Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178Z998

Protein Details
Accession A0A178Z998    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
567-587STATASPKRGHKPRVPIKEEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
496-522PRPARPSTPAHGKSRLGRLAGKRQVAR
549-561KRKVGRLGGLRKK
574-578KRGHK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 14.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MPDSACEGWQELQTTARRQCPKLFYSFSTKEQSLTLLLTDLISIWECSLDRYDILAAAARQQTSIDPSVSVDQFEVLLSKIRKSLRDGESNIIRDGRGNSQTLLLRTRIDLPRPLRPLEWTFTLEPQRASELAERILRPSLHEVFVSQNKINSLLGIIKEKDHIISRLLDRVGNSAVDLSLVFPGIAGFASRKGGHVSAADAKKHVPGMASFDEKSWTRQFANDEGYEGADRTGLSNLVRGCEKCFAHSKAEHESWVKDLPSTEKPHRNDAGKSRIGSPPSMDATQKKPDLDRESTDDEFERQATPPHLKFKGTKTATHGTTEDEETGGADEPVPKRSELSTIGGLGRRNATKAFGASKRSPDPVLAAKNKSLARRRVSTTSTETATASEDDDVAGEVPETRAAPQTRSGHPAPKSKLGVLRSRKVSPSPSPSQSRSSTSSARRASNEGPPSRNPRVAAGLSKTPENEEDQAEAEEGNDDLNDLSSTASPSPSPPPRPARPSTPAHGKSRLGRLAGKRQVARPSSRSTSPSPGEASKGDEIPETQTPTKRKVGRLGGLRKKELEATSTATASPKRGHKPRVPIKEEDHDDSDDVTDTPSPSPSIIWHACVQSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.39
3 0.45
4 0.5
5 0.52
6 0.59
7 0.61
8 0.6
9 0.62
10 0.61
11 0.57
12 0.6
13 0.61
14 0.58
15 0.57
16 0.53
17 0.45
18 0.4
19 0.38
20 0.29
21 0.25
22 0.2
23 0.13
24 0.13
25 0.12
26 0.11
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.07
32 0.09
33 0.09
34 0.11
35 0.13
36 0.14
37 0.13
38 0.14
39 0.15
40 0.14
41 0.14
42 0.16
43 0.13
44 0.18
45 0.21
46 0.19
47 0.19
48 0.19
49 0.2
50 0.22
51 0.24
52 0.19
53 0.16
54 0.18
55 0.23
56 0.23
57 0.22
58 0.17
59 0.15
60 0.14
61 0.14
62 0.13
63 0.08
64 0.14
65 0.15
66 0.16
67 0.22
68 0.25
69 0.28
70 0.33
71 0.42
72 0.42
73 0.5
74 0.52
75 0.54
76 0.58
77 0.58
78 0.54
79 0.45
80 0.38
81 0.32
82 0.32
83 0.3
84 0.26
85 0.25
86 0.24
87 0.28
88 0.31
89 0.31
90 0.31
91 0.26
92 0.24
93 0.24
94 0.31
95 0.31
96 0.32
97 0.37
98 0.38
99 0.46
100 0.49
101 0.49
102 0.42
103 0.43
104 0.44
105 0.4
106 0.4
107 0.35
108 0.33
109 0.37
110 0.41
111 0.37
112 0.34
113 0.3
114 0.29
115 0.25
116 0.26
117 0.24
118 0.21
119 0.23
120 0.27
121 0.26
122 0.25
123 0.28
124 0.26
125 0.24
126 0.28
127 0.27
128 0.24
129 0.23
130 0.23
131 0.25
132 0.3
133 0.32
134 0.26
135 0.25
136 0.25
137 0.26
138 0.25
139 0.19
140 0.15
141 0.14
142 0.15
143 0.17
144 0.17
145 0.17
146 0.18
147 0.18
148 0.19
149 0.18
150 0.18
151 0.16
152 0.2
153 0.21
154 0.24
155 0.25
156 0.24
157 0.22
158 0.23
159 0.21
160 0.17
161 0.15
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.15
185 0.21
186 0.24
187 0.24
188 0.22
189 0.23
190 0.23
191 0.23
192 0.21
193 0.13
194 0.11
195 0.16
196 0.19
197 0.21
198 0.2
199 0.19
200 0.22
201 0.21
202 0.25
203 0.22
204 0.22
205 0.19
206 0.22
207 0.25
208 0.26
209 0.3
210 0.25
211 0.24
212 0.21
213 0.21
214 0.19
215 0.16
216 0.12
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.13
227 0.13
228 0.14
229 0.19
230 0.19
231 0.19
232 0.26
233 0.27
234 0.31
235 0.33
236 0.34
237 0.34
238 0.35
239 0.35
240 0.3
241 0.28
242 0.24
243 0.25
244 0.22
245 0.16
246 0.15
247 0.17
248 0.22
249 0.27
250 0.32
251 0.37
252 0.4
253 0.46
254 0.49
255 0.48
256 0.47
257 0.48
258 0.49
259 0.45
260 0.44
261 0.4
262 0.39
263 0.37
264 0.33
265 0.26
266 0.21
267 0.2
268 0.2
269 0.19
270 0.18
271 0.21
272 0.26
273 0.27
274 0.25
275 0.24
276 0.29
277 0.33
278 0.33
279 0.31
280 0.3
281 0.33
282 0.33
283 0.32
284 0.27
285 0.22
286 0.19
287 0.18
288 0.14
289 0.09
290 0.11
291 0.12
292 0.17
293 0.18
294 0.24
295 0.24
296 0.25
297 0.28
298 0.31
299 0.38
300 0.36
301 0.36
302 0.36
303 0.41
304 0.4
305 0.39
306 0.35
307 0.26
308 0.26
309 0.24
310 0.18
311 0.12
312 0.11
313 0.09
314 0.09
315 0.07
316 0.05
317 0.05
318 0.08
319 0.09
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.13
325 0.16
326 0.15
327 0.17
328 0.15
329 0.16
330 0.17
331 0.19
332 0.18
333 0.16
334 0.17
335 0.14
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.12
340 0.14
341 0.19
342 0.2
343 0.25
344 0.27
345 0.32
346 0.33
347 0.34
348 0.32
349 0.27
350 0.27
351 0.26
352 0.31
353 0.31
354 0.3
355 0.29
356 0.34
357 0.37
358 0.41
359 0.42
360 0.42
361 0.43
362 0.46
363 0.49
364 0.49
365 0.49
366 0.47
367 0.45
368 0.4
369 0.36
370 0.32
371 0.28
372 0.23
373 0.22
374 0.17
375 0.12
376 0.09
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.12
390 0.13
391 0.14
392 0.21
393 0.26
394 0.28
395 0.34
396 0.35
397 0.37
398 0.41
399 0.48
400 0.45
401 0.47
402 0.47
403 0.44
404 0.47
405 0.45
406 0.49
407 0.48
408 0.51
409 0.49
410 0.5
411 0.5
412 0.48
413 0.49
414 0.47
415 0.48
416 0.47
417 0.49
418 0.52
419 0.52
420 0.55
421 0.52
422 0.49
423 0.46
424 0.44
425 0.45
426 0.44
427 0.5
428 0.49
429 0.49
430 0.47
431 0.47
432 0.45
433 0.46
434 0.5
435 0.46
436 0.45
437 0.47
438 0.54
439 0.54
440 0.54
441 0.46
442 0.4
443 0.4
444 0.38
445 0.37
446 0.33
447 0.33
448 0.31
449 0.32
450 0.3
451 0.26
452 0.25
453 0.25
454 0.23
455 0.19
456 0.19
457 0.18
458 0.18
459 0.17
460 0.15
461 0.11
462 0.09
463 0.08
464 0.07
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.06
472 0.06
473 0.09
474 0.09
475 0.1
476 0.1
477 0.12
478 0.2
479 0.27
480 0.32
481 0.38
482 0.46
483 0.54
484 0.61
485 0.64
486 0.64
487 0.63
488 0.64
489 0.63
490 0.66
491 0.64
492 0.63
493 0.64
494 0.6
495 0.59
496 0.62
497 0.58
498 0.5
499 0.51
500 0.52
501 0.57
502 0.6
503 0.61
504 0.56
505 0.57
506 0.63
507 0.62
508 0.62
509 0.56
510 0.57
511 0.55
512 0.55
513 0.55
514 0.51
515 0.53
516 0.49
517 0.47
518 0.43
519 0.4
520 0.38
521 0.35
522 0.35
523 0.29
524 0.28
525 0.25
526 0.22
527 0.21
528 0.23
529 0.26
530 0.27
531 0.28
532 0.34
533 0.37
534 0.42
535 0.5
536 0.52
537 0.53
538 0.57
539 0.62
540 0.63
541 0.69
542 0.74
543 0.75
544 0.77
545 0.75
546 0.68
547 0.61
548 0.58
549 0.5
550 0.42
551 0.35
552 0.33
553 0.32
554 0.3
555 0.29
556 0.27
557 0.27
558 0.27
559 0.31
560 0.34
561 0.41
562 0.5
563 0.58
564 0.63
565 0.72
566 0.79
567 0.83
568 0.81
569 0.78
570 0.76
571 0.77
572 0.75
573 0.69
574 0.63
575 0.54
576 0.49
577 0.43
578 0.36
579 0.27
580 0.21
581 0.17
582 0.15
583 0.15
584 0.15
585 0.16
586 0.16
587 0.15
588 0.16
589 0.16
590 0.23
591 0.24
592 0.26
593 0.29