Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZV11

Protein Details
Accession A0A178ZV11    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-66LNFVVATRRRHRHHHHNHTARDKHKYTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
299-304GEARRR
Subcellular Location(s) plas 22, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MSNDDNSNSDQNLYFYSPSTAAAVVFSVLYFLLTVWHGYLNFVVATRRRHRHHHHNHTARDKHKYTIPLFVACVISTAGWSVRNASIHNLASIPLYAVSASYIVISPIFVCATLYLLLTRLIRTTLPTHQQVFFRVPPHWLGRVFITLDVISFLTQCSGSGIASSGNWEGNLKTVGTNVLLVGLSLQLATFSVFLVFFGSFVKRVSWCKETAFDCGARKVVWAIWIAGFWVQVRSVYRVVEFGMGINGYPFTHEWCLYVLEAVPMFIALTVLAFCHPIKYMQQTPLPTEYALQGRERRGEARRRSDGKHLSSDRGKGGVVNNVAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.2
4 0.19
5 0.19
6 0.19
7 0.16
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.09
12 0.09
13 0.07
14 0.06
15 0.05
16 0.06
17 0.05
18 0.05
19 0.06
20 0.06
21 0.07
22 0.08
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.14
31 0.17
32 0.26
33 0.34
34 0.43
35 0.46
36 0.56
37 0.64
38 0.71
39 0.78
40 0.81
41 0.83
42 0.84
43 0.89
44 0.89
45 0.88
46 0.83
47 0.81
48 0.72
49 0.64
50 0.6
51 0.59
52 0.5
53 0.51
54 0.48
55 0.4
56 0.38
57 0.37
58 0.32
59 0.24
60 0.22
61 0.14
62 0.11
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.11
69 0.13
70 0.14
71 0.15
72 0.17
73 0.21
74 0.2
75 0.21
76 0.18
77 0.16
78 0.15
79 0.15
80 0.12
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.11
111 0.14
112 0.17
113 0.21
114 0.25
115 0.27
116 0.29
117 0.3
118 0.3
119 0.31
120 0.29
121 0.26
122 0.23
123 0.22
124 0.23
125 0.25
126 0.25
127 0.21
128 0.19
129 0.18
130 0.19
131 0.18
132 0.15
133 0.13
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.02
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.1
190 0.11
191 0.14
192 0.19
193 0.21
194 0.22
195 0.23
196 0.28
197 0.28
198 0.3
199 0.3
200 0.28
201 0.27
202 0.27
203 0.26
204 0.21
205 0.2
206 0.17
207 0.15
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.1
221 0.14
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.13
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.06
236 0.08
237 0.08
238 0.1
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.14
243 0.16
244 0.15
245 0.15
246 0.12
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.03
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.06
261 0.06
262 0.08
263 0.09
264 0.11
265 0.15
266 0.22
267 0.28
268 0.32
269 0.38
270 0.39
271 0.43
272 0.44
273 0.42
274 0.35
275 0.3
276 0.28
277 0.27
278 0.27
279 0.28
280 0.3
281 0.32
282 0.37
283 0.39
284 0.41
285 0.45
286 0.53
287 0.57
288 0.62
289 0.68
290 0.69
291 0.71
292 0.75
293 0.76
294 0.72
295 0.72
296 0.67
297 0.65
298 0.66
299 0.66
300 0.58
301 0.51
302 0.44
303 0.37
304 0.37
305 0.36