Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZSQ8

Protein Details
Accession A0A178ZSQ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-57VTPDHVPSKRRRINYQPTAESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
437-454KGRASRRGKGKETEPERK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 8, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038886  E3_SLX5/Rfp1  
CDD cd16449  RING-HC  
Amino Acid Sequences MPPAGTIALSNFLNSASASSSRKRSHAEITRSQSRSVTPDHVPSKRRRINYQPTAESSRDSTPPHPESRARFQGDGLDFRRPVMSTRDPSAATAPALHDVTIDLTADSDSDSDSDNDPLTITPESYLQQTSGEAFSQVAPRPESRTALVHAWGEAAAAQRRRFEQQRELARPRRETAMRGQPTSLRREASTQEQDEARVRNAERMRAPPFGQRSQPLEVIDLSDTDESESDTNDLIADVSIDTSAFVSRSASSFSTSPEVEFVEERRVPHVQHHSGLHRPSRTGLTPPSSHSARTQAGYSDLLRRGTQFIFENMQHLVPTGYAESLHIRRNQGGRLANDDDGPLFVNMDYRRPAFAMGPYDVFDRGSDPPREVSEAYKAPPEAQDGFIRTFGEQDVILCPLCGDELAIGKGDTKKQVWVSKNCGHVYCGDCAVNRFKGRASRRGKGKETEPERKPDSPKSVPFSVCIVDGCNTRVLGKAAMFPIYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.1
4 0.15
5 0.19
6 0.24
7 0.33
8 0.36
9 0.41
10 0.45
11 0.47
12 0.53
13 0.59
14 0.62
15 0.63
16 0.68
17 0.73
18 0.7
19 0.67
20 0.59
21 0.52
22 0.47
23 0.43
24 0.4
25 0.34
26 0.41
27 0.47
28 0.52
29 0.57
30 0.62
31 0.68
32 0.7
33 0.72
34 0.72
35 0.74
36 0.78
37 0.81
38 0.82
39 0.76
40 0.75
41 0.75
42 0.67
43 0.58
44 0.51
45 0.45
46 0.39
47 0.37
48 0.34
49 0.37
50 0.42
51 0.44
52 0.47
53 0.49
54 0.52
55 0.58
56 0.63
57 0.58
58 0.53
59 0.49
60 0.52
61 0.49
62 0.49
63 0.42
64 0.4
65 0.36
66 0.36
67 0.37
68 0.29
69 0.28
70 0.28
71 0.34
72 0.31
73 0.35
74 0.38
75 0.37
76 0.37
77 0.37
78 0.31
79 0.23
80 0.21
81 0.18
82 0.17
83 0.17
84 0.15
85 0.13
86 0.11
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.07
99 0.08
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.11
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.09
121 0.09
122 0.11
123 0.14
124 0.16
125 0.17
126 0.18
127 0.19
128 0.24
129 0.25
130 0.26
131 0.24
132 0.24
133 0.24
134 0.24
135 0.25
136 0.21
137 0.18
138 0.17
139 0.14
140 0.12
141 0.1
142 0.11
143 0.13
144 0.17
145 0.18
146 0.2
147 0.22
148 0.28
149 0.33
150 0.35
151 0.4
152 0.44
153 0.53
154 0.6
155 0.66
156 0.69
157 0.7
158 0.67
159 0.6
160 0.59
161 0.5
162 0.45
163 0.45
164 0.47
165 0.45
166 0.42
167 0.41
168 0.4
169 0.41
170 0.44
171 0.38
172 0.29
173 0.26
174 0.28
175 0.29
176 0.32
177 0.35
178 0.3
179 0.3
180 0.29
181 0.3
182 0.3
183 0.29
184 0.22
185 0.19
186 0.19
187 0.23
188 0.24
189 0.28
190 0.27
191 0.31
192 0.34
193 0.33
194 0.34
195 0.33
196 0.37
197 0.35
198 0.35
199 0.33
200 0.34
201 0.33
202 0.34
203 0.29
204 0.24
205 0.21
206 0.19
207 0.16
208 0.12
209 0.1
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.11
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.14
251 0.15
252 0.15
253 0.17
254 0.18
255 0.18
256 0.23
257 0.31
258 0.27
259 0.29
260 0.31
261 0.32
262 0.36
263 0.39
264 0.38
265 0.31
266 0.29
267 0.28
268 0.28
269 0.26
270 0.25
271 0.24
272 0.24
273 0.25
274 0.27
275 0.3
276 0.27
277 0.27
278 0.25
279 0.27
280 0.24
281 0.23
282 0.21
283 0.17
284 0.18
285 0.19
286 0.18
287 0.19
288 0.19
289 0.2
290 0.19
291 0.2
292 0.21
293 0.19
294 0.21
295 0.16
296 0.16
297 0.18
298 0.18
299 0.19
300 0.17
301 0.17
302 0.14
303 0.13
304 0.11
305 0.07
306 0.08
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.11
312 0.14
313 0.18
314 0.21
315 0.22
316 0.26
317 0.29
318 0.3
319 0.32
320 0.35
321 0.32
322 0.35
323 0.36
324 0.32
325 0.3
326 0.28
327 0.22
328 0.17
329 0.16
330 0.1
331 0.07
332 0.07
333 0.11
334 0.11
335 0.14
336 0.17
337 0.16
338 0.17
339 0.17
340 0.19
341 0.15
342 0.19
343 0.2
344 0.19
345 0.19
346 0.19
347 0.2
348 0.19
349 0.18
350 0.14
351 0.13
352 0.15
353 0.2
354 0.21
355 0.21
356 0.23
357 0.24
358 0.27
359 0.26
360 0.24
361 0.25
362 0.27
363 0.26
364 0.28
365 0.26
366 0.24
367 0.25
368 0.27
369 0.22
370 0.22
371 0.24
372 0.23
373 0.25
374 0.25
375 0.24
376 0.2
377 0.19
378 0.16
379 0.14
380 0.11
381 0.1
382 0.1
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.09
387 0.08
388 0.08
389 0.07
390 0.06
391 0.05
392 0.08
393 0.08
394 0.09
395 0.09
396 0.13
397 0.16
398 0.2
399 0.23
400 0.22
401 0.27
402 0.33
403 0.42
404 0.47
405 0.51
406 0.57
407 0.58
408 0.65
409 0.62
410 0.57
411 0.5
412 0.47
413 0.42
414 0.37
415 0.34
416 0.28
417 0.26
418 0.28
419 0.33
420 0.34
421 0.33
422 0.32
423 0.32
424 0.4
425 0.46
426 0.52
427 0.55
428 0.56
429 0.65
430 0.73
431 0.75
432 0.73
433 0.75
434 0.75
435 0.77
436 0.78
437 0.73
438 0.72
439 0.72
440 0.72
441 0.7
442 0.69
443 0.69
444 0.67
445 0.7
446 0.68
447 0.69
448 0.63
449 0.58
450 0.53
451 0.45
452 0.37
453 0.3
454 0.25
455 0.21
456 0.22
457 0.22
458 0.21
459 0.2
460 0.2
461 0.22
462 0.22
463 0.22
464 0.21
465 0.25
466 0.24