Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178Z5H7

Protein Details
Accession A0A178Z5H7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-33GQPTARATRTTRRSARQRKEPQDDIPEIHydrophilic
48-68SASNSRASKRRKMSEEPSTKIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 10, cyto_nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MPRRKGQPTARATRTTRRSARQRKEPQDDIPEIYGDMLAEAIAEEQASASNSRASKRRKMSEEPSTKIELDFDLFGSAANVHDGEETASADDAPPKLQPVVFDDFEISDESDAEFEDVDLEPATNDVAEGRPLEQKTLELDLSKTSTPRRAIQRRMPVSLAERKLRLDVHKAHLVLLLAHLKCRNRWCNSEFVHSILKPLVSRKLISLLHVDESKPQFQRSHSFTKGIEEVCALWRQQWKITARGMKRAHWREDVDAVKESEDAEDLIDFDDFKAAAISRSGSRDLGAQLFCALLRSVAVDARLVCSLQVLPFSGIAKGQTPEKPKPQYIYAPAQDYGSASHDGRVNMRPAGAPDPKRKRIVESPFPIFWVEVFSPSVQTWIPLDPLVRNTINKPKTGFEPPASDQLNSMIYVVAFEDDESARDVTRRYTQWYNAKTRKQRVESTKGGEKWWEVTMSVFEKPFSETRDEIEDATLLKRAESEPMPKNIQDFRGHPVYVLERHLRLNEVIHPRHEVGKVSTGPLKSAKLESVFRRRDVHVCRTADAWYRRGRDVNQGEQPLKRVVPKRQRNQDVAMAEDLENEDEASEGMALYAEYQTSVYEPPPVVDEKIPRNAYGNLDVYVPSMIPAGAVHIRHPLASAAARVLGIDYAEAVTGFQFKGRQGTAVIDGVVVSMNMTNAMINVIEGLESQASEEIQEARTKIILAMWKKWLTALRVHEHVHRHYGNQKHGTGDKGNDDDDDDDAEEDTMHRDEEGGGGFMLDQAELDQSEENANSVPLTTPNLKPLGQLLPAEVVHQDVIVIRSPNKLKQLPLSDLLRSHDRVTEETPHETSDAGGGFISEDGMVDQSPPHREGHEHAPSVRQNLANDEGGGFIPDEAEDDQGGGFLPEDEDGDGEPHARFITAHDGWITNTEDTMGMLSSETEHASTKERLDSTSASAGAGAGSGAENATAAGAGDSSAKPRSISTAGGRGLSRSGKEDPATSTTRSRHIPDTDMVAPSDQSPSRPMNNTATLEPDHPFSGSGQTTTTDQGDGGDETGDRFEAAHGPELQRSESGTTPASVAGSLLSHDPEDDDAEPEWLLSSLGEID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.76
3 0.75
4 0.75
5 0.79
6 0.82
7 0.87
8 0.88
9 0.9
10 0.91
11 0.91
12 0.88
13 0.85
14 0.83
15 0.76
16 0.69
17 0.6
18 0.5
19 0.41
20 0.34
21 0.26
22 0.17
23 0.12
24 0.08
25 0.06
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.04
30 0.04
31 0.04
32 0.04
33 0.06
34 0.07
35 0.08
36 0.09
37 0.14
38 0.17
39 0.22
40 0.31
41 0.37
42 0.46
43 0.55
44 0.64
45 0.66
46 0.73
47 0.77
48 0.8
49 0.82
50 0.77
51 0.72
52 0.67
53 0.6
54 0.51
55 0.43
56 0.33
57 0.26
58 0.22
59 0.17
60 0.14
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.1
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.13
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.14
83 0.16
84 0.17
85 0.18
86 0.2
87 0.26
88 0.25
89 0.25
90 0.24
91 0.23
92 0.23
93 0.23
94 0.18
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.07
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.06
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.08
116 0.09
117 0.11
118 0.17
119 0.18
120 0.2
121 0.19
122 0.2
123 0.22
124 0.25
125 0.24
126 0.19
127 0.19
128 0.2
129 0.23
130 0.23
131 0.23
132 0.23
133 0.29
134 0.32
135 0.38
136 0.46
137 0.53
138 0.61
139 0.68
140 0.74
141 0.73
142 0.74
143 0.67
144 0.6
145 0.58
146 0.58
147 0.54
148 0.49
149 0.45
150 0.42
151 0.44
152 0.44
153 0.42
154 0.41
155 0.41
156 0.43
157 0.47
158 0.46
159 0.43
160 0.41
161 0.37
162 0.28
163 0.25
164 0.25
165 0.2
166 0.22
167 0.26
168 0.26
169 0.31
170 0.4
171 0.45
172 0.44
173 0.52
174 0.51
175 0.57
176 0.58
177 0.61
178 0.53
179 0.48
180 0.48
181 0.4
182 0.4
183 0.32
184 0.3
185 0.23
186 0.26
187 0.3
188 0.25
189 0.26
190 0.25
191 0.31
192 0.3
193 0.31
194 0.32
195 0.27
196 0.28
197 0.28
198 0.27
199 0.27
200 0.3
201 0.34
202 0.31
203 0.32
204 0.32
205 0.34
206 0.42
207 0.41
208 0.46
209 0.43
210 0.45
211 0.42
212 0.44
213 0.45
214 0.38
215 0.32
216 0.23
217 0.22
218 0.21
219 0.22
220 0.17
221 0.18
222 0.23
223 0.24
224 0.26
225 0.32
226 0.33
227 0.36
228 0.43
229 0.47
230 0.45
231 0.52
232 0.52
233 0.52
234 0.6
235 0.62
236 0.6
237 0.58
238 0.58
239 0.51
240 0.56
241 0.52
242 0.44
243 0.4
244 0.35
245 0.28
246 0.26
247 0.23
248 0.15
249 0.13
250 0.1
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.1
266 0.11
267 0.14
268 0.15
269 0.14
270 0.14
271 0.16
272 0.17
273 0.19
274 0.17
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.13
279 0.12
280 0.1
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.1
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.15
307 0.19
308 0.25
309 0.31
310 0.39
311 0.44
312 0.45
313 0.48
314 0.48
315 0.5
316 0.49
317 0.51
318 0.46
319 0.43
320 0.41
321 0.37
322 0.33
323 0.27
324 0.22
325 0.16
326 0.15
327 0.12
328 0.14
329 0.16
330 0.17
331 0.2
332 0.22
333 0.21
334 0.19
335 0.2
336 0.18
337 0.17
338 0.24
339 0.28
340 0.31
341 0.39
342 0.48
343 0.53
344 0.58
345 0.57
346 0.57
347 0.59
348 0.62
349 0.61
350 0.58
351 0.58
352 0.52
353 0.52
354 0.46
355 0.37
356 0.28
357 0.22
358 0.16
359 0.12
360 0.13
361 0.12
362 0.13
363 0.13
364 0.15
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.11
372 0.11
373 0.12
374 0.16
375 0.16
376 0.16
377 0.2
378 0.28
379 0.3
380 0.31
381 0.31
382 0.29
383 0.32
384 0.37
385 0.37
386 0.3
387 0.34
388 0.33
389 0.39
390 0.38
391 0.34
392 0.28
393 0.26
394 0.24
395 0.18
396 0.16
397 0.09
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.05
402 0.04
403 0.04
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.07
408 0.08
409 0.07
410 0.08
411 0.09
412 0.1
413 0.16
414 0.17
415 0.21
416 0.25
417 0.32
418 0.39
419 0.46
420 0.53
421 0.56
422 0.63
423 0.66
424 0.7
425 0.72
426 0.69
427 0.71
428 0.69
429 0.69
430 0.66
431 0.64
432 0.62
433 0.55
434 0.5
435 0.43
436 0.35
437 0.29
438 0.25
439 0.19
440 0.12
441 0.11
442 0.13
443 0.14
444 0.15
445 0.12
446 0.11
447 0.11
448 0.14
449 0.15
450 0.15
451 0.17
452 0.16
453 0.17
454 0.21
455 0.21
456 0.19
457 0.18
458 0.16
459 0.13
460 0.13
461 0.14
462 0.09
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.12
467 0.13
468 0.19
469 0.21
470 0.25
471 0.27
472 0.26
473 0.29
474 0.28
475 0.3
476 0.27
477 0.24
478 0.24
479 0.27
480 0.26
481 0.23
482 0.23
483 0.21
484 0.2
485 0.21
486 0.19
487 0.16
488 0.17
489 0.18
490 0.17
491 0.15
492 0.15
493 0.18
494 0.24
495 0.24
496 0.24
497 0.26
498 0.25
499 0.28
500 0.28
501 0.22
502 0.16
503 0.2
504 0.2
505 0.19
506 0.22
507 0.19
508 0.19
509 0.2
510 0.19
511 0.15
512 0.15
513 0.15
514 0.14
515 0.19
516 0.23
517 0.31
518 0.32
519 0.34
520 0.36
521 0.36
522 0.4
523 0.42
524 0.44
525 0.42
526 0.4
527 0.39
528 0.37
529 0.37
530 0.37
531 0.34
532 0.3
533 0.28
534 0.3
535 0.31
536 0.32
537 0.31
538 0.34
539 0.36
540 0.38
541 0.37
542 0.37
543 0.38
544 0.36
545 0.37
546 0.29
547 0.25
548 0.25
549 0.25
550 0.31
551 0.4
552 0.49
553 0.56
554 0.65
555 0.7
556 0.68
557 0.66
558 0.63
559 0.52
560 0.44
561 0.35
562 0.27
563 0.2
564 0.17
565 0.14
566 0.08
567 0.07
568 0.05
569 0.05
570 0.03
571 0.03
572 0.03
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.03
581 0.03
582 0.04
583 0.04
584 0.05
585 0.06
586 0.05
587 0.08
588 0.08
589 0.08
590 0.1
591 0.1
592 0.11
593 0.12
594 0.16
595 0.18
596 0.26
597 0.26
598 0.25
599 0.27
600 0.27
601 0.27
602 0.26
603 0.24
604 0.17
605 0.17
606 0.16
607 0.14
608 0.12
609 0.1
610 0.07
611 0.05
612 0.05
613 0.04
614 0.04
615 0.06
616 0.08
617 0.08
618 0.09
619 0.12
620 0.12
621 0.12
622 0.12
623 0.1
624 0.1
625 0.1
626 0.1
627 0.07
628 0.07
629 0.07
630 0.07
631 0.07
632 0.05
633 0.04
634 0.04
635 0.04
636 0.03
637 0.03
638 0.03
639 0.03
640 0.03
641 0.05
642 0.05
643 0.05
644 0.07
645 0.07
646 0.11
647 0.11
648 0.12
649 0.12
650 0.13
651 0.14
652 0.14
653 0.13
654 0.1
655 0.09
656 0.08
657 0.08
658 0.06
659 0.04
660 0.03
661 0.03
662 0.03
663 0.04
664 0.03
665 0.03
666 0.04
667 0.04
668 0.03
669 0.03
670 0.03
671 0.03
672 0.03
673 0.04
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.04
679 0.04
680 0.05
681 0.06
682 0.07
683 0.09
684 0.09
685 0.09
686 0.1
687 0.1
688 0.09
689 0.11
690 0.15
691 0.16
692 0.2
693 0.25
694 0.26
695 0.25
696 0.28
697 0.28
698 0.25
699 0.29
700 0.31
701 0.29
702 0.33
703 0.35
704 0.37
705 0.39
706 0.38
707 0.39
708 0.34
709 0.33
710 0.36
711 0.41
712 0.44
713 0.45
714 0.44
715 0.4
716 0.41
717 0.42
718 0.38
719 0.34
720 0.3
721 0.25
722 0.25
723 0.21
724 0.21
725 0.18
726 0.15
727 0.14
728 0.1
729 0.08
730 0.08
731 0.08
732 0.07
733 0.06
734 0.07
735 0.07
736 0.06
737 0.06
738 0.06
739 0.06
740 0.08
741 0.08
742 0.07
743 0.06
744 0.06
745 0.06
746 0.07
747 0.07
748 0.05
749 0.04
750 0.04
751 0.05
752 0.05
753 0.06
754 0.05
755 0.06
756 0.07
757 0.07
758 0.07
759 0.07
760 0.07
761 0.06
762 0.06
763 0.07
764 0.06
765 0.1
766 0.14
767 0.15
768 0.18
769 0.21
770 0.21
771 0.2
772 0.23
773 0.22
774 0.21
775 0.2
776 0.17
777 0.18
778 0.17
779 0.18
780 0.15
781 0.12
782 0.09
783 0.09
784 0.08
785 0.06
786 0.08
787 0.1
788 0.11
789 0.11
790 0.17
791 0.2
792 0.24
793 0.31
794 0.32
795 0.32
796 0.38
797 0.43
798 0.41
799 0.44
800 0.43
801 0.37
802 0.36
803 0.38
804 0.34
805 0.3
806 0.28
807 0.26
808 0.24
809 0.25
810 0.27
811 0.32
812 0.3
813 0.32
814 0.31
815 0.29
816 0.27
817 0.25
818 0.21
819 0.15
820 0.13
821 0.09
822 0.08
823 0.07
824 0.07
825 0.07
826 0.07
827 0.04
828 0.04
829 0.04
830 0.05
831 0.05
832 0.05
833 0.06
834 0.1
835 0.13
836 0.15
837 0.15
838 0.16
839 0.18
840 0.22
841 0.31
842 0.35
843 0.35
844 0.34
845 0.4
846 0.41
847 0.42
848 0.42
849 0.34
850 0.27
851 0.29
852 0.32
853 0.26
854 0.24
855 0.21
856 0.18
857 0.16
858 0.15
859 0.11
860 0.07
861 0.06
862 0.06
863 0.07
864 0.07
865 0.08
866 0.07
867 0.07
868 0.07
869 0.07
870 0.07
871 0.05
872 0.05
873 0.04
874 0.05
875 0.05
876 0.06
877 0.06
878 0.06
879 0.07
880 0.07
881 0.07
882 0.08
883 0.08
884 0.08
885 0.08
886 0.08
887 0.08
888 0.09
889 0.18
890 0.17
891 0.18
892 0.19
893 0.19
894 0.19
895 0.23
896 0.23
897 0.14
898 0.14
899 0.13
900 0.12
901 0.12
902 0.12
903 0.08
904 0.06
905 0.06
906 0.06
907 0.07
908 0.08
909 0.08
910 0.08
911 0.09
912 0.11
913 0.16
914 0.18
915 0.19
916 0.24
917 0.24
918 0.25
919 0.27
920 0.28
921 0.27
922 0.29
923 0.27
924 0.21
925 0.2
926 0.19
927 0.15
928 0.13
929 0.08
930 0.04
931 0.04
932 0.04
933 0.04
934 0.04
935 0.04
936 0.04
937 0.04
938 0.03
939 0.03
940 0.03
941 0.03
942 0.04
943 0.07
944 0.07
945 0.1
946 0.13
947 0.13
948 0.14
949 0.15
950 0.2
951 0.19
952 0.24
953 0.26
954 0.32
955 0.33
956 0.35
957 0.35
958 0.31
959 0.33
960 0.31
961 0.28
962 0.24
963 0.27
964 0.28
965 0.3
966 0.31
967 0.31
968 0.33
969 0.35
970 0.34
971 0.38
972 0.36
973 0.4
974 0.42
975 0.42
976 0.44
977 0.44
978 0.45
979 0.4
980 0.44
981 0.41
982 0.38
983 0.35
984 0.28
985 0.25
986 0.22
987 0.25
988 0.19
989 0.18
990 0.21
991 0.25
992 0.3
993 0.34
994 0.38
995 0.39
996 0.45
997 0.47
998 0.43
999 0.43
1000 0.39
1001 0.37
1002 0.33
1003 0.29
1004 0.23
1005 0.2
1006 0.2
1007 0.16
1008 0.2
1009 0.19
1010 0.19
1011 0.17
1012 0.18
1013 0.2
1014 0.22
1015 0.21
1016 0.15
1017 0.14
1018 0.14
1019 0.15
1020 0.14
1021 0.13
1022 0.11
1023 0.1
1024 0.11
1025 0.12
1026 0.11
1027 0.09
1028 0.08
1029 0.09
1030 0.13
1031 0.15
1032 0.19
1033 0.22
1034 0.24
1035 0.28
1036 0.29
1037 0.29
1038 0.26
1039 0.26
1040 0.24
1041 0.22
1042 0.23
1043 0.21
1044 0.2
1045 0.2
1046 0.19
1047 0.18
1048 0.14
1049 0.12
1050 0.1
1051 0.08
1052 0.09
1053 0.1
1054 0.1
1055 0.1
1056 0.1
1057 0.11
1058 0.12
1059 0.15
1060 0.15
1061 0.15
1062 0.15
1063 0.16
1064 0.16
1065 0.14
1066 0.14
1067 0.11
1068 0.1
1069 0.07