 0.71
12 0.74
13 0.73
14 0.68
15 0.61
16 0.53
17 0.55
18 0.54
19 0.52
20 0.51
21 0.49
22 0.51
23 0.58
24 0.62
25 0.63
26 0.61
27 0.63
28 0.6
29 0.59
30 0.57
31 0.49
32 0.44
33 0.4
34 0.35
35 0.29
36 0.26
37 0.27
38 0.26
39 0.26
40 0.25
41 0.25
42 0.27
43 0.25
44 0.25
45 0.27
46 0.27
47 0.27
48 0.28
49 0.26
50 0.24
51 0.24
52 0.27
53 0.26
54 0.25
55 0.25
56 0.28
57 0.31
58 0.34
59 0.32
60 0.29
61 0.25
62 0.26
63 0.32
64 0.35
65 0.34
66 0.35
67 0.41
68 0.48
69 0.49
70 0.56
71 0.52
72 0.52
73 0.59
74 0.63
75 0.67
76 0.69
77 0.77
78 0.76
79 0.8
80 0.76
81 0.76
82 0.76
83 0.7
84 0.66
85 0.59
86 0.61
87 0.57
88 0.58
89 0.52
90 0.47
91 0.41
92 0.35
93 0.36
94 0.27
95 0.26
96 0.23
97 0.19
98 0.15
99 0.16
100 0.16
101 0.13
102 0.19
103 0.19
104 0.19
105 0.23
106 0.24
107 0.27
108 0.32
109 0.34
110 0.3
111 0.38
112 0.44
113 0.45
114 0.52
115 0.54
116 0.52
117 0.58
118 0.57
119 0.49
120 0.46
121 0.43
122 0.43
123 0.44
124 0.42
125 0.36
126 0.39
127 0.41
128 0.43
129 0.43
130 0.43
131 0.44
132 0.48
133 0.5
134 0.48
135 0.45
136 0.41
137 0.41
138 0.4
139 0.35
140 0.31
141 0.3
142 0.28
143 0.27
144 0.26
145 0.25
146 0.2
147 0.23
148 0.27
149 0.23
150 0.27
151 0.3
152 0.33
153 0.35
154 0.38
155 0.38
156 0.35
157 0.44
158 0.48
159 0.54
160 0.59
161 0.63
162 0.63
163 0.62
164 0.63
165 0.59
166 0.55
167 0.54
168 0.54
169 0.54
170 0.55
171 0.52
172 0.5
173 0.46
174 0.42
175 0.38
176 0.33
177 0.34
178 0.35
179 0.35
180 0.36
181 0.35
182 0.33
183 0.32
184 0.28
185 0.23
186 0.16
187 0.16
188 0.15
189 0.22
190 0.29
191 0.32
192 0.39
193 0.46
194 0.52
195 0.55
196 0.58
197 0.57
198 0.61
199 0.65
200 0.68
201 0.69
202 0.71
203 0.69
204 0.7
205 0.65
206 0.65
207 0.6
208 0.52
209 0.43
210 0.35
211 0.35
212 0.32
213 0.31
214 0.24
215 0.21
216 0.21
217 0.24
218 0.3
219 0.27
220 0.26
221 0.24
222 0.23
223 0.22
224 0.23
225 0.2
226 0.15
227 0.15
228 0.18
229 0.19
230 0.19
231 0.19
232 0.21
233 0.27
234 0.29
235 0.29
236 0.26
237 0.25
238 0.25
239 0.28
240 0.3
241 0.27
242 0.25
243 0.24
244 0.28
245 0.28
246 0.28
247 0.25
248 0.22
249 0.24
250 0.32
251 0.36
252 0.36
253 0.37
254 0.38
255 0.41
256 0.41
257 0.38
258 0.35
259 0.32
260 0.31
261 0.34
262 0.4
263 0.42
264 0.48
265 0.51
266 0.53
267 0.59
268 0.57
269 0.55
270 0.49
271 0.47
272 0.45
273 0.47
274 0.51
275 0.46
276 0.53
277 0.54
278 0.54
279 0.58
280 0.6
281 0.62
282 0.61
283 0.7
284 0.73
285 0.77
286 0.81
287 0.81
288 0.8
289 0.8
290 0.8
291 0.8
292 0.77
293 0.76
294 0.76
295 0.73
296 0.67
297 0.61
298 0.53
299 0.44
300 0.36
301 0.27
302 0.23
303 0.18
304 0.14
305 0.11
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.08
319 0.11
320 0.2
321 0.21
322 0.23
323 0.23
324 0.24
325 0.27
326 0.29
327 0.3
328 0.26
329 0.26
330 0.27
331 0.28
332 0.32
333 0.39
334 0.45
335 0.51
336 0.56
337 0.62
338 0.64
339 0.63
340 0.59
341 0.51
342 0.43
343 0.36
344 0.31
345 0.24
346 0.21
347 0.19
348 0.19
349 0.18
350 0.19
351 0.17
352 0.14
353 0.19
354 0.18
355 0.2
356 0.19
357 0.18
358 0.18
359 0.18
360 0.17
361 0.16
362 0.18
363 0.17
364 0.17
365 0.19
366 0.25
367 0.28
368 0.29
369 0.29
370 0.32
371 0.38
372 0.47
373 0.5
374 0.44
375 0.4
376 0.4
377 0.39
378 0.37
379 0.33
380 0.25
381 0.22
382 0.29
383 0.28
384 0.27
385 0.3
386 0.3
387 0.32
388 0.39
389 0.39
390 0.38
391 0.39
392 0.39
393 0.38
394 0.37
395 0.37
396 0.4
397 0.46
398 0.42
399 0.47
400 0.53
401 0.57
402 0.63
403 0.68
404 0.67
405 0.69
406 0.7
407 0.71
408 0.67
409 0.6
410 0.6
411 0.58
412 0.57
413 0.51
414 0.47
415 0.43
416 0.4
417 0.4
418 0.33
419 0.25
420 0.18
421 0.17
422 0.16
423 0.16
424 0.17
425 0.19
426 0.16
427 0.16
428 0.23
429 0.27
430 0.28
431 0.31
432 0.32
433 0.32
434 0.37
435 0.4
436 0.42
437 0.39
438 0.42
439 0.48
440 0.47
441 0.45
442 0.43
443 0.42
444 0.37
445 0.41
446 0.4
447 0.33
448 0.33
449 0.38
450 0.42
451 0.41
452 0.39
453 0.37
454 0.34
455 0.36
456 0.35
457 0.3
458 0.24
459 0.21
460 0.18
461 0.13
462 0.12
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.08
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.07
478 0.08
479 0.11
480 0.12
481 0.17
482 0.21
483 0.21
484 0.26
485 0.27
486 0.32
487 0.38
488 0.44
489 0.46
490 0.51
491 0.57
492 0.6
493 0.61
494 0.57
495 0.5
496 0.46
497 0.38
498 0.33
499 0.31
500 0.26
501 0.27
502 0.27
503 0.32
504 0.29
505 0.3
506 0.32
507 0.29
508 0.35
509 0.43
510 0.46
511 0.42
512 0.42
513 0.45
514 0.39
515 0.4
516 0.38
517 0.33
518 0.28
519 0.27
520 0.26
521 0.23
522 0.23
523 0.22
524 0.22
525 0.21
526 0.31
527 0.32
528 0.38
529 0.37
530 0.42
531 0.41
532 0.4
533 0.45
534 0.41
535 0.41
536 0.4
537 0.41
538 0.38
539 0.38
540 0.37
541 0.33
542 0.3
543 0.29
544 0.26
545 0.26
546 0.24
547 0.23
548 0.22
549 0.16
550 0.15
551 0.13
552 0.14
553 0.14
554 0.14
555 0.21
556 0.21
557 0.23
558 0.23
559 0.23
560 0.23
561 0.27
562 0.28
563 0.22
564 0.22
565 0.2
566 0.2
567 0.21
568 0.18
569 0.15
570 0.14
571 0.13
572 0.12
573 0.12
574 0.1
575 0.09
576 0.1
577 0.09
578 0.1
579 0.09
580 0.08
581 0.09
582 0.1
583 0.11
584 0.13
585 0.13
586 0.15
587 0.19
588 0.21
589 0.2
590 0.19
591 0.18
592 0.19
593 0.24
594 0.26
595 0.24
596 0.23
597 0.26
598 0.28
599 0.28
600 0.31
601 0.3
602 0.33
603 0.38
604 0.42
605 0.4
606 0.38
607 0.38
608 0.32
609 0.3
610 0.23
611 0.17
612 0.14
613 0.13
614 0.12
615 0.14
616 0.13
617 0.13
618 0.12
619 0.12
620 0.12
621 0.12
622 0.14
623 0.13
624 0.13
625 0.14
626 0.15
627 0.13
628 0.12
629 0.16
630 0.17
631 0.18
632 0.2
633 0.2
634 0.21
635 0.23
636 0.26
637 0.25
638 0.29
639 0.31
640 0.31
641 0.36
642 0.37
643 0.35
644 0.32
645 0.3
646 0.25
647 0.24
648 0.23
649 0.21
650 0.23
651 0.24
652 0.28
653 0.27
654 0.28
655 0.25
656 0.23
657 0.19
658 0.15
659 0.14
660 0.13
661 0.14
662 0.14
663 0.17
664 0.17
665 0.18
666 0.18
667 0.18
668 0.15
669 0.14
670 0.16
671 0.15
672 0.15
673 0.15
674 0.15
675 0.15
676 0.15
677 0.14
678 0.12
679 0.11
680 0.11
681 0.11
682 0.11
683 0.1
684 0.1
685 0.09
686 0.09
687 0.08
688 0.09
689 0.08
690 0.08
691 0.08
692 0.12
693 0.13
694 0.12
695 0.12
696 0.12
697 0.11
698 0.11
699 0.1
700 0.06
701 0.05
702 0.04
703 0.04
704 0.04
705 0.04
706 0.05
707 0.05
708 0.05
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.04
715 0.05
716 0.05
717 0.05
718 0.06
719 0.06
720 0.07
721 0.08
722 0.13
723 0.14
724 0.16
725 0.16
726 0.14
727 0.15
728 0.15
729 0.19
730 0.16
731 0.16
732 0.16
733 0.17
734 0.18
735 0.2
736 0.18
737 0.15
738 0.13
739 0.12
740 0.13
741 0.11
742 0.12
743 0.1
744 0.1
745 0.09
746 0.09
747 0.08
748 0.06
749 0.07
750 0.06
751 0.06
752 0.06
753 0.07
754 0.07
755 0.08
756 0.08
757 0.08
758 0.09
759 0.11
760 0.11
761 0.17
762 0.23
763 0.24
764 0.25
765 0.26
766 0.25
767 0.25
768 0.25
769 0.22
770 0.18
771 0.18
772 0.18
773 0.21
774 0.3
775 0.28
776 0.35
777 0.33
778 0.33
779 0.34
780 0.4
781 0.43
782 0.36
783 0.38
784 0.38
785 0.4
786 0.42
787 0.48
788 0.44
789 0.38
790 0.4
791 0.37
792 0.31
793 0.28
794 0.26
795 0.17
796 0.16
797 0.14
798 0.1
799 0.1
800 0.11
801 0.12
802 0.1
803 0.1
804 0.12
805 0.13
806 0.15
807 0.16
808 0.14
809 0.14
810 0.18
811 0.22
812 0.26
813 0.29
814 0.32
815 0.34
816 0.34
817 0.37
818 0.37
819 0.35
820 0.4
821 0.37
822 0.37
823 0.34
824 0.34
825 0.32
826 0.29
827 0.29
828 0.22
829 0.22
830 0.19
831 0.24
832 0.26
833 0.27
834 0.32
835 0.33
836 0.36
837 0.38
838 0.41
839 0.41
840 0.42
841 0.43
842 0.43
843 0.42
844 0.38
845 0.39
846 0.41
847 0.36
848 0.35
849 0.31
850 0.25
851 0.26
852 0.27
853 0.27
854 0.24
855 0.28
856 0.33
857 0.4
858 0.47
859 0.46
860 0.48
861 0.49
862 0.48
863 0.47
864 0.45
865 0.38
866 0.36
867 0.37
868 0.34
869 0.35
870 0.36
871 0.4
872 0.44
873 0.48
874 0.51
875 0.58
876 0.58
877 0.59
878 0.66
879 0.62
880 0.59
881 0.59
882 0.53
883 0.45
884 0.44
885 0.44
886 0.38
887 0.35
888 0.33
889 0.29
890 0.29
891 0.27
892 0.26
893 0.19
894 0.17
895 0.2
896 0.16
897 0.19
898 0.2
899 0.25
900 0.24
901 0.27
902 0.27
903 0.25
904 0.25
905 0.23
906 0.26
907 0.21
908 0.25
909 0.24
910 0.23
911 0.2
912 0.2
913 0.19
914 0.15
915 0.17
916 0.19
917 0.2
918 0.19
919 0.22
920 0.29
921 0.33
922 0.37
923 0.36
924 0.31
925 0.3
926 0.33
927 0.34
928 0.3
929 0.34
930 0.34
931 0.35
932 0.38
933 0.37
934 0.34
935 0.3
936 0.3
937 0.22
938 0.17
939 0.14
940 0.1
941 0.09
942 0.1
943 0.14
944 0.16
945 0.18
946 0.2
947 0.22
948 0.26
949 0.32
950 0.35
951 0.37
952 0.36
953 0.37
954 0.42
955 0.47
956 0.47
957 0.46
958 0.48
959 0.51
960 0.58
961 0.63
962 0.62
963 0.6
964 0.58
965 0.57
966 0.54
967 0.45
968 0.41
969 0.36
970 0.38
971 0.36
972 0.33
973 0.3
974 0.3
975 0.3
976 0.24
977 0.22
978 0.17
979 0.18
980 0.2
981 0.18
982 0.19
983 0.2
984 0.2
985 0.2
986 0.17
987 0.14
988 0.14
989 0.15
990 0.13
991 0.12
992 0.12
993 0.12
994 0.12
995 0.12
996 0.1
997 0.1
998 0.1
999 0.12
1000 0.16
1001 0.16
1002 0.17
1003 0.16
1004 0.17
1005 0.17
1006 0.15
1007 0.14
1008 0.1
1009 0.09
1010 0.08
1011 0.09
1012 0.07
1013 0.06
1014 0.06
1015 0.05
1016 0.04
1017 0.05
1018 0.04
1019 0.03
1020 0.04
1021 0.04
1022 0.07
1023 0.08
1024 0.08
1025 0.08
1026 0.08
1027 0.08
1028 0.08
1029 0.08
1030 0.06
1031 0.06
1032 0.06
1033 0.07
1034 0.08
1035 0.08
1036 0.08
1037 0.08
1038 0.07
1039 0.07
1040 0.07
1041 0.06
1042 0.11
1043 0.12
1044 0.15
1045 0.23
1046 0.24
1047 0.26
1048 0.28
1049 0.33
1050 0.32
1051 0.36
1052 0.37
1053 0.35
1054 0.37
1055 0.4
1056 0.41
1057 0.41
1058 0.38
1059 0.37
1060 0.35
1061 0.31
1062 0.28
1063 0.25
1064 0.29
1065 0.25
1066 0.26
1067 0.27
1068 0.26
1069 0.29
1070 0.3
1071 0.29
1072 0.28
1073 0.27
1074 0.28
1075 0.29
1076 0.35
1077 0.38
1078 0.44
1079 0.5
1080 0.51
1081 0.58
1082 0.64
1083 0.65
1084 0.67
1085 0.64
1086 0.65
1087 0.65
1088 0.67
1089 0.68
1090 0.67
1091 0.7
1092 0.69
1093 0.75
1094 0.77
1095 0.81
1096 0.82
1097 0.85
1098 0.88
1099 0.89
1100 0.92
1101 0.94
1102 0.94
1103 0.94
1104 0.94
1105 0.93
1106 0.9
1107 0.84
1108 0.8
1109 0.75
1110 0.68
1111 0.64
1112 0.62
1113 0.6
1114 0.61
1115 0.6
1116 0.57
1117 0.51
1118 0.49
1119 0.45
1120 0.38
1121 0.33
1122 0.27
1123 0.22
1124 0.22
1125 0.24
1126 0.24
1127 0.23
1128 0.23
1129 0.19
1130 0.17
1131 0.18
1132 0.15
1133 0.15
1134 0.17
1135 0.16
1136 0.16
1137 0.17
1138 0.2
1139 0.22
1140 0.21
1141 0.22
1142 0.23
1143 0.24
1144 0.25
1145 0.26
1146 0.26
1147 0.23
1148 0.25
1149 0.27
1150 0.26
1151 0.24
1152 0.23
1153 0.24
1154 0.22
1155 0.25
1156 0.26
1157 0.23
1158 0.2
1159 0.2
1160 0.19
1161 0.22
1162 0.21
1163 0.17
1164 0.15
1165 0.14
1166 0.15
1167 0.15
1168 0.15
1169 0.12
1170 0.13
1171 0.15
1172 0.16
1173 0.17
1174 0.16
1175 0.18
1176 0.2
1177 0.2
1178 0.21
1179 0.22
1180 0.22
1181 0.28
1182 0.35
1183 0.37
1184 0.36
1185 0.36
1186 0.35
1187 0.35
1188 0.42
1189 0.41
1190 0.41
1191 0.41
1192 0.43
1193 0.48
1194 0.54
1195 0.52
1196 0.51
1197 0.49
1198 0.43
1199 0.46
1200 0.47
1201 0.43
1202 0.37
1203 0.39
1204 0.33
1205 0.3
1206 0.31
1207 0.26
1208 0.21
1209 0.2
1210 0.2
1211 0.17
1212 0.2
1213 0.29
1214 0.35
1215 0.38
1216 0.46
1217 0.5
1218 0.56
1219 0.56
1220 0.61
1221 0.59
1222 0.54
1223 0.5
1224 0.41
1225 0.37
1226 0.3
1227 0.3
1228 0.25
1229 0.23
1230 0.26
1231 0.25
1232 0.24
1233 0.24
1234 0.24
1235 0.23
1236 0.28
1237 0.25
1238 0.23
1239 0.3
1240 0.32
1241 0.4
1242 0.41
1243 0.42
1244 0.41
1245 0.47
1246 0.43
1247 0.45
1248 0.45
1249 0.44
1250 0.48
1251 0.46
1252 0.41
1253 0.33
1254 0.31