Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZR11

Protein Details
Accession A0A178ZR11    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-155KAEAKAKKDEEKKRKEEEKDAARKVREEKKKQKDAEKQEKEABasic
271-295CPEKLGSRLHRRRRVRPVKPVKEILBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-169KKRKVTFAEKEADKAIKKAEKEEKERLKAEAKAKKDEEKKRKEEEKDAARKVREEKKKQKDAEKQEKEAEKQRKEAEAMKKER
279-289LHRRRRVRPVK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 12.166, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022043  CAF1A  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF12253  CAF1A  
Amino Acid Sequences MDAAVAPAPPPAQLTPSKKRNHEGEVIYRPGSVPSPDGQHSSPLTADDDSRCGTPNVGVHSTPLTEFGDTPVLSPSQPSSMAPADGKKRKVTFAEKEADKAIKKAEKEEKERLKAEAKAKKDEEKKRKEEEKDAARKVREEKKKQKDAEKQEKEAEKQRKEAEAMKKERAQMRIGAFFGRPAVATSPQASDLGNVSRGTTPSRRGSVTSIDLEPPLVEIKSPASKPTNSGYNEWILPFFVKEHMEVAPFNRFHSNRAVLDNDALAFNQDICPEKLGSRLHRRRRVRPVKPVKEILNEMSSTPTSSNVLADLPYKYLFFHEDIRPPYHGTYTRVVSPRRTRKLAVNSAYRGLPDTNYDYDSEAEWQEPEEGDEEVLDDDEKSEDEDGDEEMGDFLDDEGEIAKRQLIVGDMEPKCSGLCWEGEGEDGPPRDGFDLSSYRMDVLHDSTAFPIDPYSTVHWADVGKKSPAKREEKPQTPSMQPPRLPLAAVDPNSGGLLAQSGLLKFAPGDRQPETPCQTSKLKASHASGKPVKTISAEFFPAFREAVSGNPLTKTGLIEVLKNQFPKCSKDAIKNTLEAIAERRGVKEAEKKWVLIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.42
3 0.51
4 0.59
5 0.63
6 0.7
7 0.72
8 0.7
9 0.7
10 0.67
11 0.68
12 0.67
13 0.65
14 0.58
15 0.51
16 0.45
17 0.38
18 0.33
19 0.25
20 0.2
21 0.19
22 0.24
23 0.25
24 0.29
25 0.28
26 0.31
27 0.31
28 0.3
29 0.27
30 0.23
31 0.24
32 0.21
33 0.23
34 0.19
35 0.21
36 0.21
37 0.21
38 0.21
39 0.19
40 0.19
41 0.19
42 0.21
43 0.24
44 0.26
45 0.25
46 0.25
47 0.26
48 0.26
49 0.23
50 0.22
51 0.17
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.2
56 0.18
57 0.19
58 0.18
59 0.17
60 0.16
61 0.17
62 0.17
63 0.14
64 0.15
65 0.15
66 0.18
67 0.19
68 0.21
69 0.22
70 0.27
71 0.34
72 0.4
73 0.44
74 0.46
75 0.47
76 0.5
77 0.55
78 0.58
79 0.57
80 0.58
81 0.63
82 0.57
83 0.57
84 0.56
85 0.53
86 0.45
87 0.38
88 0.38
89 0.33
90 0.33
91 0.4
92 0.46
93 0.5
94 0.56
95 0.65
96 0.67
97 0.69
98 0.7
99 0.65
100 0.61
101 0.59
102 0.61
103 0.58
104 0.53
105 0.55
106 0.57
107 0.61
108 0.65
109 0.69
110 0.71
111 0.74
112 0.77
113 0.78
114 0.84
115 0.81
116 0.8
117 0.79
118 0.79
119 0.78
120 0.79
121 0.75
122 0.68
123 0.67
124 0.66
125 0.66
126 0.66
127 0.67
128 0.7
129 0.74
130 0.82
131 0.84
132 0.86
133 0.86
134 0.86
135 0.87
136 0.84
137 0.78
138 0.76
139 0.75
140 0.69
141 0.68
142 0.67
143 0.6
144 0.58
145 0.57
146 0.53
147 0.5
148 0.53
149 0.54
150 0.54
151 0.56
152 0.56
153 0.56
154 0.58
155 0.6
156 0.55
157 0.47
158 0.42
159 0.4
160 0.38
161 0.35
162 0.31
163 0.26
164 0.23
165 0.22
166 0.16
167 0.12
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.13
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.14
185 0.18
186 0.19
187 0.23
188 0.26
189 0.29
190 0.28
191 0.28
192 0.3
193 0.3
194 0.31
195 0.28
196 0.25
197 0.23
198 0.22
199 0.2
200 0.17
201 0.13
202 0.11
203 0.08
204 0.06
205 0.06
206 0.09
207 0.13
208 0.14
209 0.17
210 0.2
211 0.21
212 0.23
213 0.26
214 0.31
215 0.28
216 0.3
217 0.29
218 0.27
219 0.27
220 0.25
221 0.22
222 0.15
223 0.13
224 0.11
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.13
234 0.17
235 0.16
236 0.18
237 0.23
238 0.22
239 0.23
240 0.29
241 0.31
242 0.26
243 0.29
244 0.29
245 0.23
246 0.23
247 0.21
248 0.15
249 0.11
250 0.09
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.08
257 0.08
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.15
262 0.18
263 0.24
264 0.33
265 0.42
266 0.51
267 0.6
268 0.66
269 0.71
270 0.79
271 0.83
272 0.8
273 0.82
274 0.83
275 0.82
276 0.81
277 0.77
278 0.68
279 0.61
280 0.54
281 0.45
282 0.36
283 0.28
284 0.22
285 0.19
286 0.16
287 0.13
288 0.11
289 0.1
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.14
306 0.17
307 0.21
308 0.24
309 0.26
310 0.27
311 0.26
312 0.25
313 0.24
314 0.24
315 0.22
316 0.23
317 0.22
318 0.26
319 0.3
320 0.31
321 0.35
322 0.42
323 0.49
324 0.52
325 0.53
326 0.5
327 0.53
328 0.61
329 0.63
330 0.59
331 0.55
332 0.5
333 0.49
334 0.47
335 0.39
336 0.31
337 0.23
338 0.17
339 0.13
340 0.15
341 0.14
342 0.15
343 0.15
344 0.15
345 0.15
346 0.15
347 0.14
348 0.11
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.06
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.04
385 0.04
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.1
395 0.2
396 0.19
397 0.21
398 0.21
399 0.21
400 0.19
401 0.18
402 0.17
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.11
410 0.11
411 0.13
412 0.13
413 0.12
414 0.11
415 0.12
416 0.12
417 0.12
418 0.12
419 0.12
420 0.15
421 0.16
422 0.18
423 0.18
424 0.17
425 0.17
426 0.17
427 0.15
428 0.14
429 0.15
430 0.14
431 0.14
432 0.14
433 0.15
434 0.14
435 0.13
436 0.1
437 0.08
438 0.08
439 0.11
440 0.14
441 0.16
442 0.17
443 0.16
444 0.18
445 0.18
446 0.22
447 0.25
448 0.25
449 0.27
450 0.31
451 0.34
452 0.41
453 0.48
454 0.52
455 0.53
456 0.6
457 0.66
458 0.7
459 0.73
460 0.71
461 0.68
462 0.65
463 0.68
464 0.67
465 0.65
466 0.58
467 0.56
468 0.55
469 0.5
470 0.45
471 0.36
472 0.33
473 0.32
474 0.32
475 0.29
476 0.24
477 0.23
478 0.23
479 0.22
480 0.14
481 0.07
482 0.07
483 0.05
484 0.06
485 0.07
486 0.07
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.11
492 0.17
493 0.18
494 0.24
495 0.25
496 0.31
497 0.35
498 0.43
499 0.45
500 0.43
501 0.42
502 0.42
503 0.45
504 0.44
505 0.48
506 0.45
507 0.45
508 0.46
509 0.5
510 0.55
511 0.54
512 0.6
513 0.59
514 0.56
515 0.54
516 0.49
517 0.45
518 0.38
519 0.37
520 0.31
521 0.3
522 0.31
523 0.27
524 0.26
525 0.27
526 0.25
527 0.22
528 0.18
529 0.15
530 0.12
531 0.14
532 0.18
533 0.18
534 0.17
535 0.18
536 0.19
537 0.19
538 0.19
539 0.18
540 0.15
541 0.2
542 0.19
543 0.21
544 0.26
545 0.31
546 0.34
547 0.37
548 0.36
549 0.36
550 0.39
551 0.43
552 0.42
553 0.45
554 0.47
555 0.54
556 0.63
557 0.64
558 0.65
559 0.61
560 0.58
561 0.52
562 0.47
563 0.37
564 0.32
565 0.29
566 0.29
567 0.28
568 0.28
569 0.27
570 0.27
571 0.32
572 0.38
573 0.38
574 0.44
575 0.46