Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZM19

Protein Details
Accession A0A178ZM19    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-55VSSDFQDSTRPKKKRRKNKDDFAGSGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-47RPKKKRRKNK
242-246RAERK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 1, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018609  Bud13  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF09736  Bud13  
Amino Acid Sequences MPGGNLADYLAKNYLTAAKSPSAPKSDTVSSDFQDSTRPKKKRRKNKDDFAGSGLVIADDDEDLSLRSNASRGRREEEDEDGETPIFEAGLKSAEFRKKKGGGTWKVVATATSTVTQTSNNREEEKEADRILAEAAEESRRRRQEIEDEDAPAIVEEKDSGPRMQSGARAGLQTAADTAALVAQEEREKQREFESQRSTKAKKHKDGPVEVEETIYRDATGRRIDISLKRAEARAAAEEKVRAERKAKEDAMGDVQRREREQRRKELEDAKFLTLARGVDDEEMNDELRAKVRWDDPMAGYIAQQKAEEGAADSAKSAGKSKGSSGGRVAAKRKVYTGPPAAPNRYGILPGWRWDGVDRSNGFEKEWFQARSKRGREEELRYQWQMDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.19
3 0.22
4 0.23
5 0.24
6 0.29
7 0.34
8 0.39
9 0.37
10 0.37
11 0.38
12 0.4
13 0.41
14 0.4
15 0.4
16 0.38
17 0.34
18 0.37
19 0.34
20 0.28
21 0.33
22 0.33
23 0.39
24 0.44
25 0.52
26 0.58
27 0.69
28 0.79
29 0.82
30 0.89
31 0.91
32 0.92
33 0.94
34 0.95
35 0.93
36 0.85
37 0.79
38 0.7
39 0.58
40 0.47
41 0.36
42 0.25
43 0.16
44 0.12
45 0.08
46 0.05
47 0.05
48 0.04
49 0.05
50 0.05
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.08
55 0.1
56 0.16
57 0.23
58 0.3
59 0.33
60 0.38
61 0.41
62 0.46
63 0.47
64 0.48
65 0.45
66 0.39
67 0.37
68 0.32
69 0.28
70 0.23
71 0.19
72 0.13
73 0.08
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.07
78 0.07
79 0.09
80 0.16
81 0.24
82 0.26
83 0.29
84 0.37
85 0.4
86 0.43
87 0.5
88 0.54
89 0.53
90 0.57
91 0.6
92 0.52
93 0.49
94 0.46
95 0.38
96 0.29
97 0.23
98 0.18
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.13
103 0.16
104 0.16
105 0.22
106 0.25
107 0.27
108 0.29
109 0.29
110 0.3
111 0.32
112 0.32
113 0.29
114 0.24
115 0.22
116 0.19
117 0.19
118 0.17
119 0.12
120 0.09
121 0.06
122 0.07
123 0.11
124 0.12
125 0.15
126 0.22
127 0.24
128 0.26
129 0.28
130 0.3
131 0.36
132 0.4
133 0.45
134 0.4
135 0.39
136 0.37
137 0.35
138 0.31
139 0.21
140 0.16
141 0.08
142 0.06
143 0.05
144 0.06
145 0.08
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.14
153 0.13
154 0.14
155 0.15
156 0.15
157 0.14
158 0.14
159 0.13
160 0.11
161 0.09
162 0.07
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.07
173 0.1
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.17
178 0.24
179 0.27
180 0.32
181 0.39
182 0.38
183 0.44
184 0.5
185 0.5
186 0.48
187 0.55
188 0.56
189 0.55
190 0.6
191 0.6
192 0.61
193 0.63
194 0.63
195 0.57
196 0.51
197 0.44
198 0.37
199 0.3
200 0.24
201 0.19
202 0.14
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.11
207 0.13
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.17
212 0.2
213 0.24
214 0.23
215 0.23
216 0.24
217 0.23
218 0.23
219 0.21
220 0.18
221 0.18
222 0.17
223 0.16
224 0.16
225 0.17
226 0.18
227 0.23
228 0.23
229 0.21
230 0.23
231 0.28
232 0.31
233 0.39
234 0.38
235 0.34
236 0.33
237 0.34
238 0.37
239 0.35
240 0.32
241 0.28
242 0.3
243 0.3
244 0.31
245 0.37
246 0.39
247 0.45
248 0.52
249 0.59
250 0.64
251 0.67
252 0.72
253 0.74
254 0.68
255 0.66
256 0.61
257 0.52
258 0.45
259 0.4
260 0.34
261 0.27
262 0.23
263 0.15
264 0.12
265 0.12
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.12
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.11
276 0.12
277 0.11
278 0.15
279 0.17
280 0.22
281 0.24
282 0.27
283 0.26
284 0.28
285 0.28
286 0.24
287 0.22
288 0.23
289 0.22
290 0.19
291 0.18
292 0.15
293 0.15
294 0.15
295 0.14
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.12
303 0.13
304 0.14
305 0.14
306 0.17
307 0.19
308 0.21
309 0.29
310 0.29
311 0.31
312 0.31
313 0.36
314 0.38
315 0.42
316 0.45
317 0.42
318 0.46
319 0.44
320 0.45
321 0.43
322 0.42
323 0.45
324 0.48
325 0.48
326 0.51
327 0.57
328 0.58
329 0.54
330 0.52
331 0.46
332 0.39
333 0.34
334 0.27
335 0.28
336 0.27
337 0.28
338 0.31
339 0.28
340 0.28
341 0.28
342 0.32
343 0.27
344 0.32
345 0.31
346 0.32
347 0.38
348 0.38
349 0.37
350 0.35
351 0.35
352 0.33
353 0.39
354 0.37
355 0.36
356 0.43
357 0.5
358 0.57
359 0.61
360 0.65
361 0.63
362 0.69
363 0.72
364 0.73
365 0.75
366 0.75
367 0.75
368 0.68