Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ZNI1

Protein Details
Accession A0A178ZNI1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-95SRPGSSGRDHKPKPRDIRDEDRRGPRRDDERRRRSRSRDTPDGRRERSRSKERPAHRDRNRDKERDRDRDBasic
106-132NGHGRRERSKSRDRKRDSKDHRAERSYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-181SGRDHKPKPRDIRDEDRRGPRRDDERRRRSRSRDTPDGRRERSRSKERPAHRDRNRDKERDRDRDRGGGGRGRDVNGHGRRERSKSRDRKRDSKDHRAERSYRRSRSRSPARTGGRDGVRTRSPLRRSDHDRTRPRDRNKPDDEEPRAPKP
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 1, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MDERPAKRTKRTTSAAMWDEDEKTDSRPGSSGRDHKPKPRDIRDEDRRGPRRDDERRRRSRSRDTPDGRRERSRSKERPAHRDRNRDKERDRDRDRGGGGRGRDVNGHGRRERSKSRDRKRDSKDHRAERSYRRSRSRSPARTGGRDGVRTRSPLRRSDHDRTRPRDRNKPDDEEPRAPKPKDEQRAAQTEKPLTNGDAMAVDEDDEDALLRKMMGFTTFKSTQNTKVPGNQIYGTFEPIEVIDSRIDGFQGDLRGLASCVYYQITGQMRLGEEDLPELDRTATDSMSAIIFLFMLHYLASVTVSTIAYQLAGKCSATSDAALLQTHEEHSHNKPRIENLHARQEVFHLLKHKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.68
3 0.6
4 0.54
5 0.47
6 0.43
7 0.37
8 0.32
9 0.23
10 0.22
11 0.25
12 0.23
13 0.21
14 0.23
15 0.24
16 0.29
17 0.37
18 0.43
19 0.48
20 0.58
21 0.62
22 0.68
23 0.75
24 0.77
25 0.79
26 0.81
27 0.81
28 0.79
29 0.85
30 0.86
31 0.87
32 0.86
33 0.86
34 0.84
35 0.79
36 0.76
37 0.74
38 0.74
39 0.74
40 0.77
41 0.78
42 0.8
43 0.86
44 0.9
45 0.9
46 0.89
47 0.89
48 0.88
49 0.87
50 0.87
51 0.84
52 0.85
53 0.86
54 0.87
55 0.82
56 0.8
57 0.77
58 0.75
59 0.78
60 0.78
61 0.76
62 0.77
63 0.8
64 0.79
65 0.84
66 0.85
67 0.86
68 0.84
69 0.86
70 0.84
71 0.86
72 0.86
73 0.85
74 0.8
75 0.79
76 0.8
77 0.8
78 0.78
79 0.76
80 0.71
81 0.68
82 0.65
83 0.6
84 0.54
85 0.48
86 0.42
87 0.4
88 0.38
89 0.32
90 0.31
91 0.28
92 0.33
93 0.34
94 0.39
95 0.36
96 0.4
97 0.44
98 0.5
99 0.56
100 0.54
101 0.59
102 0.63
103 0.72
104 0.77
105 0.8
106 0.83
107 0.84
108 0.86
109 0.85
110 0.85
111 0.85
112 0.84
113 0.83
114 0.8
115 0.79
116 0.77
117 0.79
118 0.77
119 0.75
120 0.74
121 0.72
122 0.73
123 0.76
124 0.77
125 0.75
126 0.72
127 0.73
128 0.69
129 0.68
130 0.64
131 0.59
132 0.52
133 0.48
134 0.43
135 0.39
136 0.35
137 0.34
138 0.35
139 0.36
140 0.37
141 0.39
142 0.43
143 0.45
144 0.52
145 0.58
146 0.64
147 0.67
148 0.71
149 0.71
150 0.77
151 0.78
152 0.77
153 0.77
154 0.74
155 0.73
156 0.71
157 0.71
158 0.66
159 0.66
160 0.66
161 0.64
162 0.61
163 0.59
164 0.59
165 0.53
166 0.48
167 0.47
168 0.49
169 0.49
170 0.49
171 0.46
172 0.44
173 0.53
174 0.55
175 0.5
176 0.45
177 0.4
178 0.37
179 0.34
180 0.3
181 0.22
182 0.18
183 0.16
184 0.12
185 0.09
186 0.09
187 0.07
188 0.06
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.08
203 0.08
204 0.1
205 0.17
206 0.2
207 0.22
208 0.26
209 0.27
210 0.31
211 0.37
212 0.4
213 0.34
214 0.37
215 0.4
216 0.38
217 0.39
218 0.34
219 0.28
220 0.28
221 0.27
222 0.23
223 0.19
224 0.16
225 0.13
226 0.12
227 0.13
228 0.09
229 0.1
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.06
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.06
247 0.07
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.13
252 0.15
253 0.16
254 0.17
255 0.18
256 0.18
257 0.18
258 0.2
259 0.15
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.1
266 0.09
267 0.08
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.13
300 0.13
301 0.12
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.14
306 0.12
307 0.13
308 0.15
309 0.15
310 0.15
311 0.14
312 0.15
313 0.16
314 0.17
315 0.17
316 0.19
317 0.27
318 0.37
319 0.41
320 0.44
321 0.46
322 0.51
323 0.56
324 0.6
325 0.63
326 0.59
327 0.64
328 0.63
329 0.6
330 0.53
331 0.49
332 0.49
333 0.41
334 0.38